More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_3196 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_3989  TonB-dependent receptor plug  40 
 
 		 1109 aa  757    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0043  TonB-dependent receptor plug  49.45 
 
 		 1089 aa  1103    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3035  TonB-dependent receptor, plug  39.21 
 
 		 1007 aa  658    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.460012  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3556  TonB-dependent receptor, plug  39.26 
 
 		 1011 aa  664    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.70913  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5113  TonB-dependent receptor plug  40.49 
 
 		 1102 aa  753    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.298267  normal  0.131345 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5562  TonB-dependent receptor plug  38.45 
 
 		 1080 aa  709    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0203827 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1800  TonB-dependent receptor plug  38.57 
 
 		 1127 aa  698    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000499096 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0136  TonB-dependent receptor plug  43.01 
 
 		 1108 aa  873    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2854  TonB-dependent receptor plug  36.74 
 
 		 1138 aa  674    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.958759  normal  0.16457 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6427  TonB-dependent receptor plug  36.69 
 
 		 1101 aa  667    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4011  TonB-dependent receptor plug  37.66 
 
 		 1119 aa  681    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4548  TonB-dependent receptor plug  36.35 
 
 		 1109 aa  671    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.106269 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0057  TonB-dependent receptor plug  44.95 
 
 		 1014 aa  816    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3196  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 		 1099 aa  2243    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.377332 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1983  TonB-dependent receptor plug  37.67 
 
 		 1101 aa  702    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.445269  hitchhiker  0.00000345601 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4609  TonB-dependent receptor plug  38.14 
 
 		 1089 aa  703    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0115858  normal  0.547396 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3214  TonB-dependent receptor plug  38.12 
 
 		 1111 aa  729    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3164  TonB-dependent receptor plug  37.38 
 
 		 1093 aa  707    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4373  TonB-dependent receptor, plug  39.53 
 
 		 1009 aa  630  1e-179  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0229973  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1659  TonB-dependent receptor plug  36.56 
 
 		 1113 aa  630  1e-179  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.286371 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4660  TonB-dependent receptor plug  39.77 
 
 		 894 aa  608  9.999999999999999e-173  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0120659  unclonable  0.0000000000000956087 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3808  TonB-dependent receptor plug  33.82 
 
 		 1127 aa  574  1.0000000000000001e-162  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0159841  normal  0.577345 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1744  TonB-dependent receptor plug  34.1 
 
 		 1092 aa  558  1e-157  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.196303  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3206  TonB-dependent receptor plug  30.2 
 
 		 1104 aa  445  1e-123  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.165856 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4222  TonB-dependent receptor plug  30.98 
 
 		 1010 aa  396  1e-108  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2283  TonB-dependent receptor plug  28.87 
 
 		 1132 aa  393  1e-107  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00214981 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2097  TonB-dependent receptor plug  29.5 
 
 		 1110 aa  372  1e-101  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.794308  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4206  TonB-dependent receptor plug  29.84 
 
 		 1023 aa  368  1e-100  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.43352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2231  TonB-dependent receptor  28.83 
 
 		 1037 aa  366  1e-99  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3148  TonB-dependent receptor  29.17 
 
 		 1119 aa  363  1e-98  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0441  TonB-dependent receptor plug  28.55 
 
 		 1062 aa  360  9.999999999999999e-98  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1620  TonB-dependent receptor  30.02 
 
 		 1014 aa  358  1.9999999999999998e-97  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.603085  normal  0.770482 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2729  TonB-dependent receptor plug  30.14 
 
 		 999 aa  357  5e-97  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0287081 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0106  TonB-dependent receptor plug  29.57 
 
 		 1161 aa  357  5e-97  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.813272 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4210  TonB-dependent receptor plug  29.85 
 
 		 1027 aa  355  2e-96  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1623  TonB-dependent receptor plug  28.96 
 
 		 1120 aa  356  2e-96  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.21051 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0339  TonB-dependent receptor  30.93 
 
 		 1043 aa  354  4e-96  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3704  TonB-dependent receptor plug  27.94 
 
 		 1128 aa  353  8e-96  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2082  TonB-dependent receptor plug  27.85 
 
 		 1173 aa  353  1e-95  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.843003  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2523  TonB-dependent receptor  30.49 
 
 		 1019 aa  350  1e-94  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0725  TonB-dependent receptor plug  28.68 
 
 		 1129 aa  348  2e-94  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1281  TonB-dependent receptor plug  26.9 
 
 		 1152 aa  347  6e-94  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0225652  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0787  TonB-dependent receptor plug  29.42 
 
 		 1028 aa  347  8e-94  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1500  TonB-dependent receptor plug  28.11 
 
 		 1163 aa  345  2e-93  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00486924  normal  0.0635458 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6567  TonB-dependent receptor plug  27.15 
 
 		 1155 aa  345  2.9999999999999997e-93  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1584  TonB-dependent receptor plug  28.15 
 
 		 1177 aa  344  4e-93  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.268471  normal  0.21051 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2109  TonB-dependent receptor  26.48 
 
 		 1154 aa  343  1e-92  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.607649  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2412  TonB-dependent receptor  29.09 
 
 		 1029 aa  342  2e-92  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.525644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2116  TonB-dependent receptor plug  28.08 
 
 		 1114 aa  342  2e-92  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.398452  normal  0.942953 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0714  TonB-dependent receptor plug  26.36 
 
 		 1124 aa  340  5.9999999999999996e-92  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.232472  normal  0.99116 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3538  TonB-dependent receptor plug  29.85 
 
 		 1006 aa  339  9.999999999999999e-92  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.740617  normal  0.292963 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0443  TonB-dependent receptor plug  27.9 
 
 		 989 aa  337  5.999999999999999e-91  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2137  TonB-dependent receptor  28.09 
 
 		 1050 aa  337  7e-91  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.341252 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1723  TonB-dependent receptor plug  29.56 
 
 		 1071 aa  336  1e-90  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000845953  normal  0.63993 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1766  TonB-dependent receptor plug  27.59 
 
 		 1116 aa  336  1e-90  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0232965  normal  0.0564534 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0754  TonB-dependent receptor plug  28.13 
 
 		 1038 aa  336  1e-90  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1657  TonB-dependent receptor plug  26.39 
 
 		 1122 aa  335  4e-90  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.653698 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2893  TonB-dependent receptor plug  26.48 
 
 		 1077 aa  333  1e-89  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.636312  normal  0.702134 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2600  TonB-dependent receptor plug  27.82 
 
 		 1051 aa  333  1e-89  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.267837 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0956  TonB-dependent receptor plug  27.02 
 
 		 1154 aa  332  2e-89  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.648971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0973  TonB-dependent receptor plug  27.93 
 
 		 1109 aa  330  1.0000000000000001e-88  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1791  TonB-dependent receptor plug  27.15 
 
 		 1177 aa  330  1.0000000000000001e-88  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.132082  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4708  TonB-dependent receptor plug  26.95 
 
 		 1097 aa  329  1.0000000000000001e-88  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5599  TonB-dependent receptor  29 
 
 		 982 aa  328  3e-88  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.89451 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4381  TonB-dependent receptor  29.9 
 
 		 1071 aa  327  6e-88  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.380441  normal  0.425173 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4194  TonB-dependent receptor  30.04 
 
 		 1000 aa  327  8.000000000000001e-88  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.173861  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6433  TonB-dependent receptor plug  29.75 
 
 		 1013 aa  323  8e-87  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.234793  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4645  TonB-dependent receptor, plug  28.47 
 
 		 1041 aa  321  3.9999999999999996e-86  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.342481  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0679  TonB-dependent receptor plug  26 
 
 		 1148 aa  321  6e-86  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0517707  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0517  TonB-dependent receptor plug  29.09 
 
 		 1079 aa  320  7.999999999999999e-86  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00691283 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3123  TonB-dependent receptor plug  27.57 
 
 		 1139 aa  320  1e-85  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0154313  normal  0.66529 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2292  TonB-dependent receptor plug  29.4 
 
 		 1023 aa  320  1e-85  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2602  TonB-dependent receptor plug  28.19 
 
 		 1008 aa  319  2e-85  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6740  TonB-dependent receptor plug  27.7 
 
 		 1116 aa  318  3e-85  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7253  TonB-dependent receptor plug  28.6 
 
 		 996 aa  317  9.999999999999999e-85  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0939847  normal  0.604549 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0343  TonB-dependent receptor plug  28.19 
 
 		 1096 aa  315  2.9999999999999996e-84  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.603691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0633  TonB-dependent receptor plug  26.78 
 
 		 1051 aa  314  5.999999999999999e-84  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2219  TonB-dependent receptor plug  27.58 
 
 		 1106 aa  313  9e-84  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.136302 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0774  TonB-dependent receptor plug  26.58 
 
 		 1181 aa  313  1e-83  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.252982 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2764  TonB-dependent receptor plug  27.56 
 
 		 1103 aa  312  2e-83  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.533832  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0553  tonB-dependent outer membrane receptor  29.7 
 
 		 1019 aa  311  4e-83  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00261689  normal  0.358258 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2829  TonB-dependent receptor plug  28.1 
 
 		 1053 aa  311  5e-83  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.16137  normal  0.0213731 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1362  TonB-dependent receptor  26.88 
 
 		 1140 aa  310  6.999999999999999e-83  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3588  TonB-dependent receptor plug  28.06 
 
 		 986 aa  310  9e-83  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00353353  hitchhiker  0.00053116 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1778  TonB-dependent receptor plug  27.12 
 
 		 1039 aa  309  2.0000000000000002e-82  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0687  TonB-dependent receptor plug  28.39 
 
 		 1066 aa  308  2.0000000000000002e-82  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000368549  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4006  TonB-dependent receptor  28.75 
 
 		 1020 aa  308  4.0000000000000004e-82  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.629585  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3966  TonB-dependent receptor plug  26.21 
 
 		 1150 aa  306  1.0000000000000001e-81  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0876858  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0546  outer membrane receptor; ragA protein  28.86 
 
 		 1024 aa  306  2.0000000000000002e-81  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4717  TonB-dependent receptor plug  26.68 
 
 		 1155 aa  305  2.0000000000000002e-81  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.80065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1383  TonB-dependent receptor plug  26.55 
 
 		 1154 aa  305  3.0000000000000004e-81  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.219265  normal  0.257074 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1274  TonB-dependent receptor plug  28.2 
 
 		 1066 aa  305  4.0000000000000003e-81  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1077  TonB-dependent receptor plug  26.91 
 
 		 1147 aa  305  4.0000000000000003e-81  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.139666  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3950  TonB-dependent receptor  27.24 
 
 		 996 aa  304  5.000000000000001e-81  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.265866  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2207  TonB-dependent receptor plug  25.7 
 
 		 1161 aa  303  9e-81  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.582294 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0932  TonB-dependent receptor plug  29.5 
 
 		 1012 aa  303  1e-80  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.112276  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2079  TonB-dependent receptor  28.33 
 
 		 1028 aa  303  1e-80  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.297647 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2530  TonB-dependent receptor plug  26.07 
 
 		 1146 aa  302  2e-80  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3981  TonB-dependent receptor plug  28 
 
 		 1006 aa  301  4e-80  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.50745  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5672  TonB-dependent receptor plug  27.92 
 
 		 1017 aa  301  6e-80  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00146027  normal  0.794297 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>