297 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_1849 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_1849  RagB/SusD domain protein  100 
 
 		 557 aa  1140    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4497  RagB/SusD domain protein  35.28 
 
 		 531 aa  277  4e-73  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.515459 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6287  RagB/SusD domain protein  35.69 
 
 		 531 aa  264  4e-69  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.360151 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6447  RagB/SusD domain protein  36.56 
 
 		 527 aa  251  3e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3372  RagB/SusD domain protein  31.96 
 
 		 549 aa  222  1.9999999999999999e-56  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2529  RagB/SusD domain protein  31.63 
 
 		 579 aa  218  2e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.500869  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1590  RagB/SusD domain protein  30.94 
 
 		 540 aa  218  2.9999999999999998e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.361992 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1774  RagB/SusD domain protein  32.53 
 
 		 548 aa  202  1.9999999999999998e-50  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.475822  normal  0.891404 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2140  RagB/SusD domain protein  29.68 
 
 		 529 aa  185  2.0000000000000003e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.305226 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1857  RagB/SusD domain protein  32.71 
 
 		 505 aa  179  1e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.363797  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2721  RagB/SusD domain protein  31.25 
 
 		 550 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0628838  normal  0.846389 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2453  RagB/SusD domain protein  29.68 
 
 		 540 aa  169  2e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00111761  normal  0.539083 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3171  RagB/SusD domain protein  27.14 
 
 		 579 aa  160  6e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.670451  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0199  RagB/SusD domain protein  29.03 
 
 		 511 aa  154  2.9999999999999998e-36  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.820829  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1684  RagB/SusD domain protein  28.31 
 
 		 611 aa  154  5e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.390743  normal  0.0953586 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4041  RagB/SusD domain protein  26.85 
 
 		 477 aa  152  1e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.763305  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6659  RagB/SusD domain protein  28.46 
 
 		 576 aa  146  1e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.913597  normal  0.982088 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2709  RagB/SusD domain protein  28.96 
 
 		 489 aa  145  2e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.000284151  normal  0.714697 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1420  RagB/SusD domain protein  25.97 
 
 		 594 aa  144  4e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0201854 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2721  RagB/SusD domain protein  30.37 
 
 		 559 aa  143  9e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3874  RagB/SusD domain protein  29.37 
 
 		 568 aa  143  9.999999999999999e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.483678  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4636  RagB/SusD domain protein  27.1 
 
 		 593 aa  142  1.9999999999999998e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00173325  normal  0.0770072 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2666  RagB/SusD domain protein  28.22 
 
 		 528 aa  141  3e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.453951  normal  0.89358 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1487  RagB/SusD domain protein  30.15 
 
 		 561 aa  141  3e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.424946 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4455  RagB/SusD domain protein  28.01 
 
 		 506 aa  141  3e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000000846539  normal  0.670617 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3644  RagB/SusD domain protein  26.09 
 
 		 615 aa  140  7.999999999999999e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.158423  normal  0.455687 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5331  RagB/SusD domain protein  28.82 
 
 		 541 aa  140  8.999999999999999e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0214505  normal  0.577233 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1564  RagB/SusD domain protein  26.24 
 
 		 484 aa  139  1e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.914485 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4817  RagB/SusD domain protein  27.83 
 
 		 564 aa  138  2e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0936776  unclonable  0.0000000000000465252 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1299  RagB/SusD domain protein  27 
 
 		 565 aa  138  3.0000000000000003e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0107  RagB/SusD domain protein  26.88 
 
 		 476 aa  137  7.000000000000001e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.528025 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1301  RagB/SusD domain protein  27.59 
 
 		 571 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.0026313  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1801  RagB/SusD domain protein  25.9 
 
 		 587 aa  132  2.0000000000000002e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6568  RagB/SusD domain protein  26.61 
 
 		 502 aa  131  4.0000000000000003e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.101345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2473  RagB/SusD domain protein  26.6 
 
 		 615 aa  130  4.0000000000000003e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.113364  normal  0.242072 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2403  RagB/SusD domain protein  25.4 
 
 		 576 aa  130  6e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1019  RagB/SusD domain protein  28.05 
 
 		 566 aa  129  1.0000000000000001e-28  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6054  RagB/SusD domain protein  29.88 
 
 		 499 aa  129  1.0000000000000001e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2152  RagB/SusD domain protein  28.4 
 
 		 582 aa  129  1.0000000000000001e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000171014  normal  0.505642 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5520  RagB/SusD domain protein  24.69 
 
 		 599 aa  129  1.0000000000000001e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000150302  normal  0.0291709 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2242  RagB/SusD domain protein  25 
 
 		 557 aa  128  3e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0577944  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0554  RagB/SusD domain protein  26.67 
 
 		 582 aa  127  6e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.674726  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4813  RagB/SusD domain protein  26.82 
 
 		 568 aa  125  1e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00404134  unclonable  0.0000000000000282037 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5654  RagB/SusD domain protein  28.46 
 
 		 511 aa  126  1e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.576188  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4558  RagB/SusD domain protein  28.04 
 
 		 555 aa  125  2e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.001407  normal  0.0159313 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2240  RagB/SusD domain protein  27.11 
 
 		 584 aa  124  3e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0277051  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4978  RagB/SusD domain protein  24.76 
 
 		 576 aa  124  3e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000462292 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1122  RagB/SusD domain protein  30.24 
 
 		 511 aa  124  6e-27  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3634  RagB/SusD domain protein  28.7 
 
 		 508 aa  124  7e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.623243  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4646  RagB/SusD domain-containing protein  27.62 
 
 		 490 aa  123  9e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.600007  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1583  RagB/SusD domain protein  27.94 
 
 		 479 aa  122  9.999999999999999e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00621618  normal  0.437007 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2475  RagB/SusD domain protein  25.27 
 
 		 623 aa  122  1.9999999999999998e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.241068  normal  0.472175 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2208  RagB/SusD domain protein  25.59 
 
 		 531 aa  121  3e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.721066  normal  0.400828 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2248  RagB/SusD domain protein  25.97 
 
 		 596 aa  120  4.9999999999999996e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4848  RagB/SusD domain protein  28.63 
 
 		 523 aa  120  4.9999999999999996e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.101496  hitchhiker  0.00561902 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2232  RagB/SusD domain protein  26.42 
 
 		 486 aa  120  9e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5836  RagB/SusD domain protein  25.77 
 
 		 620 aa  119  9.999999999999999e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.857238 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5550  RagB/SusD domain protein  27.54 
 
 		 520 aa  117  6.9999999999999995e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.255381  normal  0.337883 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0518  RagB/SusD domain protein  24.16 
 
 		 483 aa  117  7.999999999999999e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00138157 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1125  RagB/SusD domain protein  27.76 
 
 		 583 aa  115  3e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00256792 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2282  RagB/SusD domain protein  24.83 
 
 		 540 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00108991 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1128  RagB/SusD domain protein  26.63 
 
 		 568 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0330333 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2432  RagB/SusD domain-containing protein  27.46 
 
 		 499 aa  111  3e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.199141  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1041  RagB/SusD domain protein  27.81 
 
 		 501 aa  110  8.000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0635892  normal  0.364021 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0869  RagB/SusD domain protein  24.35 
 
 		 503 aa  110  1e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0508495  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1724  RagB/SusD domain protein  25.47 
 
 		 491 aa  109  1e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.120109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0301  RagB/SusD domain protein  25.3 
 
 		 626 aa  109  2e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.788503  normal  0.462507 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1556  RagB/SusD domain protein  26.98 
 
 		 589 aa  108  3e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.31558 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3703  RagB/SusD domain protein  25.26 
 
 		 522 aa  107  4e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.380041  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3124  RagB/SusD domain protein  23.9 
 
 		 488 aa  107  6e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.115801  normal  0.453004 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4761  RagB/SusD domain protein  27.03 
 
 		 590 aa  106  1e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3405  RagB/SusD domain protein  26.8 
 
 		 600 aa  106  1e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.363725  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3524  RagB/SusD domain-containing protein  26.31 
 
 		 487 aa  105  2e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4233  RagB/SusD domain-containing protein  26.5 
 
 		 511 aa  105  2e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0680  RagB/SusD domain protein  25.67 
 
 		 477 aa  105  2e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4380  RagB/SusD domain protein  24.66 
 
 		 478 aa  102  2e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.834955  normal  0.352412 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1495  RagB/SusD domain protein  28.78 
 
 		 506 aa  102  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.253352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3391  RagB/SusD domain protein  26.44 
 
 		 507 aa  102  2e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.540028  normal  0.274912 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6530  RagB/SusD domain protein  26.6 
 
 		 521 aa  101  3e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0773  RagB/SusD domain protein  29.6 
 
 		 483 aa  102  3e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.961252  normal  0.23471 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1779  RagB/SusD domain protein  26.12 
 
 		 485 aa  101  3e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0688  RagB/SusD domain protein  28.4 
 
 		 500 aa  102  3e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0549039  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4094  RagB/SusD domain-containing protein  27.27 
 
 		 666 aa  101  4e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00249622  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4005  RagB/SusD domain protein  24.95 
 
 		 495 aa  101  5e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0243804  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4433  RagB/SusD domain-containing protein  25.98 
 
 		 494 aa  100  6e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.51618  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4318  RagB/SusD domain protein  24.35 
 
 		 481 aa  100  6e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0553974 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4268  RagB/SusD domain protein  25.5 
 
 		 503 aa  100  7e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.246385  normal  0.146292 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0810  RagB/SusD domain protein  25.14 
 
 		 499 aa  98.6  3e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00428067  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1343  RagB/SusD domain protein  25.13 
 
 		 631 aa  98.2  4e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0193776  normal  0.446946 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0276  RagB/SusD domain protein  27.25 
 
 		 582 aa  97.8  5e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.125375  normal  0.63958 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2846  RagB/SusD domain protein  26.04 
 
 		 487 aa  97.4  6e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000771194  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0755  RagB/SusD domain protein  25.26 
 
 		 494 aa  96.3  1e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.906028  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2115  RagB/SusD domain protein  26 
 
 		 508 aa  96.3  1e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.103234  normal  0.67321 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2989  RagB/SusD domain protein  24.26 
 
 		 588 aa  96.7  1e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.157394  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0273  RagB/SusD domain protein  27.35 
 
 		 582 aa  95.9  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.13078 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3870  RagB/SusD domain-containing protein  26.18 
 
 		 498 aa  95.1  3e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.248974  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1439  RagB/SusD domain protein  27.35 
 
 		 527 aa  94  7e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.271044 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3496  RagB/SusD domain protein  25.38 
 
 		 519 aa  93.6  8e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000423782  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0005  RagB/SusD domain protein  23.95 
 
 		 504 aa  92.8  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2828  RagB/SusD domain protein  23.85 
 
 		 549 aa  92.8  1e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.251846  normal  0.0738006 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>