214 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_4268 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010552  BamMC406_4268  helicase c2  100 
 
 		 766 aa  1548    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0100597  normal  0.178799 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2839  DEAD_2 domain protein  58.72 
 
 		 762 aa  871    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2972  DEAD_2 domain-containing protein  58.69 
 
 		 753 aa  909    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.114076 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3036  hypothetical protein  59.06 
 
 		 761 aa  906    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0104594  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2510  helicase c2  57.14 
 
 		 788 aa  864    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00268076 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2806  DEAD_2 domain protein  57.42 
 
 		 785 aa  835    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.717048  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2909  DEAD_2  58.79 
 
 		 775 aa  914    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0996428 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2943  DEAD_2 domain-containing protein  57.8 
 
 		 753 aa  877    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1416  helicase c2  53.27 
 
 		 855 aa  823    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5827  DEAD_2  58.33 
 
 		 779 aa  892    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2454  Uvs006  72.66 
 
 		 746 aa  1029    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.107257  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5813  helicase c2  61.53 
 
 		 790 aa  884    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.208635 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2690  DEAD_2  59.74 
 
 		 772 aa  941    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00215798 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1630  Rad3-related DNA helicases-like  94.91 
 
 		 766 aa  1434    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.138986  normal  0.527518 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1550  DNA repair helicase  72.79 
 
 		 745 aa  1078    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1361  helicase c2  56.19 
 
 		 801 aa  893    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1180  hypothetical protein  71.24 
 
 		 754 aa  1101    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.749053  normal  0.379614 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1498  helicase c2  55.86 
 
 		 773 aa  840    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.486316  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3978  helicase c2  95.3 
 
 		 766 aa  1428    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0904062  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5309  DEAD_2 domain-containing protein  70.07 
 
 		 756 aa  1087    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.173286  hitchhiker  0.0033003 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3801  helicase c2  98.83 
 
 		 766 aa  1535    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.354929 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40350  hypothetical protein  61.07 
 
 		 758 aa  906    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.650358  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2850  DEAD_2 domain-containing protein  58.85 
 
 		 753 aa  873    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4389  helicase c2  95.3 
 
 		 766 aa  1428    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.787433  normal  0.56553 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3423  hypothetical protein  60.13 
 
 		 758 aa  896    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0015  DEAD_2 domain-containing protein  48.1 
 
 		 750 aa  699    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.338089  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0185  helicase c2  56.54 
 
 		 798 aa  831    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0984  DEAD_2 domain-containing protein  60 
 
 		 773 aa  915    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2428  helicase c2  53.97 
 
 		 855 aa  837    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.376304  normal  0.732574 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5421  DEAD_2 domain protein  71.37 
 
 		 754 aa  1112    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0909  hypothetical protein  59.53 
 
 		 773 aa  868    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.205853  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1260  putative ATP-dependent helicase  73.11 
 
 		 755 aa  1050    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1186  putative ATP-dependent helicase  72.98 
 
 		 755 aa  1046    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.146047  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0928  ATP-dependent helicase, putative  71.68 
 
 		 495 aa  687    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.568065  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4111  helicase c2  58.69 
 
 		 766 aa  884    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.620969 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4233  helicase c2  92.47 
 
 		 757 aa  1389    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.134799  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5966  helicase c2  95.43 
 
 		 766 aa  1431    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.224812  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1376  DNA repair helicase, truncation  69.91 
 
 		 431 aa  618  1e-175  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.731908  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0660  DEAD_2 domain protein  32.78 
 
 		 790 aa  442  1e-123  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0289  DEAD_2  33.68 
 
 		 785 aa  443  1e-123  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00121679  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2947  DEAD_2 domain protein  33.85 
 
 		 774 aa  439  1e-121  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.443127  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0995  DEAD_2 domain protein  31.15 
 
 		 777 aa  433  1e-120  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1408  putative ATP-dependent helicase  31.78 
 
 		 781 aa  413  1e-114  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1217  ATP-dependent helicase, putative  31.27 
 
 		 781 aa  412  1e-113  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.11747  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0224  DEAD_2 domain-containing protein  30.47 
 
 		 852 aa  326  1e-87  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0115724  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2112  DEAD_2 domain-containing protein  28.86 
 
 		 797 aa  229  1e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4042  DEAD_2 domain protein  31.3 
 
 		 798 aa  227  6e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4133  DEAD_2 domain protein  30.86 
 
 		 798 aa  224  4.9999999999999996e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1847  DEAD_2 domain-containing protein  30.98 
 
 		 807 aa  219  1e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4835  helicase c2  28.79 
 
 		 874 aa  181  2.9999999999999997e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0589586 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1104  queuine tRNA-ribosyltransferase  24.92 
 
 		 676 aa  117  6e-25  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0965  helicase c2  25.99 
 
 		 654 aa  115  4.0000000000000004e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.228923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1117  DEAD_2 domain-containing protein  24.78 
 
 		 712 aa  110  1e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.708962  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1376  DNA helicase RepD  29.18 
 
 		 773 aa  107  6e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.905642  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1699  DEAD_2 domain protein  26.75 
 
 		 670 aa  107  7e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0524758  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0478  DEAD_2 domain-containing protein  25.25 
 
 		 588 aa  106  1e-21  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.738253  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1812  DEAD_2 domain-containing protein  23.68 
 
 		 617 aa  105  3e-21  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0429091  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0789  helicase c2  25.7 
 
 		 669 aa  103  2e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.222881  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1672  helicase c2  25.2 
 
 		 739 aa  96.3  2e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0196  DEAD_2 domain protein  27.44 
 
 		 619 aa  93.6  1e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.544403  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1566  Rad3-related DNA helicases  27.2 
 
 		 726 aa  82.4  0.00000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000243015  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1737  DEAD_2 domain-containing protein  24.5 
 
 		 574 aa  82.4  0.00000000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000703978 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1117  DEAD_2 domain-containing protein  23.39 
 
 		 582 aa  82.4  0.00000000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1769  DEAD_2 domain protein  24.95 
 
 		 729 aa  78.6  0.0000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.863576  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0335  DEAD_2 domain protein  25.45 
 
 		 723 aa  77.8  0.0000000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1918  helicase c2  27.08 
 
 		 790 aa  76.6  0.000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.885633  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0390  DEAD_2 domain-containing protein  22.83 
 
 		 580 aa  75.9  0.000000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.12513 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1416  DEAD_2 domain protein  24.06 
 
 		 722 aa  74.3  0.000000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6530  putative ATP-dependent helicase  26.28 
 
 		 674 aa  71.6  0.00000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.290122  normal  0.0410108 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3766  helicase c2  34.38 
 
 		 806 aa  70.9  0.00000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0534  helicase c2  19.94 
 
 		 669 aa  68.6  0.0000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11361  ATP-dependent helicase dinG  27.25 
 
 		 664 aa  68.6  0.0000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00520548  normal  0.0965757 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2630  ATP-dependent DNA helicase DinG  22.43 
 
 		 691 aa  68.6  0.0000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0816  helicase c2  26.9 
 
 		 787 aa  68.2  0.0000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.524115 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1536  DEAD_2 domain protein  20.89 
 
 		 537 aa  66.6  0.000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.849616  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2347  helicase c2  25.64 
 
 		 670 aa  66.2  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.490547  normal  0.859108 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4634  helicase c2  23.3 
 
 		 674 aa  65.5  0.000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0823  DEAD_2 domain protein  27.8 
 
 		 739 aa  65.5  0.000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3841  helicase c2  26.89 
 
 		 665 aa  64.7  0.000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.478709  normal  0.0359375 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3855  helicase c2  26.89 
 
 		 665 aa  64.7  0.000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.210682  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3929  helicase c2  26.89 
 
 		 665 aa  64.7  0.000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0336304  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2272  ATP-dependent DNA helicase DinG  27.09 
 
 		 712 aa  63.2  0.00000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1863  helicase c2  24.01 
 
 		 668 aa  62.8  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.879395 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2483  ATP-dependent DNA helicase DinG  26.96 
 
 		 690 aa  62.8  0.00000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00204554 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2118  ATP-dependent DNA helicase DinG  25.11 
 
 		 707 aa  62  0.00000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.149773  hitchhiker  0.000000714427 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2205  helicase c2  27.31 
 
 		 676 aa  62  0.00000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.632178  normal  0.363279 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0371  DNA repair helicase RAD3  21.29 
 
 		 669 aa  62  0.00000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1480  helicase c2  29.46 
 
 		 710 aa  61.6  0.00000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.124092  normal  1 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_54072  xeroderma pigmentosum group D complementing protein  23.26 
 
 		 782 aa  61.2  0.00000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1867  DEAD_2 domain-containing protein  21.58 
 
 		 541 aa  60.8  0.00000009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.512598 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23060  DNA helicase, Rad3  26.33 
 
 		 692 aa  60.1  0.0000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0774743 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2429  ATP-dependent DNA helicase DinG  21.9 
 
 		 691 aa  60.1  0.0000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1566  ATP-dependent DNA helicase DinG  26.15 
 
 		 692 aa  60.5  0.0000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000620367 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0466  helicase c2  20.76 
 
 		 669 aa  60.1  0.0000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_24915  predicted protein  22.36 
 
 		 791 aa  60.1  0.0000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.615618  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2627  DEAD_2 domain protein  24.63 
 
 		 723 aa  60.1  0.0000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.510755 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_37445  predicted protein  21.6 
 
 		 938 aa  60.1  0.0000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.258887  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17400  DNA helicase, Rad3  26.5 
 
 		 765 aa  59.3  0.0000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0589917  normal  0.041503 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2656  ATP-dependent DNA helicase DinG  25.81 
 
 		 690 aa  58.5  0.0000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.765136  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_54439  YPL008W (CHL1)-like protein  18.38 
 
 		 835 aa  58.9  0.0000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.106037 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>