132 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_37445 on replicon NC_009358
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009358  OSTLU_37445  predicted protein  100 
 
 
938 aa  1962    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.258887  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_32894  predicted protein  31.77 
 
 
1067 aa  350  9e-95  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0780237  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_24915  predicted protein  29.9 
 
 
791 aa  309  2.0000000000000002e-82  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.615618  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_40695  predicted protein  28.25 
 
 
749 aa  266  1e-69  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00000000149445  normal  0.993011 
 
 
-
 
NC_006684  CNB05090  CHL1 helicase, putative  26.38 
 
 
849 aa  208  3e-52  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_54439  YPL008W (CHL1)-like protein  25 
 
 
835 aa  202  1.9999999999999998e-50  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.106037 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_50344  DNA helicase component of transcription factor b  24.76 
 
 
793 aa  202  1.9999999999999998e-50  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09436  5' to 3' DNA helicase (Eurofung)  24.79 
 
 
791 aa  194  8e-48  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_37740  predicted protein  25 
 
 
849 aa  184  6e-45  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.689797  normal  0.0804873 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_10282  predicted protein  24.96 
 
 
614 aa  179  3e-43  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10414  DNA helicase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G05590)  23.44 
 
 
841 aa  152  3e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA05570  general RNA polymerase II transcription factor, putative  25.23 
 
 
799 aa  125  4e-27  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.946623  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0620  DEAD_2 domain-containing protein  24.23 
 
 
634 aa  117  8.999999999999998e-25  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_26944  predicted protein  27.8 
 
 
788 aa  117  1.0000000000000001e-24  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.168097 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_54072  xeroderma pigmentosum group D complementing protein  27.64 
 
 
782 aa  115  6e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_27831  predicted protein  60.22 
 
 
402 aa  112  5e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0440405 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0335  DEAD_2 domain protein  22.82 
 
 
723 aa  106  2e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1104  queuine tRNA-ribosyltransferase  23.33 
 
 
676 aa  104  6e-21  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1217  ATP-dependent helicase, putative  23.57 
 
 
781 aa  104  7e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.11747  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1737  DEAD_2 domain-containing protein  22.78 
 
 
574 aa  103  1e-20  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.000703978 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1812  DEAD_2 domain-containing protein  23.5 
 
 
617 aa  102  2e-20  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0429091  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1408  putative ATP-dependent helicase  23.2 
 
 
781 aa  102  3e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0789  helicase c2  21.99 
 
 
669 aa  101  6e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.222881  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0965  helicase c2  21.48 
 
 
654 aa  101  8e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.228923  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0196  DEAD_2 domain protein  24.16 
 
 
619 aa  99  3e-19  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.544403  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1769  DEAD_2 domain protein  22.24 
 
 
729 aa  98.2  6e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.863576  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1416  DEAD_2 domain protein  21.36 
 
 
722 aa  97.1  1e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1117  DEAD_2 domain-containing protein  22.47 
 
 
712 aa  97.4  1e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.708962  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1699  DEAD_2 domain protein  21.6 
 
 
670 aa  96.3  2e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0524758  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1117  DEAD_2 domain-containing protein  22.59 
 
 
582 aa  90.9  1e-16  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2947  DEAD_2 domain protein  22.14 
 
 
774 aa  87.4  0.000000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.443127  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1672  helicase c2  21.52 
 
 
739 aa  86.7  0.000000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2112  DEAD_2 domain-containing protein  20.97 
 
 
797 aa  87  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0134  DEAD_2 domain-containing protein  22.31 
 
 
537 aa  84.7  0.000000000000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  hitchhiker  0.00117441 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0224  DEAD_2 domain-containing protein  22.19 
 
 
852 aa  81.6  0.00000000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0115724  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1376  DNA helicase RepD  21.57 
 
 
773 aa  81.3  0.00000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.905642  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1566  Rad3-related DNA helicases  23.63 
 
 
726 aa  81.3  0.00000000000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000243015  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0390  DEAD_2 domain-containing protein  22.43 
 
 
580 aa  79  0.0000000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.12513 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2627  DEAD_2 domain protein  24.17 
 
 
723 aa  75.1  0.000000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.510755 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0289  DEAD_2  21.88 
 
 
785 aa  74.7  0.000000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00121679  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4133  DEAD_2 domain protein  20.82 
 
 
798 aa  72.4  0.00000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1288  DEAD_2 domain protein  25.97 
 
 
550 aa  70.5  0.0000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1550  DNA repair helicase  22.74 
 
 
745 aa  70.9  0.0000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0660  DEAD_2 domain protein  21.38 
 
 
790 aa  70.5  0.0000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1867  DEAD_2 domain-containing protein  26.61 
 
 
541 aa  70.1  0.0000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.512598 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1847  DEAD_2 domain-containing protein  21.76 
 
 
807 aa  69.3  0.0000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2690  DEAD_2  20.96 
 
 
772 aa  68.2  0.0000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00215798 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0995  DEAD_2 domain protein  20.27 
 
 
777 aa  68.2  0.0000000008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2909  DEAD_2  20.78 
 
 
775 aa  67  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0996428 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0015  DEAD_2 domain-containing protein  22.21 
 
 
750 aa  66.6  0.000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.338089  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5813  helicase c2  20.04 
 
 
790 aa  66.2  0.000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.208635 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4042  DEAD_2 domain protein  20.79 
 
 
798 aa  65.9  0.000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0984  DEAD_2 domain-containing protein  20.48 
 
 
773 aa  65.5  0.000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2943  DEAD_2 domain-containing protein  20.86 
 
 
753 aa  65.5  0.000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2806  DEAD_2 domain protein  21.79 
 
 
785 aa  64.3  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.717048  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0185  helicase c2  19.12 
 
 
798 aa  63.2  0.00000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0823  DEAD_2 domain protein  22.11 
 
 
739 aa  63.2  0.00000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5309  DEAD_2 domain-containing protein  21.28 
 
 
756 aa  63.5  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.173286  hitchhiker  0.0033003 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2454  Uvs006  21.6 
 
 
746 aa  62.4  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.107257  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1186  putative ATP-dependent helicase  21.6 
 
 
755 aa  62.4  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.146047  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1260  putative ATP-dependent helicase  21.6 
 
 
755 aa  62  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4233  helicase c2  21.09 
 
 
757 aa  61.2  0.00000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.134799  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2839  DEAD_2 domain protein  20.5 
 
 
762 aa  60.5  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3036  hypothetical protein  21.6 
 
 
761 aa  60.8  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0104594  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1357  DEAD_2 domain-containing protein  20.09 
 
 
575 aa  60.8  0.0000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0243831 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2850  DEAD_2 domain-containing protein  20.5 
 
 
753 aa  60.8  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2975  helicase c2  20.26 
 
 
807 aa  60.1  0.0000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3978  helicase c2  21.31 
 
 
766 aa  60.1  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0904062  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4389  helicase c2  21.31 
 
 
766 aa  60.1  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.787433  normal  0.56553 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0478  DEAD_2 domain-containing protein  21.76 
 
 
588 aa  59.7  0.0000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.738253  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4268  helicase c2  20.84 
 
 
766 aa  59.3  0.0000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0100597  normal  0.178799 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5966  helicase c2  20.57 
 
 
766 aa  58.5  0.0000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.224812  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2510  helicase c2  20.4 
 
 
788 aa  58.2  0.0000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00268076 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2630  ATP-dependent DNA helicase DinG  21.44 
 
 
691 aa  57.8  0.0000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3801  helicase c2  21.6 
 
 
766 aa  57.8  0.0000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.354929 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3423  hypothetical protein  19.85 
 
 
758 aa  57  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1498  helicase c2  18.9 
 
 
773 aa  56.2  0.000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.486316  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2470  ATP-dependent DNA helicase DinG  20.14 
 
 
690 aa  56.2  0.000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00127477 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40350  hypothetical protein  19.94 
 
 
758 aa  56.2  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.650358  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1536  DEAD_2 domain protein  21.36 
 
 
537 aa  55.5  0.000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.849616  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0928  ATP-dependent helicase, putative  21.2 
 
 
495 aa  55.5  0.000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.568065  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2972  DEAD_2 domain-containing protein  21.43 
 
 
753 aa  55.1  0.000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.114076 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1376  DNA repair helicase, truncation  21.2 
 
 
431 aa  55.1  0.000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.731908  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1180  hypothetical protein  21.57 
 
 
754 aa  54.7  0.000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.749053  normal  0.379614 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1461  ATP-dependent DNA helicase DinG  21.54 
 
 
732 aa  54.7  0.000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.498771 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5421  DEAD_2 domain protein  20.52 
 
 
754 aa  54.7  0.000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2538  ATP-dependent DNA helicase DinG  20 
 
 
690 aa  53.9  0.00001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.536241  unclonable  0.0000322681 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2630  ATP-dependent DNA helicase DinG  20 
 
 
690 aa  53.9  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.920562  hitchhiker  0.00302525 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3766  helicase c2  26.95 
 
 
806 aa  53.9  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1025  DNA polymerase III, epsilon subunit/ATP-dependent helicase DinG  22.83 
 
 
902 aa  53.1  0.00002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1918  helicase c2  27.38 
 
 
790 aa  53.5  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.885633  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1630  Rad3-related DNA helicases-like  21.4 
 
 
766 aa  53.5  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.138986  normal  0.527518 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4835  helicase c2  20.88 
 
 
874 aa  52.4  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0589586 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2777  ATP-dependent DNA helicase DinG  23.33 
 
 
726 aa  52.4  0.00004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1321  ATP-dependent DNA helicase DinG  23.33 
 
 
726 aa  52.4  0.00004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2856  ATP-dependent DNA helicase DinG  23.33 
 
 
726 aa  52.4  0.00004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.642331  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5827  DEAD_2  20.12 
 
 
779 aa  51.6  0.00006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1013  helicase c2  22.27 
 
 
588 aa  51.6  0.00007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0909  hypothetical protein  22.81 
 
 
773 aa  51.6  0.00007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.205853  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1514  DnaQ family exonuclease/DinG family helicase  23.08 
 
 
897 aa  51.2  0.00008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.103927  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>