More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_0224 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_0224  DEAD_2 domain-containing protein  100 
 
 		 852 aa  1758    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0115724  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0289  DEAD_2  49.71 
 
 		 785 aa  691    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00121679  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0660  DEAD_2 domain protein  44.11 
 
 		 790 aa  642    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2947  DEAD_2 domain protein  46.84 
 
 		 774 aa  631  1e-179  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.443127  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1217  ATP-dependent helicase, putative  38.43 
 
 		 781 aa  555  1e-156  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.11747  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1408  putative ATP-dependent helicase  41.58 
 
 		 781 aa  541  9.999999999999999e-153  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0995  DEAD_2 domain protein  39.63 
 
 		 777 aa  513  1e-144  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2690  DEAD_2  32.36 
 
 		 772 aa  352  2e-95  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00215798 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5827  DEAD_2  32.95 
 
 		 779 aa  350  5e-95  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5309  DEAD_2 domain-containing protein  31.84 
 
 		 756 aa  350  8e-95  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.173286  hitchhiker  0.0033003 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1550  DNA repair helicase  31.16 
 
 		 745 aa  346  1e-93  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1180  hypothetical protein  31.97 
 
 		 754 aa  346  1e-93  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.749053  normal  0.379614 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0185  helicase c2  31.59 
 
 		 798 aa  346  1e-93  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5421  DEAD_2 domain protein  31.98 
 
 		 754 aa  343  5.999999999999999e-93  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2943  DEAD_2 domain-containing protein  32.41 
 
 		 753 aa  343  7e-93  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2839  DEAD_2 domain protein  32.26 
 
 		 762 aa  337  5e-91  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2909  DEAD_2  32.23 
 
 		 775 aa  335  1e-90  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0996428 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0984  DEAD_2 domain-containing protein  31.75 
 
 		 773 aa  335  2e-90  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2850  DEAD_2 domain-containing protein  32.41 
 
 		 753 aa  335  2e-90  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0015  DEAD_2 domain-containing protein  30.4 
 
 		 750 aa  332  2e-89  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.338089  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2972  DEAD_2 domain-containing protein  31.4 
 
 		 753 aa  331  3e-89  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.114076 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2806  DEAD_2 domain protein  31.44 
 
 		 785 aa  328  3e-88  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.717048  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1361  helicase c2  29.96 
 
 		 801 aa  326  1e-87  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1186  putative ATP-dependent helicase  31.69 
 
 		 755 aa  325  2e-87  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.146047  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4233  helicase c2  31.08 
 
 		 757 aa  325  2e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.134799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1260  putative ATP-dependent helicase  32.26 
 
 		 755 aa  325  2e-87  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2454  Uvs006  32.26 
 
 		 746 aa  325  3e-87  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.107257  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3036  hypothetical protein  31.58 
 
 		 761 aa  323  6e-87  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0104594  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5966  helicase c2  32.11 
 
 		 766 aa  319  1e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.224812  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40350  hypothetical protein  31.23 
 
 		 758 aa  317  4e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.650358  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3423  hypothetical protein  31.87 
 
 		 758 aa  315  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2510  helicase c2  30.38 
 
 		 788 aa  315  1.9999999999999998e-84  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00268076 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1498  helicase c2  30.78 
 
 		 773 aa  310  6.999999999999999e-83  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.486316  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4111  helicase c2  30.04 
 
 		 766 aa  302  1e-80  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.620969 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1847  DEAD_2 domain-containing protein  27.89 
 
 		 807 aa  300  8e-80  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2112  DEAD_2 domain-containing protein  29.02 
 
 		 797 aa  285  3.0000000000000004e-75  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4042  DEAD_2 domain protein  30.26 
 
 		 798 aa  283  9e-75  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4133  DEAD_2 domain protein  31.44 
 
 		 798 aa  282  2e-74  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1416  helicase c2  26.77 
 
 		 855 aa  268  2.9999999999999995e-70  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2428  helicase c2  26.75 
 
 		 855 aa  266  1e-69  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.376304  normal  0.732574 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5813  helicase c2  27.99 
 
 		 790 aa  265  2e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.208635 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0928  ATP-dependent helicase, putative  32.41 
 
 		 495 aa  238  4e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.568065  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4835  helicase c2  28.66 
 
 		 874 aa  235  2.0000000000000002e-60  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0589586 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1376  DNA repair helicase, truncation  33.03 
 
 		 431 aa  223  1.9999999999999999e-56  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.731908  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1630  Rad3-related DNA helicases-like  34.13 
 
 		 766 aa  177  9e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.138986  normal  0.527518 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4268  helicase c2  34.13 
 
 		 766 aa  176  1.9999999999999998e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0100597  normal  0.178799 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3801  helicase c2  34.47 
 
 		 766 aa  174  3.9999999999999995e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.354929 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3978  helicase c2  34.47 
 
 		 766 aa  174  5e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0904062  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4389  helicase c2  34.47 
 
 		 766 aa  174  5e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.787433  normal  0.56553 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0909  hypothetical protein  40.82 
 
 		 773 aa  174  6.999999999999999e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.205853  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0965  helicase c2  25.8 
 
 		 654 aa  157  1e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.228923  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1104  queuine tRNA-ribosyltransferase  24.21 
 
 		 676 aa  146  1e-33  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1117  DEAD_2 domain-containing protein  26.77 
 
 		 712 aa  138  5e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.708962  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0789  helicase c2  23.94 
 
 		 669 aa  136  1.9999999999999998e-30  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.222881  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0196  DEAD_2 domain protein  23.59 
 
 		 619 aa  133  2.0000000000000002e-29  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.544403  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1699  DEAD_2 domain protein  24.12 
 
 		 670 aa  131  5.0000000000000004e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0524758  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1672  helicase c2  26.49 
 
 		 739 aa  125  3e-27  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0478  DEAD_2 domain-containing protein  25.54 
 
 		 588 aa  117  1.0000000000000001e-24  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.738253  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1812  DEAD_2 domain-containing protein  25.12 
 
 		 617 aa  117  1.0000000000000001e-24  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0429091  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1117  DEAD_2 domain-containing protein  24.59 
 
 		 582 aa  105  4e-21  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1737  DEAD_2 domain-containing protein  24.58 
 
 		 574 aa  104  5e-21  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000703978 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1918  helicase c2  30.97 
 
 		 790 aa  95.9  3e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.885633  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0390  DEAD_2 domain-containing protein  25.04 
 
 		 580 aa  93.6  1e-17  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.12513 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1376  DNA helicase RepD  23.76 
 
 		 773 aa  91.7  5e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.905642  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1867  DEAD_2 domain-containing protein  23.91 
 
 		 541 aa  90.9  1e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.512598 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0620  DEAD_2 domain-containing protein  23.77 
 
 		 634 aa  90.5  1e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1619  helicase c2  22.73 
 
 		 629 aa  85.5  0.000000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1566  Rad3-related DNA helicases  27.85 
 
 		 726 aa  85.5  0.000000000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000243015  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2627  DEAD_2 domain protein  22.26 
 
 		 723 aa  82.4  0.00000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.510755 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_37445  predicted protein  22.19 
 
 		 938 aa  81.6  0.00000000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.258887  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1357  DEAD_2 domain-containing protein  22.87 
 
 		 575 aa  80.5  0.0000000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0243831 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0335  DEAD_2 domain protein  22.04 
 
 		 723 aa  80.5  0.0000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3766  helicase c2  28.84 
 
 		 806 aa  80.5  0.0000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0823  DEAD_2 domain protein  22.2 
 
 		 739 aa  79.3  0.0000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0979  helicase domain-containing protein  21.99 
 
 		 706 aa  77.8  0.0000000000008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0544879  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1416  DEAD_2 domain protein  25.51 
 
 		 722 aa  77.8  0.0000000000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1495  hypothetical protein  21.73 
 
 		 636 aa  77  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1467  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  27.9 
 
 		 934 aa  77  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.533097  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1990  helicase c2  22.74 
 
 		 649 aa  77.4  0.000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1197  helicase c2  22.43 
 
 		 661 aa  77.4  0.000000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.0000973223  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2022  hypothetical protein  21.1 
 
 		 636 aa  76.6  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.6889  normal  0.891564 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1961  hypothetical protein  21.73 
 
 		 636 aa  76.6  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.915388  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1310  hypothetical protein  21.73 
 
 		 636 aa  76.6  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.027986  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1965  hypothetical protein  21.1 
 
 		 636 aa  76.6  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3886  ATP-dependent helicase  23.09 
 
 		 647 aa  75.5  0.000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0816  helicase c2  31.61 
 
 		 787 aa  75.5  0.000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.524115 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1727  helicase c2  27.78 
 
 		 641 aa  74.7  0.000000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1452  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  27.24 
 
 		 934 aa  74.3  0.000000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1565  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  27.24 
 
 		 934 aa  74.3  0.000000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.554006  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1636  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  27.24 
 
 		 934 aa  73.9  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00174148 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1424  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  27.24 
 
 		 934 aa  73.9  0.00000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1425  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  27.24 
 
 		 934 aa  73.9  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.446116  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2228  helicase c2  21.13 
 
 		 639 aa  73.2  0.00000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.232993  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3747  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  27.54 
 
 		 934 aa  72.8  0.00000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.739451  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1598  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  27.54 
 
 		 934 aa  72.4  0.00000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00523268  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1859  helicase c2  28.29 
 
 		 674 aa  72.4  0.00000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.347581  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1709  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  26.81 
 
 		 934 aa  72  0.00000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000649538  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1933  helicase c2  26.27 
 
 		 639 aa  71.6  0.00000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1769  DEAD_2 domain protein  20.78 
 
 		 729 aa  71.2  0.00000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.863576  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1671  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  26.45 
 
 		 934 aa  70.5  0.0000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.697043  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>