More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_2205 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_11361  ATP-dependent helicase dinG  62.07 
 
 
664 aa  700    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00520548  normal  0.0965757 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2347  helicase c2  61.98 
 
 
670 aa  710    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.490547  normal  0.859108 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1812  helicase c2  49.72 
 
 
706 aa  635    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1280  helicase c2  62.48 
 
 
677 aa  702    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0225088  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3345  DEAD/DEAH box helicase domain protein  61.17 
 
 
694 aa  773    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.127637  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2167  helicase c2:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  60.29 
 
 
706 aa  727    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1957  helicase c2  59.97 
 
 
699 aa  739    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0276528  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17400  DNA helicase, Rad3  56.69 
 
 
765 aa  670    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0589917  normal  0.041503 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1504  helicase c2  57 
 
 
672 aa  666    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.328202  normal  0.416282 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3855  helicase c2  63.98 
 
 
665 aa  752    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.210682  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2205  helicase c2  100 
 
 
676 aa  1336    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.632178  normal  0.363279 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29270  DNA helicase, Rad3  62.59 
 
 
684 aa  781    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.318454 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6530  putative ATP-dependent helicase  74.45 
 
 
674 aa  954    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.290122  normal  0.0410108 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3929  helicase c2  63.98 
 
 
665 aa  752    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0336304  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4298  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  63.83 
 
 
666 aa  738    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.641288 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3841  helicase c2  63.98 
 
 
665 aa  752    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.478709  normal  0.0359375 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0995  helicase c2  62.46 
 
 
681 aa  811    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.900844  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1256  helicase c2  54.36 
 
 
696 aa  603  1.0000000000000001e-171  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1467  helicase c2  51.84 
 
 
690 aa  602  1.0000000000000001e-171  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0659778  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1563  helicase c2  54.02 
 
 
728 aa  598  1e-170  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.192384  decreased coverage  0.00181092 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23060  DNA helicase, Rad3  52.62 
 
 
692 aa  596  1e-169  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0774743 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1469  helicase c2  52.64 
 
 
685 aa  593  1e-168  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000142659 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10610  DNA helicase, Rad3  52.65 
 
 
673 aa  591  1e-167  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.382167  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3824  helicase c2  54.32 
 
 
676 aa  588  1e-167  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.00296278  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0323  helicase c2  52.54 
 
 
699 aa  585  1e-166  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000323796 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0280  helicase c2  51.56 
 
 
683 aa  588  1e-166  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0332575 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0239  helicase c2  49.85 
 
 
664 aa  582  1e-164  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07310  putative glutamate--cysteine ligase/putative amino acid ligase  50.85 
 
 
699 aa  566  1e-160  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2435  helicase c2  52.4 
 
 
679 aa  551  1e-155  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.184328  normal  0.864461 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1052  helicase c2  49.85 
 
 
669 aa  534  1e-150  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.325194 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1480  helicase c2  49.93 
 
 
710 aa  489  1e-136  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.124092  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1566  helicase c2  62.44 
 
 
844 aa  462  9.999999999999999e-129  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.102401  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1545  DNA polymerase III, epsilon subunit  34.5 
 
 
944 aa  310  5e-83  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.676592  decreased coverage  0.000191845 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0636  helicase c2  36.21 
 
 
660 aa  310  5e-83  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0997  helicase c2  36.14 
 
 
643 aa  309  9e-83  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.179863 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4634  helicase c2  35.75 
 
 
674 aa  306  8.000000000000001e-82  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1106  helicase c2  31.34 
 
 
636 aa  304  3.0000000000000004e-81  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.243566 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0709  helicase c2  36.16 
 
 
650 aa  301  3e-80  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.968194 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0820  helicase c2  36.01 
 
 
650 aa  298  2e-79  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.932295  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01131  ATP-dependent helicase  34.16 
 
 
639 aa  296  6e-79  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.625206  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4478  helicase c2  37.25 
 
 
633 aa  294  3e-78  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.647625  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1921  helicase c2  34.49 
 
 
725 aa  293  7e-78  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.782434  normal  0.028244 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1593  helicase c2  33.51 
 
 
725 aa  293  9e-78  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.601772  normal  0.0255754 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0532  helicase c2  39.06 
 
 
649 aa  291  3e-77  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2809  helicase c2  33.33 
 
 
707 aa  289  1e-76  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004095  DinG family ATP-dependent helicase YoaA  32.82 
 
 
646 aa  289  1e-76  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2013  helicase c2  35.88 
 
 
639 aa  289  1e-76  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.479282  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1235  helicase c2  36.03 
 
 
743 aa  288  2e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0895293  normal  0.149585 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4323  helicase c2  36.26 
 
 
631 aa  287  5e-76  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0897  helicase c2  35.85 
 
 
647 aa  286  5.999999999999999e-76  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01374  ATP-dependent helicase  32.77 
 
 
644 aa  287  5.999999999999999e-76  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1342  helicase c2  34.44 
 
 
754 aa  285  2.0000000000000002e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1575  putative ATP-dependent helicase  32.83 
 
 
646 aa  285  2.0000000000000002e-75  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.718112  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1626  ATP-dependent DNA helicase-related protein  35.03 
 
 
713 aa  284  4.0000000000000003e-75  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1310  hypothetical protein  33.48 
 
 
636 aa  283  6.000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.027986  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1495  hypothetical protein  33.48 
 
 
636 aa  283  6.000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2022  hypothetical protein  33.48 
 
 
636 aa  283  7.000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.6889  normal  0.891564 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1965  hypothetical protein  33.48 
 
 
636 aa  283  7.000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1003  DNA polymerase III, epsilon subunit  32.47 
 
 
960 aa  283  8.000000000000001e-75  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1961  hypothetical protein  33.48 
 
 
636 aa  283  8.000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.915388  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2677  helicase c2  32.18 
 
 
646 aa  281  3e-74  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.663694  normal  0.183253 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1412  helicase c2  34.04 
 
 
658 aa  280  4e-74  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.102914  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1380  hypothetical protein  33.79 
 
 
636 aa  280  5e-74  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.434814  normal  0.350106 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2034  hypothetical protein  33.89 
 
 
636 aa  280  6e-74  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01778  conserved protein with nucleoside triphosphate hydrolase domain  33.89 
 
 
636 aa  280  6e-74  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.548012  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1825  helicase c2  33.89 
 
 
636 aa  280  6e-74  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.979985  normal  0.491186 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2535  hypothetical protein  33.89 
 
 
636 aa  280  6e-74  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.50615  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01766  hypothetical protein  33.89 
 
 
636 aa  280  6e-74  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.479225  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1896  hypothetical protein  33.89 
 
 
636 aa  280  6e-74  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1835  helicase c2  33.79 
 
 
636 aa  280  8e-74  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00837342  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1933  helicase c2  34.48 
 
 
639 aa  280  9e-74  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2094  helicase c2  35.89 
 
 
673 aa  279  1e-73  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.239782  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0911  putative ATP-dependent helicase  32.53 
 
 
651 aa  278  2e-73  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2068  hypothetical protein  33.73 
 
 
636 aa  277  5e-73  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3167  helicase c2  32.32 
 
 
876 aa  276  8e-73  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000644587  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1409  helicase c2  35.69 
 
 
651 aa  276  9e-73  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2517  ATP-dependent helicase, DEXD family  35.78 
 
 
641 aa  275  2.0000000000000002e-72  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.764826  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2147  helicase c2  35.78 
 
 
641 aa  275  2.0000000000000002e-72  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0303331  hitchhiker  0.00135971 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3224  DNA polymerase III, epsilon subunit  31.98 
 
 
927 aa  275  2.0000000000000002e-72  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00101103  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3886  ATP-dependent helicase  32.94 
 
 
647 aa  274  4.0000000000000004e-72  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2763  helicase c2  32.83 
 
 
634 aa  273  6e-72  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0359097  hitchhiker  0.00537714 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3029  DnaQ family exonuclease/DinG family helicase  31.28 
 
 
929 aa  273  7e-72  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0411  helicase c2  34.45 
 
 
646 aa  272  1e-71  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1709  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  30.43 
 
 
934 aa  271  2e-71  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000649538  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2524  helicase c2  34.99 
 
 
755 aa  270  8e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00188741  decreased coverage  0.000000000263353 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1403  helicase c2  35.91 
 
 
757 aa  270  8e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.127709  hitchhiker  0.000000348035 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1671  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  30.13 
 
 
934 aa  269  1e-70  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.697043  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2302  ATP-dependent helicase, DinG family protein  31.04 
 
 
662 aa  269  1e-70  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.783815  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1990  helicase c2  34.29 
 
 
649 aa  269  1e-70  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1779  helicase c2:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  34.39 
 
 
641 aa  269  2e-70  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.66637 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1425  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  30.09 
 
 
934 aa  267  4e-70  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.446116  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2251  ATP-dependent helicase, putative  35.67 
 
 
755 aa  267  5.999999999999999e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.247338  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1452  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  30.09 
 
 
934 aa  265  1e-69  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1886  hypothetical protein  30.56 
 
 
652 aa  266  1e-69  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1364  helicase c2  33.69 
 
 
640 aa  266  1e-69  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01597  ATP-dependent helicase  35.69 
 
 
675 aa  266  1e-69  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1565  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  30.09 
 
 
934 aa  265  1e-69  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.554006  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1651  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  33.04 
 
 
952 aa  266  1e-69  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0188  helicase c2  33.49 
 
 
659 aa  265  1e-69  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00148037  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1612  putative ATP-dependent helicase  34.39 
 
 
751 aa  265  2e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00100383  normal  0.548735 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>