More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_1902 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003909  BCE_1692  hypothetical protein  66.67 
 
 
645 aa  896    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1470  hypothetical protein  66.36 
 
 
645 aa  893    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.36032  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1442  ATP-dependent helicase DinG  66.51 
 
 
645 aa  895    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1443  ATP-dependent helicase DinG  66.51 
 
 
645 aa  895    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1586  hypothetical protein  66.36 
 
 
645 aa  893    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.674087  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3725  hypothetical protein  66.36 
 
 
645 aa  893    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0167806  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1486  helicase c2  66.36 
 
 
645 aa  889    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.530371  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1619  hypothetical protein  66.82 
 
 
645 aa  899    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.68003  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1656  hypothetical protein  66.51 
 
 
645 aa  895    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.10694 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1300  helicase c2  66.67 
 
 
645 aa  896    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1902  helicase c2  100 
 
 
646 aa  1334    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2382  helicase c2  85.76 
 
 
653 aa  1130    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1731  hypothetical protein  66.51 
 
 
645 aa  895    Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000833443  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1544  helicase c2  37.03 
 
 
635 aa  412  1e-113  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0592026  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1991  helicase c2  36.49 
 
 
657 aa  404  1e-111  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0246396  normal  0.166002 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1942  helicase c2  26.11 
 
 
832 aa  204  4e-51  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.357662  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1899  DNA polymerase III, epsilon subunit  27.56 
 
 
956 aa  193  1e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0589249 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4634  helicase c2  29.48 
 
 
674 aa  187  6e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1269  helicase c2  28.31 
 
 
636 aa  187  7e-46  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1265  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  26.21 
 
 
929 aa  186  1.0000000000000001e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00466144  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3621  helicase c2  27.42 
 
 
838 aa  186  2.0000000000000003e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3747  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  26.36 
 
 
934 aa  183  7e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.739451  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0911  putative ATP-dependent helicase  26.94 
 
 
651 aa  183  7e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1545  DNA polymerase III, epsilon subunit  26.4 
 
 
944 aa  182  1e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.676592  decreased coverage  0.000191845 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1886  hypothetical protein  28.06 
 
 
652 aa  182  1e-44  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0997  helicase c2  26.93 
 
 
643 aa  182  1e-44  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.179863 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1859  helicase c2  26.57 
 
 
674 aa  181  4e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.347581  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1897  hypothetical protein  27.64 
 
 
652 aa  181  4.999999999999999e-44  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1598  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  26.05 
 
 
934 aa  180  7e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00523268  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0528  helicase c2  27.06 
 
 
667 aa  180  8e-44  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2172  helicase c2  26.42 
 
 
659 aa  179  1e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1452  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  26.62 
 
 
934 aa  178  2e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1565  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  26.62 
 
 
934 aa  178  2e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.554006  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1805  helicase c2  26.42 
 
 
659 aa  179  2e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4478  helicase c2  28.5 
 
 
633 aa  177  4e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.647625  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0188  helicase c2  27.47 
 
 
659 aa  177  4e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00148037  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1197  helicase c2  26.98 
 
 
661 aa  177  4e-43  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.0000973223  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1709  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  26.58 
 
 
934 aa  177  4e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000649538  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1671  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  26.58 
 
 
934 aa  177  6e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.697043  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4459  helicase c2  28.5 
 
 
633 aa  177  6e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.157065  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4323  helicase c2  27.8 
 
 
631 aa  176  9.999999999999999e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1467  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  26.73 
 
 
934 aa  176  9.999999999999999e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.533097  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1636  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  26.47 
 
 
934 aa  175  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00174148 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1424  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  26.47 
 
 
934 aa  175  1.9999999999999998e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1425  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  26.47 
 
 
934 aa  175  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.446116  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17400  DNA helicase, Rad3  27.61 
 
 
765 aa  174  5e-42  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0589917  normal  0.041503 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2081  ATP-dependent helicase DinG  26.23 
 
 
633 aa  173  7.999999999999999e-42  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0411  helicase c2  26.11 
 
 
646 aa  173  7.999999999999999e-42  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2413  helicase c2  26.95 
 
 
669 aa  173  1e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0561182  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1934  helicase c2  26.8 
 
 
640 aa  172  2e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.101214  normal  0.540234 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1824  helicase c2  26.77 
 
 
664 aa  172  2e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.678424  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2156  DNA polymerase III, epsilon subunit  25.65 
 
 
934 aa  172  3e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.814989  hitchhiker  0.00934468 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2424  helicase c2  26.8 
 
 
669 aa  171  3e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2205  helicase c2  27.46 
 
 
676 aa  171  3e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.632178  normal  0.363279 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2532  helicase c2  26.8 
 
 
640 aa  170  6e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.139439 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1409  helicase c2  27.08 
 
 
651 aa  170  9e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0733  ATP-dependent DNA helicase  27.67 
 
 
640 aa  168  2e-40  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.982369  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004095  DinG family ATP-dependent helicase YoaA  26.11 
 
 
646 aa  168  2.9999999999999998e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6611  helicase c2  25.72 
 
 
729 aa  167  5e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0933933 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2535  helicase C2  27.09 
 
 
645 aa  167  6.9999999999999995e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.801549  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1575  putative ATP-dependent helicase  25.54 
 
 
646 aa  167  6.9999999999999995e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.718112  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3886  ATP-dependent helicase  26.89 
 
 
647 aa  166  1.0000000000000001e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1651  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  24.4 
 
 
952 aa  166  1.0000000000000001e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0648  helicase c2  25.62 
 
 
668 aa  166  2.0000000000000002e-39  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0820  helicase c2  26.96 
 
 
650 aa  165  3e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.932295  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2527  helicase c2  27.03 
 
 
653 aa  165  3e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0816709  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01374  ATP-dependent helicase  25.47 
 
 
644 aa  164  6e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2677  helicase c2  25.28 
 
 
646 aa  163  9e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.663694  normal  0.183253 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0709  helicase c2  26.96 
 
 
650 aa  163  1e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.968194 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1727  helicase c2  25.21 
 
 
641 aa  162  1e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2809  helicase c2  25.55 
 
 
707 aa  162  2e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2455  helicase c2  27.53 
 
 
641 aa  162  2e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0636  helicase c2  25.72 
 
 
660 aa  161  3e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2877  helicase c2  25.75 
 
 
658 aa  161  3e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.679539 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1364  helicase c2  26.59 
 
 
640 aa  160  5e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1626  ATP-dependent DNA helicase-related protein  25.55 
 
 
713 aa  160  6e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2763  helicase c2  27.21 
 
 
634 aa  160  7e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0359097  hitchhiker  0.00537714 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2094  helicase c2  28.37 
 
 
673 aa  160  8e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.239782  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0363  ATP-dependent helicase DinG  27.03 
 
 
840 aa  158  2e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.01237  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1991  ATP-dependent helicase, putative  25.57 
 
 
645 aa  159  2e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01131  ATP-dependent helicase  25.9 
 
 
639 aa  158  3e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.625206  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1504  helicase c2  25.86 
 
 
672 aa  158  3e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.328202  normal  0.416282 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2535  hypothetical protein  25.8 
 
 
636 aa  158  4e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.50615  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01778  conserved protein with nucleoside triphosphate hydrolase domain  25.8 
 
 
636 aa  158  4e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.548012  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1825  helicase c2  25.8 
 
 
636 aa  158  4e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.979985  normal  0.491186 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2034  hypothetical protein  25.8 
 
 
636 aa  158  4e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01766  hypothetical protein  25.8 
 
 
636 aa  158  4e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.479225  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1940  ATP-dependent helicase DinG  24.66 
 
 
665 aa  157  4e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.497186  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1896  hypothetical protein  25.8 
 
 
636 aa  158  4e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0995  helicase c2  25.08 
 
 
681 aa  157  5.0000000000000005e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.900844  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4122  helicase c2  25.11 
 
 
843 aa  157  7e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000977416  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1106  helicase c2  26.25 
 
 
636 aa  157  7e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.243566 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1380  hypothetical protein  25.64 
 
 
636 aa  157  8e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.434814  normal  0.350106 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2196  helicase c2  25.08 
 
 
641 aa  155  2e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00456377 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1961  hypothetical protein  25.12 
 
 
636 aa  155  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.915388  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1310  hypothetical protein  25.12 
 
 
636 aa  155  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.027986  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1921  helicase c2  25.08 
 
 
725 aa  155  2e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.782434  normal  0.028244 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2022  hypothetical protein  25.12 
 
 
636 aa  155  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.6889  normal  0.891564 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1965  hypothetical protein  25.12 
 
 
636 aa  155  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2347  helicase c2  25.98 
 
 
670 aa  155  2e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.490547  normal  0.859108 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>