72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_37740 on replicon NC_009370
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009370  OSTLU_37740  predicted protein  100 
 
 		 849 aa  1738    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.689797  normal  0.0804873 
 
 
-
 
NC_006684  CNB05090  CHL1 helicase, putative  35.75 
 
 		 849 aa  451  1e-125  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_54439  YPL008W (CHL1)-like protein  30.3 
 
 		 835 aa  421  1e-116  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.106037 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_10282  predicted protein  34.5 
 
 		 614 aa  388  1e-106  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10414  DNA helicase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G05590)  30.63 
 
 		 841 aa  370  1e-101  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_32894  predicted protein  26.54 
 
 		 1067 aa  224  4e-57  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0780237  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09436  5' to 3' DNA helicase (Eurofung)  24.56 
 
 		 791 aa  187  5e-46  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_37445  predicted protein  25 
 
 		 938 aa  186  2.0000000000000003e-45  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.258887  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_50344  DNA helicase component of transcription factor b  24.82 
 
 		 793 aa  178  3e-43  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_54072  xeroderma pigmentosum group D complementing protein  24.35 
 
 		 782 aa  149  3e-34  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA05570  general RNA polymerase II transcription factor, putative  29.93 
 
 		 799 aa  129  2.0000000000000002e-28  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.946623  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_26944  predicted protein  29.82 
 
 		 788 aa  130  2.0000000000000002e-28  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.168097 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_40695  predicted protein  27.09 
 
 		 749 aa  127  6e-28  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00000000149445  normal  0.993011 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_24915  predicted protein  26.97 
 
 		 791 aa  126  2e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.615618  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1672  helicase c2  29.58 
 
 		 739 aa  85.5  0.000000000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0789  helicase c2  22.17 
 
 		 669 aa  84  0.00000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.222881  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1699  DEAD_2 domain protein  21.24 
 
 		 670 aa  82.4  0.00000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0524758  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1104  queuine tRNA-ribosyltransferase  22.44 
 
 		 676 aa  80.9  0.00000000000009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0335  DEAD_2 domain protein  23.48 
 
 		 723 aa  79.7  0.0000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0196  DEAD_2 domain protein  22.14 
 
 		 619 aa  79.3  0.0000000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.544403  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2627  DEAD_2 domain protein  22.97 
 
 		 723 aa  75.1  0.000000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.510755 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0965  helicase c2  21.36 
 
 		 654 aa  70.9  0.00000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.228923  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1566  Rad3-related DNA helicases  26.97 
 
 		 726 aa  69.3  0.0000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000243015  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1769  DEAD_2 domain protein  24.03 
 
 		 729 aa  68.9  0.0000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.863576  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1737  DEAD_2 domain-containing protein  26.53 
 
 		 574 aa  63.9  0.00000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000703978 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1536  DEAD_2 domain protein  27.98 
 
 		 537 aa  63.2  0.00000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.849616  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0660  DEAD_2 domain protein  28.05 
 
 		 790 aa  62.4  0.00000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0134  DEAD_2 domain-containing protein  29.27 
 
 		 537 aa  62.4  0.00000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00117441 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0823  DEAD_2 domain protein  28.34 
 
 		 739 aa  62.4  0.00000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1416  DEAD_2 domain protein  26.92 
 
 		 722 aa  62  0.00000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0995  DEAD_2 domain protein  24.26 
 
 		 777 aa  62  0.00000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1376  DNA helicase RepD  25 
 
 		 773 aa  59.7  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.905642  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1117  DEAD_2 domain-containing protein  21.41 
 
 		 712 aa  59.3  0.0000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.708962  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2510  helicase c2  27.81 
 
 		 788 aa  55.8  0.000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00268076 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0289  DEAD_2  27.53 
 
 		 785 aa  55.1  0.000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00121679  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0390  DEAD_2 domain-containing protein  26.17 
 
 		 580 aa  54.7  0.000008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.12513 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5827  DEAD_2  32.23 
 
 		 779 aa  54.3  0.000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0015  DEAD_2 domain-containing protein  27.4 
 
 		 750 aa  54.3  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.338089  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1847  DEAD_2 domain-containing protein  22.37 
 
 		 807 aa  52.8  0.00003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0224  DEAD_2 domain-containing protein  24.64 
 
 		 852 aa  52.8  0.00003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0115724  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2972  DEAD_2 domain-containing protein  28.4 
 
 		 753 aa  50.4  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.114076 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1408  putative ATP-dependent helicase  24.27 
 
 		 781 aa  50.4  0.0001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2428  helicase c2  27.12 
 
 		 855 aa  50.1  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.376304  normal  0.732574 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1217  ATP-dependent helicase, putative  24.27 
 
 		 781 aa  49.3  0.0003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.11747  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1260  putative ATP-dependent helicase  27.72 
 
 		 755 aa  49.3  0.0003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2454  Uvs006  27.72 
 
 		 746 aa  49.3  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.107257  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0620  DEAD_2 domain-containing protein  23.74 
 
 		 634 aa  49.7  0.0003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1186  putative ATP-dependent helicase  27.72 
 
 		 755 aa  48.9  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.146047  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0888  helicase c2  28.23 
 
 		 466 aa  48.9  0.0004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2850  DEAD_2 domain-containing protein  29.09 
 
 		 753 aa  48.9  0.0004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2112  DEAD_2 domain-containing protein  22.43 
 
 		 797 aa  48.9  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1416  helicase c2  30.65 
 
 		 855 aa  48.9  0.0004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2806  DEAD_2 domain protein  26.53 
 
 		 785 aa  48.9  0.0004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.717048  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2839  DEAD_2 domain protein  29.09 
 
 		 762 aa  48.9  0.0004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1288  DEAD_2 domain protein  38.71 
 
 		 550 aa  48.5  0.0005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5813  helicase c2  29.89 
 
 		 790 aa  48.5  0.0006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.208635 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40350  hypothetical protein  25 
 
 		 758 aa  48.1  0.0006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.650358  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2515  helicase c2  30.43 
 
 		 917 aa  48.1  0.0006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1550  DNA repair helicase  26.74 
 
 		 745 aa  48.1  0.0007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0909  hypothetical protein  24.89 
 
 		 773 aa  48.1  0.0007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.205853  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0478  DEAD_2 domain-containing protein  28.57 
 
 		 588 aa  47  0.001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.738253  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5309  DEAD_2 domain-containing protein  26.63 
 
 		 756 aa  46.2  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.173286  hitchhiker  0.0033003 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2943  DEAD_2 domain-containing protein  28.48 
 
 		 753 aa  46.2  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2909  DEAD_2  25.7 
 
 		 775 aa  47  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0996428 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4835  helicase c2  28.8 
 
 		 874 aa  46.2  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0589586 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1812  DEAD_2 domain-containing protein  35.71 
 
 		 617 aa  46.2  0.003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0429091  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1376  DNA repair helicase, truncation  27.17 
 
 		 431 aa  45.8  0.003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.731908  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0928  ATP-dependent helicase, putative  26.63 
 
 		 495 aa  45.8  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.568065  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0185  helicase c2  28.69 
 
 		 798 aa  45.8  0.003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3423  hypothetical protein  24.75 
 
 		 758 aa  45.8  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1867  DEAD_2 domain-containing protein  37.36 
 
 		 541 aa  45.4  0.005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.512598 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1585  ATP-dependent DNA helicase DinG  32.61 
 
 		 725 aa  44.7  0.008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.629158  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>