214 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_1128 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_1128  RagB/SusD domain protein  100 
 
 		 568 aa  1177    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0330333 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2240  RagB/SusD domain protein  36.43 
 
 		 584 aa  258  3e-67  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0277051  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3874  RagB/SusD domain protein  35.07 
 
 		 568 aa  238  3e-61  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.483678  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2242  RagB/SusD domain protein  31.65 
 
 		 557 aa  228  2e-58  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0577944  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1301  RagB/SusD domain protein  31.85 
 
 		 571 aa  213  5.999999999999999e-54  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.0026313  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4813  RagB/SusD domain protein  31.71 
 
 		 568 aa  213  7e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00404134  unclonable  0.0000000000000282037 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1299  RagB/SusD domain protein  30.55 
 
 		 565 aa  209  1e-52  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1125  RagB/SusD domain protein  33.65 
 
 		 583 aa  207  5e-52  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00256792 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1420  RagB/SusD domain protein  29.57 
 
 		 594 aa  199  1.0000000000000001e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0201854 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4817  RagB/SusD domain protein  32.39 
 
 		 564 aa  198  2.0000000000000003e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0936776  unclonable  0.0000000000000465252 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4636  RagB/SusD domain protein  30.11 
 
 		 593 aa  193  9e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00173325  normal  0.0770072 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3405  RagB/SusD domain protein  29.6 
 
 		 600 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.363725  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1487  RagB/SusD domain protein  32.19 
 
 		 561 aa  182  2e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.424946 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1019  RagB/SusD domain protein  30.58 
 
 		 566 aa  179  1e-43  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3644  RagB/SusD domain protein  27.94 
 
 		 615 aa  173  5.999999999999999e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.158423  normal  0.455687 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4558  RagB/SusD domain protein  32.71 
 
 		 555 aa  169  2e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.001407  normal  0.0159313 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3876  RagB/SusD domain protein  28.11 
 
 		 587 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5520  RagB/SusD domain protein  28.97 
 
 		 599 aa  162  1e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000150302  normal  0.0291709 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2721  RagB/SusD domain protein  29.97 
 
 		 559 aa  156  8e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2140  RagB/SusD domain protein  28.92 
 
 		 529 aa  152  2e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.305226 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6287  RagB/SusD domain protein  28.87 
 
 		 531 aa  150  5e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.360151 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4497  RagB/SusD domain protein  29.32 
 
 		 531 aa  143  9.999999999999999e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.515459 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1021  RagB/SusD domain protein  26.64 
 
 		 582 aa  139  1e-31  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00103937  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2475  RagB/SusD domain protein  26 
 
 		 623 aa  139  2e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.241068  normal  0.472175 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1590  RagB/SusD domain protein  28.12 
 
 		 540 aa  138  3.0000000000000003e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.361992 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2473  RagB/SusD domain protein  26.14 
 
 		 615 aa  136  9e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.113364  normal  0.242072 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2102  RagB/SusD domain protein  28.04 
 
 		 617 aa  135  1.9999999999999998e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.337622  normal  0.239188 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5836  RagB/SusD domain protein  27.85 
 
 		 620 aa  131  3e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.857238 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3372  RagB/SusD domain protein  29.01 
 
 		 549 aa  130  7.000000000000001e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2559  RagB/SusD domain protein  28.45 
 
 		 629 aa  127  7e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.615969  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4737  RagB/SusD domain protein  26.75 
 
 		 625 aa  123  9.999999999999999e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.273253 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0711  RagB/SusD domain protein  25.92 
 
 		 642 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0174034  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0199  RagB/SusD domain protein  27.04 
 
 		 511 aa  120  7.999999999999999e-26  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.820829  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2152  RagB/SusD domain protein  26.65 
 
 		 582 aa  119  9.999999999999999e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000171014  normal  0.505642 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0107  RagB/SusD domain protein  25.88 
 
 		 476 aa  117  5e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.528025 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2104  RagB/SusD domain protein  25.79 
 
 		 581 aa  116  1.0000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.475472 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1774  RagB/SusD domain protein  24.67 
 
 		 548 aa  113  1.0000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.475822  normal  0.891404 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4100  RagB/SusD domain protein  25.81 
 
 		 638 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2640  RagB/SusD domain protein  26.41 
 
 		 584 aa  113  1.0000000000000001e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0117999  normal  0.357997 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1849  RagB/SusD domain protein  26.63 
 
 		 557 aa  112  2.0000000000000002e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1857  RagB/SusD domain protein  24.86 
 
 		 505 aa  111  3e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.363797  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1801  RagB/SusD domain protein  26.16 
 
 		 587 aa  111  3e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6447  RagB/SusD domain protein  28.63 
 
 		 527 aa  110  8.000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5331  RagB/SusD domain protein  26.85 
 
 		 541 aa  103  7e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0214505  normal  0.577233 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0565  RagB/SusD domain protein  25 
 
 		 673 aa  102  2e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.642447  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3634  RagB/SusD domain protein  27.17 
 
 		 508 aa  97.1  9e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.623243  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4696  RagB/SusD domain protein  26.85 
 
 		 639 aa  95.9  2e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000012975  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4094  RagB/SusD domain-containing protein  28.02 
 
 		 666 aa  94.4  5e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00249622  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4974  RagB/SusD domain protein  24.68 
 
 		 636 aa  94  7e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4041  RagB/SusD domain protein  25.63 
 
 		 477 aa  94  7e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.763305  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2522  RagB/SusD domain protein  27.89 
 
 		 522 aa  92  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2709  RagB/SusD domain protein  26.21 
 
 		 489 aa  92.8  2e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.000284151  normal  0.714697 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2413  RagB/SusD domain protein  26.37 
 
 		 480 aa  92  3e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2666  RagB/SusD domain protein  25.44 
 
 		 528 aa  90.5  7e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.453951  normal  0.89358 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4286  RagB/SusD domain protein  23.59 
 
 		 630 aa  90.5  8e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0680  RagB/SusD domain protein  23.08 
 
 		 477 aa  89.7  1e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1583  RagB/SusD domain protein  25.09 
 
 		 479 aa  89.4  1e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00621618  normal  0.437007 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0322  RagB/SusD domain protein  23.41 
 
 		 534 aa  87.8  5e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0946991  normal  0.209656 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0502  RagB/SusD domain protein  36.05 
 
 		 677 aa  87.4  7e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00011099  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4718  RagB/SusD domain protein  25.86 
 
 		 499 aa  86.3  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1910  RagB/SusD domain protein  24.22 
 
 		 594 aa  84.3  0.000000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.289351 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1343  RagB/SusD domain protein  25.78 
 
 		 631 aa  84  0.000000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0193776  normal  0.446946 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4380  RagB/SusD domain protein  22.37 
 
 		 478 aa  83.6  0.000000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.834955  normal  0.352412 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0355  RagB/SusD domain protein  23.13 
 
 		 633 aa  83.2  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0973758  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2298  RagB/SusD domain protein  31.28 
 
 		 629 aa  82.8  0.00000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0544973 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4433  RagB/SusD domain-containing protein  24.2 
 
 		 494 aa  82  0.00000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.51618  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6797  RagB/SusD domain protein  34.71 
 
 		 638 aa  82  0.00000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000012034  hitchhiker  0.000000000461447 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3171  RagB/SusD domain protein  24.53 
 
 		 579 aa  80.5  0.00000000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.670451  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2858  RagB/SusD domain protein  37.16 
 
 		 646 aa  80.1  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00145898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3524  RagB/SusD domain-containing protein  25.71 
 
 		 487 aa  79  0.0000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0301  RagB/SusD domain protein  27.19 
 
 		 626 aa  79.3  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.788503  normal  0.462507 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0440  RagB/SusD domain protein  26.57 
 
 		 561 aa  77.8  0.0000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00952484  normal  0.789519 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2809  RagB/SusD domain protein  25.62 
 
 		 627 aa  77.4  0.0000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0471827  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1041  RagB/SusD domain protein  32.56 
 
 		 501 aa  77.8  0.0000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0635892  normal  0.364021 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2529  RagB/SusD domain protein  25 
 
 		 579 aa  77.4  0.0000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.500869  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2721  RagB/SusD domain protein  24.41 
 
 		 550 aa  76.6  0.000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0628838  normal  0.846389 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0956  RagB/SusD domain protein  32 
 
 		 498 aa  76.3  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.587305  normal  0.507784 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1275  RagB/SusD domain protein  25.53 
 
 		 460 aa  75.5  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.583707 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1564  RagB/SusD domain protein  27.06 
 
 		 484 aa  75.1  0.000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.914485 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5673  RagB/SusD domain protein  24.85 
 
 		 555 aa  74.7  0.000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0033424  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1556  RagB/SusD domain protein  23.31 
 
 		 589 aa  74.3  0.000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.31558 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3634  RagB/SusD domain protein  22.39 
 
 		 510 aa  73.9  0.000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.358652  normal  0.222637 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2846  RagB/SusD domain protein  25 
 
 		 487 aa  73.9  0.000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000771194  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1439  RagB/SusD domain protein  24.21 
 
 		 527 aa  73.6  0.000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.271044 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1129  RagB/SusD domain protein  25 
 
 		 493 aa  73.6  0.000000000009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.259882  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6659  RagB/SusD domain protein  26.08 
 
 		 576 aa  72.8  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.913597  normal  0.982088 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0931  RagB/SusD domain protein  23.71 
 
 		 494 aa  71.6  0.00000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00244516  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2301  RagB/SusD domain protein  30.05 
 
 		 565 aa  71.2  0.00000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6054  RagB/SusD domain protein  28.37 
 
 		 499 aa  70.5  0.00000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4950  RagB/SusD domain protein  22.75 
 
 		 592 aa  70.1  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0441936  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1602  RagB/SusD domain protein  22.52 
 
 		 570 aa  68.6  0.0000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.71543 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4455  RagB/SusD domain protein  29.08 
 
 		 506 aa  68.6  0.0000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000000846539  normal  0.670617 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4783  RagB/SusD domain protein  33.14 
 
 		 548 aa  68.9  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1122  RagB/SusD domain protein  24.03 
 
 		 511 aa  67  0.0000000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1260  RagB/SusD domain protein  32 
 
 		 685 aa  67  0.0000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.296024  normal  0.398588 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0781  RagB/SusD domain-containing protein  30.09 
 
 		 531 aa  66.6  0.000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2432  RagB/SusD domain-containing protein  24.46 
 
 		 499 aa  66.6  0.000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.199141  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0810  RagB/SusD domain protein  26.05 
 
 		 499 aa  66.2  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00428067  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3703  RagB/SusD domain protein  23.05 
 
 		 522 aa  66.6  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.380041  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4503  RagB/SusD domain protein  22.51 
 
 		 607 aa  65.9  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.468205  normal  0.602053 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>