105 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_2975 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013158  Huta_2465  helicase c2  65.62 
 
 		 806 aa  1003    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2975  helicase c2  100 
 
 		 807 aa  1635    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1918  helicase c2  41.71 
 
 		 790 aa  530  1e-149  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.885633  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3766  helicase c2  41.54 
 
 		 806 aa  532  1e-149  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0816  helicase c2  42.24 
 
 		 787 aa  528  1e-148  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.524115 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2627  DEAD_2 domain protein  28.62 
 
 		 723 aa  223  8e-57  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.510755 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1416  DEAD_2 domain protein  28.24 
 
 		 722 aa  201  5e-50  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1376  DNA helicase RepD  24.52 
 
 		 773 aa  201  6e-50  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.905642  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0335  DEAD_2 domain protein  37.46 
 
 		 723 aa  173  9e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1566  Rad3-related DNA helicases  23.42 
 
 		 726 aa  168  2.9999999999999998e-40  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000243015  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1769  DEAD_2 domain protein  36.07 
 
 		 729 aa  165  3e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.863576  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0823  DEAD_2 domain protein  35.43 
 
 		 739 aa  156  1e-36  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1104  queuine tRNA-ribosyltransferase  22.76 
 
 		 676 aa  139  3.0000000000000003e-31  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1672  helicase c2  25.48 
 
 		 739 aa  114  9e-24  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1699  DEAD_2 domain protein  22.73 
 
 		 670 aa  106  2e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0524758  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1117  DEAD_2 domain-containing protein  22.73 
 
 		 712 aa  104  7e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.708962  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0965  helicase c2  22.65 
 
 		 654 aa  100  8e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.228923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_26944  predicted protein  23.25 
 
 		 788 aa  92.4  3e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.168097 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4133  DEAD_2 domain protein  24.47 
 
 		 798 aa  89.7  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA05570  general RNA polymerase II transcription factor, putative  23.7 
 
 		 799 aa  86.3  0.000000000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.946623  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1847  DEAD_2 domain-containing protein  24.87 
 
 		 807 aa  85.1  0.000000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09436  5' to 3' DNA helicase (Eurofung)  21.53 
 
 		 791 aa  84.3  0.000000000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0789  helicase c2  28.81 
 
 		 669 aa  83.6  0.00000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.222881  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4042  DEAD_2 domain protein  27.52 
 
 		 798 aa  71.2  0.00000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_50344  DNA helicase component of transcription factor b  23.74 
 
 		 793 aa  68.2  0.0000000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0289  DEAD_2  23.86 
 
 		 785 aa  67.8  0.0000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00121679  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4835  helicase c2  28.08 
 
 		 874 aa  67.8  0.0000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0589586 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0196  DEAD_2 domain protein  27.74 
 
 		 619 aa  67  0.000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.544403  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2947  DEAD_2 domain protein  24.42 
 
 		 774 aa  66.6  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.443127  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2112  DEAD_2 domain-containing protein  27.53 
 
 		 797 aa  65.5  0.000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0995  DEAD_2 domain protein  23.05 
 
 		 777 aa  65.1  0.000000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_32894  predicted protein  21.92 
 
 		 1067 aa  63.2  0.00000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0780237  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5813  helicase c2  33.14 
 
 		 790 aa  62  0.00000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.208635 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_24915  predicted protein  20.28 
 
 		 791 aa  61.6  0.00000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.615618  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1217  ATP-dependent helicase, putative  21.34 
 
 		 781 aa  60.1  0.0000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.11747  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0390  DEAD_2 domain-containing protein  36.6 
 
 		 580 aa  60.1  0.0000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.12513 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_37445  predicted protein  20.26 
 
 		 938 aa  60.5  0.0000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.258887  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4111  helicase c2  25.16 
 
 		 766 aa  59.7  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.620969 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0660  DEAD_2 domain protein  23.08 
 
 		 790 aa  60.1  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1408  putative ATP-dependent helicase  21.34 
 
 		 781 aa  58.5  0.0000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5827  DEAD_2  27.4 
 
 		 779 aa  55.8  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0224  DEAD_2 domain-containing protein  22.57 
 
 		 852 aa  55.8  0.000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0115724  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2943  DEAD_2 domain-containing protein  31.41 
 
 		 753 aa  55.8  0.000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2839  DEAD_2 domain protein  32.05 
 
 		 762 aa  55.5  0.000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2850  DEAD_2 domain-containing protein  32.05 
 
 		 753 aa  55.5  0.000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1779  helicase c2:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  33.33 
 
 		 641 aa  54.7  0.000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.66637 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0185  helicase c2  23.88 
 
 		 798 aa  54.7  0.000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1357  DEAD_2 domain-containing protein  32.08 
 
 		 575 aa  53.9  0.00001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0243831 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2972  DEAD_2 domain-containing protein  30.52 
 
 		 753 aa  53.5  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.114076 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1156  helicase c2  30.19 
 
 		 649 aa  52.8  0.00003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0984  DEAD_2 domain-containing protein  24.55 
 
 		 773 aa  52.8  0.00003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2483  ATP-dependent DNA helicase DinG  24.8 
 
 		 690 aa  52  0.00005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00204554 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1737  DEAD_2 domain-containing protein  27.72 
 
 		 574 aa  51.6  0.00005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000703978 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1361  helicase c2  26.42 
 
 		 801 aa  51.6  0.00006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_54072  xeroderma pigmentosum group D complementing protein  27.84 
 
 		 782 aa  51.2  0.00008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1498  helicase c2  28.4 
 
 		 773 aa  50.8  0.00009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.486316  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1364  helicase c2  31.33 
 
 		 640 aa  50.8  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1812  DEAD_2 domain-containing protein  27.02 
 
 		 617 aa  50.4  0.0001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0429091  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0909  hypothetical protein  28.57 
 
 		 773 aa  48.9  0.0003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.205853  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5309  DEAD_2 domain-containing protein  33 
 
 		 756 aa  48.9  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.173286  hitchhiker  0.0033003 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1117  DEAD_2 domain-containing protein  30.12 
 
 		 582 aa  48.5  0.0005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3886  ATP-dependent helicase  24.44 
 
 		 647 aa  47.8  0.0007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1030  Rad3-related DNA helicase  21.59 
 
 		 937 aa  48.1  0.0007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0174435  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3224  DNA polymerase III, epsilon subunit  31.78 
 
 		 927 aa  48.1  0.0007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00101103  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1003  DNA polymerase III, epsilon subunit  27.33 
 
 		 960 aa  48.1  0.0007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40350  hypothetical protein  23.69 
 
 		 758 aa  47  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.650358  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_54439  YPL008W (CHL1)-like protein  21.2 
 
 		 835 aa  47.4  0.001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.106037 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3423  hypothetical protein  23.93 
 
 		 758 aa  47.4  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1545  DNA polymerase III, epsilon subunit  30.84 
 
 		 944 aa  47  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.676592  decreased coverage  0.000191845 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1288  DEAD_2 domain protein  22.74 
 
 		 550 aa  46.2  0.002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1550  DNA repair helicase  24.21 
 
 		 745 aa  46.6  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4634  helicase c2  25.45 
 
 		 674 aa  46.6  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0532  helicase c2  28.9 
 
 		 649 aa  46.6  0.002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1899  DNA polymerase III, epsilon subunit  30.83 
 
 		 956 aa  47  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0589249 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_10282  predicted protein  45 
 
 		 614 aa  46.6  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2272  ATP-dependent DNA helicase DinG  21.38 
 
 		 712 aa  45.8  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB05090  CHL1 helicase, putative  21.16 
 
 		 849 aa  45.8  0.003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2454  Uvs006  33.33 
 
 		 746 aa  45.8  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.107257  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1630  Rad3-related DNA helicases-like  33.91 
 
 		 766 aa  45.8  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.138986  normal  0.527518 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2809  helicase c2  24.9 
 
 		 707 aa  45.8  0.003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3801  helicase c2  33.91 
 
 		 766 aa  45.8  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.354929 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1260  putative ATP-dependent helicase  33.33 
 
 		 755 aa  45.8  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0374  primosomal protein N'  32.99 
 
 		 754 aa  45.8  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0607469  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4233  helicase c2  34.65 
 
 		 757 aa  46.2  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.134799  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5966  helicase c2  33.91 
 
 		 766 aa  45.8  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.224812  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2510  helicase c2  25.37 
 
 		 788 aa  45.8  0.003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00268076 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4268  helicase c2  35 
 
 		 766 aa  45.8  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0100597  normal  0.178799 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2806  DEAD_2 domain protein  25.18 
 
 		 785 aa  45.8  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.717048  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10414  DNA helicase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G05590)  20.82 
 
 		 841 aa  45.4  0.004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1536  DEAD_2 domain protein  23.21 
 
 		 537 aa  45.4  0.004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.849616  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2909  DEAD_2  31.13 
 
 		 775 aa  45.4  0.004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0996428 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3978  helicase c2  35 
 
 		 766 aa  45.4  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0904062  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4389  helicase c2  35 
 
 		 766 aa  45.4  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.787433  normal  0.56553 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1186  putative ATP-dependent helicase  33.33 
 
 		 755 aa  45.4  0.004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.146047  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_40695  predicted protein  24.48 
 
 		 749 aa  45.4  0.004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00000000149445  normal  0.993011 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5421  DEAD_2 domain protein  27.95 
 
 		 754 aa  45.1  0.005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1180  hypothetical protein  28.57 
 
 		 754 aa  44.7  0.006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.749053  normal  0.379614 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0620  DEAD_2 domain-containing protein  26.36 
 
 		 634 aa  45.1  0.006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1897  hypothetical protein  26.67 
 
 		 652 aa  44.3  0.008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2690  DEAD_2  25.37 
 
 		 772 aa  44.3  0.008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00215798 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>