181 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG0534 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PG0534  hypothetical protein  100 
 
 		 827 aa  1709    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.993491 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06685  hypothetical protein  34.83 
 
 		 821 aa  477  1e-133  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.048704  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0118  TonB-dependent receptor, plug  33.69 
 
 		 821 aa  469  9.999999999999999e-131  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1606  hypothetical protein  32.69 
 
 		 802 aa  422  1e-117  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00919182  normal  0.909176 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1856  TonB-dependent receptor  33.01 
 
 		 792 aa  394  1e-108  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.693128  normal  0.812872 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2272  TonB-dependent receptor  32.58 
 
 		 814 aa  329  1.0000000000000001e-88  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5340  TonB-dependent receptor plug  28.79 
 
 		 814 aa  93.2  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.640858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3569  TonB-dependent receptor  32.26 
 
 		 787 aa  91.3  6e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.557391  normal  0.493539 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6201  TonB-dependent receptor plug  33.92 
 
 		 792 aa  89  3e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.180882  normal  0.205128 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4749  TonB-dependent receptor plug  30.08 
 
 		 806 aa  85.1  0.000000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.782569  normal  0.236895 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3591  TonB-dependent receptor plug  25.32 
 
 		 730 aa  84.7  0.000000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.765405  normal  0.0684866 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0978  TonB-dependent receptor plug  28.96 
 
 		 753 aa  82.4  0.00000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.103139  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6408  TonB-dependent receptor  29.67 
 
 		 772 aa  80.9  0.00000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5669  TonB-dependent receptor plug  27.89 
 
 		 789 aa  80.9  0.00000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2914  TonB-dependent receptor plug  30.97 
 
 		 800 aa  80.1  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0667343  normal  0.659608 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4916  TonB-dependent receptor, plug  26.81 
 
 		 719 aa  78.2  0.0000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.526454  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0150  TonB-dependent receptor, plug  24.31 
 
 		 872 aa  76.3  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.755251  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2553  TonB-dependent receptor plug  30.08 
 
 		 775 aa  75.5  0.000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.826043  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1590  TonB-dependent receptor  28.39 
 
 		 790 aa  73.9  0.00000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09768  putative outer membrane protein  27.98 
 
 		 780 aa  73.2  0.00000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.990428  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0274  TonB-dependent receptor  28.85 
 
 		 791 aa  72  0.00000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4371  TonB-dependent receptor plug  27.54 
 
 		 874 aa  71.6  0.00000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000169571  normal  0.0339201 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1161  TonB-dependent receptor  26.84 
 
 		 935 aa  70.9  0.0000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.880371  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2180  TonB-dependent receptor  24.19 
 
 		 793 aa  68.9  0.0000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.111173  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1234  TonB-dependent receptor plug  24.39 
 
 		 716 aa  68.2  0.0000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1924  TonB-dependent receptor, plug  27.41 
 
 		 1035 aa  67.4  0.000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5213  TonB-dependent receptor plug  26.57 
 
 		 831 aa  66.2  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1720  TonB-dependent receptor plug  30.26 
 
 		 760 aa  66.6  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.864818  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2062  TonB-dependent receptor  25.4 
 
 		 791 aa  64.7  0.000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7227  TonB-dependent receptor plug  25.28 
 
 		 875 aa  64.7  0.000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4830  TonB-dependent receptor plug  27.73 
 
 		 771 aa  64.3  0.000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2829  TonB-dependent receptor plug  27.11 
 
 		 803 aa  63.2  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4810  TonB-dependent receptor plug  27.74 
 
 		 1073 aa  62.8  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0674411  normal  0.790047 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0150  hypothetical protein  25.78 
 
 		 822 aa  62.8  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000486167 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0030  TonB-dependent receptor plug  29.22 
 
 		 786 aa  62.4  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1758  TonB-dependent receptor  25.55 
 
 		 1089 aa  62  0.00000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.208023  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2819  TonB-dependent receptor  28.77 
 
 		 897 aa  61.2  0.00000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3438  TonB-dependent receptor plug  24.9 
 
 		 772 aa  61.2  0.00000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1641  hypothetical protein  36.11 
 
 		 853 aa  60.5  0.0000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.819235  normal  0.0314988 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1980  TonB family protein  21.44 
 
 		 859 aa  60.5  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.163466  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1227  TonB-dependent receptor plug  25.33 
 
 		 923 aa  59.7  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.333141 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08731  putative TonB-dependent outer membrane receptor protein  27.03 
 
 		 917 aa  59.7  0.0000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.954861  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3789  TonB-dependent receptor plug  28.1 
 
 		 1169 aa  59.7  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.474486  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2320  TonB-dependent receptor  26.8 
 
 		 947 aa  60.1  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.500689  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1307  TonB-dependent receptor plug  26.45 
 
 		 779 aa  58.9  0.0000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3633  TonB-dependent receptor  26.27 
 
 		 1010 aa  59.3  0.0000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3693  TonB-dependent receptor plug  28.71 
 
 		 881 aa  59.3  0.0000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.000588542  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1139  TonB-dependent receptor plug  25.7 
 
 		 1064 aa  58.9  0.0000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.278361  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0617  outer membrane protein  23.46 
 
 		 800 aa  58.2  0.0000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.223458  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1314  TonB-dependent receptor  25.58 
 
 		 735 aa  57.4  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1387  TonB-dependent receptor plug  26.69 
 
 		 1008 aa  57.4  0.000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.840954  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4401  TonB-dependent receptor  25.11 
 
 		 923 aa  57  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1074  TonB-dependent receptor plug  34.86 
 
 		 1114 aa  57.4  0.000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1460  TonB-dependent receptor plug  30.37 
 
 		 1065 aa  57.4  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1750  TonB-dependent receptor  24.9 
 
 		 1087 aa  56.6  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3629  hypothetical protein  27.03 
 
 		 816 aa  55.8  0.000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0659  hypothetical protein  26.89 
 
 		 888 aa  55.5  0.000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2367  hypothetical protein  25.32 
 
 		 767 aa  55.5  0.000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5733  TonB-dependent receptor plug  28.27 
 
 		 804 aa  55.5  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0884503 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1473  TonB-dependent receptor plug  30.84 
 
 		 1021 aa  55.5  0.000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0507296  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2376  TonB-dependent receptor plug  24.34 
 
 		 797 aa  55.5  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.7024  normal  0.460904 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1121  TonB-dependent receptor plug  27.52 
 
 		 1003 aa  54.7  0.000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2398  TonB-dependent receptor  27.27 
 
 		 966 aa  54.7  0.000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1438  TonB-dependent receptor, plug  22.22 
 
 		 928 aa  54.7  0.000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4946  TonB-dependent receptor plug  30.62 
 
 		 1077 aa  54.7  0.000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1683  TonB-dependent receptor plug  26.87 
 
 		 1045 aa  54.3  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.125257 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1905  TonB-dependent receptor plug  29.61 
 
 		 1070 aa  53.5  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0328  TonB-dependent receptor plug  22.78 
 
 		 1127 aa  53.5  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5310  hypothetical protein  24.18 
 
 		 791 aa  53.1  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.26896  normal  0.238591 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1126  TonB-dependent receptor plug  26.2 
 
 		 1056 aa  53.1  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00950151 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2403  hypothetical protein  32.67 
 
 		 848 aa  53.1  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.931107  normal  0.265597 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0403  TonB-dependent receptor, plug  27.24 
 
 		 1083 aa  52.8  0.00003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1006  TonB-dependent receptor plug  27.03 
 
 		 1038 aa  52.8  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0320899  normal  0.449755 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6273  TonB-dependent receptor  23.45 
 
 		 736 aa  52.4  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000590633  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0080  TonB-dependent receptor plug  24.31 
 
 		 1040 aa  52.8  0.00003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0236  TonB-dependent receptor  25.9 
 
 		 958 aa  52.4  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2082  TonB-dependent receptor plug  35.51 
 
 		 1173 aa  52.8  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.843003  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2711  TonB-dependent receptor, plug  33.33 
 
 		 1032 aa  52  0.00004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4559  TonB-dependent receptor, plug  22.44 
 
 		 1010 aa  52  0.00004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01505  putative TonB-dependent transmembrane receptor protein  29.36 
 
 		 803 aa  52  0.00004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3946  TonB-dependent receptor plug  27.13 
 
 		 1043 aa  52  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4550  TonB-dependent receptor plug  32.71 
 
 		 1192 aa  51.6  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.816272 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0784  TonB-dependent receptor plug  29.49 
 
 		 1013 aa  51.6  0.00006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3871  TonB-dependent receptor, plug  28.21 
 
 		 1002 aa  51.2  0.00007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.929379  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3978  TonB-dependent receptor plug  31.86 
 
 		 1059 aa  51.2  0.00007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00000935862  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3588  TonB-dependent receptor plug  30.22 
 
 		 986 aa  51.6  0.00007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00353353  hitchhiker  0.00053116 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2695  hypothetical protein  29.41 
 
 		 854 aa  51.2  0.00007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.579466 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7253  TonB-dependent receptor plug  27.94 
 
 		 996 aa  51.2  0.00007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0939847  normal  0.604549 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0616  TonB-dependent receptor plug  28.15 
 
 		 1063 aa  50.8  0.00009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3901  TonB-dependent receptor  26.24 
 
 		 734 aa  50.8  0.00009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.707047  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5092  TonB-dependent receptor plug  24.89 
 
 		 988 aa  50.8  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.303703  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0652  TonB-dependent receptor plug  23.84 
 
 		 897 aa  50.4  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0300  TonB-dependent receptor plug  31.71 
 
 		 1079 aa  50.4  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.11238 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0120  TonB-dependent receptor  24.66 
 
 		 833 aa  50.4  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1070  TonB-dependent receptor  26.53 
 
 		 991 aa  50.8  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13268  hypothetical protein  28.44 
 
 		 828 aa  49.7  0.0002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.923691  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2466  TonB-dependent receptor  21.59 
 
 		 887 aa  50.1  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2137  TonB-dependent receptor  31.13 
 
 		 1050 aa  49.7  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.341252 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2292  TonB-dependent receptor plug  27.19 
 
 		 1023 aa  49.7  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4389  TonB-dependent receptor plug  24 
 
 		 775 aa  50.1  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0212821 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>