176 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_4337 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_4337  coagulation factor 5/8 type domain protein  100 
 
 		 933 aa  1841    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.202539 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7479  Carbohydrate binding family 6  48.87 
 
 		 918 aa  234  5e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5042  glycoside hydrolase family 3 domain protein  47.88 
 
 		 1321 aa  224  4e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1609  Beta-glucosidase  48.13 
 
 		 1338 aa  199  2.0000000000000003e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.344254 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3294  coagulation factor 5/8 type domain protein  77.78 
 
 		 1109 aa  195  3e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3140  hypothetical protein  31.02 
 
 		 1213 aa  188  5e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.242437  normal  0.09538 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1605  coagulation factor 5/8 type domain protein  60.14 
 
 		 1212 aa  187  9e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.232079 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1873  carbohydrate-binding family 6 protein  31.53 
 
 		 1091 aa  182  4e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00027012  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0373  coagulation factor 5/8 type domain protein  52.36 
 
 		 795 aa  177  7e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.634884  normal  0.96557 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4979  Carbohydrate-binding family 9  29.51 
 
 		 1418 aa  172  3e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.502529  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1882  parallel beta-helix repeat-containing protein  27.04 
 
 		 1410 aa  169  2.9999999999999998e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3784  Glycoprotein endo-alpha-1,2-mannosidase  56.74 
 
 		 510 aa  166  3e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00391126  normal  0.836971 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0812  hypothetical protein  56.93 
 
 		 1200 aa  165  4.0000000000000004e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3395  coagulation factor 5/8 type domain protein  58.09 
 
 		 1448 aa  164  8.000000000000001e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.392146  normal  0.950176 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3707  Carbohydrate binding family 6  31.13 
 
 		 1000 aa  159  2e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.176968  normal  0.212982 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1308  APHP domain-containing protein  28.57 
 
 		 1085 aa  159  3e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0025589  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1017  parallel beta-helix repeat-containing protein  31.17 
 
 		 584 aa  154  8.999999999999999e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.769292 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3805  glycoside hydrolase family 18  35.88 
 
 		 801 aa  150  1.0000000000000001e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.165252 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3706  coagulation factor 5/8 type domain protein  28.69 
 
 		 823 aa  145  3e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.301567  normal  0.394151 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7012  hypothetical protein  29.8 
 
 		 675 aa  141  4.999999999999999e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.342221  hitchhiker  0.00752546 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4658  mycodextranase  29.17 
 
 		 671 aa  134  6.999999999999999e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.575597  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2066  Carbohydrate binding family 6  44.44 
 
 		 870 aa  122  3e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2193  carbohydrate-binding family 6 protein  41 
 
 		 948 aa  120  9.999999999999999e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.43679  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2070  Carbohydrate binding family 6  43.59 
 
 		 802 aa  119  1.9999999999999998e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.002169  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5033  coagulation factor 5/8 type domain protein  48.53 
 
 		 1001 aa  119  3e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1978  Carbohydrate binding family 6  44.38 
 
 		 823 aa  119  3e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.410685 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2067  Carbohydrate binding family 6  43.54 
 
 		 819 aa  118  3.9999999999999997e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.517806  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1473  Carbohydrate binding family 6  40.62 
 
 		 719 aa  118  6e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  unclonable  0.0000967191  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2068  Carbohydrate binding family 6  43.92 
 
 		 1356 aa  118  6e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.684202  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0907  Carbohydrate binding family 6  43.92 
 
 		 845 aa  117  1.0000000000000001e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00955406  normal  0.403954 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0216  hypothetical protein  38.92 
 
 		 630 aa  115  4.0000000000000004e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.80342 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1960  Carbohydrate binding family 6  40.99 
 
 		 786 aa  115  5e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0676284  normal  0.0447838 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1961  Carbohydrate binding family 6  42.11 
 
 		 840 aa  114  6e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  unclonable  0.00050409  normal  0.0219561 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2071  Carbohydrate binding family 6  43.45 
 
 		 1380 aa  112  3e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.306385  normal  0.362656 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1920  Carbohydrate binding family 6  41.06 
 
 		 777 aa  111  8.000000000000001e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.208758 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2671  Carbohydrate binding family 6  40.99 
 
 		 581 aa  110  1e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.684309 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1961  Endo-1,4-beta-xylanase  41.94 
 
 		 524 aa  110  2e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2137  Carbohydrate binding family 6  38.3 
 
 		 1262 aa  109  2e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.138075  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4284  Carbohydrate binding family 6  43.54 
 
 		 705 aa  109  3e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.162289  normal  0.0937971 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1051  endoglucanase-related protein  39.18 
 
 		 1295 aa  108  4e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.222685 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2494  hypothetical protein  41.25 
 
 		 610 aa  108  5e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1783  Carbohydrate binding family 6  42.11 
 
 		 2554 aa  106  3e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0078  Carbohydrate binding family 6  37.57 
 
 		 1234 aa  105  4e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.511687 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1810  Carbohydrate binding family 6  40.79 
 
 		 3295 aa  105  4e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3892  hypothetical protein  39.87 
 
 		 550 aa  105  5e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0718789  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1779  Carbohydrate binding family 6  36.81 
 
 		 526 aa  104  6e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00214562  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1784  Carbohydrate binding family 6  41.45 
 
 		 1732 aa  104  7e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.847863  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3536  Carbohydrate binding family 6  45.83 
 
 		 726 aa  103  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.414252  normal  0.419471 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0488  Carbohydrate binding family 6  37.87 
 
 		 1799 aa  103  2e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2971  glycoside hydrolase family 43  37.18 
 
 		 855 aa  103  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0529993 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3309  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  36.17 
 
 		 208 aa  101  6e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1342  periplasmic copper-binding  33.17 
 
 		 919 aa  101  6e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.766214 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2992  helix-turn-helix, AraC type  33.67 
 
 		 982 aa  100  9e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0557584  hitchhiker  0.000000421127 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0652  Beta-glucanase/Beta-glucan synthetase-like  40.14 
 
 		 569 aa  100  1e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.307266  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0404  Carbohydrate binding family 6  33.91 
 
 		 468 aa  100  1e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.813596 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1344  periplasmic copper-binding  35.68 
 
 		 954 aa  100  1e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.283677  normal  0.307468 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4512  Carbohydrate binding family 6  37.66 
 
 		 1391 aa  99.4  3e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.472745 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2929  hypothetical protein  42.4 
 
 		 673 aa  98.6  5e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3260  hypothetical protein  38.51 
 
 		 500 aa  98.2  6e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00293464 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5117  Carbohydrate binding family 6  35.05 
 
 		 1132 aa  97.8  8e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.17685 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1756  Carbohydrate binding family 6  31.68 
 
 		 930 aa  97.1  2e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.127893  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3324  carbohydrate-binding family 6 protein  38.18 
 
 		 972 aa  96.3  3e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0172  coagulation factor 5/8 type domain protein  32.12 
 
 		 685 aa  95.9  3e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.238557  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0431  Carbohydrate binding family 6  32.88 
 
 		 966 aa  94.7  6e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.174739  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2618  Carbohydrate binding family 6  37.87 
 
 		 522 aa  94.4  8e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0533616 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2398  Carbohydrate binding family 6  33.9 
 
 		 1004 aa  93.6  2e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0137535  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1393  thiol oxidoreductase-like  32.34 
 
 		 1707 aa  92.4  4e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.619739  normal  0.222979 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3218  Alpha-L-fucosidase  38.78 
 
 		 798 aa  91.7  6e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.266545  normal  0.296598 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6229  Carbohydrate binding family 6  43.64 
 
 		 461 aa  90.9  1e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0675  Carbohydrate binding family 6  33.33 
 
 		 875 aa  90.9  1e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.783168 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2209  Carbohydrate binding family 6  35.03 
 
 		 739 aa  90.9  1e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.858511  normal  0.120589 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3003  hypothetical protein  41.07 
 
 		 1167 aa  90.1  2e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.25795  hitchhiker  0.000812606 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1838  Carbohydrate binding family 6  36.54 
 
 		 1035 aa  89.4  3e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.533489  normal  0.441295 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0112  hypothetical protein  37.58 
 
 		 1024 aa  88.6  4e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0292658  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0493  Carbohydrate binding family 6  34.9 
 
 		 627 aa  89  4e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0405  Carbohydrate binding family 6  39.73 
 
 		 749 aa  87.8  9e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.85643 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1469  Carbohydrate binding family 6  38.36 
 
 		 735 aa  87.4  0.000000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3203  Ig domain-containing protein  27.23 
 
 		 981 aa  85.1  0.000000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2670  PKD domain containing protein  35.06 
 
 		 1387 aa  84.7  0.000000000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.195027  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2186  glycoside hydrolase family 18  42.34 
 
 		 536 aa  84.3  0.000000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0363978  hitchhiker  0.000898498 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3753  Carbohydrate binding family 6  37.84 
 
 		 639 aa  79.7  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000661715 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4175  glycoside hydrolase family protein  37.11 
 
 		 541 aa  79.7  0.0000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3023  endoglucanase-like  38.18 
 
 		 869 aa  79  0.0000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102959 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4545  glycoside hydrolase family 16  41.23 
 
 		 383 aa  78.6  0.0000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4176  carbohydrate-binding family 6 protein  38.98 
 
 		 884 aa  77.8  0.0000000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2996  endoglucanase-like  32.67 
 
 		 853 aa  77.4  0.000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0689244  hitchhiker  0.000000433363 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2993  endoglucanase-like  32.24 
 
 		 863 aa  76.3  0.000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0380373  hitchhiker  0.000000401461 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2187  Carbohydrate binding family 6  37.84 
 
 		 389 aa  75.9  0.000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00108018  hitchhiker  0.000808611 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4174  carbohydrate-binding family 6 protein  37.39 
 
 		 957 aa  75.1  0.000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.49527  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02670  glycoside hydrolase family 16  31.08 
 
 		 503 aa  73.6  0.00000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3927  peptidyl-Asp metallopeptidase. metallo peptidase. MEROPS family M72  32.2 
 
 		 465 aa  70.5  0.0000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0686  periplasmic copper-binding  33.77 
 
 		 461 aa  68.2  0.0000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.241556 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2832  hypothetical protein  37.04 
 
 		 877 aa  68.2  0.0000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0897926  normal  0.0109857 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4786  protein of unknown function DUF1111  38.46 
 
 		 879 aa  67  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3972  coagulation factor 5/8 type domain protein  44.19 
 
 		 929 aa  66.2  0.000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.443016  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0755  Carbohydrate binding family 6  33.54 
 
 		 627 aa  65.1  0.000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.40711 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7912  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  30.15 
 
 		 953 aa  63.9  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.241269  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5654  Beta-N-acetylhexosaminidase  39.69 
 
 		 756 aa  63.2  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.171925  normal  0.428495 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4312  coagulation factor 5/8 type domain protein  39.29 
 
 		 1007 aa  62.8  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.382948  hitchhiker  0.000989115 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4311  coagulation factor 5/8 type domain protein  40.71 
 
 		 755 aa  62.4  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0177286  hitchhiker  0.00166201 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>