More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maeo_0979 on replicon NC_009635
Organism: Methanococcus aeolicus Nankai-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009637  MmarC7_0466  helicase c2  61.11 
 
 		 669 aa  870    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0979  helicase domain-containing protein  100 
 
 		 706 aa  1442    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0544879  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0371  DNA repair helicase RAD3  60.4 
 
 		 669 aa  866    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0534  helicase c2  59.46 
 
 		 669 aa  846    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1453  helicase c2  60.97 
 
 		 669 aa  874    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3747  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  25.11 
 
 		 934 aa  143  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.739451  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1467  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  24.82 
 
 		 934 aa  132  2.0000000000000002e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.533097  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1824  helicase c2  23.92 
 
 		 664 aa  124  6e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.678424  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1934  helicase c2  24.6 
 
 		 640 aa  124  8e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.101214  normal  0.540234 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1197  helicase c2  23.95 
 
 		 661 aa  123  9.999999999999999e-27  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.0000973223  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2413  helicase c2  24.53 
 
 		 669 aa  121  3.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0561182  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2424  helicase c2  24.46 
 
 		 669 aa  121  6e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2532  helicase c2  24.6 
 
 		 640 aa  121  6e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.139439 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3621  helicase c2  22.36 
 
 		 838 aa  112  3e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1942  helicase c2  25.49 
 
 		 832 aa  106  1e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.357662  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0509  helicase c2  23.48 
 
 		 843 aa  106  2e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1812  DEAD_2 domain-containing protein  22.89 
 
 		 617 aa  99  3e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0429091  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2115  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  22.29 
 
 		 921 aa  98.2  4e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1899  DNA polymerase III, epsilon subunit  30.08 
 
 		 956 aa  94.4  7e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0589249 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1225  ATP-dependent DNA helicase DinG  22.19 
 
 		 714 aa  93.6  1e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1598  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  30.94 
 
 		 934 aa  90.5  1e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00523268  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3856  ATP-dependent DNA helicase DinG  21.21 
 
 		 714 aa  89  3e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.160495  normal  0.793215 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1425  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  30.94 
 
 		 934 aa  88.6  4e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.446116  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1424  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  30.94 
 
 		 934 aa  87.8  5e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1003  DNA polymerase III, epsilon subunit  28.11 
 
 		 960 aa  88.2  5e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1636  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  30.94 
 
 		 934 aa  87.8  5e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00174148 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0188  helicase c2  30.68 
 
 		 659 aa  88.2  5e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00148037  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4120  ATP-dependent helicase, DinG family  21.21 
 
 		 714 aa  87.8  6e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1452  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  30.94 
 
 		 934 aa  87.8  6e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1565  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  30.94 
 
 		 934 aa  87.8  6e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.554006  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2630  ATP-dependent DNA helicase DinG  31.87 
 
 		 690 aa  87.4  7e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.920562  hitchhiker  0.00302525 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1545  DNA polymerase III, epsilon subunit  28.4 
 
 		 944 aa  87.4  8e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.676592  decreased coverage  0.000191845 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1886  hypothetical protein  28.45 
 
 		 652 aa  87  0.000000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2470  ATP-dependent DNA helicase DinG  31.87 
 
 		 690 aa  87  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00127477 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0224  DEAD_2 domain-containing protein  23.04 
 
 		 852 aa  87  0.000000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0115724  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1709  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  30.19 
 
 		 934 aa  85.5  0.000000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000649538  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1671  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  30.19 
 
 		 934 aa  85.5  0.000000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.697043  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1566  ATP-dependent DNA helicase DinG  29.48 
 
 		 692 aa  85.5  0.000000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000620367 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0196  DEAD_2 domain protein  30 
 
 		 619 aa  85.5  0.000000000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.544403  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2538  ATP-dependent DNA helicase DinG  31.08 
 
 		 690 aa  85.5  0.000000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.536241  unclonable  0.0000322681 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1743  DNA polymerase III, epsilon subunit  27.67 
 
 		 930 aa  85.1  0.000000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.23026  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0709  helicase c2  25.55 
 
 		 650 aa  84.7  0.000000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.968194 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1235  helicase c2  26.34 
 
 		 743 aa  84.3  0.000000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0895293  normal  0.149585 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1265  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  31.51 
 
 		 929 aa  84.3  0.000000000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00466144  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1897  hypothetical protein  27.59 
 
 		 652 aa  84.3  0.000000000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1513  ATP-dependent DNA helicase DinG  31.08 
 
 		 690 aa  84.3  0.000000000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.433839  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2656  ATP-dependent DNA helicase DinG  28.74 
 
 		 690 aa  84.3  0.000000000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.765136  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0820  helicase c2  25.45 
 
 		 650 aa  84  0.000000000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.932295  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1819  ATP-dependent DNA helicase DinG  31.47 
 
 		 690 aa  83.6  0.00000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2483  ATP-dependent DNA helicase DinG  29.12 
 
 		 690 aa  83.6  0.00000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00204554 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1249  ATP-dependent DNA helicase DinG  30.12 
 
 		 691 aa  84  0.00000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000153763 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0997  helicase c2  27.56 
 
 		 643 aa  82.8  0.00000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.179863 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2429  ATP-dependent DNA helicase DinG  28.35 
 
 		 691 aa  83.2  0.00000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6611  helicase c2  31.03 
 
 		 729 aa  83.2  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0933933 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1863  helicase c2  25.81 
 
 		 668 aa  82.8  0.00000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.879395 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1154  DNA polymerase III, epsilon subunit  29.31 
 
 		 921 aa  82.4  0.00000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3224  DNA polymerase III, epsilon subunit  27.43 
 
 		 927 aa  82.4  0.00000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00101103  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3086  ATP-dependent DNA helicase DinG  29.88 
 
 		 692 aa  81.6  0.00000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.175143  hitchhiker  0.0000411022 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1342  helicase c2  25.23 
 
 		 754 aa  81.6  0.00000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0411  helicase c2  27.48 
 
 		 646 aa  81.6  0.00000000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4486  helicase c2  25 
 
 		 714 aa  81.3  0.00000000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.24845  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1156  helicase c2  29.92 
 
 		 649 aa  81.3  0.00000000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1347  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  32.02 
 
 		 957 aa  80.9  0.00000000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.579486 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1737  DEAD_2 domain-containing protein  23.96 
 
 		 574 aa  80.9  0.00000000000008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000703978 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2156  DNA polymerase III, epsilon subunit  27.52 
 
 		 934 aa  80.1  0.0000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.814989  hitchhiker  0.00934468 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2535  helicase C2  28.05 
 
 		 645 aa  80.1  0.0000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.801549  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1618  ATP-dependent DNA helicase DinG  29.88 
 
 		 690 aa  79.3  0.0000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.326155  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1652  ATP-dependent DNA helicase DinG  29.88 
 
 		 690 aa  79.3  0.0000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.303868 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2725  ATP-dependent DNA helicase DinG  29.88 
 
 		 690 aa  79.3  0.0000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0300555  hitchhiker  0.000425027 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1629  ATP-dependent DNA helicase DinG  29.88 
 
 		 690 aa  79.7  0.0000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.117477  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0916  DnaQ family exonuclease/DinG family helicase  31.1 
 
 		 954 aa  78.6  0.0000000000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1847  DEAD_2 domain-containing protein  22.18 
 
 		 807 aa  78.2  0.0000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0897  helicase c2  24.5 
 
 		 647 aa  78.2  0.0000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2196  helicase c2  27.89 
 
 		 641 aa  78.2  0.0000000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00456377 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2630  ATP-dependent DNA helicase DinG  28.63 
 
 		 691 aa  77.8  0.0000000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1626  ATP-dependent DNA helicase-related protein  28.14 
 
 		 713 aa  77  0.000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1593  helicase c2  27.71 
 
 		 725 aa  76.6  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.601772  normal  0.0255754 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4634  helicase c2  28.63 
 
 		 674 aa  76.6  0.000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0733  ATP-dependent DNA helicase  28.44 
 
 		 640 aa  76.6  0.000000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.982369  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0911  putative ATP-dependent helicase  29.26 
 
 		 651 aa  76.6  0.000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2677  helicase c2  25.17 
 
 		 646 aa  76.3  0.000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.663694  normal  0.183253 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1940  ATP-dependent helicase DinG  30.28 
 
 		 665 aa  76.3  0.000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.497186  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2527  helicase c2  32.34 
 
 		 653 aa  75.9  0.000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0816709  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3886  ATP-dependent helicase  31.78 
 
 		 647 aa  75.5  0.000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1575  putative ATP-dependent helicase  27.51 
 
 		 646 aa  75.5  0.000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.718112  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2205  helicase c2  25.22 
 
 		 676 aa  75.9  0.000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.632178  normal  0.363279 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2316  helicase c2  28.27 
 
 		 670 aa  75.5  0.000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1619  helicase c2  26.85 
 
 		 629 aa  75.5  0.000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1921  helicase c2  27.27 
 
 		 725 aa  75.1  0.000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.782434  normal  0.028244 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1727  helicase c2  26.98 
 
 		 641 aa  75.1  0.000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1106  helicase c2  30.86 
 
 		 636 aa  75.1  0.000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.243566 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2178  ATP-dependent DNA helicase DinG  30.16 
 
 		 686 aa  75.1  0.000000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.647766 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19450  ATP-dependent DNA helicase DinG  19.89 
 
 		 714 aa  74.7  0.000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0648  helicase c2  26.67 
 
 		 668 aa  74.7  0.000000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1828  helicase c2  26.07 
 
 		 688 aa  73.9  0.000000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.147958  normal  0.434412 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2228  helicase c2  26.7 
 
 		 639 aa  73.6  0.00000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.232993  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1900  helicase c2  26.07 
 
 		 688 aa  73.9  0.00000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2378  helicase c2  26.58 
 
 		 636 aa  73.9  0.00000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2617  helicase c2  27.52 
 
 		 668 aa  73.2  0.00000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.203354  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2809  helicase c2  31.28 
 
 		 707 aa  73.6  0.00000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>