270 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_1416 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013743  Htur_0335  DEAD_2 domain protein  66.16 
 
 		 723 aa  997    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1769  DEAD_2 domain protein  64.11 
 
 		 729 aa  968    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.863576  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2627  DEAD_2 domain protein  63.64 
 
 		 723 aa  929    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.510755 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1416  DEAD_2 domain protein  100 
 
 		 722 aa  1450    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0823  DEAD_2 domain protein  71.6 
 
 		 739 aa  1070    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1566  Rad3-related DNA helicases  39.95 
 
 		 726 aa  566  1e-160  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000243015  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1376  DNA helicase RepD  40.37 
 
 		 773 aa  545  1e-153  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.905642  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0816  helicase c2  30.47 
 
 		 787 aa  223  9e-57  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.524115 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2975  helicase c2  28 
 
 		 807 aa  200  1.0000000000000001e-49  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1104  queuine tRNA-ribosyltransferase  24.08 
 
 		 676 aa  166  2.0000000000000002e-39  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0196  DEAD_2 domain protein  24.03 
 
 		 619 aa  158  4e-37  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.544403  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0965  helicase c2  23.42 
 
 		 654 aa  154  5.9999999999999996e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.228923  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1672  helicase c2  24.07 
 
 		 739 aa  152  2e-35  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1117  DEAD_2 domain-containing protein  23.84 
 
 		 712 aa  151  5e-35  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.708962  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0789  helicase c2  24.57 
 
 		 669 aa  150  6e-35  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.222881  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_50344  DNA helicase component of transcription factor b  23.85 
 
 		 793 aa  139  2e-31  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1918  helicase c2  36.79 
 
 		 790 aa  137  6.0000000000000005e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.885633  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2465  helicase c2  34.1 
 
 		 806 aa  137  9.999999999999999e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1699  DEAD_2 domain protein  25.04 
 
 		 670 aa  135  3.9999999999999996e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0524758  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3766  helicase c2  36.48 
 
 		 806 aa  131  4.0000000000000003e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0289  DEAD_2  23.07 
 
 		 785 aa  117  5e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00121679  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA05570  general RNA polymerase II transcription factor, putative  21.31 
 
 		 799 aa  114  8.000000000000001e-24  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.946623  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4042  DEAD_2 domain protein  26.9 
 
 		 798 aa  108  3e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_32894  predicted protein  24.95 
 
 		 1067 aa  108  4e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0780237  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4133  DEAD_2 domain protein  26.54 
 
 		 798 aa  105  4e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_54072  xeroderma pigmentosum group D complementing protein  22.51 
 
 		 782 aa  101  5e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0995  DEAD_2 domain protein  23.8 
 
 		 777 aa  99.4  2e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3224  DNA polymerase III, epsilon subunit  24.53 
 
 		 927 aa  98.2  5e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00101103  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1347  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  22.1 
 
 		 957 aa  97.8  6e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.579486 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1847  DEAD_2 domain-containing protein  25.53 
 
 		 807 aa  97.8  6e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_37445  predicted protein  21.36 
 
 		 938 aa  97.1  1e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.258887  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0660  DEAD_2 domain protein  24.27 
 
 		 790 aa  97.1  1e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1812  DEAD_2 domain-containing protein  23.17 
 
 		 617 aa  96.7  1e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0429091  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2947  DEAD_2 domain protein  24.02 
 
 		 774 aa  95.1  4e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.443127  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1288  DEAD_2 domain protein  22.71 
 
 		 550 aa  90.1  1e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2112  DEAD_2 domain-containing protein  24.01 
 
 		 797 aa  90.1  1e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1265  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  22.67 
 
 		 929 aa  89.4  2e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00466144  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_26944  predicted protein  20.79 
 
 		 788 aa  87  0.000000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.168097 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1942  helicase c2  20.9 
 
 		 832 aa  85.9  0.000000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.357662  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_24915  predicted protein  20.48 
 
 		 791 aa  85.5  0.000000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.615618  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1990  ATP-dependent helicase DinG  21.26 
 
 		 709 aa  85.1  0.000000000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1867  DEAD_2 domain-containing protein  24.46 
 
 		 541 aa  85.1  0.000000000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.512598 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0185  helicase c2  24.22 
 
 		 798 aa  84.3  0.000000000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2909  DEAD_2  27.56 
 
 		 775 aa  84  0.000000000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0996428 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0023  Rad3-related DNA helicases  23.33 
 
 		 851 aa  84  0.00000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000466591  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09436  5' to 3' DNA helicase (Eurofung)  25 
 
 		 791 aa  82  0.00000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3036  hypothetical protein  28.57 
 
 		 761 aa  82  0.00000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0104594  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1671  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  22.1 
 
 		 934 aa  81.3  0.00000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.697043  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0015  DEAD_2 domain-containing protein  27.1 
 
 		 750 aa  81.3  0.00000000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.338089  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1467  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  21.89 
 
 		 934 aa  80.5  0.00000000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.533097  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2690  DEAD_2  22.22 
 
 		 772 aa  79.3  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00215798 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1498  helicase c2  26.5 
 
 		 773 aa  79.3  0.0000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.486316  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1709  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  22.13 
 
 		 934 aa  79  0.0000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000649538  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1416  helicase c2  24.09 
 
 		 855 aa  77.8  0.0000000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0224  DEAD_2 domain-containing protein  25.51 
 
 		 852 aa  77.8  0.0000000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0115724  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4835  helicase c2  27.08 
 
 		 874 aa  77.4  0.0000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0589586 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1357  DEAD_2 domain-containing protein  29.92 
 
 		 575 aa  77.4  0.0000000000009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0243831 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2806  DEAD_2 domain protein  29.26 
 
 		 785 aa  77.4  0.0000000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.717048  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5827  DEAD_2  23.27 
 
 		 779 aa  77  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1408  putative ATP-dependent helicase  24.79 
 
 		 781 aa  76.3  0.000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2428  helicase c2  24.55 
 
 		 855 aa  76.6  0.000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.376304  normal  0.732574 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1117  DEAD_2 domain-containing protein  27.2 
 
 		 582 aa  75.5  0.000000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1424  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  21.9 
 
 		 934 aa  75.9  0.000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1425  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  21.9 
 
 		 934 aa  75.9  0.000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.446116  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1636  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  21.9 
 
 		 934 aa  75.9  0.000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00174148 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1902  helicase c2  22.73 
 
 		 646 aa  75.5  0.000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1217  ATP-dependent helicase, putative  24.79 
 
 		 781 aa  75.5  0.000000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.11747  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5813  helicase c2  32.17 
 
 		 790 aa  74.3  0.000000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.208635 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0909  hypothetical protein  28.7 
 
 		 773 aa  74.3  0.000000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.205853  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40350  hypothetical protein  26.82 
 
 		 758 aa  73.9  0.000000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.650358  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3621  helicase c2  23.05 
 
 		 838 aa  73.6  0.00000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4111  helicase c2  25.93 
 
 		 766 aa  73.6  0.00000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.620969 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1737  DEAD_2 domain-containing protein  24.64 
 
 		 574 aa  73.2  0.00000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000703978 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3423  hypothetical protein  26.74 
 
 		 758 aa  72.8  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0478  DEAD_2 domain-containing protein  22.78 
 
 		 588 aa  73.2  0.00000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.738253  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4268  helicase c2  23.89 
 
 		 766 aa  72  0.00000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0100597  normal  0.178799 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2943  DEAD_2 domain-containing protein  28.74 
 
 		 753 aa  72  0.00000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01131  ATP-dependent helicase  20.53 
 
 		 639 aa  71.6  0.00000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.625206  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3801  helicase c2  24.06 
 
 		 766 aa  71.6  0.00000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.354929 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2809  helicase c2  22.01 
 
 		 707 aa  71.2  0.00000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2454  Uvs006  30.36 
 
 		 746 aa  70.5  0.00000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.107257  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1260  putative ATP-dependent helicase  30.36 
 
 		 755 aa  70.5  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5966  helicase c2  29.39 
 
 		 766 aa  70.5  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.224812  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2972  DEAD_2 domain-containing protein  29.41 
 
 		 753 aa  70.5  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.114076 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1186  putative ATP-dependent helicase  30.36 
 
 		 755 aa  70.5  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.146047  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_54439  YPL008W (CHL1)-like protein  20.78 
 
 		 835 aa  70.1  0.0000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.106037 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2850  DEAD_2 domain-containing protein  27.94 
 
 		 753 aa  69.3  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2839  DEAD_2 domain protein  27.94 
 
 		 762 aa  69.3  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1550  DNA repair helicase  30.22 
 
 		 745 aa  69.3  0.0000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_10282  predicted protein  26.05 
 
 		 614 aa  69.7  0.0000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1630  Rad3-related DNA helicases-like  28.98 
 
 		 766 aa  68.9  0.0000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.138986  normal  0.527518 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4634  helicase c2  23.59 
 
 		 674 aa  68.9  0.0000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0390  DEAD_2 domain-containing protein  25.94 
 
 		 580 aa  68.9  0.0000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.12513 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4233  helicase c2  24.44 
 
 		 757 aa  68.6  0.0000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.134799  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1361  helicase c2  25.72 
 
 		 801 aa  68.6  0.0000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0188  helicase c2  22.16 
 
 		 659 aa  68.2  0.0000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00148037  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5309  DEAD_2 domain-containing protein  24.25 
 
 		 756 aa  68.2  0.0000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.173286  hitchhiker  0.0033003 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0024  helicase c2  20.65 
 
 		 846 aa  67.4  0.0000000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0928  ATP-dependent helicase, putative  29.91 
 
 		 495 aa  67  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.568065  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0648  helicase c2  22.52 
 
 		 668 aa  67  0.000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>