245 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A1376 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A1376  DNA helicase RepD  100 
 
 		 773 aa  1585    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.905642  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1566  Rad3-related DNA helicases  56.45 
 
 		 726 aa  897    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000243015  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0335  DEAD_2 domain protein  41.71 
 
 		 723 aa  591  1e-167  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0823  DEAD_2 domain protein  41.58 
 
 		 739 aa  586  1e-166  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1769  DEAD_2 domain protein  39.97 
 
 		 729 aa  578  1.0000000000000001e-163  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.863576  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1416  DEAD_2 domain protein  40.77 
 
 		 722 aa  553  1e-156  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2627  DEAD_2 domain protein  39.17 
 
 		 723 aa  549  1e-155  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.510755 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2975  helicase c2  24.7 
 
 		 807 aa  203  9.999999999999999e-51  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0816  helicase c2  25.52 
 
 		 787 aa  202  1.9999999999999998e-50  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.524115 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2465  helicase c2  25.19 
 
 		 806 aa  191  5.999999999999999e-47  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3766  helicase c2  25.18 
 
 		 806 aa  179  1e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1918  helicase c2  26.89 
 
 		 790 aa  163  1e-38  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.885633  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1699  DEAD_2 domain protein  24.09 
 
 		 670 aa  124  5e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0524758  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0965  helicase c2  22.71 
 
 		 654 aa  123  1.9999999999999998e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.228923  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5966  helicase c2  30.31 
 
 		 766 aa  113  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.224812  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1630  Rad3-related DNA helicases-like  29.53 
 
 		 766 aa  109  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.138986  normal  0.527518 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4233  helicase c2  29.13 
 
 		 757 aa  108  3e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.134799  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4268  helicase c2  29.18 
 
 		 766 aa  108  5e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0100597  normal  0.178799 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3801  helicase c2  29.18 
 
 		 766 aa  108  5e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.354929 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3978  helicase c2  28.84 
 
 		 766 aa  107  9e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0904062  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4389  helicase c2  28.84 
 
 		 766 aa  107  9e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.787433  normal  0.56553 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0196  DEAD_2 domain protein  30.54 
 
 		 619 aa  107  1e-21  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.544403  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1550  DNA repair helicase  29.92 
 
 		 745 aa  106  1e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2454  Uvs006  29.92 
 
 		 746 aa  104  8e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.107257  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1260  putative ATP-dependent helicase  29.92 
 
 		 755 aa  103  1e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1186  putative ATP-dependent helicase  29.92 
 
 		 755 aa  103  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.146047  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09436  5' to 3' DNA helicase (Eurofung)  24.27 
 
 		 791 aa  102  2e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0928  ATP-dependent helicase, putative  29.51 
 
 		 495 aa  100  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.568065  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1376  DNA repair helicase, truncation  29.27 
 
 		 431 aa  99.4  3e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.731908  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2947  DEAD_2 domain protein  27.38 
 
 		 774 aa  99  3e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.443127  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2112  DEAD_2 domain-containing protein  20.69 
 
 		 797 aa  97.8  7e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1104  queuine tRNA-ribosyltransferase  29.63 
 
 		 676 aa  96.3  2e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1416  helicase c2  30.26 
 
 		 855 aa  95.9  3e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2428  helicase c2  29.52 
 
 		 855 aa  95.9  3e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.376304  normal  0.732574 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1672  helicase c2  25.96 
 
 		 739 aa  94.4  7e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5813  helicase c2  29.13 
 
 		 790 aa  94  9e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.208635 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0289  DEAD_2  27.78 
 
 		 785 aa  93.2  1e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00121679  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4111  helicase c2  27.16 
 
 		 766 aa  92.8  2e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.620969 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3036  hypothetical protein  26.6 
 
 		 761 aa  92.4  3e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0104594  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0660  DEAD_2 domain protein  27.38 
 
 		 790 aa  92  3e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5827  DEAD_2  27.46 
 
 		 779 aa  92.4  3e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1942  helicase c2  23.38 
 
 		 832 aa  92.4  3e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.357662  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4042  DEAD_2 domain protein  21.63 
 
 		 798 aa  91.3  5e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5309  DEAD_2 domain-containing protein  26.58 
 
 		 756 aa  91.3  6e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.173286  hitchhiker  0.0033003 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2806  DEAD_2 domain protein  26.23 
 
 		 785 aa  91.3  7e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.717048  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5421  DEAD_2 domain protein  24.13 
 
 		 754 aa  90.5  1e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1408  putative ATP-dependent helicase  25.2 
 
 		 781 aa  89.7  2e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_40695  predicted protein  23.5 
 
 		 749 aa  89.4  3e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00000000149445  normal  0.993011 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2909  DEAD_2  27.61 
 
 		 775 aa  89  3e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0996428 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1217  ATP-dependent helicase, putative  26.6 
 
 		 781 aa  88.6  4e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.11747  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1180  hypothetical protein  25.08 
 
 		 754 aa  85.9  0.000000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.749053  normal  0.379614 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0995  DEAD_2 domain protein  25.98 
 
 		 777 aa  85.5  0.000000000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0224  DEAD_2 domain-containing protein  28.35 
 
 		 852 aa  84  0.000000000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0115724  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0984  DEAD_2 domain-containing protein  24.43 
 
 		 773 aa  84  0.00000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2943  DEAD_2 domain-containing protein  26 
 
 		 753 aa  82.8  0.00000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0909  hypothetical protein  26.23 
 
 		 773 aa  82.8  0.00000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.205853  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1498  helicase c2  28.35 
 
 		 773 aa  82.4  0.00000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.486316  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0015  DEAD_2 domain-containing protein  25.19 
 
 		 750 aa  82.4  0.00000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.338089  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0185  helicase c2  23.66 
 
 		 798 aa  82  0.00000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_37445  predicted protein  21.57 
 
 		 938 aa  81.6  0.00000000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.258887  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_50344  DNA helicase component of transcription factor b  26.27 
 
 		 793 aa  81.6  0.00000000000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2510  helicase c2  25.4 
 
 		 788 aa  80.9  0.00000000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00268076 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2690  DEAD_2  25.95 
 
 		 772 aa  80.9  0.00000000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00215798 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1812  DEAD_2 domain-containing protein  21.96 
 
 		 617 aa  79.7  0.0000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0429091  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2850  DEAD_2 domain-containing protein  25.31 
 
 		 753 aa  79  0.0000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2839  DEAD_2 domain protein  25.31 
 
 		 762 aa  78.6  0.0000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3423  hypothetical protein  26.14 
 
 		 758 aa  78.6  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1361  helicase c2  24.21 
 
 		 801 aa  77.8  0.0000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_54439  YPL008W (CHL1)-like protein  21.88 
 
 		 835 aa  77.4  0.0000000000009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.106037 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4133  DEAD_2 domain protein  23.67 
 
 		 798 aa  77  0.000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0789  helicase c2  26.23 
 
 		 669 aa  76.6  0.000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.222881  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40350  hypothetical protein  24.14 
 
 		 758 aa  75.5  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.650358  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1357  DEAD_2 domain-containing protein  29.32 
 
 		 575 aa  75.1  0.000000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0243831 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1847  DEAD_2 domain-containing protein  22.86 
 
 		 807 aa  75.1  0.000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB05090  CHL1 helicase, putative  28.52 
 
 		 849 aa  73.9  0.00000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2972  DEAD_2 domain-containing protein  24.4 
 
 		 753 aa  72.8  0.00000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.114076 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0466  helicase c2  21.47 
 
 		 669 aa  72.4  0.00000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1117  DEAD_2 domain-containing protein  25.17 
 
 		 712 aa  72.4  0.00000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.708962  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4835  helicase c2  25.83 
 
 		 874 aa  71.2  0.00000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0589586 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0620  DEAD_2 domain-containing protein  21.27 
 
 		 634 aa  70.5  0.0000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_32894  predicted protein  36.11 
 
 		 1067 aa  70.9  0.0000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0780237  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1737  DEAD_2 domain-containing protein  27.03 
 
 		 574 aa  69.7  0.0000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000703978 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3112  DNA polymerase III, epsilon subunit  21.17 
 
 		 966 aa  68.6  0.0000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.0000116759  hitchhiker  0.000000000648685 
 
 
-
 
NC_006670  CNA05570  general RNA polymerase II transcription factor, putative  26.01 
 
 		 799 aa  67.8  0.0000000008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.946623  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1409  helicase c2  22.46 
 
 		 651 aa  67.4  0.0000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_26944  predicted protein  22.92 
 
 		 788 aa  67.4  0.000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.168097 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1117  DEAD_2 domain-containing protein  25.57 
 
 		 582 aa  65.1  0.000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3621  helicase c2  23 
 
 		 838 aa  65.1  0.000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3167  helicase c2  22.31 
 
 		 876 aa  64.7  0.000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000644587  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10414  DNA helicase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G05590)  25.49 
 
 		 841 aa  63.5  0.00000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1347  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  23.03 
 
 		 957 aa  63.5  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.579486 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07920  helicase c2  27.48 
 
 		 822 aa  63.9  0.00000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1727  helicase c2  24.37 
 
 		 641 aa  63.9  0.00000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0911  putative ATP-dependent helicase  21.81 
 
 		 651 aa  63.5  0.00000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1867  DEAD_2 domain-containing protein  25.79 
 
 		 541 aa  63.9  0.00000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.512598 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1288  DEAD_2 domain protein  24.9 
 
 		 550 aa  62.4  0.00000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0390  DEAD_2 domain-containing protein  26.32 
 
 		 580 aa  62.8  0.00000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.12513 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0528  helicase c2  21.61 
 
 		 667 aa  62  0.00000004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1624  ATP-dependent DNA helicase DinG  20.92 
 
 		 721 aa  61.6  0.00000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_10282  predicted protein  32.99 
 
 		 614 aa  61.2  0.00000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>