More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_2094 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_2094  helicase c2  100 
 
 		 673 aa  1323    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.239782  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0648  helicase c2  35.49 
 
 		 668 aa  334  2e-90  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0997  helicase c2  35.48 
 
 		 643 aa  333  4e-90  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.179863 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1412  helicase c2  34.64 
 
 		 658 aa  330  4e-89  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.102914  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4323  helicase c2  38.2 
 
 		 631 aa  330  5.0000000000000004e-89  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6611  helicase c2  37.11 
 
 		 729 aa  328  2.0000000000000001e-88  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0933933 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4459  helicase c2  38.22 
 
 		 633 aa  327  5e-88  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.157065  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4478  helicase c2  37.93 
 
 		 633 aa  325  2e-87  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.647625  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4468  helicase c2  39.84 
 
 		 635 aa  322  1.9999999999999998e-86  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.261313  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3093  helicase c2  36.87 
 
 		 681 aa  320  3.9999999999999996e-86  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.649657 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4634  helicase c2  34.5 
 
 		 674 aa  320  6e-86  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0636  helicase c2  35.49 
 
 		 660 aa  315  1.9999999999999998e-84  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0820  helicase c2  35.29 
 
 		 650 aa  313  9e-84  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.932295  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01778  conserved protein with nucleoside triphosphate hydrolase domain  35.38 
 
 		 636 aa  312  1e-83  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.548012  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01766  hypothetical protein  35.38 
 
 		 636 aa  312  1e-83  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.479225  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2535  hypothetical protein  35.38 
 
 		 636 aa  312  1e-83  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.50615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1896  hypothetical protein  35.38 
 
 		 636 aa  312  1e-83  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1825  helicase c2  35.38 
 
 		 636 aa  312  1e-83  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.979985  normal  0.491186 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1380  hypothetical protein  35.38 
 
 		 636 aa  312  1e-83  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.434814  normal  0.350106 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2034  hypothetical protein  35.38 
 
 		 636 aa  312  1e-83  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0709  helicase c2  35.1 
 
 		 650 aa  311  2e-83  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.968194 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01597  ATP-dependent helicase  37.52 
 
 		 675 aa  311  2e-83  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01131  ATP-dependent helicase  34.32 
 
 		 639 aa  311  2.9999999999999997e-83  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.625206  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2517  ATP-dependent helicase, DEXD family  35.59 
 
 		 641 aa  311  4e-83  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.764826  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2147  helicase c2  35.59 
 
 		 641 aa  311  4e-83  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0303331  hitchhiker  0.00135971 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1235  helicase c2  34.81 
 
 		 743 aa  310  5e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0895293  normal  0.149585 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2068  hypothetical protein  35.23 
 
 		 636 aa  309  9e-83  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1835  helicase c2  35.23 
 
 		 636 aa  308  1.0000000000000001e-82  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00837342  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0188  helicase c2  34.4 
 
 		 659 aa  308  2.0000000000000002e-82  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00148037  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1921  helicase c2  33.53 
 
 		 725 aa  306  1.0000000000000001e-81  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.782434  normal  0.028244 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3167  helicase c2  34.84 
 
 		 876 aa  305  1.0000000000000001e-81  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000644587  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1593  helicase c2  33.38 
 
 		 725 aa  305  1.0000000000000001e-81  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.601772  normal  0.0255754 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1106  helicase c2  29.84 
 
 		 636 aa  303  5.000000000000001e-81  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.243566 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1933  helicase c2  34.68 
 
 		 639 aa  303  8.000000000000001e-81  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0363  ATP-dependent helicase DinG  35.04 
 
 		 840 aa  302  1e-80  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.01237  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1961  hypothetical protein  35.14 
 
 		 636 aa  302  1e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.915388  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2022  hypothetical protein  35.14 
 
 		 636 aa  301  2e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.6889  normal  0.891564 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1965  hypothetical protein  35.14 
 
 		 636 aa  301  2e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2406  hypothetical protein  35.33 
 
 		 634 aa  301  3e-80  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00282147  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2128  helicase c2  35.03 
 
 		 634 aa  301  3e-80  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2763  helicase c2  35.14 
 
 		 634 aa  301  4e-80  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0359097  hitchhiker  0.00537714 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2017  hypothetical protein  35.03 
 
 		 634 aa  301  4e-80  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.451998  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1310  hypothetical protein  35.14 
 
 		 636 aa  301  4e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.027986  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1364  helicase c2  35.72 
 
 		 640 aa  300  4e-80  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1156  helicase c2  37.09 
 
 		 649 aa  300  4e-80  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1495  hypothetical protein  35.14 
 
 		 636 aa  301  4e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01374  ATP-dependent helicase  33.53 
 
 		 644 aa  301  4e-80  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1626  ATP-dependent DNA helicase-related protein  33.28 
 
 		 713 aa  299  9e-80  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004095  DinG family ATP-dependent helicase YoaA  33.38 
 
 		 646 aa  299  9e-80  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2228  helicase c2  34.68 
 
 		 639 aa  299  1e-79  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.232993  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1403  helicase c2  33.69 
 
 		 757 aa  298  2e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.127709  hitchhiker  0.000000348035 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2527  helicase c2  35.09 
 
 		 653 aa  298  2e-79  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0816709  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2013  helicase c2  36.4 
 
 		 639 aa  297  3e-79  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.479282  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2207  putative ATP-dependent helicase  34.7 
 
 		 749 aa  298  3e-79  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1727  helicase c2  32.74 
 
 		 641 aa  298  3e-79  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2809  helicase c2  34.07 
 
 		 707 aa  296  7e-79  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1990  helicase c2  36.6 
 
 		 649 aa  296  7e-79  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1575  putative ATP-dependent helicase  33.68 
 
 		 646 aa  296  1e-78  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.718112  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0911  putative ATP-dependent helicase  32.89 
 
 		 651 aa  295  2e-78  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1942  helicase c2  28.09 
 
 		 832 aa  295  2e-78  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.357662  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1612  putative ATP-dependent helicase  33.38 
 
 		 751 aa  294  4e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00100383  normal  0.548735 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2524  helicase c2  34.05 
 
 		 755 aa  294  4e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00188741  decreased coverage  0.000000000263353 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1805  helicase c2  33.79 
 
 		 659 aa  293  8e-78  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1901  helicase c2  35.44 
 
 		 675 aa  293  9e-78  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1967  ATP-dependent helicase  35.44 
 
 		 675 aa  293  1e-77  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07920  helicase c2  29.45 
 
 		 822 aa  292  1e-77  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2172  helicase c2  33.64 
 
 		 659 aa  292  1e-77  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2081  ATP-dependent helicase DinG  33.84 
 
 		 633 aa  291  2e-77  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1824  helicase c2  34.89 
 
 		 664 aa  290  4e-77  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.678424  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1859  helicase c2  33.18 
 
 		 674 aa  290  5.0000000000000004e-77  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.347581  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2535  helicase C2  32.54 
 
 		 645 aa  290  6e-77  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.801549  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0897  helicase c2  35.05 
 
 		 647 aa  290  6e-77  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3886  ATP-dependent helicase  32.24 
 
 		 647 aa  290  8e-77  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1940  ATP-dependent helicase DinG  34.69 
 
 		 665 aa  289  1e-76  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.497186  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2302  ATP-dependent helicase, DinG family protein  32.09 
 
 		 662 aa  289  1e-76  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.783815  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0023  Rad3-related DNA helicases  36.06 
 
 		 851 aa  288  2e-76  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000466591  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2455  helicase c2  32.63 
 
 		 641 aa  288  2e-76  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0532  helicase c2  35.92 
 
 		 649 aa  288  2e-76  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0733  ATP-dependent DNA helicase  33.83 
 
 		 640 aa  288  2.9999999999999996e-76  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.982369  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2424  helicase c2  34.09 
 
 		 669 aa  286  1.0000000000000001e-75  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2413  helicase c2  34.09 
 
 		 669 aa  285  2.0000000000000002e-75  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0561182  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1934  helicase c2  33.94 
 
 		 640 aa  285  2.0000000000000002e-75  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.101214  normal  0.540234 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1991  ATP-dependent helicase, putative  35.92 
 
 		 645 aa  284  3.0000000000000004e-75  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2532  helicase c2  33.94 
 
 		 640 aa  284  3.0000000000000004e-75  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.139439 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1409  helicase c2  35.09 
 
 		 651 aa  283  8.000000000000001e-75  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3770  helicase c2  33.76 
 
 		 830 aa  283  9e-75  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2316  helicase c2  32.86 
 
 		 670 aa  281  3e-74  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2677  helicase c2  30.94 
 
 		 646 aa  281  3e-74  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.663694  normal  0.183253 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1886  hypothetical protein  30.93 
 
 		 652 aa  279  1e-73  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3854  helicase c2  33.85 
 
 		 830 aa  278  2e-73  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000920192 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1897  hypothetical protein  31.54 
 
 		 652 aa  278  3e-73  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1347  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  30.9 
 
 		 957 aa  278  3e-73  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.579486 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1779  helicase c2:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  33.98 
 
 		 641 aa  277  5e-73  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.66637 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1003  DNA polymerase III, epsilon subunit  34.04 
 
 		 960 aa  276  6e-73  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1619  helicase c2  32.33 
 
 		 629 aa  273  5.000000000000001e-72  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0239  helicase c2  33.53 
 
 		 664 aa  272  1e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1154  DNA polymerase III, epsilon subunit  33.52 
 
 		 921 aa  271  2.9999999999999997e-71  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1743  DNA polymerase III, epsilon subunit  32.29 
 
 		 930 aa  269  1e-70  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.23026  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29270  DNA helicase, Rad3  34.66 
 
 		 684 aa  267  5e-70  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.318454 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1295  helicase c2  35.44 
 
 		 664 aa  266  1e-69  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>