More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcer98_1265 on replicon NC_009674
Organism: Bacillus cytotoxicus NVH 391-98



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003909  BCE_1671  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  80.35 
 
 
934 aa  1556    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.697043  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1467  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  80.74 
 
 
934 aa  1565    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.533097  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1452  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  79.66 
 
 
934 aa  1560    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1424  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  79.98 
 
 
934 aa  1565    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1425  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  80.09 
 
 
934 aa  1566    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.446116  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3747  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  81.5 
 
 
934 aa  1576    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.739451  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1565  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  79.66 
 
 
934 aa  1560    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.554006  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1636  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  79.98 
 
 
934 aa  1565    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00174148 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1598  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  81.72 
 
 
934 aa  1579    Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00523268  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0504  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  42.2 
 
 
909 aa  739    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1709  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  80.68 
 
 
934 aa  1562    Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000649538  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2115  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  43.61 
 
 
921 aa  776    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1265  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  100 
 
 
929 aa  1918    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00466144  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1154  DNA polymerase III, epsilon subunit  32.84 
 
 
921 aa  473  1e-132  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1743  DNA polymerase III, epsilon subunit  33.37 
 
 
930 aa  468  9.999999999999999e-131  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.23026  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1899  DNA polymerase III, epsilon subunit  33.54 
 
 
956 aa  465  1e-129  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0589249 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0562  DNA polymerase III, epsilon subunit  32.7 
 
 
921 aa  451  1e-125  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3224  DNA polymerase III, epsilon subunit  31.26 
 
 
927 aa  444  1e-123  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00101103  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1347  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  32.29 
 
 
957 aa  440  9.999999999999999e-123  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.579486 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1003  DNA polymerase III, epsilon subunit  32.57 
 
 
960 aa  438  1e-121  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3029  DnaQ family exonuclease/DinG family helicase  33.23 
 
 
929 aa  431  1e-119  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0916  DnaQ family exonuclease/DinG family helicase  31.1 
 
 
954 aa  429  1e-119  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2156  DNA polymerase III, epsilon subunit  31.26 
 
 
934 aa  425  1e-117  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.814989  hitchhiker  0.00934468 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1651  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  30.91 
 
 
952 aa  425  1e-117  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1543  DnaQ family exonuclease/DinG family helicase  30.33 
 
 
897 aa  379  1e-103  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.959984  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1514  DnaQ family exonuclease/DinG family helicase  30.33 
 
 
897 aa  379  1e-103  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.103927  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1025  DNA polymerase III, epsilon subunit/ATP-dependent helicase DinG  29.32 
 
 
902 aa  360  7e-98  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1030  Rad3-related DNA helicase  30.47 
 
 
937 aa  343  7e-93  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0174435  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1942  helicase c2  30.87 
 
 
832 aa  337  5e-91  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.357662  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07920  helicase c2  32.01 
 
 
822 aa  334  5e-90  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0023  Rad3-related DNA helicases  29.44 
 
 
851 aa  332  2e-89  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000466591  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3621  helicase c2  30.83 
 
 
838 aa  325  3e-87  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3167  helicase c2  31.17 
 
 
876 aa  318  2e-85  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000644587  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0509  helicase c2  30.39 
 
 
843 aa  318  2e-85  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4122  helicase c2  31.1 
 
 
843 aa  318  4e-85  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000977416  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0897  helicase c2  31.04 
 
 
647 aa  313  1e-83  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1197  helicase c2  31.56 
 
 
661 aa  313  1e-83  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.0000973223  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0188  helicase c2  30.13 
 
 
659 aa  310  5e-83  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00148037  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0363  ATP-dependent helicase DinG  30.08 
 
 
840 aa  308  3e-82  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.01237  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3112  DNA polymerase III, epsilon subunit  27.73 
 
 
966 aa  306  1.0000000000000001e-81  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.0000116759  hitchhiker  0.000000000648685 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2677  helicase c2  31.2 
 
 
646 aa  304  5.000000000000001e-81  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.663694  normal  0.183253 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3854  helicase c2  30.07 
 
 
830 aa  304  6.000000000000001e-81  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000920192 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3770  helicase c2  30.07 
 
 
830 aa  301  4e-80  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6611  helicase c2  30 
 
 
729 aa  299  2e-79  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0933933 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0411  helicase c2  31.86 
 
 
646 aa  297  6e-79  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1359  DNA polymerase III, epsilon subunit  27.1 
 
 
978 aa  295  3e-78  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.838712  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28440  exonuclease, DNA polymerase III, epsilon subunit family  27.04 
 
 
986 aa  291  4e-77  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.32018  normal  0.0233138 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0733  ATP-dependent DNA helicase  29.56 
 
 
640 aa  290  7e-77  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.982369  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0636  helicase c2  30.69 
 
 
660 aa  290  9e-77  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3886  ATP-dependent helicase  31.49 
 
 
647 aa  288  2.9999999999999996e-76  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4323  helicase c2  29.62 
 
 
631 aa  286  1.0000000000000001e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2013  helicase c2  29.53 
 
 
639 aa  286  1.0000000000000001e-75  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.479282  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1990  ATP-dependent helicase DinG  30.19 
 
 
709 aa  285  2.0000000000000002e-75  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01131  ATP-dependent helicase  29.97 
 
 
639 aa  285  2.0000000000000002e-75  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.625206  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1575  putative ATP-dependent helicase  29.07 
 
 
646 aa  285  2.0000000000000002e-75  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.718112  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4478  helicase c2  29.47 
 
 
633 aa  286  2.0000000000000002e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.647625  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004095  DinG family ATP-dependent helicase YoaA  30.29 
 
 
646 aa  284  5.000000000000001e-75  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1961  hypothetical protein  30.38 
 
 
636 aa  284  6.000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.915388  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4468  helicase c2  30.4 
 
 
635 aa  283  1e-74  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.261313  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01778  conserved protein with nucleoside triphosphate hydrolase domain  30.67 
 
 
636 aa  282  2e-74  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.548012  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01766  hypothetical protein  30.67 
 
 
636 aa  282  2e-74  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.479225  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1896  hypothetical protein  30.67 
 
 
636 aa  282  2e-74  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2034  hypothetical protein  30.67 
 
 
636 aa  282  2e-74  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1825  helicase c2  30.67 
 
 
636 aa  282  2e-74  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.979985  normal  0.491186 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2022  hypothetical protein  30.24 
 
 
636 aa  282  2e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.6889  normal  0.891564 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1965  hypothetical protein  30.24 
 
 
636 aa  282  2e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1990  helicase c2  29.72 
 
 
649 aa  282  2e-74  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2535  hypothetical protein  30.67 
 
 
636 aa  282  2e-74  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.50615  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1495  hypothetical protein  30.24 
 
 
636 aa  281  4e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1380  hypothetical protein  30.52 
 
 
636 aa  281  4e-74  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.434814  normal  0.350106 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1310  hypothetical protein  30.24 
 
 
636 aa  281  4e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.027986  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0528  helicase c2  30.29 
 
 
667 aa  281  5e-74  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1412  helicase c2  30.01 
 
 
658 aa  280  1e-73  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.102914  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0024  helicase c2  27.71 
 
 
846 aa  280  1e-73  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01374  ATP-dependent helicase  29.14 
 
 
644 aa  280  1e-73  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4634  helicase c2  31.3 
 
 
674 aa  279  2e-73  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1835  helicase c2  30.52 
 
 
636 aa  278  3e-73  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00837342  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2068  hypothetical protein  30.52 
 
 
636 aa  278  3e-73  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1921  helicase c2  30.29 
 
 
725 aa  277  7e-73  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.782434  normal  0.028244 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4459  helicase c2  29.6 
 
 
633 aa  276  1.0000000000000001e-72  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.157065  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2302  ATP-dependent helicase, DinG family protein  30.72 
 
 
662 aa  275  2.0000000000000002e-72  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.783815  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1593  helicase c2  30.44 
 
 
725 aa  275  3e-72  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.601772  normal  0.0255754 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1897  hypothetical protein  30.86 
 
 
652 aa  274  5.000000000000001e-72  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2378  helicase c2  30.77 
 
 
636 aa  274  5.000000000000001e-72  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1886  hypothetical protein  30.72 
 
 
652 aa  273  1e-71  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2763  helicase c2  29.59 
 
 
634 aa  271  2.9999999999999997e-71  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0359097  hitchhiker  0.00537714 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1933  helicase c2  29.48 
 
 
639 aa  271  4e-71  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2809  helicase c2  29.41 
 
 
707 aa  271  5e-71  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2017  hypothetical protein  29.44 
 
 
634 aa  270  5.9999999999999995e-71  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.451998  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2128  helicase c2  29.44 
 
 
634 aa  270  5.9999999999999995e-71  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1269  helicase c2  30.13 
 
 
636 aa  269  2e-70  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2228  helicase c2  30.03 
 
 
639 aa  269  2e-70  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.232993  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1545  DNA polymerase III, epsilon subunit  34.22 
 
 
944 aa  261  3e-68  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.676592  decreased coverage  0.000191845 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1409  helicase c2  29.1 
 
 
651 aa  260  9e-68  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2251  ATP-dependent helicase, putative  28.95 
 
 
755 aa  259  1e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.247338  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11361  ATP-dependent helicase dinG  28.53 
 
 
664 aa  260  1e-67  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00520548  normal  0.0965757 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1403  helicase c2  30.11 
 
 
757 aa  258  3e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.127709  hitchhiker  0.000000348035 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2094  helicase c2  29.75 
 
 
673 aa  257  6e-67  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.239782  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0997  helicase c2  30.39 
 
 
643 aa  257  7e-67  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.179863 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3486  helicase c2  27.26 
 
 
698 aa  253  1e-65  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>