254 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_1117 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_1117  DEAD_2 domain-containing protein  100 
 
 		 712 aa  1473    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.708962  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0965  helicase c2  51.99 
 
 		 654 aa  731    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.228923  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1699  DEAD_2 domain protein  60 
 
 		 670 aa  850    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0524758  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1104  queuine tRNA-ribosyltransferase  56.04 
 
 		 676 aa  794    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0789  helicase c2  61.14 
 
 		 669 aa  886    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.222881  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1672  helicase c2  33.19 
 
 		 739 aa  325  2e-87  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1812  DEAD_2 domain-containing protein  25.77 
 
 		 617 aa  166  1.0000000000000001e-39  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0429091  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1217  ATP-dependent helicase, putative  25 
 
 		 781 aa  164  4.0000000000000004e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.11747  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0196  DEAD_2 domain protein  24.61 
 
 		 619 aa  163  1e-38  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.544403  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1408  putative ATP-dependent helicase  24.89 
 
 		 781 aa  157  7e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1416  DEAD_2 domain protein  23.84 
 
 		 722 aa  151  5e-35  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0289  DEAD_2  26.34 
 
 		 785 aa  150  6e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00121679  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2112  DEAD_2 domain-containing protein  26.34 
 
 		 797 aa  146  1e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1847  DEAD_2 domain-containing protein  28.78 
 
 		 807 aa  144  6e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2947  DEAD_2 domain protein  27.66 
 
 		 774 aa  144  7e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.443127  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0224  DEAD_2 domain-containing protein  26.77 
 
 		 852 aa  138  4e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0115724  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0823  DEAD_2 domain protein  24.35 
 
 		 739 aa  137  7.000000000000001e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2627  DEAD_2 domain protein  22.25 
 
 		 723 aa  134  6e-30  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.510755 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4042  DEAD_2 domain protein  28.41 
 
 		 798 aa  133  1.0000000000000001e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1566  Rad3-related DNA helicases  23.84 
 
 		 726 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000243015  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4133  DEAD_2 domain protein  27.71 
 
 		 798 aa  131  5.0000000000000004e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0660  DEAD_2 domain protein  24.61 
 
 		 790 aa  130  1.0000000000000001e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5827  DEAD_2  28.6 
 
 		 779 aa  127  6e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09436  5' to 3' DNA helicase (Eurofung)  22.82 
 
 		 791 aa  127  9e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0335  DEAD_2 domain protein  22.15 
 
 		 723 aa  123  9.999999999999999e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2690  DEAD_2  26.1 
 
 		 772 aa  122  3e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00215798 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_50344  DNA helicase component of transcription factor b  22.55 
 
 		 793 aa  122  3e-26  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0015  DEAD_2 domain-containing protein  24.85 
 
 		 750 aa  121  3.9999999999999996e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.338089  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0995  DEAD_2 domain protein  24.53 
 
 		 777 aa  121  4.9999999999999996e-26  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1498  helicase c2  24 
 
 		 773 aa  119  3e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.486316  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2454  Uvs006  26.46 
 
 		 746 aa  118  3.9999999999999997e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.107257  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0984  DEAD_2 domain-containing protein  24.28 
 
 		 773 aa  118  5e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1186  putative ATP-dependent helicase  26.46 
 
 		 755 aa  117  5e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.146047  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1260  putative ATP-dependent helicase  26.46 
 
 		 755 aa  117  6e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1769  DEAD_2 domain protein  22.95 
 
 		 729 aa  115  2.0000000000000002e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.863576  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5421  DEAD_2 domain protein  23.62 
 
 		 754 aa  116  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4835  helicase c2  26.97 
 
 		 874 aa  115  2.0000000000000002e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0589586 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0390  DEAD_2 domain-containing protein  22.93 
 
 		 580 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.12513 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_26944  predicted protein  23.09 
 
 		 788 aa  114  4.0000000000000004e-24  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.168097 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5309  DEAD_2 domain-containing protein  24.12 
 
 		 756 aa  115  4.0000000000000004e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.173286  hitchhiker  0.0033003 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2806  DEAD_2 domain protein  22.47 
 
 		 785 aa  114  6e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.717048  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4111  helicase c2  26.46 
 
 		 766 aa  114  8.000000000000001e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.620969 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0928  ATP-dependent helicase, putative  26.25 
 
 		 495 aa  113  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.568065  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0185  helicase c2  26.16 
 
 		 798 aa  112  2.0000000000000002e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1550  DNA repair helicase  25.98 
 
 		 745 aa  112  3e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2909  DEAD_2  25.22 
 
 		 775 aa  110  8.000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0996428 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2839  DEAD_2 domain protein  26.29 
 
 		 762 aa  110  1e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2943  DEAD_2 domain-containing protein  25.83 
 
 		 753 aa  110  1e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3423  hypothetical protein  23.82 
 
 		 758 aa  110  1e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5813  helicase c2  25.32 
 
 		 790 aa  110  1e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.208635 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1416  helicase c2  24.74 
 
 		 855 aa  109  2e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1376  DNA repair helicase, truncation  26.09 
 
 		 431 aa  109  2e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.731908  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2850  DEAD_2 domain-containing protein  26.58 
 
 		 753 aa  109  2e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1180  hypothetical protein  23.67 
 
 		 754 aa  109  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.749053  normal  0.379614 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2428  helicase c2  25.26 
 
 		 855 aa  109  2e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.376304  normal  0.732574 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3036  hypothetical protein  25.05 
 
 		 761 aa  108  5e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0104594  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40350  hypothetical protein  23.26 
 
 		 758 aa  107  5e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.650358  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA05570  general RNA polymerase II transcription factor, putative  22.8 
 
 		 799 aa  107  7e-22  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.946623  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2510  helicase c2  26.11 
 
 		 788 aa  107  8e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00268076 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3801  helicase c2  24.26 
 
 		 766 aa  107  8e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.354929 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_54439  YPL008W (CHL1)-like protein  20.94 
 
 		 835 aa  105  2e-21  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.106037 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0478  DEAD_2 domain-containing protein  23.73 
 
 		 588 aa  105  4e-21  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.738253  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1361  helicase c2  24.03 
 
 		 801 aa  103  1e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0909  hypothetical protein  25.64 
 
 		 773 aa  100  7e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.205853  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2972  DEAD_2 domain-containing protein  24.84 
 
 		 753 aa  99.8  1e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.114076 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_37445  predicted protein  22.47 
 
 		 938 aa  97.4  7e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.258887  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB05090  CHL1 helicase, putative  22.51 
 
 		 849 aa  95.9  2e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1918  helicase c2  28.72 
 
 		 790 aa  95.1  4e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.885633  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1357  DEAD_2 domain-containing protein  22.56 
 
 		 575 aa  94.7  6e-18  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0243831 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4268  helicase c2  29.07 
 
 		 766 aa  92  3e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0100597  normal  0.178799 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2975  helicase c2  24.29 
 
 		 807 aa  91.3  6e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1630  Rad3-related DNA helicases-like  28.29 
 
 		 766 aa  90.5  9e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.138986  normal  0.527518 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1288  DEAD_2 domain protein  22.51 
 
 		 550 aa  90.1  1e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5966  helicase c2  27.73 
 
 		 766 aa  90.1  1e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.224812  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4233  helicase c2  27.73 
 
 		 757 aa  90.5  1e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.134799  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1737  DEAD_2 domain-containing protein  22.86 
 
 		 574 aa  88.6  4e-16  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000703978 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3978  helicase c2  27.52 
 
 		 766 aa  87.8  6e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0904062  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4389  helicase c2  27.52 
 
 		 766 aa  87.8  6e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.787433  normal  0.56553 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1117  DEAD_2 domain-containing protein  23.57 
 
 		 582 aa  86.7  0.000000000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_24915  predicted protein  20.99 
 
 		 791 aa  82.4  0.00000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.615618  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0620  DEAD_2 domain-containing protein  21.67 
 
 		 634 aa  81.6  0.00000000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3766  helicase c2  25.74 
 
 		 806 aa  80.9  0.00000000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0816  helicase c2  26.69 
 
 		 787 aa  80.1  0.0000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.524115 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_10282  predicted protein  21.15 
 
 		 614 aa  79.3  0.0000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01557  ATP-dependent DNA helicase DinG  23.82 
 
 		 691 aa  78.6  0.0000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1990  helicase c2  25.81 
 
 		 649 aa  78.2  0.0000000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_54072  xeroderma pigmentosum group D complementing protein  25.17 
 
 		 782 aa  76.6  0.000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1867  DEAD_2 domain-containing protein  23.14 
 
 		 541 aa  75.1  0.000000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.512598 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_40695  predicted protein  26.14 
 
 		 749 aa  75.1  0.000000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00000000149445  normal  0.993011 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2068  hypothetical protein  25.7 
 
 		 636 aa  73.6  0.00000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2809  helicase c2  23.04 
 
 		 707 aa  72.4  0.00000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1859  helicase c2  23.13 
 
 		 674 aa  73.2  0.00000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.347581  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10414  DNA helicase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G05590)  20.58 
 
 		 841 aa  72  0.00000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1295  helicase c2  22.73 
 
 		 664 aa  72  0.00000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2172  helicase c2  23.13 
 
 		 659 aa  72.4  0.00000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2034  hypothetical protein  25.49 
 
 		 636 aa  71.6  0.00000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1896  hypothetical protein  25.49 
 
 		 636 aa  71.6  0.00000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1805  helicase c2  23.13 
 
 		 659 aa  71.6  0.00000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2535  hypothetical protein  25.49 
 
 		 636 aa  71.6  0.00000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.50615  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01766  hypothetical protein  25.49 
 
 		 636 aa  71.6  0.00000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.479225  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>