267 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_2806 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_2839  DEAD_2 domain protein  52.68 
 
 		 762 aa  763    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2943  DEAD_2 domain-containing protein  52.14 
 
 		 753 aa  771    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4268  helicase c2  57.42 
 
 		 766 aa  832    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0100597  normal  0.178799 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3423  hypothetical protein  55.42 
 
 		 758 aa  797    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2850  DEAD_2 domain-containing protein  52.95 
 
 		 753 aa  769    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3036  hypothetical protein  52.79 
 
 		 761 aa  809    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0104594  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5421  DEAD_2 domain protein  56.75 
 
 		 754 aa  854    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2909  DEAD_2  53.46 
 
 		 775 aa  828    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0996428 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5309  DEAD_2 domain-containing protein  56.48 
 
 		 756 aa  847    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.173286  hitchhiker  0.0033003 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4233  helicase c2  57.28 
 
 		 757 aa  827    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.134799  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5827  DEAD_2  54.68 
 
 		 779 aa  822    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2454  Uvs006  57.72 
 
 		 746 aa  790    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.107257  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2690  DEAD_2  53.01 
 
 		 772 aa  820    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00215798 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5813  helicase c2  52.05 
 
 		 790 aa  725    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.208635 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1630  Rad3-related DNA helicases-like  56.64 
 
 		 766 aa  828    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.138986  normal  0.527518 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1550  DNA repair helicase  58.47 
 
 		 745 aa  826    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1416  helicase c2  49 
 
 		 855 aa  734    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5966  helicase c2  56.64 
 
 		 766 aa  818    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.224812  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2510  helicase c2  52.73 
 
 		 788 aa  784    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00268076 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1361  helicase c2  54.56 
 
 		 801 aa  822    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1260  putative ATP-dependent helicase  57.87 
 
 		 755 aa  799    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1180  hypothetical protein  56.13 
 
 		 754 aa  847    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.749053  normal  0.379614 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0909  hypothetical protein  55.76 
 
 		 773 aa  781    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.205853  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1498  helicase c2  52.74 
 
 		 773 aa  744    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.486316  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4111  helicase c2  53.28 
 
 		 766 aa  790    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.620969 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3978  helicase c2  56.5 
 
 		 766 aa  817    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0904062  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2972  DEAD_2 domain-containing protein  53.94 
 
 		 753 aa  808    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.114076 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1186  putative ATP-dependent helicase  57.73 
 
 		 755 aa  795    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.146047  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3801  helicase c2  57.03 
 
 		 766 aa  826    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.354929 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40350  hypothetical protein  55.81 
 
 		 758 aa  798    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.650358  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4389  helicase c2  56.5 
 
 		 766 aa  817    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.787433  normal  0.56553 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2806  DEAD_2 domain protein  100 
 
 		 785 aa  1594    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.717048  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0015  DEAD_2 domain-containing protein  47.54 
 
 		 750 aa  674    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.338089  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0185  helicase c2  54.64 
 
 		 798 aa  780    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0984  DEAD_2 domain-containing protein  53.94 
 
 		 773 aa  807    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2428  helicase c2  48.77 
 
 		 855 aa  728    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.376304  normal  0.732574 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0928  ATP-dependent helicase, putative  56.42 
 
 		 495 aa  519  1.0000000000000001e-145  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.568065  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1376  DNA repair helicase, truncation  54.88 
 
 		 431 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.731908  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2947  DEAD_2 domain protein  35.82 
 
 		 774 aa  455  1.0000000000000001e-126  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.443127  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0660  DEAD_2 domain protein  34.04 
 
 		 790 aa  446  1.0000000000000001e-124  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0995  DEAD_2 domain protein  30.42 
 
 		 777 aa  421  1e-116  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0289  DEAD_2  33.99 
 
 		 785 aa  413  1e-114  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00121679  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1408  putative ATP-dependent helicase  30.82 
 
 		 781 aa  409  1.0000000000000001e-112  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1217  ATP-dependent helicase, putative  30.3 
 
 		 781 aa  404  1e-111  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.11747  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0224  DEAD_2 domain-containing protein  31.44 
 
 		 852 aa  338  2.9999999999999997e-91  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0115724  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2112  DEAD_2 domain-containing protein  29.2 
 
 		 797 aa  258  4e-67  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4133  DEAD_2 domain protein  28.71 
 
 		 798 aa  251  3e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4042  DEAD_2 domain protein  27.79 
 
 		 798 aa  249  1e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1847  DEAD_2 domain-containing protein  29.63 
 
 		 807 aa  245  3e-63  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1104  queuine tRNA-ribosyltransferase  26.27 
 
 		 676 aa  142  3e-32  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0789  helicase c2  24.66 
 
 		 669 aa  137  5e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.222881  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1672  helicase c2  26.29 
 
 		 739 aa  132  3e-29  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1699  DEAD_2 domain protein  23.87 
 
 		 670 aa  128  5e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0524758  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1812  DEAD_2 domain-containing protein  24.84 
 
 		 617 aa  127  8.000000000000001e-28  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0429091  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0965  helicase c2  25.05 
 
 		 654 aa  119  1.9999999999999998e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.228923  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4835  helicase c2  36.6 
 
 		 874 aa  119  1.9999999999999998e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0589586 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1117  DEAD_2 domain-containing protein  22.32 
 
 		 712 aa  117  7.999999999999999e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.708962  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0478  DEAD_2 domain-containing protein  25.97 
 
 		 588 aa  115  4.0000000000000004e-24  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.738253  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0390  DEAD_2 domain-containing protein  25.73 
 
 		 580 aa  111  5e-23  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.12513 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1737  DEAD_2 domain-containing protein  25.64 
 
 		 574 aa  102  4e-20  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000703978 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0196  DEAD_2 domain protein  28.99 
 
 		 619 aa  100  1e-19  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.544403  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1566  Rad3-related DNA helicases  23.05 
 
 		 726 aa  97.8  6e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000243015  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1453  helicase c2  22.27 
 
 		 669 aa  93.2  2e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1117  DEAD_2 domain-containing protein  24.05 
 
 		 582 aa  93.2  2e-17  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0466  helicase c2  21.6 
 
 		 669 aa  92  4e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1376  DNA helicase RepD  26.23 
 
 		 773 aa  90.9  8e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.905642  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0534  helicase c2  19.97 
 
 		 669 aa  89.7  2e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1867  DEAD_2 domain-containing protein  23.52 
 
 		 541 aa  85.9  0.000000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.512598 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0620  DEAD_2 domain-containing protein  22.96 
 
 		 634 aa  86.7  0.000000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1357  DEAD_2 domain-containing protein  24.45 
 
 		 575 aa  79  0.0000000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0243831 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1416  DEAD_2 domain protein  29.15 
 
 		 722 aa  77.8  0.0000000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0371  DNA repair helicase RAD3  21.31 
 
 		 669 aa  77.8  0.0000000000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1288  DEAD_2 domain protein  21.55 
 
 		 550 aa  77  0.000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1918  helicase c2  28.24 
 
 		 790 aa  73.6  0.00000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.885633  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6530  putative ATP-dependent helicase  24.49 
 
 		 674 aa  73.6  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.290122  normal  0.0410108 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0335  DEAD_2 domain protein  27.63 
 
 		 723 aa  71.6  0.00000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2347  helicase c2  26.68 
 
 		 670 aa  71.6  0.00000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.490547  normal  0.859108 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_54072  xeroderma pigmentosum group D complementing protein  26.15 
 
 		 782 aa  70.5  0.0000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2627  DEAD_2 domain protein  26.82 
 
 		 723 aa  70.1  0.0000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.510755 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3841  helicase c2  25.81 
 
 		 665 aa  69.7  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.478709  normal  0.0359375 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3855  helicase c2  25.81 
 
 		 665 aa  69.3  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.210682  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_37445  predicted protein  21.58 
 
 		 938 aa  70.1  0.0000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.258887  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3929  helicase c2  25.81 
 
 		 665 aa  69.3  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0336304  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0823  DEAD_2 domain protein  28.05 
 
 		 739 aa  68.9  0.0000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_26944  predicted protein  25.19 
 
 		 788 aa  68.9  0.0000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.168097 
 
 
-
 
NC_006670  CNA05570  general RNA polymerase II transcription factor, putative  26.52 
 
 		 799 aa  68.6  0.0000000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.946623  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1467  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  27.27 
 
 		 934 aa  67.8  0.0000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.533097  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1769  DEAD_2 domain protein  26.42 
 
 		 729 aa  65.9  0.000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.863576  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29270  DNA helicase, Rad3  23.69 
 
 		 684 aa  65.5  0.000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.318454 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3766  helicase c2  33.33 
 
 		 806 aa  65.5  0.000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4298  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.33 
 
 		 666 aa  65.1  0.000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.641288 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1671  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  27.27 
 
 		 934 aa  64.3  0.000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.697043  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3747  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  27.27 
 
 		 934 aa  64.3  0.000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.739451  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1598  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  27.27 
 
 		 934 aa  63.9  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00523268  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2118  ATP-dependent DNA helicase DinG  26.16 
 
 		 707 aa  63.9  0.00000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.149773  hitchhiker  0.000000714427 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1709  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  27.27 
 
 		 934 aa  63.5  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000649538  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1265  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  26.16 
 
 		 929 aa  63.2  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00466144  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_40695  predicted protein  23.71 
 
 		 749 aa  62.8  0.00000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00000000149445  normal  0.993011 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0816  helicase c2  26.91 
 
 		 787 aa  62  0.00000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.524115 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1452  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  26.86 
 
 		 934 aa  62  0.00000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>