293 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_1672 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008553  Mthe_1672  helicase c2  100 
 
 		 739 aa  1517    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1104  queuine tRNA-ribosyltransferase  32.68 
 
 		 676 aa  360  4e-98  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1699  DEAD_2 domain protein  32.13 
 
 		 670 aa  344  4e-93  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0524758  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0789  helicase c2  32.71 
 
 		 669 aa  338  1.9999999999999998e-91  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.222881  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1117  DEAD_2 domain-containing protein  33.19 
 
 		 712 aa  325  3e-87  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.708962  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0965  helicase c2  32.12 
 
 		 654 aa  322  1.9999999999999998e-86  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.228923  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1416  DEAD_2 domain protein  24.07 
 
 		 722 aa  152  2e-35  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2627  DEAD_2 domain protein  24.23 
 
 		 723 aa  146  2e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.510755 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2947  DEAD_2 domain protein  26.65 
 
 		 774 aa  144  8e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.443127  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1812  DEAD_2 domain-containing protein  25.54 
 
 		 617 aa  142  3e-32  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0429091  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0335  DEAD_2 domain protein  23.5 
 
 		 723 aa  141  6e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1769  DEAD_2 domain protein  24.01 
 
 		 729 aa  140  7.999999999999999e-32  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.863576  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1566  Rad3-related DNA helicases  24.22 
 
 		 726 aa  133  1.0000000000000001e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000243015  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0660  DEAD_2 domain protein  23.92 
 
 		 790 aa  133  1.0000000000000001e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0196  DEAD_2 domain protein  25.04 
 
 		 619 aa  128  4.0000000000000003e-28  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.544403  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4042  DEAD_2 domain protein  26.51 
 
 		 798 aa  127  1e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2806  DEAD_2 domain protein  27.91 
 
 		 785 aa  126  2e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.717048  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4133  DEAD_2 domain protein  26.77 
 
 		 798 aa  126  2e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0224  DEAD_2 domain-containing protein  26.49 
 
 		 852 aa  125  2e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0115724  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0289  DEAD_2  24.96 
 
 		 785 aa  124  9e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00121679  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1217  ATP-dependent helicase, putative  25.15 
 
 		 781 aa  122  1.9999999999999998e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.11747  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1847  DEAD_2 domain-containing protein  33.33 
 
 		 807 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2112  DEAD_2 domain-containing protein  30.82 
 
 		 797 aa  121  4.9999999999999996e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1408  putative ATP-dependent helicase  24.95 
 
 		 781 aa  118  3e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0995  DEAD_2 domain protein  26.46 
 
 		 777 aa  117  1.0000000000000001e-24  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0015  DEAD_2 domain-containing protein  27.59 
 
 		 750 aa  115  3e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.338089  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0620  DEAD_2 domain-containing protein  23.85 
 
 		 634 aa  114  7.000000000000001e-24  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0984  DEAD_2 domain-containing protein  24.93 
 
 		 773 aa  114  7.000000000000001e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2690  DEAD_2  23.87 
 
 		 772 aa  114  8.000000000000001e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00215798 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2975  helicase c2  25.48 
 
 		 807 aa  114  8.000000000000001e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_54439  YPL008W (CHL1)-like protein  23.54 
 
 		 835 aa  112  2.0000000000000002e-23  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.106037 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2428  helicase c2  26.9 
 
 		 855 aa  111  4.0000000000000004e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.376304  normal  0.732574 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_50344  DNA helicase component of transcription factor b  22.7 
 
 		 793 aa  110  8.000000000000001e-23  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1416  helicase c2  26.32 
 
 		 855 aa  109  2e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB05090  CHL1 helicase, putative  23.08 
 
 		 849 aa  108  3e-22  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA05570  general RNA polymerase II transcription factor, putative  23.94 
 
 		 799 aa  108  4e-22  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.946623  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1550  DNA repair helicase  27.4 
 
 		 745 aa  108  5e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5813  helicase c2  25.41 
 
 		 790 aa  106  1e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.208635 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_26944  predicted protein  23.09 
 
 		 788 aa  106  1e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.168097 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0816  helicase c2  25 
 
 		 787 aa  106  2e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.524115 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2454  Uvs006  27.13 
 
 		 746 aa  105  3e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.107257  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1918  helicase c2  25.74 
 
 		 790 aa  105  3e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.885633  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0185  helicase c2  25.48 
 
 		 798 aa  105  3e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1260  putative ATP-dependent helicase  27.13 
 
 		 755 aa  105  3e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1186  putative ATP-dependent helicase  27.13 
 
 		 755 aa  104  5e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.146047  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3036  hypothetical protein  23.43 
 
 		 761 aa  103  1e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0104594  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0928  ATP-dependent helicase, putative  27.53 
 
 		 495 aa  103  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.568065  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5827  DEAD_2  26.06 
 
 		 779 aa  102  2e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1376  DNA repair helicase, truncation  27.33 
 
 		 431 aa  101  6e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.731908  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2465  helicase c2  26.98 
 
 		 806 aa  100  8e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4111  helicase c2  29.9 
 
 		 766 aa  100  1e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.620969 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2510  helicase c2  25.73 
 
 		 788 aa  97.4  8e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00268076 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09436  5' to 3' DNA helicase (Eurofung)  21.49 
 
 		 791 aa  97.1  1e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5966  helicase c2  26.37 
 
 		 766 aa  97.1  1e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.224812  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0478  DEAD_2 domain-containing protein  24.09 
 
 		 588 aa  97.1  1e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.738253  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4233  helicase c2  26.87 
 
 		 757 aa  95.9  2e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.134799  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40350  hypothetical protein  26.2 
 
 		 758 aa  95.5  3e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.650358  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4835  helicase c2  24.75 
 
 		 874 aa  94.4  6e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0589586 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3978  helicase c2  25.96 
 
 		 766 aa  94.7  6e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0904062  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4389  helicase c2  25.96 
 
 		 766 aa  94.7  6e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.787433  normal  0.56553 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1376  DNA helicase RepD  25.96 
 
 		 773 aa  94.4  7e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.905642  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2943  DEAD_2 domain-containing protein  25.41 
 
 		 753 aa  92.8  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0823  DEAD_2 domain protein  26.22 
 
 		 739 aa  92.4  2e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5309  DEAD_2 domain-containing protein  30.3 
 
 		 756 aa  92  3e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.173286  hitchhiker  0.0033003 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5421  DEAD_2 domain protein  24.02 
 
 		 754 aa  92  3e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4268  helicase c2  25.2 
 
 		 766 aa  91.3  6e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0100597  normal  0.178799 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_24915  predicted protein  21.58 
 
 		 791 aa  90.9  7e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.615618  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1361  helicase c2  23.91 
 
 		 801 aa  90.1  1e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3423  hypothetical protein  28.1 
 
 		 758 aa  88.2  5e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2972  DEAD_2 domain-containing protein  23.84 
 
 		 753 aa  87.8  7e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.114076 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2909  DEAD_2  27.02 
 
 		 775 aa  87.8  7e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0996428 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1180  hypothetical protein  25.24 
 
 		 754 aa  87.4  8e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.749053  normal  0.379614 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_54072  xeroderma pigmentosum group D complementing protein  27.34 
 
 		 782 aa  86.3  0.000000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_10282  predicted protein  22.91 
 
 		 614 aa  86.3  0.000000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_37445  predicted protein  21.52 
 
 		 938 aa  86.7  0.000000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.258887  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_37740  predicted protein  29.58 
 
 		 849 aa  85.5  0.000000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.689797  normal  0.0804873 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1630  Rad3-related DNA helicases-like  30.18 
 
 		 766 aa  84  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.138986  normal  0.527518 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1498  helicase c2  28.52 
 
 		 773 aa  84  0.00000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.486316  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2839  DEAD_2 domain protein  28.73 
 
 		 762 aa  82.8  0.00000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2850  DEAD_2 domain-containing protein  28.73 
 
 		 753 aa  82.8  0.00000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2524  helicase c2  27.09 
 
 		 755 aa  80.1  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00188741  decreased coverage  0.000000000263353 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3801  helicase c2  28.62 
 
 		 766 aa  80.1  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.354929 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_40695  predicted protein  23.69 
 
 		 749 aa  79.3  0.0000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00000000149445  normal  0.993011 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10414  DNA helicase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G05590)  21.38 
 
 		 841 aa  79  0.0000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1612  putative ATP-dependent helicase  27.29 
 
 		 751 aa  78.2  0.0000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00100383  normal  0.548735 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1403  helicase c2  24.63 
 
 		 757 aa  77.8  0.0000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.127709  hitchhiker  0.000000348035 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2677  helicase c2  22.63 
 
 		 646 aa  77.4  0.0000000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.663694  normal  0.183253 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0909  hypothetical protein  28.24 
 
 		 773 aa  75.9  0.000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.205853  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3766  helicase c2  28.62 
 
 		 806 aa  75.1  0.000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1990  helicase c2  24.79 
 
 		 649 aa  75.1  0.000000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1380  hypothetical protein  23.49 
 
 		 636 aa  72.8  0.00000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.434814  normal  0.350106 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01778  conserved protein with nucleoside triphosphate hydrolase domain  23.49 
 
 		 636 aa  72  0.00000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.548012  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01766  hypothetical protein  23.49 
 
 		 636 aa  72  0.00000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.479225  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2535  hypothetical protein  23.49 
 
 		 636 aa  72  0.00000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.50615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2034  hypothetical protein  23.49 
 
 		 636 aa  72  0.00000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1235  helicase c2  23.64 
 
 		 743 aa  72  0.00000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0895293  normal  0.149585 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2809  helicase c2  22.59 
 
 		 707 aa  72.4  0.00000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2535  helicase C2  24.49 
 
 		 645 aa  72  0.00000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.801549  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1825  helicase c2  23.49 
 
 		 636 aa  72  0.00000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.979985  normal  0.491186 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1896  hypothetical protein  23.49 
 
 		 636 aa  72  0.00000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>