More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aboo_0196 on replicon NC_013926
Organism: Aciduliprofundum boonei T469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013926  Aboo_0196  DEAD_2 domain protein  100 
 
 		 619 aa  1264    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.544403  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1812  DEAD_2 domain-containing protein  28.32 
 
 		 617 aa  208  2e-52  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0429091  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4133  DEAD_2 domain protein  26.87 
 
 		 798 aa  198  2.0000000000000003e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4042  DEAD_2 domain protein  26.15 
 
 		 798 aa  197  4.0000000000000005e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1104  queuine tRNA-ribosyltransferase  26.75 
 
 		 676 aa  194  3e-48  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0335  DEAD_2 domain protein  24.79 
 
 		 723 aa  189  1e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1847  DEAD_2 domain-containing protein  25.48 
 
 		 807 aa  187  4e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1769  DEAD_2 domain protein  25.29 
 
 		 729 aa  184  3e-45  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.863576  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2947  DEAD_2 domain protein  25.91 
 
 		 774 aa  184  3e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.443127  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2112  DEAD_2 domain-containing protein  25.2 
 
 		 797 aa  181  2.9999999999999997e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0823  DEAD_2 domain protein  24.53 
 
 		 739 aa  179  1e-43  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1416  DEAD_2 domain protein  24.03 
 
 		 722 aa  172  2e-41  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2627  DEAD_2 domain protein  24.26 
 
 		 723 aa  172  2e-41  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.510755 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1117  DEAD_2 domain-containing protein  24.61 
 
 		 712 aa  172  2e-41  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.708962  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1699  DEAD_2 domain protein  25.94 
 
 		 670 aa  171  3e-41  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0524758  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0289  DEAD_2  26.39 
 
 		 785 aa  169  2e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00121679  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0660  DEAD_2 domain protein  26.84 
 
 		 790 aa  168  2.9999999999999998e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1217  ATP-dependent helicase, putative  27.3 
 
 		 781 aa  168  2.9999999999999998e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.11747  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0789  helicase c2  23.77 
 
 		 669 aa  167  5e-40  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.222881  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1408  putative ATP-dependent helicase  27.46 
 
 		 781 aa  167  5.9999999999999996e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1737  DEAD_2 domain-containing protein  28.26 
 
 		 574 aa  163  1e-38  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000703978 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0478  DEAD_2 domain-containing protein  26.7 
 
 		 588 aa  158  2e-37  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.738253  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0965  helicase c2  24.69 
 
 		 654 aa  155  2.9999999999999998e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.228923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1357  DEAD_2 domain-containing protein  26.05 
 
 		 575 aa  152  2e-35  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0243831 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1117  DEAD_2 domain-containing protein  25.7 
 
 		 582 aa  150  5e-35  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0995  DEAD_2 domain protein  24.84 
 
 		 777 aa  147  6e-34  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0224  DEAD_2 domain-containing protein  24.23 
 
 		 852 aa  144  5e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0115724  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5827  DEAD_2  24.47 
 
 		 779 aa  140  7e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4835  helicase c2  24.47 
 
 		 874 aa  139  1e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0589586 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0390  DEAD_2 domain-containing protein  26.59 
 
 		 580 aa  139  1e-31  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.12513 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1672  helicase c2  25.19 
 
 		 739 aa  139  2e-31  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1566  Rad3-related DNA helicases  23.83 
 
 		 726 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000243015  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3036  hypothetical protein  23.98 
 
 		 761 aa  132  3e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0104594  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2909  DEAD_2  23.04 
 
 		 775 aa  127  6e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0996428 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2690  DEAD_2  22.15 
 
 		 772 aa  127  7e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00215798 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2972  DEAD_2 domain-containing protein  22.81 
 
 		 753 aa  126  1e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.114076 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5421  DEAD_2 domain protein  21.59 
 
 		 754 aa  125  2e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2943  DEAD_2 domain-containing protein  22.26 
 
 		 753 aa  125  3e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0015  DEAD_2 domain-containing protein  24.88 
 
 		 750 aa  123  9.999999999999999e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.338089  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1288  DEAD_2 domain protein  24.88 
 
 		 550 aa  121  3e-26  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1498  helicase c2  21.8 
 
 		 773 aa  120  6e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.486316  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0185  helicase c2  23.25 
 
 		 798 aa  120  9.999999999999999e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0620  DEAD_2 domain-containing protein  25.2 
 
 		 634 aa  119  1.9999999999999998e-25  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3423  hypothetical protein  24.17 
 
 		 758 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2839  DEAD_2 domain protein  22.59 
 
 		 762 aa  118  3e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2850  DEAD_2 domain-containing protein  22.75 
 
 		 753 aa  118  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5309  DEAD_2 domain-containing protein  21.43 
 
 		 756 aa  117  7.999999999999999e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.173286  hitchhiker  0.0033003 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0909  hypothetical protein  21.93 
 
 		 773 aa  115  3e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.205853  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40350  hypothetical protein  23.16 
 
 		 758 aa  113  9e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.650358  normal  1 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_37445  predicted protein  24.16 
 
 		 938 aa  112  2.0000000000000002e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.258887  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2510  helicase c2  22.54 
 
 		 788 aa  112  2.0000000000000002e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00268076 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1918  helicase c2  23.21 
 
 		 790 aa  111  4.0000000000000004e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.885633  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1361  helicase c2  20.58 
 
 		 801 aa  110  9.000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1376  DNA helicase RepD  30.54 
 
 		 773 aa  106  1e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.905642  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1412  helicase c2  23.87 
 
 		 658 aa  105  2e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.102914  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5813  helicase c2  31.02 
 
 		 790 aa  105  3e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.208635 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0528  helicase c2  25.15 
 
 		 667 aa  103  1e-20  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_24915  predicted protein  22.49 
 
 		 791 aa  102  2e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.615618  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0911  putative ATP-dependent helicase  25 
 
 		 651 aa  100  7e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2806  DEAD_2 domain protein  28.99 
 
 		 785 aa  99.8  1e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.717048  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0816  helicase c2  20.75 
 
 		 787 aa  99  2e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.524115 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4111  helicase c2  29.28 
 
 		 766 aa  99.4  2e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.620969 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2809  helicase c2  24.32 
 
 		 707 aa  99.4  2e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2677  helicase c2  22.6 
 
 		 646 aa  98.6  3e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.663694  normal  0.183253 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0411  helicase c2  23.44 
 
 		 646 aa  97.8  5e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1933  helicase c2  23.8 
 
 		 639 aa  96.7  1e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1106  helicase c2  24.36 
 
 		 636 aa  95.5  2e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.243566 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1867  DEAD_2 domain-containing protein  24.87 
 
 		 541 aa  95.9  2e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.512598 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5966  helicase c2  27.91 
 
 		 766 aa  95.5  3e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.224812  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1727  helicase c2  22.86 
 
 		 641 aa  95.1  3e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4233  helicase c2  27.91 
 
 		 757 aa  95.5  3e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.134799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2763  helicase c2  23.89 
 
 		 634 aa  94.7  4e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0359097  hitchhiker  0.00537714 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2228  helicase c2  23.33 
 
 		 639 aa  94.7  4e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.232993  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3766  helicase c2  33.99 
 
 		 806 aa  94.7  4e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01374  ATP-dependent helicase  24.15 
 
 		 644 aa  94.4  6e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1630  Rad3-related DNA helicases-like  27.44 
 
 		 766 aa  93.6  9e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.138986  normal  0.527518 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3978  helicase c2  27.44 
 
 		 766 aa  93.6  9e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0904062  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4389  helicase c2  27.44 
 
 		 766 aa  93.6  9e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.787433  normal  0.56553 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004095  DinG family ATP-dependent helicase YoaA  24.77 
 
 		 646 aa  93.6  1e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0897  helicase c2  23.24 
 
 		 647 aa  93.2  1e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1180  hypothetical protein  26.98 
 
 		 754 aa  93.2  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.749053  normal  0.379614 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4268  helicase c2  27.44 
 
 		 766 aa  93.6  1e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0100597  normal  0.178799 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2630  ATP-dependent DNA helicase DinG  22.27 
 
 		 691 aa  93.2  1e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3801  helicase c2  27.44 
 
 		 766 aa  93.2  1e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.354929 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09436  5' to 3' DNA helicase (Eurofung)  22.67 
 
 		 791 aa  92.4  2e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1225  ATP-dependent DNA helicase DinG  22.09 
 
 		 714 aa  92.4  2e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2378  helicase c2  23.28 
 
 		 636 aa  92.8  2e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1575  putative ATP-dependent helicase  24.28 
 
 		 646 aa  91.7  3e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.718112  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2097  helicase c2  22.71 
 
 		 644 aa  91.7  4e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0479006  normal  0.269462 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2128  helicase c2  23.11 
 
 		 634 aa  91.7  4e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2017  hypothetical protein  23.11 
 
 		 634 aa  91.3  5e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.451998  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1416  helicase c2  28.7 
 
 		 855 aa  91.3  5e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2527  helicase c2  22.89 
 
 		 653 aa  91.3  5e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0816709  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07920  helicase c2  24.81 
 
 		 822 aa  90.9  6e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0997  helicase c2  23.82 
 
 		 643 aa  90.5  8e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.179863 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0636  helicase c2  23.49 
 
 		 660 aa  90.5  8e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2454  Uvs006  26.98 
 
 		 746 aa  90.5  9e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.107257  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_50344  DNA helicase component of transcription factor b  21.77 
 
 		 793 aa  89.7  1e-16  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA05570  general RNA polymerase II transcription factor, putative  21.82 
 
 		 799 aa  89.7  1e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.946623  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2428  helicase c2  28.24 
 
 		 855 aa  89.7  1e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.376304  normal  0.732574 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>