256 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_5421 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_1416  helicase c2  53.29 
 
 		 855 aa  818    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2839  DEAD_2 domain protein  59.39 
 
 		 762 aa  904    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4233  helicase c2  70.9 
 
 		 757 aa  1061    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.134799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1186  putative ATP-dependent helicase  73.8 
 
 		 755 aa  1061    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.146047  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3036  hypothetical protein  58.48 
 
 		 761 aa  902    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0104594  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0928  ATP-dependent helicase, putative  74.34 
 
 		 495 aa  696    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.568065  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5813  helicase c2  60.23 
 
 		 790 aa  876    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.208635 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2909  DEAD_2  59.15 
 
 		 775 aa  924    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0996428 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2943  DEAD_2 domain-containing protein  59.52 
 
 		 753 aa  917    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5827  DEAD_2  57.6 
 
 		 779 aa  892    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2454  Uvs006  73.49 
 
 		 746 aa  1045    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.107257  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2690  DEAD_2  59.5 
 
 		 772 aa  931    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00215798 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1630  Rad3-related DNA helicases-like  70.72 
 
 		 766 aa  1068    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.138986  normal  0.527518 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1550  DNA repair helicase  73.62 
 
 		 745 aa  1093    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5966  helicase c2  70.85 
 
 		 766 aa  1057    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.224812  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3423  hypothetical protein  60.34 
 
 		 758 aa  922    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1361  helicase c2  56.91 
 
 		 801 aa  906    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1180  hypothetical protein  94.16 
 
 		 754 aa  1462    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.749053  normal  0.379614 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1498  helicase c2  56.22 
 
 		 773 aa  856    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.486316  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1260  putative ATP-dependent helicase  73.54 
 
 		 755 aa  1058    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3978  helicase c2  71.11 
 
 		 766 aa  1062    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0904062  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5309  DEAD_2 domain-containing protein  75.03 
 
 		 756 aa  1181    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.173286  hitchhiker  0.0033003 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2510  helicase c2  56.42 
 
 		 788 aa  874    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00268076 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3801  helicase c2  71.37 
 
 		 766 aa  1072    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.354929 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40350  hypothetical protein  59.97 
 
 		 758 aa  909    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.650358  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4111  helicase c2  59.15 
 
 		 766 aa  912    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.620969 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4389  helicase c2  71.11 
 
 		 766 aa  1062    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.787433  normal  0.56553 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2972  DEAD_2 domain-containing protein  58.17 
 
 		 753 aa  918    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.114076 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5421  DEAD_2 domain protein  100 
 
 		 754 aa  1549    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2850  DEAD_2 domain-containing protein  59.65 
 
 		 753 aa  909    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0015  DEAD_2 domain-containing protein  48.07 
 
 		 750 aa  704    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.338089  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0185  helicase c2  55.74 
 
 		 798 aa  816    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0984  DEAD_2 domain-containing protein  60.31 
 
 		 773 aa  941    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2806  DEAD_2 domain protein  56.75 
 
 		 785 aa  830    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.717048  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2428  helicase c2  52.82 
 
 		 855 aa  813    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.376304  normal  0.732574 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0909  hypothetical protein  58.92 
 
 		 773 aa  848    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.205853  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4268  helicase c2  71.37 
 
 		 766 aa  1074    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0100597  normal  0.178799 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1376  DNA repair helicase, truncation  72.9 
 
 		 431 aa  635  1e-180  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.731908  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2947  DEAD_2 domain protein  35.17 
 
 		 774 aa  446  1.0000000000000001e-124  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.443127  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0660  DEAD_2 domain protein  33.38 
 
 		 790 aa  441  9.999999999999999e-123  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1408  putative ATP-dependent helicase  32.77 
 
 		 781 aa  436  1e-121  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0995  DEAD_2 domain protein  32 
 
 		 777 aa  426  1e-118  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1217  ATP-dependent helicase, putative  31.98 
 
 		 781 aa  427  1e-118  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.11747  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0289  DEAD_2  33.33 
 
 		 785 aa  424  1e-117  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00121679  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0224  DEAD_2 domain-containing protein  31.98 
 
 		 852 aa  343  5.999999999999999e-93  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0115724  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1847  DEAD_2 domain-containing protein  28.3 
 
 		 807 aa  247  4e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2112  DEAD_2 domain-containing protein  28.42 
 
 		 797 aa  247  4.9999999999999997e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4133  DEAD_2 domain protein  29.3 
 
 		 798 aa  242  2e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4042  DEAD_2 domain protein  28.48 
 
 		 798 aa  241  4e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4835  helicase c2  28.96 
 
 		 874 aa  174  3.9999999999999995e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0589586 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0965  helicase c2  25.37 
 
 		 654 aa  120  7e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.228923  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1104  queuine tRNA-ribosyltransferase  26.55 
 
 		 676 aa  119  1.9999999999999998e-25  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0196  DEAD_2 domain protein  21.59 
 
 		 619 aa  119  3e-25  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.544403  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1117  DEAD_2 domain-containing protein  23.62 
 
 		 712 aa  116  2.0000000000000002e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.708962  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0478  DEAD_2 domain-containing protein  24.66 
 
 		 588 aa  116  2.0000000000000002e-24  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.738253  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0789  helicase c2  25.97 
 
 		 669 aa  108  5e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.222881  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1812  DEAD_2 domain-containing protein  23.86 
 
 		 617 aa  103  9e-21  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0429091  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1699  DEAD_2 domain protein  25.93 
 
 		 670 aa  97.1  1e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0524758  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1672  helicase c2  24.02 
 
 		 739 aa  92  3e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1376  DNA helicase RepD  24.13 
 
 		 773 aa  90.5  9e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.905642  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1737  DEAD_2 domain-containing protein  22.9 
 
 		 574 aa  89.4  2e-16  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000703978 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1117  DEAD_2 domain-containing protein  23.75 
 
 		 582 aa  87.4  8e-16  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1566  Rad3-related DNA helicases  21.01 
 
 		 726 aa  84.3  0.000000000000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000243015  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1867  DEAD_2 domain-containing protein  22.93 
 
 		 541 aa  83.6  0.00000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.512598 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1288  DEAD_2 domain protein  19.97 
 
 		 550 aa  83.2  0.00000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1357  DEAD_2 domain-containing protein  23.41 
 
 		 575 aa  83.2  0.00000000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0243831 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0534  helicase c2  21.57 
 
 		 669 aa  82.4  0.00000000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0466  helicase c2  21.18 
 
 		 669 aa  80.5  0.0000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1453  helicase c2  21 
 
 		 669 aa  76.3  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0371  DNA repair helicase RAD3  21.03 
 
 		 669 aa  75.9  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0390  DEAD_2 domain-containing protein  23.21 
 
 		 580 aa  75.1  0.000000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.12513 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1918  helicase c2  25.66 
 
 		 790 aa  74.7  0.000000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.885633  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3766  helicase c2  27.02 
 
 		 806 aa  72.4  0.00000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0335  DEAD_2 domain protein  22.63 
 
 		 723 aa  67.4  0.0000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1769  DEAD_2 domain protein  23.91 
 
 		 729 aa  67  0.000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.863576  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0816  helicase c2  26.85 
 
 		 787 aa  65.9  0.000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.524115 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0620  DEAD_2 domain-containing protein  22.78 
 
 		 634 aa  65.1  0.000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2118  ATP-dependent DNA helicase DinG  25 
 
 		 707 aa  64.3  0.000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.149773  hitchhiker  0.000000714427 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11361  ATP-dependent helicase dinG  28.46 
 
 		 664 aa  62.4  0.00000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00520548  normal  0.0965757 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4634  helicase c2  23.11 
 
 		 674 aa  60.8  0.00000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2272  ATP-dependent DNA helicase DinG  27.71 
 
 		 712 aa  60.5  0.0000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17400  DNA helicase, Rad3  25.33 
 
 		 765 aa  60.5  0.0000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0589917  normal  0.041503 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3841  helicase c2  25.43 
 
 		 665 aa  59.7  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.478709  normal  0.0359375 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2347  helicase c2  30 
 
 		 670 aa  59.7  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.490547  normal  0.859108 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3855  helicase c2  25.43 
 
 		 665 aa  59.7  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.210682  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3929  helicase c2  25.43 
 
 		 665 aa  59.7  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0336304  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1129  ATP-dependent DNA helicase DinG  24.37 
 
 		 694 aa  59.7  0.0000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0640459  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1480  helicase c2  27.03 
 
 		 710 aa  59.3  0.0000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.124092  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0280  helicase c2  29.63 
 
 		 683 aa  58.2  0.0000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0332575 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4298  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.23 
 
 		 666 aa  58.2  0.0000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.641288 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0823  DEAD_2 domain protein  25.51 
 
 		 739 aa  57.8  0.0000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1197  helicase c2  22.57 
 
 		 661 aa  57.8  0.0000008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.0000973223  normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB05090  CHL1 helicase, putative  35.85 
 
 		 849 aa  57  0.000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2515  helicase c2  29.8 
 
 		 917 aa  57  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0979  helicase domain-containing protein  23.44 
 
 		 706 aa  57  0.000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0544879  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3747  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  20.39 
 
 		 934 aa  57  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.739451  normal  1 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_54072  xeroderma pigmentosum group D complementing protein  22.57 
 
 		 782 aa  56.6  0.000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0323  helicase c2  25.27 
 
 		 699 aa  56.2  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000323796 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23060  DNA helicase, Rad3  28.85 
 
 		 692 aa  56.2  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0774743 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2877  helicase c2  28.21 
 
 		 658 aa  56.2  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.679539 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>