More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_1469 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011886  Achl_1469  helicase c2  100 
 
 		 685 aa  1376    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000142659 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17400  DNA helicase, Rad3  53.33 
 
 		 765 aa  672    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0589917  normal  0.041503 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1504  helicase c2  58.38 
 
 		 672 aa  684    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.328202  normal  0.416282 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1467  helicase c2  87.65 
 
 		 690 aa  1202    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0659778  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07310  putative glutamate--cysteine ligase/putative amino acid ligase  61.87 
 
 		 699 aa  763    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23060  DNA helicase, Rad3  51.91 
 
 		 692 aa  630  1e-179  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0774743 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10610  DNA helicase, Rad3  51.48 
 
 		 673 aa  625  1e-178  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.382167  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1563  helicase c2  51.11 
 
 		 728 aa  619  1e-176  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.192384  decreased coverage  0.00181092 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1256  helicase c2  53.16 
 
 		 696 aa  613  9.999999999999999e-175  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0995  helicase c2  50 
 
 		 681 aa  597  1e-169  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.900844  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6530  putative ATP-dependent helicase  52.12 
 
 		 674 aa  597  1e-169  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.290122  normal  0.0410108 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2435  helicase c2  53.36 
 
 		 679 aa  585  1e-166  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.184328  normal  0.864461 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2347  helicase c2  51.98 
 
 		 670 aa  583  1.0000000000000001e-165  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.490547  normal  0.859108 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3855  helicase c2  51.96 
 
 		 665 aa  578  1e-164  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.210682  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1052  helicase c2  50 
 
 		 669 aa  582  1e-164  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.325194 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3929  helicase c2  51.96 
 
 		 665 aa  578  1e-164  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0336304  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4298  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  50.73 
 
 		 666 aa  582  1e-164  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.641288 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3841  helicase c2  51.96 
 
 		 665 aa  578  1e-164  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.478709  normal  0.0359375 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3345  DEAD/DEAH box helicase domain protein  47.61 
 
 		 694 aa  577  1.0000000000000001e-163  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.127637  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1812  helicase c2  48.22 
 
 		 706 aa  577  1.0000000000000001e-163  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29270  DNA helicase, Rad3  49 
 
 		 684 aa  576  1.0000000000000001e-163  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.318454 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1957  helicase c2  48.32 
 
 		 699 aa  568  1e-160  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0276528  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2205  helicase c2  52.64 
 
 		 676 aa  562  1.0000000000000001e-159  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.632178  normal  0.363279 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2167  helicase c2:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  48.49 
 
 		 706 aa  552  1e-156  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1280  helicase c2  50.65 
 
 		 677 aa  548  1e-154  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0225088  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11361  ATP-dependent helicase dinG  50.3 
 
 		 664 aa  547  1e-154  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00520548  normal  0.0965757 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3824  helicase c2  48.31 
 
 		 676 aa  541  9.999999999999999e-153  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.00296278  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0323  helicase c2  47.74 
 
 		 699 aa  524  1e-147  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000323796 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0280  helicase c2  47.39 
 
 		 683 aa  519  1e-146  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0332575 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0239  helicase c2  46.59 
 
 		 664 aa  513  1e-144  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1480  helicase c2  47.2 
 
 		 710 aa  501  1e-140  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.124092  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1566  helicase c2  45.54 
 
 		 844 aa  313  7.999999999999999e-84  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.102401  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4634  helicase c2  33.78 
 
 		 674 aa  301  2e-80  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01778  conserved protein with nucleoside triphosphate hydrolase domain  32.99 
 
 		 636 aa  289  1e-76  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.548012  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1835  helicase c2  32.99 
 
 		 636 aa  289  1e-76  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00837342  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2034  hypothetical protein  32.99 
 
 		 636 aa  289  1e-76  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2535  hypothetical protein  32.99 
 
 		 636 aa  289  1e-76  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.50615  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01766  hypothetical protein  32.99 
 
 		 636 aa  289  1e-76  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.479225  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1825  helicase c2  32.99 
 
 		 636 aa  289  1e-76  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.979985  normal  0.491186 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1896  hypothetical protein  32.99 
 
 		 636 aa  289  1e-76  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2763  helicase c2  32.6 
 
 		 634 aa  288  2e-76  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0359097  hitchhiker  0.00537714 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1380  hypothetical protein  32.84 
 
 		 636 aa  288  2.9999999999999996e-76  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.434814  normal  0.350106 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0636  helicase c2  33.54 
 
 		 660 aa  288  2.9999999999999996e-76  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1933  helicase c2  33.62 
 
 		 639 aa  287  5e-76  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2068  hypothetical protein  32.84 
 
 		 636 aa  286  9e-76  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2527  helicase c2  33.14 
 
 		 653 aa  283  5.000000000000001e-75  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0816709  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1961  hypothetical protein  32.61 
 
 		 636 aa  283  6.000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.915388  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2022  hypothetical protein  32.61 
 
 		 636 aa  283  7.000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.6889  normal  0.891564 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1965  hypothetical protein  32.61 
 
 		 636 aa  283  7.000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1310  hypothetical protein  32.61 
 
 		 636 aa  283  1e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.027986  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1495  hypothetical protein  32.61 
 
 		 636 aa  282  1e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2228  helicase c2  33.28 
 
 		 639 aa  278  2e-73  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.232993  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0997  helicase c2  33.72 
 
 		 643 aa  278  3e-73  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.179863 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2094  helicase c2  34.9 
 
 		 673 aa  276  6e-73  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.239782  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1106  helicase c2  29.73 
 
 		 636 aa  275  1.0000000000000001e-72  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.243566 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2809  helicase c2  32.31 
 
 		 707 aa  275  2.0000000000000002e-72  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01131  ATP-dependent helicase  32.36 
 
 		 639 aa  275  3e-72  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.625206  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1743  DNA polymerase III, epsilon subunit  30.69 
 
 		 930 aa  274  5.000000000000001e-72  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.23026  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1235  helicase c2  33.38 
 
 		 743 aa  273  6e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0895293  normal  0.149585 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0911  putative ATP-dependent helicase  32.53 
 
 		 651 aa  271  4e-71  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2378  helicase c2  31.76 
 
 		 636 aa  270  5e-71  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1409  helicase c2  35.34 
 
 		 651 aa  270  5.9999999999999995e-71  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0411  helicase c2  32.93 
 
 		 646 aa  270  8e-71  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1003  DNA polymerase III, epsilon subunit  30.91 
 
 		 960 aa  270  8e-71  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2013  helicase c2  33.14 
 
 		 639 aa  269  1e-70  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.479282  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1342  helicase c2  32.44 
 
 		 754 aa  269  1e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0532  helicase c2  34.74 
 
 		 649 aa  269  2e-70  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2128  helicase c2  31.67 
 
 		 634 aa  268  2.9999999999999995e-70  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1990  helicase c2  33.53 
 
 		 649 aa  267  4e-70  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2677  helicase c2  30.7 
 
 		 646 aa  268  4e-70  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.663694  normal  0.183253 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1575  putative ATP-dependent helicase  32.03 
 
 		 646 aa  267  5e-70  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.718112  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1347  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  28.86 
 
 		 957 aa  267  5.999999999999999e-70  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.579486 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2017  hypothetical protein  32.15 
 
 		 634 aa  266  7e-70  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.451998  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2406  hypothetical protein  32.15 
 
 		 634 aa  266  1e-69  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00282147  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1412  helicase c2  31.98 
 
 		 658 aa  265  2e-69  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.102914  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3886  ATP-dependent helicase  29.28 
 
 		 647 aa  264  4e-69  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1295  helicase c2  33.95 
 
 		 664 aa  263  8.999999999999999e-69  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1779  helicase c2:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  32.28 
 
 		 641 aa  262  2e-68  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.66637 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004095  DinG family ATP-dependent helicase YoaA  31.84 
 
 		 646 aa  262  2e-68  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01374  ATP-dependent helicase  31.3 
 
 		 644 aa  261  3e-68  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2316  helicase c2  33.58 
 
 		 670 aa  261  4e-68  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1269  helicase c2  31 
 
 		 636 aa  260  7e-68  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1990  ATP-dependent helicase DinG  27.44 
 
 		 709 aa  258  2e-67  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2517  ATP-dependent helicase, DEXD family  33.08 
 
 		 641 aa  258  2e-67  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.764826  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2147  helicase c2  33.08 
 
 		 641 aa  258  2e-67  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0303331  hitchhiker  0.00135971 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1886  hypothetical protein  30.86 
 
 		 652 aa  257  5e-67  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1364  helicase c2  33.23 
 
 		 640 aa  257  5e-67  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1593  helicase c2  32.42 
 
 		 725 aa  256  8e-67  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.601772  normal  0.0255754 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1897  hypothetical protein  31.3 
 
 		 652 aa  255  2.0000000000000002e-66  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1727  helicase c2  29.82 
 
 		 641 aa  255  2.0000000000000002e-66  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1154  DNA polymerase III, epsilon subunit  31.03 
 
 		 921 aa  254  3e-66  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2302  ATP-dependent helicase, DinG family protein  29.73 
 
 		 662 aa  254  3e-66  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.783815  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0648  helicase c2  32.59 
 
 		 668 aa  254  5.000000000000001e-66  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1899  DNA polymerase III, epsilon subunit  30.98 
 
 		 956 aa  254  5.000000000000001e-66  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0589249 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2877  helicase c2  33.33 
 
 		 658 aa  252  1e-65  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.679539 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1863  helicase c2  34.78 
 
 		 668 aa  251  2e-65  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.879395 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1197  helicase c2  30.81 
 
 		 661 aa  251  3e-65  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.0000973223  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1403  helicase c2  32.88 
 
 		 757 aa  251  4e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.127709  hitchhiker  0.000000348035 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2524  helicase c2  32.47 
 
 		 755 aa  250  7e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00188741  decreased coverage  0.000000000263353 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0733  ATP-dependent DNA helicase  30.54 
 
 		 640 aa  249  1e-64  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.982369  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>