299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_1566 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A1376  DNA helicase RepD  56.45 
 
 		 773 aa  882    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.905642  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1566  Rad3-related DNA helicases  100 
 
 		 726 aa  1506    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000243015  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0335  DEAD_2 domain protein  41.7 
 
 		 723 aa  601  1e-170  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0823  DEAD_2 domain protein  41.52 
 
 		 739 aa  588  1e-166  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1769  DEAD_2 domain protein  40.41 
 
 		 729 aa  578  1e-164  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.863576  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1416  DEAD_2 domain protein  39.95 
 
 		 722 aa  566  1e-160  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2627  DEAD_2 domain protein  40.87 
 
 		 723 aa  565  1.0000000000000001e-159  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.510755 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0816  helicase c2  26.44 
 
 		 787 aa  192  2e-47  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.524115 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1918  helicase c2  25.25 
 
 		 790 aa  187  6e-46  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.885633  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3766  helicase c2  24.91 
 
 		 806 aa  163  9e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2465  helicase c2  26.77 
 
 		 806 aa  153  1e-35  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1104  queuine tRNA-ribosyltransferase  23.25 
 
 		 676 aa  147  7.0000000000000006e-34  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2975  helicase c2  24.57 
 
 		 807 aa  145  3e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0965  helicase c2  23.86 
 
 		 654 aa  141  3e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.228923  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1672  helicase c2  24.22 
 
 		 739 aa  133  1.0000000000000001e-29  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1117  DEAD_2 domain-containing protein  23.84 
 
 		 712 aa  132  2.0000000000000002e-29  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.708962  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1699  DEAD_2 domain protein  23.79 
 
 		 670 aa  127  6e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0524758  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0196  DEAD_2 domain protein  23.83 
 
 		 619 aa  127  9e-28  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.544403  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1408  putative ATP-dependent helicase  24.12 
 
 		 781 aa  116  1.0000000000000001e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2947  DEAD_2 domain protein  23.62 
 
 		 774 aa  112  2.0000000000000002e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.443127  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1217  ATP-dependent helicase, putative  24.04 
 
 		 781 aa  110  1e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.11747  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0789  helicase c2  22.3 
 
 		 669 aa  108  3e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.222881  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0995  DEAD_2 domain protein  21.96 
 
 		 777 aa  98.6  4e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2806  DEAD_2 domain protein  23.05 
 
 		 785 aa  97.4  7e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.717048  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09436  5' to 3' DNA helicase (Eurofung)  24 
 
 		 791 aa  94  9e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_54072  xeroderma pigmentosum group D complementing protein  23.49 
 
 		 782 aa  92.8  2e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1265  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  22.81 
 
 		 929 aa  93.2  2e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00466144  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1847  DEAD_2 domain-containing protein  21.27 
 
 		 807 aa  92.4  2e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4042  DEAD_2 domain protein  23.46 
 
 		 798 aa  90.5  1e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0185  helicase c2  21.02 
 
 		 798 aa  89.4  2e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0528  helicase c2  23.11 
 
 		 667 aa  87.8  6e-16  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2454  Uvs006  26.34 
 
 		 746 aa  87  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.107257  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1260  putative ATP-dependent helicase  26.34 
 
 		 755 aa  87  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1550  DNA repair helicase  21.93 
 
 		 745 aa  87  0.000000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1186  putative ATP-dependent helicase  26.34 
 
 		 755 aa  87  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.146047  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4233  helicase c2  28 
 
 		 757 aa  86.7  0.000000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.134799  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0224  DEAD_2 domain-containing protein  27.85 
 
 		 852 aa  85.5  0.000000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0115724  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1630  Rad3-related DNA helicases-like  28 
 
 		 766 aa  85.5  0.000000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.138986  normal  0.527518 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0289  DEAD_2  28.11 
 
 		 785 aa  85.1  0.000000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00121679  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5966  helicase c2  28 
 
 		 766 aa  85.1  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.224812  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2943  DEAD_2 domain-containing protein  27.24 
 
 		 753 aa  85.1  0.000000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0660  DEAD_2 domain protein  25.95 
 
 		 790 aa  84.7  0.000000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2909  DEAD_2  20.57 
 
 		 775 aa  84.3  0.000000000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0996428 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5421  DEAD_2 domain protein  21.01 
 
 		 754 aa  84.3  0.000000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2839  DEAD_2 domain protein  27.39 
 
 		 762 aa  84  0.00000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1376  DNA repair helicase, truncation  22.57 
 
 		 431 aa  83.6  0.00000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.731908  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2850  DEAD_2 domain-containing protein  27.39 
 
 		 753 aa  83.6  0.00000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3978  helicase c2  27.6 
 
 		 766 aa  83.6  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0904062  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4389  helicase c2  27.6 
 
 		 766 aa  83.6  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.787433  normal  0.56553 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0928  ATP-dependent helicase, putative  25.93 
 
 		 495 aa  83.6  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.568065  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2112  DEAD_2 domain-containing protein  26.59 
 
 		 797 aa  83.2  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1942  helicase c2  22.69 
 
 		 832 aa  83.2  0.00000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.357662  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4268  helicase c2  27.2 
 
 		 766 aa  82.4  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0100597  normal  0.178799 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3801  helicase c2  27.62 
 
 		 766 aa  83.2  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.354929 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1347  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  23.28 
 
 		 957 aa  81.6  0.00000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.579486 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0984  DEAD_2 domain-containing protein  21.15 
 
 		 773 aa  81.6  0.00000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5309  DEAD_2 domain-containing protein  22.78 
 
 		 756 aa  81.3  0.00000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.173286  hitchhiker  0.0033003 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_37445  predicted protein  23.63 
 
 		 938 aa  81.3  0.00000000000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.258887  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5827  DEAD_2  21.25 
 
 		 779 aa  80.5  0.0000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2972  DEAD_2 domain-containing protein  25.93 
 
 		 753 aa  80.1  0.0000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.114076 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1812  DEAD_2 domain-containing protein  22.6 
 
 		 617 aa  79.7  0.0000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0429091  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1416  helicase c2  27.68 
 
 		 855 aa  78.6  0.0000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2690  DEAD_2  20.68 
 
 		 772 aa  78.6  0.0000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00215798 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1498  helicase c2  21.59 
 
 		 773 aa  78.6  0.0000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.486316  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2428  helicase c2  27.68 
 
 		 855 aa  78.6  0.0000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.376304  normal  0.732574 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3036  hypothetical protein  24.05 
 
 		 761 aa  78.2  0.0000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0104594  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4133  DEAD_2 domain protein  25.79 
 
 		 798 aa  77.8  0.0000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0911  putative ATP-dependent helicase  22.03 
 
 		 651 aa  75.1  0.000000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1180  hypothetical protein  20.4 
 
 		 754 aa  75.1  0.000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.749053  normal  0.379614 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1737  DEAD_2 domain-containing protein  21.54 
 
 		 574 aa  75.1  0.000000000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000703978 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0620  DEAD_2 domain-containing protein  23.06 
 
 		 634 aa  74.3  0.000000000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1129  ATP-dependent DNA helicase DinG  24.71 
 
 		 694 aa  74.3  0.000000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0640459  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1361  helicase c2  25.52 
 
 		 801 aa  73.2  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5813  helicase c2  26.01 
 
 		 790 aa  73.2  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.208635 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2510  helicase c2  25 
 
 		 788 aa  72.4  0.00000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00268076 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01557  ATP-dependent DNA helicase DinG  22.35 
 
 		 691 aa  71.6  0.00000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0015  DEAD_2 domain-containing protein  23.44 
 
 		 750 aa  71.2  0.00000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.338089  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_50344  DNA helicase component of transcription factor b  27.82 
 
 		 793 aa  70.9  0.00000000008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1409  helicase c2  23.2 
 
 		 651 aa  70.5  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1727  helicase c2  19.89 
 
 		 641 aa  70.1  0.0000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_14100  exonuclease, DNA polymerase III, epsilon subunit family  25 
 
 		 1043 aa  69.7  0.0000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_37740  predicted protein  26.97 
 
 		 849 aa  69.3  0.0000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.689797  normal  0.0804873 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004095  DinG family ATP-dependent helicase YoaA  22.18 
 
 		 646 aa  69.3  0.0000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2527  helicase c2  23.19 
 
 		 653 aa  68.9  0.0000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0816709  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23060  DNA helicase, Rad3  21.6 
 
 		 692 aa  69.3  0.0000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0774743 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_32894  predicted protein  29.11 
 
 		 1067 aa  68.2  0.0000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0780237  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4111  helicase c2  23.26 
 
 		 766 aa  68.2  0.0000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.620969 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0909  hypothetical protein  24.8 
 
 		 773 aa  67.8  0.0000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.205853  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4334  ATP-dependent DNA helicase DinG  20 
 
 		 714 aa  67.4  0.0000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.044641  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01131  ATP-dependent helicase  21.11 
 
 		 639 aa  67.4  0.0000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.625206  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA05570  general RNA polymerase II transcription factor, putative  26.12 
 
 		 799 aa  67  0.000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.946623  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3856  ATP-dependent DNA helicase DinG  20 
 
 		 714 aa  67  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.160495  normal  0.793215 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1412  helicase c2  21.77 
 
 		 658 aa  67  0.000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.102914  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50840  ATP-dependent DNA helicase DinG  20 
 
 		 714 aa  66.6  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00144938 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4120  ATP-dependent helicase, DinG family  19.86 
 
 		 714 aa  66.2  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1225  ATP-dependent DNA helicase DinG  20.28 
 
 		 714 aa  66.6  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1902  helicase c2  22.48 
 
 		 646 aa  65.5  0.000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40350  hypothetical protein  25.56 
 
 		 758 aa  65.5  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.650358  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1467  helicase c2  21.58 
 
 		 690 aa  65.5  0.000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0659778  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4122  helicase c2  22.21 
 
 		 843 aa  65.5  0.000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000977416  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>