More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_1563 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_17400  DNA helicase, Rad3  54.33 
 
 		 765 aa  649    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0589917  normal  0.041503 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2435  helicase c2  60.78 
 
 		 679 aa  700    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.184328  normal  0.864461 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1467  helicase c2  51.88 
 
 		 690 aa  650    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0659778  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1563  helicase c2  100 
 
 		 728 aa  1422    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.192384  decreased coverage  0.00181092 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1052  helicase c2  57.14 
 
 		 669 aa  689    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.325194 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1504  helicase c2  59.57 
 
 		 672 aa  684    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.328202  normal  0.416282 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23060  DNA helicase, Rad3  65.56 
 
 		 692 aa  867    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0774743 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1256  helicase c2  67.52 
 
 		 696 aa  805    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1469  helicase c2  51.11 
 
 		 685 aa  634  1e-180  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000142659 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0995  helicase c2  54.74 
 
 		 681 aa  629  1e-179  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.900844  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1812  helicase c2  51.49 
 
 		 706 aa  621  1e-176  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6530  putative ATP-dependent helicase  52.83 
 
 		 674 aa  612  9.999999999999999e-175  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.290122  normal  0.0410108 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10610  DNA helicase, Rad3  50.43 
 
 		 673 aa  598  1e-169  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.382167  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3345  DEAD/DEAH box helicase domain protein  51.33 
 
 		 694 aa  589  1e-167  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.127637  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29270  DNA helicase, Rad3  52.85 
 
 		 684 aa  589  1e-167  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.318454 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1957  helicase c2  52.05 
 
 		 699 aa  586  1e-166  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0276528  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2167  helicase c2:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  53.86 
 
 		 706 aa  580  1e-164  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2205  helicase c2  54.02 
 
 		 676 aa  575  1.0000000000000001e-162  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.632178  normal  0.363279 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4298  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  52.56 
 
 		 666 aa  573  1.0000000000000001e-162  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.641288 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2347  helicase c2  53.75 
 
 		 670 aa  565  1.0000000000000001e-159  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.490547  normal  0.859108 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07310  putative glutamate--cysteine ligase/putative amino acid ligase  50.28 
 
 		 699 aa  555  1e-156  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0239  helicase c2  47.93 
 
 		 664 aa  550  1e-155  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11361  ATP-dependent helicase dinG  51.38 
 
 		 664 aa  549  1e-155  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00520548  normal  0.0965757 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1280  helicase c2  52.2 
 
 		 677 aa  547  1e-154  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0225088  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3855  helicase c2  51.09 
 
 		 665 aa  548  1e-154  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.210682  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3841  helicase c2  51.09 
 
 		 665 aa  548  1e-154  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.478709  normal  0.0359375 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3929  helicase c2  51.09 
 
 		 665 aa  548  1e-154  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0336304  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3824  helicase c2  51.16 
 
 		 676 aa  543  1e-153  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.00296278  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0323  helicase c2  48.81 
 
 		 699 aa  535  1e-151  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000323796 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0280  helicase c2  48.26 
 
 		 683 aa  533  1e-150  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0332575 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1480  helicase c2  49.21 
 
 		 710 aa  498  1e-139  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.124092  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1566  helicase c2  49.43 
 
 		 844 aa  298  3e-79  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.102401  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4634  helicase c2  32.62 
 
 		 674 aa  293  7e-78  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0636  helicase c2  34.35 
 
 		 660 aa  279  1e-73  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0997  helicase c2  33.57 
 
 		 643 aa  278  2e-73  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.179863 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1364  helicase c2  31.46 
 
 		 640 aa  274  4.0000000000000004e-72  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3224  DNA polymerase III, epsilon subunit  32.26 
 
 		 927 aa  274  5.000000000000001e-72  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00101103  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1342  helicase c2  31.54 
 
 		 754 aa  271  4e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2517  ATP-dependent helicase, DEXD family  32.52 
 
 		 641 aa  270  8e-71  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.764826  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2147  helicase c2  32.52 
 
 		 641 aa  270  8e-71  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0303331  hitchhiker  0.00135971 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1235  helicase c2  31.71 
 
 		 743 aa  268  2.9999999999999995e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0895293  normal  0.149585 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1295  helicase c2  34.74 
 
 		 664 aa  265  2e-69  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2677  helicase c2  29.97 
 
 		 646 aa  263  6e-69  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.663694  normal  0.183253 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0897  helicase c2  33.43 
 
 		 647 aa  263  6.999999999999999e-69  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1743  DNA polymerase III, epsilon subunit  31.07 
 
 		 930 aa  261  2e-68  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.23026  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1412  helicase c2  31.4 
 
 		 658 aa  262  2e-68  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.102914  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0911  putative ATP-dependent helicase  31.34 
 
 		 651 aa  262  2e-68  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2809  helicase c2  30.01 
 
 		 707 aa  262  2e-68  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1886  hypothetical protein  29.69 
 
 		 652 aa  261  3e-68  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01131  ATP-dependent helicase  31.27 
 
 		 639 aa  260  7e-68  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.625206  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1897  hypothetical protein  29.87 
 
 		 652 aa  259  1e-67  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1779  helicase c2:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  32.57 
 
 		 641 aa  259  1e-67  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.66637 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0411  helicase c2  31.91 
 
 		 646 aa  259  2e-67  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6611  helicase c2  34.75 
 
 		 729 aa  257  5e-67  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0933933 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01597  ATP-dependent helicase  34.35 
 
 		 675 aa  256  8e-67  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1612  putative ATP-dependent helicase  30.71 
 
 		 751 aa  256  1.0000000000000001e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00100383  normal  0.548735 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1403  helicase c2  32.52 
 
 		 757 aa  254  5.000000000000001e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.127709  hitchhiker  0.000000348035 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0532  helicase c2  34.2 
 
 		 649 aa  252  2e-65  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3093  helicase c2  34.15 
 
 		 681 aa  252  2e-65  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.649657 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2524  helicase c2  32.11 
 
 		 755 aa  250  7e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00188741  decreased coverage  0.000000000263353 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1991  ATP-dependent helicase, putative  34.06 
 
 		 645 aa  248  3e-64  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2081  ATP-dependent helicase DinG  28.84 
 
 		 633 aa  248  3e-64  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1824  helicase c2  29.48 
 
 		 664 aa  248  3e-64  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.678424  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3167  helicase c2  31.59 
 
 		 876 aa  248  3e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000644587  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1347  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  27.08 
 
 		 957 aa  248  3e-64  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.579486 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1805  helicase c2  28.43 
 
 		 659 aa  248  4e-64  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1933  helicase c2  31.41 
 
 		 639 aa  247  4.9999999999999997e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2535  helicase C2  28.9 
 
 		 645 aa  247  6e-64  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.801549  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1859  helicase c2  28.29 
 
 		 674 aa  247  6.999999999999999e-64  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.347581  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3886  ATP-dependent helicase  29.54 
 
 		 647 aa  246  9.999999999999999e-64  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2378  helicase c2  31.34 
 
 		 636 aa  246  9.999999999999999e-64  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2013  helicase c2  32.6 
 
 		 639 aa  245  1.9999999999999999e-63  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.479282  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1409  helicase c2  33.08 
 
 		 651 aa  245  1.9999999999999999e-63  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0733  ATP-dependent DNA helicase  30.23 
 
 		 640 aa  245  1.9999999999999999e-63  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.982369  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2196  helicase c2  29.12 
 
 		 641 aa  244  3e-63  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00456377 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1990  ATP-dependent helicase DinG  26.75 
 
 		 709 aa  244  3.9999999999999997e-63  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1863  helicase c2  31.79 
 
 		 668 aa  244  5e-63  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.879395 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4478  helicase c2  34.38 
 
 		 633 aa  244  5e-63  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.647625  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1269  helicase c2  28.47 
 
 		 636 aa  243  6e-63  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2413  helicase c2  29.24 
 
 		 669 aa  243  7e-63  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0561182  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0188  helicase c2  31.46 
 
 		 659 aa  243  7e-63  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00148037  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1197  helicase c2  31.23 
 
 		 661 aa  243  7.999999999999999e-63  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.0000973223  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2424  helicase c2  29.24 
 
 		 669 aa  243  7.999999999999999e-63  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1545  DNA polymerase III, epsilon subunit  32.16 
 
 		 944 aa  242  1e-62  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.676592  decreased coverage  0.000191845 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2172  helicase c2  28.29 
 
 		 659 aa  243  1e-62  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2532  helicase c2  29.1 
 
 		 640 aa  242  2e-62  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.139439 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1934  helicase c2  29.4 
 
 		 640 aa  242  2e-62  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.101214  normal  0.540234 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4323  helicase c2  33.91 
 
 		 631 aa  240  9e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2316  helicase c2  31.89 
 
 		 670 aa  239  1e-61  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2094  helicase c2  34.61 
 
 		 673 aa  239  1e-61  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.239782  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0648  helicase c2  30.52 
 
 		 668 aa  238  2e-61  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2302  ATP-dependent helicase, DinG family protein  27.67 
 
 		 662 aa  238  2e-61  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.783815  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2455  helicase c2  27.98 
 
 		 641 aa  238  3e-61  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0528  helicase c2  24.02 
 
 		 667 aa  238  3e-61  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2527  helicase c2  31.78 
 
 		 653 aa  237  6e-61  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0816709  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1967  ATP-dependent helicase  32.61 
 
 		 675 aa  235  2.0000000000000002e-60  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1901  helicase c2  32.61 
 
 		 675 aa  235  2.0000000000000002e-60  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2763  helicase c2  31.62 
 
 		 634 aa  234  4.0000000000000004e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0359097  hitchhiker  0.00537714 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4122  helicase c2  29.53 
 
 		 843 aa  234  6e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000977416  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1156  helicase c2  33.38 
 
 		 649 aa  233  9e-60  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>