152 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_2125 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_2125  Ricin B lectin  100 
 
 		 491 aa  1002    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4621  Ricin B lectin  39.47 
 
 		 497 aa  296  6e-79  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3804  Ricin B lectin  38.04 
 
 		 497 aa  279  8e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.404288  normal  0.817018 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4872  Ricin B lectin  39.28 
 
 		 489 aa  270  2.9999999999999997e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.111071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6907  Ricin B lectin  36.1 
 
 		 469 aa  270  5.9999999999999995e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00437458  decreased coverage  0.0000226989 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4280  Ricin B lectin  35.73 
 
 		 494 aa  265  1e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.104165 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1428  Ricin B lectin  47.55 
 
 		 1139 aa  136  8e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.737248  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0976  Arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  39.18 
 
 		 507 aa  126  8.000000000000001e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1643  parallel beta-helix repeat-containing ricin B lectin  44.37 
 
 		 563 aa  125  1e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0383  Ricin B lectin  49.26 
 
 		 401 aa  126  1e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0376  Endo-1,4-beta-xylanase  51.85 
 
 		 495 aa  125  1e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2530  Ricin B lectin  44.97 
 
 		 412 aa  125  2e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00551776  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4966  Alpha-N-arabinofuranosidase  47.3 
 
 		 507 aa  124  5e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.451245  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0740  Arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  38.97 
 
 		 507 aa  123  6e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4084  Ricin B lectin  40.88 
 
 		 1413 aa  120  7e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2942  Alpha-N-arabinofuranosidase  41.29 
 
 		 474 aa  114  3e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0858983  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3944  Alpha-N-arabinofuranosidase  42.54 
 
 		 466 aa  110  8.000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5674  Ricin B lectin  35.65 
 
 		 425 aa  109  9.000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.510311 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4856  Ricin B lectin  43.07 
 
 		 569 aa  108  2e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.173308  normal  0.0148414 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3927  Ricin B lectin  43.94 
 
 		 436 aa  108  2e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1280  glycoside hydrolase family 43  40.15 
 
 		 691 aa  106  1e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.286369  hitchhiker  0.00183728 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2848  Alpha-N-arabinofuranosidase  45.93 
 
 		 520 aa  104  3e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.724859  decreased coverage  0.0053695 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0661  Ricin B lectin  40.74 
 
 		 571 aa  103  6e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1905  glucan endo-1,6-beta-glucosidase  38.51 
 
 		 695 aa  103  6e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1014  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  41.55 
 
 		 472 aa  102  2e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000194163  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3710  arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  37.11 
 
 		 476 aa  99  2e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000857688  normal  0.462081 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6290  Ricin B lectin  39.04 
 
 		 1259 aa  99  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0798248 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1962  Endo-1,4-beta-xylanase  40.15 
 
 		 411 aa  98.6  2e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.634854  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4855  Ricin B lectin  36.71 
 
 		 503 aa  97.8  4e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0410154  normal  0.0144537 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4496  glycoside hydrolase family 43  41.35 
 
 		 503 aa  97.1  7e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0241272  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4332  Ricin B lectin  39.58 
 
 		 615 aa  96.7  8e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.817761  normal  0.0720026 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4904  Ricin B lectin  36.55 
 
 		 494 aa  95.9  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.146094  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2809  ATPase  39.55 
 
 		 789 aa  95.1  3e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.153749  decreased coverage  0.000000401461 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2450  Ricin B lectin  39.39 
 
 		 582 aa  94.7  3e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0349225  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3586  arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  29.01 
 
 		 514 aa  94.7  4e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4176  carbohydrate-binding family 6 protein  38.93 
 
 		 884 aa  92.8  1e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1313  Pectate lyase  40.44 
 
 		 430 aa  92  2e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0268992  hitchhiker  0.00857009 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2449  glycoside hydrolase family 43  36.76 
 
 		 537 aa  91.3  4e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.114761  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6159  Alpha-N-arabinofuranosidase  36.55 
 
 		 507 aa  90.9  5e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.444689  normal  0.0822461 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3240  protein of unknown function DUF291  36.36 
 
 		 2073 aa  90.5  6e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4174  carbohydrate-binding family 6 protein  37.88 
 
 		 957 aa  90.1  8e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.49527  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3803  Ricin B lectin  36 
 
 		 943 aa  89.4  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.307116  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4440  Ricin B lectin  39.39 
 
 		 566 aa  88.2  3e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0151299  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1461  Ricin B lectin  40.15 
 
 		 560 aa  87  7e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.851115  normal  0.229288 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4287  Ricin B lectin  40.69 
 
 		 647 aa  87  7e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.718232  normal  0.560117 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4504  glycoside hydrolase family 43  36.57 
 
 		 510 aa  85.9  0.000000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4574  Ricin B lectin  34.59 
 
 		 672 aa  85.5  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0859  Ricin B lectin  36 
 
 		 483 aa  81.3  0.00000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4199  Ricin B lectin  33.82 
 
 		 474 aa  80.5  0.00000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.876848  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5663  Ricin B lectin  36.96 
 
 		 1187 aa  79.7  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.765642  normal  0.474781 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6866  Ricin B lectin  33.85 
 
 		 493 aa  79  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.191188  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6252  Ricin B lectin  35.77 
 
 		 737 aa  77.4  0.0000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.189274 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4198  Pectinesterase  33.86 
 
 		 487 aa  76.6  0.0000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.018397  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2967  Ricin B lectin  30.07 
 
 		 230 aa  74.7  0.000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6977  hypothetical protein  32.34 
 
 		 897 aa  74.7  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.449457  normal  0.690746 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3068  Ricin B lectin  32.84 
 
 		 489 aa  74.3  0.000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3108  Ricin B lectin  32.35 
 
 		 368 aa  74.3  0.000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.448739  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4932  Alpha-L-fucosidase  34.81 
 
 		 663 aa  73.2  0.000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00307055  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1703  hypothetical protein  34.27 
 
 		 392 aa  73.2  0.00000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.595343 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3716  Glucan endo-1,6-beta-glucosidase  36.23 
 
 		 648 aa  72.8  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0082152 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4363  protein of unknown function DUF1680  31.58 
 
 		 963 aa  73.2  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0125989  normal  0.151908 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0329  Pectate lyase  33.54 
 
 		 445 aa  72.4  0.00000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0745769 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4884  glycoside hydrolase family 62  35.2 
 
 		 492 aa  72  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.918627 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2992  helix-turn-helix, AraC type  37.01 
 
 		 982 aa  71.6  0.00000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0557584  hitchhiker  0.000000421127 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5656  Ricin B lectin  36.22 
 
 		 824 aa  71.6  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0407757  normal  0.559684 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0455  Carbohydrate binding family 6  33.59 
 
 		 618 aa  70.5  0.00000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5654  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.71 
 
 		 756 aa  70.1  0.00000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.171925  normal  0.428495 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1625  Ricin B lectin  34.81 
 
 		 664 aa  69.3  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.174665  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4964  Pectinesterase  33.33 
 
 		 794 aa  68.6  0.0000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.467463  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3581  Glycoside hydrolase family 59  36.6 
 
 		 801 aa  68.2  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4911  Ricin B lectin  32.03 
 
 		 472 aa  67.4  0.0000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.036155  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2993  endoglucanase-like  35.43 
 
 		 863 aa  67.4  0.0000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0380373  hitchhiker  0.000000401461 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4928  glycoside hydrolase family 10  31.82 
 
 		 490 aa  67.4  0.0000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.870217  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7918  Alpha-galactosidase  34.06 
 
 		 535 aa  66.6  0.0000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.542076  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4873  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  34.13 
 
 		 489 aa  65.9  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.958979  normal  0.944256 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4880  Ricin B lectin  33.08 
 
 		 558 aa  65.5  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0253313  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4927  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  33.86 
 
 		 498 aa  65.5  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.290499  normal  0.586744 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2866  glycoside hydrolase family 43  30.25 
 
 		 487 aa  65.5  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.141314  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4905  Ricin B lectin  34.38 
 
 		 461 aa  64.7  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.151016  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3106  Ricin B lectin  30.99 
 
 		 548 aa  63.5  0.000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0930028  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3107  protein of unknown function DUF1680  28.36 
 
 		 771 aa  63.5  0.000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0859472  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4436  glucan 1,6-alpha-isomaltosidase  36.07 
 
 		 1172 aa  63.2  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4882  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  32.03 
 
 		 500 aa  63.2  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0472231  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4930  Ricin B lectin  31.1 
 
 		 801 aa  62.8  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.199916  normal  0.917817 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5006  glycoside hydrolase family 5  30.99 
 
 		 516 aa  62  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.180234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2738  Ricin B lectin  33.07 
 
 		 468 aa  61.2  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.16823  normal  0.176429 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4959  Ricin B lectin  30.88 
 
 		 576 aa  61.2  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.572354  normal  0.851755 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4912  Ricin B lectin  32.03 
 
 		 547 aa  60.1  0.00000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.365133  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3742  Ricin B lectin  30.77 
 
 		 374 aa  60.1  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00367387  normal  0.957672 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4931  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  32.28 
 
 		 493 aa  59.7  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0127437  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4828  Ricin B lectin  31.76 
 
 		 555 aa  58.5  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000773759 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0456  Ricin B lectin  33.08 
 
 		 568 aa  58.5  0.0000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4926  Ricin B lectin  34.27 
 
 		 748 aa  58.5  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.164927  normal  0.377281 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4995  Ricin B lectin  29.41 
 
 		 1016 aa  58.2  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.214567  normal  0.0224239 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1664  lectin repeat-containing protein  29.37 
 
 		 806 aa  57  0.0000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.912119  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1713  lectin repeat-containing protein  29.37 
 
 		 806 aa  57  0.0000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1921  lectin repeat-containing protein  29.37 
 
 		 806 aa  57  0.0000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00570044  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0596  ricin-type beta-trefoil lectin domain/galactose oxidase domain-containing protein  29.37 
 
 		 806 aa  57  0.0000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.39383  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0730  lectin repeat-containing protein  28.87 
 
 		 806 aa  56.2  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.584993  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2233  ricin-type beta-trefoil lectin domain/galactose oxidase domain-containing protein  30.16 
 
 		 806 aa  56.2  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>