More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_0280 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_0323  helicase c2  93.92 
 
 		 699 aa  1213    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000323796 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0239  helicase c2  61.82 
 
 		 664 aa  763    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0280  helicase c2  100 
 
 		 683 aa  1334    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0332575 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29270  DNA helicase, Rad3  52.28 
 
 		 684 aa  605  1.0000000000000001e-171  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.318454 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0995  helicase c2  52.06 
 
 		 681 aa  597  1e-169  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.900844  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6530  putative ATP-dependent helicase  50.52 
 
 		 674 aa  581  1e-164  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.290122  normal  0.0410108 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3345  DEAD/DEAH box helicase domain protein  51.09 
 
 		 694 aa  574  1.0000000000000001e-162  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.127637  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1504  helicase c2  53.42 
 
 		 672 aa  572  1.0000000000000001e-162  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.328202  normal  0.416282 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1812  helicase c2  48.36 
 
 		 706 aa  568  1e-160  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1957  helicase c2  49.57 
 
 		 699 aa  559  1e-158  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0276528  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17400  DNA helicase, Rad3  49.92 
 
 		 765 aa  556  1e-157  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0589917  normal  0.041503 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2205  helicase c2  51.56 
 
 		 676 aa  556  1e-157  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.632178  normal  0.363279 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4298  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  50.97 
 
 		 666 aa  556  1e-157  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.641288 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2167  helicase c2:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  50.44 
 
 		 706 aa  554  1e-156  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3841  helicase c2  50.08 
 
 		 665 aa  548  1e-155  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.478709  normal  0.0359375 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3855  helicase c2  50.08 
 
 		 665 aa  548  1e-154  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.210682  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23060  DNA helicase, Rad3  48.9 
 
 		 692 aa  548  1e-154  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0774743 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3929  helicase c2  50.08 
 
 		 665 aa  548  1e-154  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0336304  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10610  DNA helicase, Rad3  49.62 
 
 		 673 aa  546  1e-154  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.382167  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11361  ATP-dependent helicase dinG  50.08 
 
 		 664 aa  543  1e-153  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00520548  normal  0.0965757 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2347  helicase c2  50 
 
 		 670 aa  539  9.999999999999999e-153  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.490547  normal  0.859108 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1280  helicase c2  49.85 
 
 		 677 aa  537  1e-151  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0225088  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1467  helicase c2  48.52 
 
 		 690 aa  528  1e-148  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0659778  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2435  helicase c2  50.9 
 
 		 679 aa  516  1.0000000000000001e-145  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.184328  normal  0.864461 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1256  helicase c2  49.57 
 
 		 696 aa  513  1e-144  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1563  helicase c2  47.99 
 
 		 728 aa  511  1e-143  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.192384  decreased coverage  0.00181092 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1052  helicase c2  48.17 
 
 		 669 aa  503  1e-141  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.325194 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1469  helicase c2  47.39 
 
 		 685 aa  501  1e-140  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000142659 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3824  helicase c2  47.24 
 
 		 676 aa  480  1e-134  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.00296278  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1480  helicase c2  47.46 
 
 		 710 aa  476  1e-133  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.124092  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07310  putative glutamate--cysteine ligase/putative amino acid ligase  46.14 
 
 		 699 aa  464  1e-129  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1566  helicase c2  47.61 
 
 		 844 aa  333  9e-90  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.102401  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1364  helicase c2  36.31 
 
 		 640 aa  300  5e-80  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1897  hypothetical protein  32.25 
 
 		 652 aa  295  2e-78  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2677  helicase c2  32.97 
 
 		 646 aa  294  3e-78  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.663694  normal  0.183253 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1886  hypothetical protein  31.48 
 
 		 652 aa  290  7e-77  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1412  helicase c2  33.94 
 
 		 658 aa  284  4.0000000000000003e-75  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.102914  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0709  helicase c2  33.84 
 
 		 650 aa  283  9e-75  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.968194 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1235  helicase c2  33.33 
 
 		 743 aa  283  1e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0895293  normal  0.149585 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0820  helicase c2  33.78 
 
 		 650 aa  282  2e-74  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.932295  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2763  helicase c2  34.36 
 
 		 634 aa  280  5e-74  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0359097  hitchhiker  0.00537714 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1626  ATP-dependent DNA helicase-related protein  33.62 
 
 		 713 aa  280  7e-74  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01597  ATP-dependent helicase  35.47 
 
 		 675 aa  279  1e-73  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0636  helicase c2  35.19 
 
 		 660 aa  279  1e-73  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6611  helicase c2  34.09 
 
 		 729 aa  278  3e-73  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0933933 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0997  helicase c2  34.72 
 
 		 643 aa  277  5e-73  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.179863 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4634  helicase c2  32.48 
 
 		 674 aa  275  2.0000000000000002e-72  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1835  helicase c2  33.9 
 
 		 636 aa  274  4.0000000000000004e-72  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00837342  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1380  hypothetical protein  33.9 
 
 		 636 aa  273  6e-72  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.434814  normal  0.350106 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2535  hypothetical protein  33.9 
 
 		 636 aa  273  1e-71  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.50615  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01778  conserved protein with nucleoside triphosphate hydrolase domain  33.9 
 
 		 636 aa  273  1e-71  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.548012  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01766  hypothetical protein  33.9 
 
 		 636 aa  273  1e-71  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.479225  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1896  hypothetical protein  33.9 
 
 		 636 aa  273  1e-71  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1825  helicase c2  33.9 
 
 		 636 aa  273  1e-71  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.979985  normal  0.491186 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2034  hypothetical protein  33.9 
 
 		 636 aa  273  1e-71  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2022  hypothetical protein  33.54 
 
 		 636 aa  272  2e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.6889  normal  0.891564 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1965  hypothetical protein  33.54 
 
 		 636 aa  272  2e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1961  hypothetical protein  33.54 
 
 		 636 aa  271  2e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.915388  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1310  hypothetical protein  33.84 
 
 		 636 aa  271  2.9999999999999997e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.027986  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2378  helicase c2  34.35 
 
 		 636 aa  271  2.9999999999999997e-71  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0411  helicase c2  34.5 
 
 		 646 aa  271  2.9999999999999997e-71  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2068  hypothetical protein  33.74 
 
 		 636 aa  270  5.9999999999999995e-71  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1575  putative ATP-dependent helicase  32.48 
 
 		 646 aa  270  5.9999999999999995e-71  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.718112  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0363  ATP-dependent helicase DinG  32.68 
 
 		 840 aa  270  7e-71  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.01237  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2406  hypothetical protein  33.99 
 
 		 634 aa  270  7e-71  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00282147  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1921  helicase c2  33.05 
 
 		 725 aa  270  8.999999999999999e-71  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.782434  normal  0.028244 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1495  hypothetical protein  33.38 
 
 		 636 aa  269  1e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2128  helicase c2  33.84 
 
 		 634 aa  270  1e-70  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2809  helicase c2  31.43 
 
 		 707 aa  270  1e-70  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3093  helicase c2  34.6 
 
 		 681 aa  268  2e-70  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.649657 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1593  helicase c2  32.76 
 
 		 725 aa  268  2.9999999999999995e-70  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.601772  normal  0.0255754 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2013  helicase c2  33.69 
 
 		 639 aa  268  2.9999999999999995e-70  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.479282  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01131  ATP-dependent helicase  32.2 
 
 		 639 aa  268  2.9999999999999995e-70  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.625206  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4478  helicase c2  35.76 
 
 		 633 aa  267  5e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.647625  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004095  DinG family ATP-dependent helicase YoaA  32.01 
 
 		 646 aa  267  5e-70  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01374  ATP-dependent helicase  31.64 
 
 		 644 aa  267  5.999999999999999e-70  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4459  helicase c2  35.1 
 
 		 633 aa  266  8e-70  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.157065  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1863  helicase c2  36.1 
 
 		 668 aa  266  8e-70  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.879395 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1933  helicase c2  33.59 
 
 		 639 aa  266  1e-69  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2094  helicase c2  36.18 
 
 		 673 aa  266  1e-69  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.239782  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4323  helicase c2  34.84 
 
 		 631 aa  266  1e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1990  helicase c2  33.84 
 
 		 649 aa  265  2e-69  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2147  helicase c2  34.35 
 
 		 641 aa  265  2e-69  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0303331  hitchhiker  0.00135971 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1409  helicase c2  34.63 
 
 		 651 aa  265  2e-69  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2517  ATP-dependent helicase, DEXD family  34.35 
 
 		 641 aa  265  2e-69  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.764826  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0911  putative ATP-dependent helicase  32.59 
 
 		 651 aa  264  4e-69  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2228  helicase c2  33.74 
 
 		 639 aa  264  4.999999999999999e-69  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.232993  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1295  helicase c2  35.67 
 
 		 664 aa  263  1e-68  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0532  helicase c2  34.74 
 
 		 649 aa  263  1e-68  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0648  helicase c2  31.31 
 
 		 668 aa  262  2e-68  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1156  helicase c2  35.1 
 
 		 649 aa  261  2e-68  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2316  helicase c2  34.89 
 
 		 670 aa  261  3e-68  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2617  helicase c2  34.52 
 
 		 668 aa  261  3e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.203354  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0509  helicase c2  32.27 
 
 		 843 aa  261  3e-68  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4122  helicase c2  31.6 
 
 		 843 aa  260  5.0000000000000005e-68  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000977416  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1106  helicase c2  29.77 
 
 		 636 aa  260  7e-68  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.243566 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2527  helicase c2  34.35 
 
 		 653 aa  260  7e-68  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0816709  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0897  helicase c2  33.48 
 
 		 647 aa  259  1e-67  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0733  ATP-dependent DNA helicase  31.54 
 
 		 640 aa  257  5e-67  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.982369  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2251  ATP-dependent helicase, putative  33.43 
 
 		 755 aa  257  6e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.247338  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>