More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_3875 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_3875  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 		 937 aa  1907    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3406  TonB-dependent receptor plug  35.44 
 
 		 1006 aa  546  1e-154  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1124  TonB-dependent receptor  33.4 
 
 		 953 aa  474  1e-132  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.223448  hitchhiker  0.00360467 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3877  TonB-dependent receptor plug  33.93 
 
 		 1036 aa  470  1.0000000000000001e-131  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1298  TonB-dependent receptor  32.53 
 
 		 929 aa  453  1.0000000000000001e-126  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0684189  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2641  TonB-dependent receptor plug  32.22 
 
 		 1123 aa  451  1e-125  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.42355  normal  0.497616 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2241  TonB-dependent receptor plug  32.34 
 
 		 1027 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.122093  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2244  TonB-dependent receptor plug  32.57 
 
 		 1109 aa  448  1.0000000000000001e-124  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1300  TonB-dependent receptor plug  31.62 
 
 		 1029 aa  442  9.999999999999999e-123  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.298752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2243  TonB-dependent receptor  32.39 
 
 		 913 aa  439  1e-121  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4637  TonB-dependent receptor  33.4 
 
 		 1061 aa  434  1e-120  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0127859  normal  0.0510805 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1126  TonB-dependent receptor plug  32.21 
 
 		 1056 aa  419  9.999999999999999e-116  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00950151 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1022  TonB-dependent receptor plug  31.22 
 
 		 1094 aa  415  1e-114  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0353971  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2722  TonB-dependent receptor  31.24 
 
 		 1045 aa  415  1e-114  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1121  TonB-dependent receptor plug  31.79 
 
 		 1145 aa  412  1e-113  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000289736 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1421  TonB-dependent receptor  32.73 
 
 		 1144 aa  409  1.0000000000000001e-112  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0101171 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1020  TonB-dependent receptor  31.78 
 
 		 917 aa  408  1.0000000000000001e-112  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.111548  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5521  TonB-dependent receptor plug  30.79 
 
 		 1130 aa  406  1e-111  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000129215  normal  0.0524869 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4559  TonB-dependent receptor  31.5 
 
 		 1033 aa  400  9.999999999999999e-111  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00904545 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6796  TonB-dependent receptor  31.25 
 
 		 1081 aa  386  1e-106  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000906345  hitchhiker  0.0000117399 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2560  TonB-dependent receptor plug  31.03 
 
 		 1062 aa  389  1e-106  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4812  TonB-dependent receptor  30.94 
 
 		 1018 aa  387  1e-106  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000883537  unclonable  0.000000000000117998 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0501  TonB-dependent receptor plug  30.45 
 
 		 1086 aa  387  1e-106  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00157557  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5835  TonB-dependent receptor plug  31 
 
 		 1033 aa  386  1e-105  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.880431  normal  0.557328 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4736  TonB-dependent receptor plug  30.52 
 
 		 1046 aa  384  1e-105  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.399087 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6448  TonB-dependent receptor  31.01 
 
 		 1130 aa  377  1e-103  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2299  TonB-dependent receptor plug  32.1 
 
 		 1056 aa  375  1e-102  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.531432  normal  0.0856053 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1488  TonB-dependent receptor  30.64 
 
 		 1056 aa  371  1e-101  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.376333 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2530  TonB-dependent receptor plug  29.29 
 
 		 1146 aa  372  1e-101  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0300  TonB-dependent receptor plug  29.68 
 
 		 1079 aa  367  1e-100  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.11238 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2474  TonB-dependent receptor plug  28.74 
 
 		 1095 aa  369  1e-100  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.840021  normal  0.838838 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3371  TonB-dependent receptor plug  29.78 
 
 		 1036 aa  365  3e-99  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1773  TonB-dependent receptor plug  30.19 
 
 		 1013 aa  363  6e-99  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.27129 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0566  TonB-dependent receptor plug  30.09 
 
 		 1043 aa  363  7.0000000000000005e-99  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00250412  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2476  TonB-dependent receptor plug  28.74 
 
 		 1095 aa  361  3e-98  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.263017  normal  0.39845 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4814  TonB-dependent receptor  29.34 
 
 		 1025 aa  361  4e-98  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0976743  unclonable  0.000000000000101535 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4101  TonB-dependent receptor plug  28.51 
 
 		 1068 aa  360  5e-98  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2857  TonB-dependent receptor plug  29.67 
 
 		 1148 aa  360  7e-98  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.22615  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3643  TonB-dependent receptor  27.75 
 
 		 1086 aa  357  7.999999999999999e-97  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.15651  normal  0.747331 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0710  TonB-dependent receptor plug  29.73 
 
 		 1176 aa  356  1e-96  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.611235  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6286  TonB-dependent receptor plug  29.72 
 
 		 1168 aa  354  4e-96  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1845  TonB-dependent receptor plug  29.34 
 
 		 1128 aa  347  5e-94  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.430799  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1342  TonB-dependent receptor plug  29.63 
 
 		 1047 aa  343  7e-93  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00542277  normal  0.165874 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1858  TonB-dependent receptor plug  30.16 
 
 		 1026 aa  343  7e-93  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0198  TonB-dependent receptor plug  30.35 
 
 		 1020 aa  341  2.9999999999999998e-92  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0106  TonB-dependent receptor plug  29.63 
 
 		 1161 aa  339  1.9999999999999998e-91  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.813272 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4496  TonB-dependent receptor plug  29.09 
 
 		 1031 aa  338  1.9999999999999998e-91  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.567286 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2710  TonB-dependent receptor plug  30.29 
 
 		 1127 aa  332  1e-89  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.302213  normal  0.762273 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1850  TonB-dependent receptor plug  28.07 
 
 		 1019 aa  320  7e-86  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.5615  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2101  TonB-dependent receptor plug  28.33 
 
 		 1038 aa  319  2e-85  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.693236  normal  0.298537 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0754  TonB-dependent receptor plug  28.11 
 
 		 1038 aa  318  3e-85  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6567  TonB-dependent receptor plug  27.65 
 
 		 1155 aa  315  2.9999999999999996e-84  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2139  TonB-dependent receptor plug  29.74 
 
 		 1131 aa  312  2e-83  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0246116  normal  0.23403 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4287  TonB-dependent receptor  28.06 
 
 		 1065 aa  308  3e-82  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.653235  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0774  TonB-dependent receptor plug  28.73 
 
 		 1181 aa  307  5.0000000000000004e-82  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.252982 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3172  TonB-dependent receptor plug  27.24 
 
 		 1138 aa  305  4.0000000000000003e-81  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.455515  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1565  TonB-dependent receptor plug  29.87 
 
 		 1142 aa  304  6.000000000000001e-81  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2667  TonB-dependent receptor  27.82 
 
 		 1093 aa  300  8e-80  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0190872  normal  0.932221 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5655  TonB-dependent receptor plug  28.56 
 
 		 1164 aa  300  9e-80  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.268168  normal  0.858728 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5549  TonB-dependent receptor plug  27.06 
 
 		 1036 aa  299  2e-79  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.604752  normal  0.603269 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0196  TonB-dependent receptor plug  27.49 
 
 		 1034 aa  296  9e-79  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1274  TonB-dependent receptor plug  27.48 
 
 		 1066 aa  292  2e-77  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0356  TonB-dependent receptor plug  27.75 
 
 		 1128 aa  291  3e-77  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.36308  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2722  TonB-dependent receptor plug  28 
 
 		 1139 aa  287  5.999999999999999e-76  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.784353 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1778  TonB-dependent receptor plug  27.79 
 
 		 1039 aa  287  7e-76  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4504  TonB-dependent receptor plug  26.55 
 
 		 1074 aa  286  1.0000000000000001e-75  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.342548  normal  0.477441 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1555  TonB-dependent receptor plug  28.03 
 
 		 1104 aa  286  2.0000000000000002e-75  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.10988 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4645  TonB-dependent receptor, plug  27.58 
 
 		 1041 aa  285  3.0000000000000004e-75  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.342481  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3251  TonB-dependent receptor  28.6 
 
 		 1128 aa  281  6e-74  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.672464  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1584  TonB-dependent receptor plug  27.37 
 
 		 1177 aa  279  2e-73  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.268471  normal  0.21051 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4975  TonB-dependent receptor plug  26.29 
 
 		 1055 aa  278  4e-73  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.416467  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2231  TonB-dependent receptor  28.26 
 
 		 1037 aa  274  4.0000000000000004e-72  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4760  TonB-dependent receptor plug  26.29 
 
 		 1100 aa  274  5.000000000000001e-72  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0782  TonB-dependent receptor, plug  26.7 
 
 		 1043 aa  272  2e-71  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2103  TonB-dependent receptor plug  26.33 
 
 		 966 aa  272  2e-71  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.994808  normal  0.204772 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0553  TonB-dependent receptor plug  25.9 
 
 		 1036 aa  272  2e-71  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5260  TonB-dependent receptor plug  26.1 
 
 		 1060 aa  271  4e-71  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2454  TonB-dependent receptor plug  28.38 
 
 		 1024 aa  270  8e-71  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.000000521114  normal  0.729289 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1380  TonB-dependent receptor plug  27.21 
 
 		 1192 aa  269  1e-70  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000706938  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4819  TonB-dependent receptor  28 
 
 		 1033 aa  269  2e-70  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0660191  unclonable  0.000000000000144143 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5330  TonB-dependent receptor  25.8 
 
 		 1177 aa  268  2e-70  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000015057  normal  0.0697872 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4849  TonB-dependent receptor plug  25.58 
 
 		 1052 aa  268  2.9999999999999995e-70  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.626865  hitchhiker  0.00508751 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6053  TonB-dependent receptor plug  28.31 
 
 		 1006 aa  267  5.999999999999999e-70  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0679  TonB-dependent receptor plug  26.77 
 
 		 1148 aa  267  7e-70  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0517707  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0517  TonB-dependent receptor plug  25.99 
 
 		 1079 aa  264  6e-69  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00691283 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4434  TonB-dependent receptor, plug  26.4 
 
 		 1023 aa  264  6.999999999999999e-69  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.810934  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0714  TonB-dependent receptor plug  26.97 
 
 		 1124 aa  259  2e-67  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.232472  normal  0.99116 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6660  TonB-dependent receptor plug  26.03 
 
 		 1075 aa  257  6e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.150052  normal  0.983819 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3538  TonB-dependent receptor plug  27.61 
 
 		 1006 aa  257  8e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.740617  normal  0.292963 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1128  TonB-dependent receptor plug  26.46 
 
 		 1004 aa  257  9e-67  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.979284  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5486  TonB-dependent receptor plug  27.29 
 
 		 1147 aa  256  2.0000000000000002e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.370163  normal  0.067232 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2249  TonB-dependent receptor plug  26.15 
 
 		 1190 aa  255  2.0000000000000002e-66  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.520087  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3950  TonB-dependent receptor  28.21 
 
 		 996 aa  253  1e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.265866  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7271  TonB-dependent receptor plug  25.78 
 
 		 1084 aa  253  1e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000107039  normal  0.655848 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4194  TonB-dependent receptor  26.24 
 
 		 1000 aa  252  2e-65  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.173861  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1911  TonB-dependent receptor plug  26.79 
 
 		 1064 aa  252  2e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.420637 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0955  TonB-dependent receptor plug  26.71 
 
 		 1079 aa  253  2e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.14605  normal  0.53847 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5315  TonB-dependent receptor plug  27.24 
 
 		 1039 aa  251  3e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0672223  normal  0.942477 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6529  TonB-dependent receptor plug  25.84 
 
 		 1075 aa  252  3e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2245  TonB-dependent receptor  26.49 
 
 		 1040 aa  251  3e-65  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.184688 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>