94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_1107 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_1107  endoglucanase  100 
 
 		 1302 aa  2603    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.480089  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2103  endoglucanase  47.37 
 
 		 346 aa  301  5e-80  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.438737  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3237  cellulase  48.01 
 
 		 630 aa  297  7e-79  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000087335  normal  0.349209 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3239  cellulase  50.92 
 
 		 638 aa  285  4.0000000000000003e-75  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00277111  normal  0.266356 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2337  glycoside hydrolase family 5  43.77 
 
 		 505 aa  264  6.999999999999999e-69  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.422091  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1529  Cellulase  48.53 
 
 		 426 aa  264  6.999999999999999e-69  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2612  glycoside hydrolase family 5  43.65 
 
 		 505 aa  258  4e-67  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.125365  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1886  Cellulase  47.06 
 
 		 451 aa  256  2.0000000000000002e-66  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.271202  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4946  cellulase  40.06 
 
 		 322 aa  251  5e-65  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00452483  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2494  hypothetical protein  46.01 
 
 		 610 aa  250  1e-64  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1404  cellulase  39.26 
 
 		 457 aa  236  3e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.690204  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3003  hypothetical protein  44.19 
 
 		 1167 aa  232  4e-59  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.25795  hitchhiker  0.000812606 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0428  glycoside hydrolase family 5  34.66 
 
 		 930 aa  184  1e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4424  glycoside hydrolase family protein  37.06 
 
 		 709 aa  182  4.999999999999999e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0594  Cellulase  38.34 
 
 		 755 aa  182  4.999999999999999e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0901  cellulase  34.49 
 
 		 466 aa  176  2.9999999999999996e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1941  Cellulase  32.91 
 
 		 347 aa  170  2e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.966513  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2009  Cellulase  32.8 
 
 		 748 aa  160  2e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.428719  normal  0.0728263 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1368  Cellulase  31.1 
 
 		 426 aa  154  1e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.828638 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2410  glycoside hydrolase family protein  32.04 
 
 		 459 aa  139  3.0000000000000003e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.840511  normal  0.905848 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2285  glycoside hydrolase family protein  30.19 
 
 		 462 aa  137  1.9999999999999998e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4115  hypothetical protein  39.18 
 
 		 2278 aa  118  7.999999999999999e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.143212  hitchhiker  0.000960597 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5223  hypothetical protein  31.73 
 
 		 1228 aa  111  1e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.774723 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2395  glycoside hydrolase family 5  28.06 
 
 		 1221 aa  103  2e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.740563  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4289  glycoside hydrolase family 5  30.31 
 
 		 717 aa  101  8e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.162807  normal  0.0359435 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1240  bifunctional xylanase/esterase; CBM9 module, glycoside hydrolase family 8 protein and carbohydrate esterase family 4 protein  38.96 
 
 		 1748 aa  99.8  3e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.267391  normal  0.341436 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4205  hypothetical protein  33.98 
 
 		 1386 aa  99.8  3e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2379  xylanase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 11 protein  37.31 
 
 		 1160 aa  94  2e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  unclonable  0.000000600941  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5393  hypothetical protein  38.78 
 
 		 1303 aa  88.2  8e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.56459  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1238  beta-xylosidase/endoglucanase  40.35 
 
 		 1275 aa  84  0.00000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2387  Fibronectin type III domain protein  27.89 
 
 		 703 aa  80.9  0.0000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2510  Carbohydrate-binding family 9  26.54 
 
 		 626 aa  80.1  0.0000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2852  beta-glycosidase-like protein  48.31 
 
 		 1152 aa  75.9  0.000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.359276  normal  0.0739949 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1486  multicopper oxidase type 2  53.85 
 
 		 1601 aa  75.1  0.000000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.131565  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2043  xylanase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 10 protein  48.24 
 
 		 1247 aa  73.9  0.00000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2040  esterase-like protein  55.07 
 
 		 1002 aa  73.6  0.00000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.400928  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2044  beta-xylosidase/alpha-L-arabinofuranosidase- like protein  53.62 
 
 		 1474 aa  72.8  0.00000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2042  CHU large protein, xylanase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 5 protein  53.62 
 
 		 1217 aa  72.8  0.00000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2041  polyfunctional acetylxylan esterase/b-xylosidase/a-L-arabinofuranosidase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 43 protein and carbohydrate esterase family 6 protein  53.62 
 
 		 1585 aa  72.8  0.00000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3714  PKD domain containing protein  31.08 
 
 		 1771 aa  71.6  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.333758  normal  0.0659323 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2398  Carbohydrate binding family 6  22.91 
 
 		 1004 aa  70.5  0.0000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0137535  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2394  Fibronectin type III domain protein  24.21 
 
 		 651 aa  70.1  0.0000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.253992  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0302  glycoside hydrolase family 5  25.42 
 
 		 481 aa  67  0.000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0480106  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0242  PKD domain containing protein  25.62 
 
 		 1987 aa  66.6  0.000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2149  glycoside hydrolase family 5 protein  44.59 
 
 		 1108 aa  65.9  0.000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  unclonable  0.000000532282  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3971  hypothetical protein  29.07 
 
 		 3602 aa  63.9  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2399  hypothetical protein  40.16 
 
 		 1406 aa  58.9  0.0000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0276  Cellulase  29.41 
 
 		 335 aa  58.5  0.0000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.166979  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1239  bifunctional acetylxylan esterase/xylanase, CBM4 module, glycoside hydrolase family 10 protein and carbohydrate esterase family 6 protein  42.17 
 
 		 1414 aa  57.8  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.830301 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2254  PKD domain-containing protein  29.91 
 
 		 1011 aa  57.4  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000165849  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2006  cellulose-binding family II  24.15 
 
 		 1194 aa  57  0.000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0781083  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1155  xyloglucanase  27.06 
 
 		 1288 aa  57.4  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0025  glycoside hydrolase family 5  24.21 
 
 		 358 aa  57.4  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1051  endoglucanase-related protein  43.48 
 
 		 1295 aa  56.2  0.000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.222685 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0490  hypothetical protein  34.31 
 
 		 691 aa  55.5  0.000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.79487  normal  0.17216 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2184  Chitinase  40 
 
 		 1362 aa  54.3  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00723588 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1959  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  30.21 
 
 		 984 aa  54.3  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.54299  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2564  PKD domain-containing protein  31.6 
 
 		 1107 aa  53.9  0.00002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.543991 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1162  pectate lyase  48.33 
 
 		 991 aa  53.1  0.00003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.211021 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1945  fibronectin type III domain-containing protein  53.23 
 
 		 1047 aa  53.1  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.771273  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2327  fibronectin, type III domain-containing protein  46.27 
 
 		 482 aa  53.1  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00610541  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6890  cellobiohydrolase A (1 4-beta-cellobiosidase A)- like protein  38.96 
 
 		 767 aa  52.8  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3180  glycoside hydrolase family protein  38.1 
 
 		 963 aa  52.8  0.00004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000076749 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2957  glycoside hydrolase family protein  38.1 
 
 		 966 aa  52.8  0.00004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0791  hypothetical protein  36.92 
 
 		 692 aa  52.8  0.00004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.195904  normal  0.0459938 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3802  protease  30.77 
 
 		 778 aa  52.4  0.00005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.239343 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2388  Fibronectin type III domain protein  18.65 
 
 		 768 aa  52.4  0.00006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.52789  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3727  b-glycosidase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 8 protein  47.44 
 
 		 1223 aa  51.2  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0598979  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01330  hypothetical protein  31.68 
 
 		 306 aa  51.2  0.0001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.719075  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0413  glycoside hydrolase family protein  33.07 
 
 		 1224 aa  51.2  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0549  Fibronectin type III domain protein  31.28 
 
 		 4429 aa  50.8  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0107  conserved repeat domain protein  44.87 
 
 		 4896 aa  50.1  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.615678 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3478  hypothetical protein  29.95 
 
 		 3737 aa  49.7  0.0004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2588  hypothetical protein  28.29 
 
 		 1022 aa  49.3  0.0005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03270  hypothetical protein  35.53 
 
 		 1070 aa  48.9  0.0007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.88849  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5117  Carbohydrate binding family 6  31.73 
 
 		 1132 aa  48.5  0.0008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.17685 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2451  Fibronectin type III domain protein  40.91 
 
 		 1219 aa  48.5  0.0008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4909  coagulation factor 5/8 type domain protein  37.37 
 
 		 915 aa  48.1  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.01005  normal  0.104643 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000210  chitodextrinase precursor  40.58 
 
 		 1054 aa  47.8  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0800752  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09473  fat protein-possibly involved in cell-cell attachment  38.46 
 
 		 1441 aa  47  0.002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0638  chitodextrinase  36.49 
 
 		 1051 aa  47.4  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3746  Ig family protein  28.24 
 
 		 3542 aa  47.4  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2484  glycoside hydrolase family protein  26.49 
 
 		 1127 aa  47.4  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.1184  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3748  hypothetical protein  27.78 
 
 		 371 aa  47  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.012971  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3105  hypothetical protein  33.33 
 
 		 787 aa  46.6  0.003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.667845  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1075  beta-glycosidase-like protein  27.55 
 
 		 2690 aa  46.6  0.003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.243053 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2328  fibronectin, type III domain-containing protein  50 
 
 		 675 aa  46.6  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000140812  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05945  chitinase  42.62 
 
 		 1053 aa  46.2  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0065  glycoside hydrolase family 5  23.31 
 
 		 378 aa  46.6  0.004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0936  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  40 
 
 		 979 aa  45.8  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2445  fibronectin, type III domain-containing protein  43.86 
 
 		 499 aa  45.8  0.006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.628775  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2604  glycoside hydrolase family protein  24.7 
 
 		 1127 aa  45.8  0.006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0488265  hitchhiker  0.00483231 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1860  glycoside hydrolase family 18  24.7 
 
 		 1127 aa  45.1  0.008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.686097  hitchhiker  0.0000000988456 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3146  FG-GAP repeat protein  26 
 
 		 1337 aa  44.7  0.01  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>