More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_1858 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_2710  TonB-dependent receptor plug  45.42 
 
 		 1127 aa  845    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.302213  normal  0.762273 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0198  TonB-dependent receptor plug  52.53 
 
 		 1020 aa  1080    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1565  TonB-dependent receptor plug  41.42 
 
 		 1142 aa  736    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1858  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 		 1026 aa  2089    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4496  TonB-dependent receptor plug  37.08 
 
 		 1031 aa  575  1.0000000000000001e-162  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.567286 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4042  TonB-dependent receptor  37.72 
 
 		 1026 aa  570  1e-161  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2139  TonB-dependent receptor plug  36.35 
 
 		 1131 aa  564  1.0000000000000001e-159  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0246116  normal  0.23403 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1773  TonB-dependent receptor plug  34.6 
 
 		 1013 aa  543  1e-153  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.27129 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3172  TonB-dependent receptor plug  36.31 
 
 		 1138 aa  541  9.999999999999999e-153  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.455515  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6286  TonB-dependent receptor plug  35.19 
 
 		 1168 aa  537  1e-151  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6448  TonB-dependent receptor  36.87 
 
 		 1130 aa  534  1e-150  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2530  TonB-dependent receptor plug  35.01 
 
 		 1146 aa  531  1e-149  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4559  TonB-dependent receptor  34.12 
 
 		 1033 aa  521  1e-146  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00904545 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3371  TonB-dependent receptor plug  34.96 
 
 		 1036 aa  518  1.0000000000000001e-145  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1850  TonB-dependent receptor plug  34.51 
 
 		 1019 aa  517  1.0000000000000001e-145  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.5615  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0300  TonB-dependent receptor plug  34.07 
 
 		 1079 aa  512  1e-143  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.11238 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1589  TonB-dependent receptor plug  34.32 
 
 		 1164 aa  512  1e-143  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.318649 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2991  TonB-dependent receptor plug  33.77 
 
 		 1082 aa  513  1e-143  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.40723  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2722  TonB-dependent receptor plug  35.68 
 
 		 1139 aa  511  1e-143  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.784353 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1012  TonB-dependent receptor  35.08 
 
 		 994 aa  508  9.999999999999999e-143  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.467602 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5655  TonB-dependent receptor plug  34.94 
 
 		 1164 aa  507  9.999999999999999e-143  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.268168  normal  0.858728 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2231  TonB-dependent receptor  34.19 
 
 		 1037 aa  504  1e-141  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0932  TonB-dependent receptor plug  35.08 
 
 		 1012 aa  501  1e-140  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.112276  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0196  TonB-dependent receptor plug  34.16 
 
 		 1034 aa  501  1e-140  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5260  TonB-dependent receptor plug  34.37 
 
 		 1060 aa  500  1e-140  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6567  TonB-dependent receptor plug  33.08 
 
 		 1155 aa  499  1e-139  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4532  TonB-dependent receptor plug  34.55 
 
 		 1053 aa  493  9.999999999999999e-139  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.171577  normal  0.0460383 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0553  TonB-dependent receptor plug  34.38 
 
 		 1036 aa  490  1e-137  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1488  TonB-dependent receptor  33.24 
 
 		 1056 aa  488  1e-136  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.376333 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0106  TonB-dependent receptor plug  33.75 
 
 		 1161 aa  489  1e-136  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.813272 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1911  TonB-dependent receptor plug  34.28 
 
 		 1064 aa  488  1e-136  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.420637 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4736  TonB-dependent receptor plug  33.74 
 
 		 1046 aa  487  1e-136  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.399087 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2474  TonB-dependent receptor plug  33.68 
 
 		 1095 aa  482  1e-134  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.840021  normal  0.838838 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5330  TonB-dependent receptor  33.05 
 
 		 1177 aa  481  1e-134  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000015057  normal  0.0697872 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1421  TonB-dependent receptor  32.76 
 
 		 1144 aa  478  1e-133  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0101171 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2137  TonB-dependent receptor  32.85 
 
 		 1050 aa  479  1e-133  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.341252 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5599  TonB-dependent receptor  33.72 
 
 		 982 aa  474  1e-132  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.89451 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3538  TonB-dependent receptor plug  32.65 
 
 		 1006 aa  473  1e-132  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.740617  normal  0.292963 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1274  TonB-dependent receptor plug  32.13 
 
 		 1066 aa  473  1e-132  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0754  TonB-dependent receptor plug  31.72 
 
 		 1038 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2412  TonB-dependent receptor  33.15 
 
 		 1029 aa  472  1.0000000000000001e-131  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.525644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2602  TonB-dependent receptor plug  33.62 
 
 		 1008 aa  471  1.0000000000000001e-131  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2454  TonB-dependent receptor plug  35.72 
 
 		 1024 aa  469  9.999999999999999e-131  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.000000521114  normal  0.729289 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3704  TonB-dependent receptor plug  33.78 
 
 		 1128 aa  468  9.999999999999999e-131  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2116  TonB-dependent receptor plug  31.93 
 
 		 1114 aa  465  1e-129  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.398452  normal  0.942953 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3950  TonB-dependent receptor  34.64 
 
 		 996 aa  466  1e-129  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.265866  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2402  TonB-dependent receptor plug  32.63 
 
 		 1217 aa  463  1e-129  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1778  TonB-dependent receptor plug  33.52 
 
 		 1039 aa  462  9.999999999999999e-129  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5549  TonB-dependent receptor plug  33.59 
 
 		 1036 aa  462  9.999999999999999e-129  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.604752  normal  0.603269 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1042  TonB-dependent receptor plug  32.55 
 
 		 1058 aa  457  1e-127  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.951864  normal  0.539314 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1584  TonB-dependent receptor plug  31.58 
 
 		 1177 aa  458  1e-127  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.268471  normal  0.21051 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1723  TonB-dependent receptor plug  32.14 
 
 		 1071 aa  456  1e-127  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000845953  normal  0.63993 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6053  TonB-dependent receptor plug  32.26 
 
 		 1006 aa  457  1e-127  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4979  TonB-dependent receptor plug  33.33 
 
 		 1188 aa  453  1.0000000000000001e-126  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000632908 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4269  TonB-dependent receptor  31.33 
 
 		 1038 aa  455  1.0000000000000001e-126  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.927077  normal  0.139586 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3251  TonB-dependent receptor  33.11 
 
 		 1128 aa  451  1e-125  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.672464  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2476  TonB-dependent receptor plug  33.33 
 
 		 1095 aa  452  1e-125  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.263017  normal  0.39845 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4760  TonB-dependent receptor plug  33.55 
 
 		 1100 aa  451  1e-125  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4006  TonB-dependent receptor  33.11 
 
 		 1020 aa  449  1.0000000000000001e-124  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.629585  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0774  TonB-dependent receptor plug  32.67 
 
 		 1181 aa  446  1.0000000000000001e-124  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.252982 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0725  TonB-dependent receptor plug  33.3 
 
 		 1129 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3282  TonB-dependent receptor plug  32.4 
 
 		 1085 aa  447  1.0000000000000001e-124  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.260131  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4949  TonB-dependent receptor plug  31.68 
 
 		 1062 aa  449  1.0000000000000001e-124  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.188744  normal  0.822466 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0955  TonB-dependent receptor plug  31.53 
 
 		 1079 aa  444  1e-123  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.14605  normal  0.53847 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3643  TonB-dependent receptor  31.1 
 
 		 1086 aa  443  1e-123  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.15651  normal  0.747331 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4819  TonB-dependent receptor  32.63 
 
 		 1033 aa  441  9.999999999999999e-123  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0660191  unclonable  0.000000000000144143 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7271  TonB-dependent receptor plug  31.58 
 
 		 1084 aa  441  9.999999999999999e-123  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000107039  normal  0.655848 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2845  TonB-dependent receptor  31.08 
 
 		 1025 aa  442  9.999999999999999e-123  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.346257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4206  TonB-dependent receptor plug  32.57 
 
 		 1023 aa  441  9.999999999999999e-123  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.43352  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4645  TonB-dependent receptor, plug  33.43 
 
 		 1041 aa  442  9.999999999999999e-123  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.342481  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0868  TonB-dependent receptor plug  31.06 
 
 		 1117 aa  441  9.999999999999999e-123  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.503541  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1380  TonB-dependent receptor plug  32.02 
 
 		 1192 aa  442  9.999999999999999e-123  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000706938  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3981  TonB-dependent receptor plug  32.37 
 
 		 1006 aa  437  1e-121  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.50745  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4434  TonB-dependent receptor, plug  32.37 
 
 		 1023 aa  437  1e-121  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.810934  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0517  TonB-dependent receptor plug  32.17 
 
 		 1079 aa  437  1e-121  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00691283 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0679  TonB-dependent receptor plug  32.01 
 
 		 1148 aa  438  1e-121  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0517707  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3877  TonB-dependent receptor plug  30.93 
 
 		 1036 aa  436  1e-121  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6740  TonB-dependent receptor plug  32.26 
 
 		 1116 aa  437  1e-121  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0443  TonB-dependent receptor plug  32.6 
 
 		 989 aa  439  1e-121  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2722  TonB-dependent receptor  31.96 
 
 		 1045 aa  439  1e-121  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2020  TonB-dependent receptor, plug  32.46 
 
 		 1005 aa  434  1e-120  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0714  TonB-dependent receptor plug  32.74 
 
 		 1124 aa  434  1e-120  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.232472  normal  0.99116 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5672  TonB-dependent receptor plug  32.43 
 
 		 1017 aa  436  1e-120  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00146027  normal  0.794297 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0782  TonB-dependent receptor, plug  32.42 
 
 		 1043 aa  430  1e-119  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2729  TonB-dependent receptor plug  32.7 
 
 		 999 aa  432  1e-119  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0287081 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4194  TonB-dependent receptor  31.28 
 
 		 1000 aa  428  1e-118  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.173861  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2600  TonB-dependent receptor plug  30.83 
 
 		 1051 aa  427  1e-118  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.267837 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1500  TonB-dependent receptor plug  32.68 
 
 		 1163 aa  429  1e-118  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00486924  normal  0.0635458 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1460  TonB-dependent receptor  32.39 
 
 		 1189 aa  429  1e-118  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.198313 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2292  TonB-dependent receptor plug  31.18 
 
 		 1023 aa  428  1e-118  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4708  TonB-dependent receptor plug  33.27 
 
 		 1097 aa  427  1e-118  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6529  TonB-dependent receptor plug  31.62 
 
 		 1075 aa  424  1e-117  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1560  TonB-dependent receptor  30.57 
 
 		 1049 aa  425  1e-117  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3863  TonB-dependent receptor  31.21 
 
 		 1034 aa  423  1e-117  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.711761  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1077  TonB-dependent receptor plug  32.66 
 
 		 1147 aa  424  1e-117  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.139666  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4210  TonB-dependent receptor plug  32.15 
 
 		 1027 aa  426  1e-117  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2207  TonB-dependent receptor plug  31.32 
 
 		 1161 aa  426  1e-117  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.582294 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4637  TonB-dependent receptor  30.92 
 
 		 1061 aa  425  1e-117  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0127859  normal  0.0510805 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2082  TonB-dependent receptor plug  31.37 
 
 		 1173 aa  420  1e-116  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.843003  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1657  TonB-dependent receptor plug  31.47 
 
 		 1122 aa  420  1e-116  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.653698 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>