98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_2465 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013202  Hmuk_2975  helicase c2  65.62 
 
 		 807 aa  1031    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2465  helicase c2  100 
 
 		 806 aa  1620    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1918  helicase c2  43.47 
 
 		 790 aa  562  1.0000000000000001e-159  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.885633  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0816  helicase c2  43.24 
 
 		 787 aa  550  1e-155  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.524115 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3766  helicase c2  42.39 
 
 		 806 aa  531  1e-149  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2627  DEAD_2 domain protein  27.18 
 
 		 723 aa  216  9.999999999999999e-55  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.510755 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1376  DNA helicase RepD  25.06 
 
 		 773 aa  204  7e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.905642  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1416  DEAD_2 domain protein  28.01 
 
 		 722 aa  186  1.0000000000000001e-45  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0335  DEAD_2 domain protein  39.67 
 
 		 723 aa  180  8e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1769  DEAD_2 domain protein  36.57 
 
 		 729 aa  167  1.0000000000000001e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.863576  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1566  Rad3-related DNA helicases  26.93 
 
 		 726 aa  159  2e-37  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000243015  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0823  DEAD_2 domain protein  35.08 
 
 		 739 aa  145  4e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1672  helicase c2  26.69 
 
 		 739 aa  101  7e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1104  queuine tRNA-ribosyltransferase  27.95 
 
 		 676 aa  92.4  3e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2112  DEAD_2 domain-containing protein  23.47 
 
 		 797 aa  92.4  3e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_50344  DNA helicase component of transcription factor b  22.1 
 
 		 793 aa  92  4e-17  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1117  DEAD_2 domain-containing protein  20.56 
 
 		 712 aa  89.4  2e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.708962  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1847  DEAD_2 domain-containing protein  24.92 
 
 		 807 aa  89  3e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0965  helicase c2  22.15 
 
 		 654 aa  87.4  0.000000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.228923  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1699  DEAD_2 domain protein  23.21 
 
 		 670 aa  85.5  0.000000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0524758  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09436  5' to 3' DNA helicase (Eurofung)  21.47 
 
 		 791 aa  85.1  0.000000000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0789  helicase c2  29.08 
 
 		 669 aa  82.8  0.00000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.222881  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2943  DEAD_2 domain-containing protein  22.62 
 
 		 753 aa  79.3  0.0000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_54072  xeroderma pigmentosum group D complementing protein  21.55 
 
 		 782 aa  76.6  0.000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2972  DEAD_2 domain-containing protein  23.58 
 
 		 753 aa  75.1  0.000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.114076 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4133  DEAD_2 domain protein  30 
 
 		 798 aa  74.7  0.000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1498  helicase c2  24.24 
 
 		 773 aa  72.8  0.00000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.486316  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4042  DEAD_2 domain protein  29.56 
 
 		 798 aa  71.6  0.00000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5827  DEAD_2  27.92 
 
 		 779 aa  71.2  0.00000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2850  DEAD_2 domain-containing protein  24.84 
 
 		 753 aa  70.5  0.0000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2839  DEAD_2 domain protein  24.84 
 
 		 762 aa  70.5  0.0000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2947  DEAD_2 domain protein  26.69 
 
 		 774 aa  70.1  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.443127  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA05570  general RNA polymerase II transcription factor, putative  24.57 
 
 		 799 aa  70.1  0.0000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.946623  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0196  DEAD_2 domain protein  25.29 
 
 		 619 aa  68.6  0.0000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.544403  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0289  DEAD_2  23.3 
 
 		 785 aa  67.4  0.000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00121679  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2510  helicase c2  24.29 
 
 		 788 aa  67.4  0.000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00268076 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4111  helicase c2  26.75 
 
 		 766 aa  66.6  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.620969 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_26944  predicted protein  22.8 
 
 		 788 aa  66.6  0.000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.168097 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0660  DEAD_2 domain protein  24.1 
 
 		 790 aa  65.9  0.000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0224  DEAD_2 domain-containing protein  27.01 
 
 		 852 aa  65.5  0.000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0115724  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4835  helicase c2  27.7 
 
 		 874 aa  63.5  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0589586 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0995  DEAD_2 domain protein  23.51 
 
 		 777 aa  62.8  0.00000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1361  helicase c2  25.44 
 
 		 801 aa  62.4  0.00000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1408  putative ATP-dependent helicase  23.97 
 
 		 781 aa  62  0.00000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0984  DEAD_2 domain-containing protein  23.93 
 
 		 773 aa  59.7  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1217  ATP-dependent helicase, putative  22.86 
 
 		 781 aa  59.7  0.0000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.11747  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40350  hypothetical protein  22.54 
 
 		 758 aa  59.3  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.650358  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3423  hypothetical protein  26.6 
 
 		 758 aa  58.2  0.0000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5813  helicase c2  33.99 
 
 		 790 aa  57.8  0.0000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.208635 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0015  DEAD_2 domain-containing protein  25.09 
 
 		 750 aa  57  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.338089  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2463  hypothetical protein  86.21 
 
 		 45 aa  56.2  0.000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB05090  CHL1 helicase, putative  24.65 
 
 		 849 aa  54.3  0.000009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_24915  predicted protein  23.08 
 
 		 791 aa  53.1  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.615618  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1156  helicase c2  28.16 
 
 		 649 aa  52.8  0.00003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_54439  YPL008W (CHL1)-like protein  21.13 
 
 		 835 aa  52.8  0.00003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.106037 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1132  hypothetical protein  22.15 
 
 		 681 aa  52  0.00005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2428  helicase c2  24.53 
 
 		 855 aa  51.2  0.00007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.376304  normal  0.732574 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1416  helicase c2  23.9 
 
 		 855 aa  51.2  0.00008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1364  helicase c2  30 
 
 		 640 aa  50.8  0.00009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1812  DEAD_2 domain-containing protein  25.27 
 
 		 617 aa  50.8  0.0001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0429091  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2454  Uvs006  25 
 
 		 746 aa  50.4  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.107257  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2806  DEAD_2 domain protein  24.4 
 
 		 785 aa  50.1  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.717048  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1186  putative ATP-dependent helicase  25 
 
 		 755 aa  50.1  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.146047  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0909  hypothetical protein  25.43 
 
 		 773 aa  49.7  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.205853  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1180  hypothetical protein  25.17 
 
 		 754 aa  50.1  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.749053  normal  0.379614 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1260  putative ATP-dependent helicase  25 
 
 		 755 aa  50.1  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0185  helicase c2  25.75 
 
 		 798 aa  48.9  0.0003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_37445  predicted protein  26.7 
 
 		 938 aa  48.9  0.0003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.258887  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3036  hypothetical protein  24.54 
 
 		 761 aa  48.9  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0104594  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_32894  predicted protein  30.51 
 
 		 1067 aa  48.9  0.0003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0780237  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3978  helicase c2  25.27 
 
 		 766 aa  49.3  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0904062  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4389  helicase c2  25.27 
 
 		 766 aa  49.3  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.787433  normal  0.56553 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4268  helicase c2  25.65 
 
 		 766 aa  48.5  0.0004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0100597  normal  0.178799 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1357  DEAD_2 domain-containing protein  31.48 
 
 		 575 aa  48.9  0.0004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0243831 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2690  DEAD_2  23.6 
 
 		 772 aa  48.9  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00215798 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3801  helicase c2  26.02 
 
 		 766 aa  48.9  0.0004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.354929 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10414  DNA helicase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G05590)  27.34 
 
 		 841 aa  48.5  0.0005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_40695  predicted protein  26.8 
 
 		 749 aa  48.5  0.0005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00000000149445  normal  0.993011 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1249  ATP-dependent DNA helicase DinG  25.19 
 
 		 691 aa  48.5  0.0005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000153763 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5309  DEAD_2 domain-containing protein  24.1 
 
 		 756 aa  48.5  0.0005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.173286  hitchhiker  0.0033003 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5966  helicase c2  25.99 
 
 		 766 aa  48.1  0.0006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.224812  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1630  Rad3-related DNA helicases-like  25.99 
 
 		 766 aa  47.8  0.0007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.138986  normal  0.527518 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2909  DEAD_2  23.67 
 
 		 775 aa  47.8  0.0008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0996428 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2515  helicase c2  33.33 
 
 		 917 aa  47.8  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4233  helicase c2  26.06 
 
 		 757 aa  47  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.134799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0928  ATP-dependent helicase, putative  24.05 
 
 		 495 aa  46.6  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.568065  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2483  ATP-dependent DNA helicase DinG  24.19 
 
 		 690 aa  46.2  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00204554 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0390  DEAD_2 domain-containing protein  26.28 
 
 		 580 aa  46.2  0.002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.12513 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0620  DEAD_2 domain-containing protein  23.93 
 
 		 634 aa  47  0.002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1652  ATP-dependent DNA helicase DinG  22.39 
 
 		 690 aa  45.8  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.303868 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1618  ATP-dependent DNA helicase DinG  22.39 
 
 		 690 aa  45.8  0.003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.326155  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1629  ATP-dependent DNA helicase DinG  22.39 
 
 		 690 aa  45.8  0.003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.117477  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5421  DEAD_2 domain protein  24.16 
 
 		 754 aa  46.2  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2725  ATP-dependent DNA helicase DinG  22.39 
 
 		 690 aa  45.8  0.003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0300555  hitchhiker  0.000425027 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1550  DNA repair helicase  30.14 
 
 		 745 aa  45.4  0.004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1376  DNA repair helicase, truncation  24.05 
 
 		 431 aa  45.8  0.004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.731908  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1737  DEAD_2 domain-containing protein  28.79 
 
 		 574 aa  44.7  0.006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000703978 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0532  helicase c2  29.71 
 
 		 649 aa  44.3  0.01  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>