202 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_1416 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_2839  DEAD_2 domain protein  50.89 
 
 		 762 aa  769    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3036  hypothetical protein  48.13 
 
 		 761 aa  751    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0104594  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4268  helicase c2  53.27 
 
 		 766 aa  806    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0100597  normal  0.178799 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2909  DEAD_2  49.65 
 
 		 775 aa  775    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0996428 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5827  DEAD_2  48.89 
 
 		 779 aa  764    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1416  helicase c2  100 
 
 		 855 aa  1710    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5309  DEAD_2 domain-containing protein  54.36 
 
 		 756 aa  870    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.173286  hitchhiker  0.0033003 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2454  Uvs006  55.53 
 
 		 746 aa  798    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.107257  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2690  DEAD_2  49.47 
 
 		 772 aa  792    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00215798 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1630  Rad3-related DNA helicases-like  53.74 
 
 		 766 aa  818    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.138986  normal  0.527518 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4233  helicase c2  54.18 
 
 		 757 aa  816    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.134799  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2943  DEAD_2 domain-containing protein  49.7 
 
 		 753 aa  764    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1550  DNA repair helicase  54.58 
 
 		 745 aa  823    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5966  helicase c2  53.5 
 
 		 766 aa  808    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.224812  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5421  DEAD_2 domain protein  53.65 
 
 		 754 aa  840    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1361  helicase c2  49.36 
 
 		 801 aa  778    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2510  helicase c2  50.75 
 
 		 788 aa  780    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00268076 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1180  hypothetical protein  53.95 
 
 		 754 aa  847    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.749053  normal  0.379614 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5813  helicase c2  61.08 
 
 		 790 aa  920    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.208635 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1498  helicase c2  48.59 
 
 		 773 aa  732    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.486316  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2972  DEAD_2 domain-containing protein  50.89 
 
 		 753 aa  786    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.114076 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3978  helicase c2  52.92 
 
 		 766 aa  800    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0904062  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3801  helicase c2  53.15 
 
 		 766 aa  803    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.354929 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40350  hypothetical protein  51.18 
 
 		 758 aa  764    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.650358  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3423  hypothetical protein  51.12 
 
 		 758 aa  764    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4389  helicase c2  52.92 
 
 		 766 aa  800    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.787433  normal  0.56553 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2850  DEAD_2 domain-containing protein  50.77 
 
 		 753 aa  768    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2806  DEAD_2 domain protein  48.88 
 
 		 785 aa  730    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.717048  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0015  DEAD_2 domain-containing protein  43.77 
 
 		 750 aa  650    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.338089  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0185  helicase c2  51.83 
 
 		 798 aa  759    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0984  DEAD_2 domain-containing protein  51.87 
 
 		 773 aa  808    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2428  helicase c2  96.02 
 
 		 855 aa  1565    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.376304  normal  0.732574 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0909  hypothetical protein  51.76 
 
 		 773 aa  748    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.205853  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1260  putative ATP-dependent helicase  55.78 
 
 		 755 aa  809    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1186  putative ATP-dependent helicase  55.9 
 
 		 755 aa  809    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.146047  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4111  helicase c2  50.12 
 
 		 766 aa  764    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.620969 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0928  ATP-dependent helicase, putative  57.39 
 
 		 495 aa  546  1e-154  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.568065  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1376  DNA repair helicase, truncation  56.34 
 
 		 431 aa  496  1e-139  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.731908  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2947  DEAD_2 domain protein  33.1 
 
 		 774 aa  439  1e-121  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.443127  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0289  DEAD_2  29.56 
 
 		 785 aa  399  1e-109  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00121679  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0660  DEAD_2 domain protein  28.37 
 
 		 790 aa  396  1e-108  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0995  DEAD_2 domain protein  27.17 
 
 		 777 aa  390  1e-107  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1217  ATP-dependent helicase, putative  27.63 
 
 		 781 aa  391  1e-107  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.11747  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1408  putative ATP-dependent helicase  27.63 
 
 		 781 aa  388  1e-106  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0224  DEAD_2 domain-containing protein  26.77 
 
 		 852 aa  274  4.0000000000000004e-72  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0115724  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4042  DEAD_2 domain protein  27.97 
 
 		 798 aa  226  1e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4133  DEAD_2 domain protein  27.89 
 
 		 798 aa  221  3.9999999999999997e-56  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1847  DEAD_2 domain-containing protein  27.51 
 
 		 807 aa  218  4e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2112  DEAD_2 domain-containing protein  25.79 
 
 		 797 aa  201  7e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1104  queuine tRNA-ribosyltransferase  24.72 
 
 		 676 aa  137  9.999999999999999e-31  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4835  helicase c2  36.65 
 
 		 874 aa  132  2.0000000000000002e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0589586 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0789  helicase c2  25.39 
 
 		 669 aa  124  7e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.222881  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1672  helicase c2  24.41 
 
 		 739 aa  118  3.9999999999999997e-25  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0965  helicase c2  25.05 
 
 		 654 aa  118  5e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.228923  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1699  DEAD_2 domain protein  26.72 
 
 		 670 aa  114  6e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0524758  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1117  DEAD_2 domain-containing protein  25.42 
 
 		 712 aa  111  5e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.708962  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1376  DNA helicase RepD  30.43 
 
 		 773 aa  96.7  2e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.905642  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0478  DEAD_2 domain-containing protein  25.34 
 
 		 588 aa  95.9  3e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.738253  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0196  DEAD_2 domain protein  28.31 
 
 		 619 aa  92  4e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.544403  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1812  DEAD_2 domain-containing protein  27.24 
 
 		 617 aa  91.7  5e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0429091  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0816  helicase c2  24.28 
 
 		 787 aa  82  0.00000000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.524115 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1918  helicase c2  28.79 
 
 		 790 aa  80.5  0.0000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.885633  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1566  Rad3-related DNA helicases  27.56 
 
 		 726 aa  79  0.0000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000243015  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1416  DEAD_2 domain protein  23.28 
 
 		 722 aa  77.4  0.000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1769  DEAD_2 domain protein  22.67 
 
 		 729 aa  72.4  0.00000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.863576  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3766  helicase c2  36.42 
 
 		 806 aa  71.6  0.00000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA05570  general RNA polymerase II transcription factor, putative  22.32 
 
 		 799 aa  68.2  0.0000000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.946623  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2627  DEAD_2 domain protein  23.14 
 
 		 723 aa  67.4  0.000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.510755 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1117  DEAD_2 domain-containing protein  23.94 
 
 		 582 aa  65.9  0.000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_40695  predicted protein  22.48 
 
 		 749 aa  64.7  0.000000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00000000149445  normal  0.993011 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0335  DEAD_2 domain protein  28.12 
 
 		 723 aa  64.3  0.000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1737  DEAD_2 domain-containing protein  22.46 
 
 		 574 aa  63.9  0.00000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000703978 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_54072  xeroderma pigmentosum group D complementing protein  22.58 
 
 		 782 aa  62.4  0.00000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0620  DEAD_2 domain-containing protein  22.27 
 
 		 634 aa  60.1  0.0000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_54439  YPL008W (CHL1)-like protein  18.66 
 
 		 835 aa  59.7  0.0000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.106037 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_26944  predicted protein  24.9 
 
 		 788 aa  59.3  0.0000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.168097 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_37445  predicted protein  20.06 
 
 		 938 aa  58.5  0.0000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.258887  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2118  ATP-dependent DNA helicase DinG  25.78 
 
 		 707 aa  57  0.000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.149773  hitchhiker  0.000000714427 
 
 
-
 
NC_006684  CNB05090  CHL1 helicase, putative  24.14 
 
 		 849 aa  56.6  0.000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3086  ATP-dependent DNA helicase DinG  20.95 
 
 		 692 aa  56.2  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.175143  hitchhiker  0.0000411022 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1453  helicase c2  34.55 
 
 		 669 aa  56.2  0.000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0371  DNA repair helicase RAD3  34.55 
 
 		 669 aa  56.6  0.000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0466  helicase c2  33.64 
 
 		 669 aa  56.2  0.000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2465  helicase c2  23.9 
 
 		 806 aa  55.8  0.000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0979  helicase domain-containing protein  25.12 
 
 		 706 aa  55.1  0.000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0544879  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4290  ATP-dependent DNA helicase DinG  28.97 
 
 		 714 aa  54.7  0.000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0823  DEAD_2 domain protein  25.55 
 
 		 739 aa  54.7  0.000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0995  ATP-dependent DNA helicase DinG  30.87 
 
 		 708 aa  54.3  0.000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.196461  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2515  helicase c2  29.8 
 
 		 917 aa  54.3  0.000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2877  helicase c2  28.97 
 
 		 658 aa  53.9  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.679539 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19450  ATP-dependent DNA helicase DinG  28.83 
 
 		 714 aa  53.9  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2535  helicase C2  25.77 
 
 		 645 aa  54.3  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.801549  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0534  helicase c2  35.71 
 
 		 669 aa  53.5  0.00001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1125  ATP-dependent DNA helicase DinG  28.97 
 
 		 714 aa  53.1  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.437588  hitchhiker  0.0000838668 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2272  ATP-dependent DNA helicase DinG  29.24 
 
 		 712 aa  53.5  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2381  ATP-dependent DNA helicase DinG  34.69 
 
 		 720 aa  53.1  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00980399 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1161  ATP-dependent DNA helicase DinG  28.97 
 
 		 714 aa  53.1  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.665209  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1146  ATP-dependent DNA helicase DinG  28.97 
 
 		 714 aa  53.1  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.980909  normal  0.730569 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3747  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  23.53 
 
 		 934 aa  53.5  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.739451  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1867  DEAD_2 domain-containing protein  23.9 
 
 		 541 aa  52.8  0.00003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.512598 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>