More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_1957 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_0995  helicase c2  62.1 
 
 		 681 aa  821    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.900844  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29270  DNA helicase, Rad3  62.77 
 
 		 684 aa  808    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.318454 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2167  helicase c2:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  55.87 
 
 		 706 aa  672    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3841  helicase c2  59.5 
 
 		 665 aa  719    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.478709  normal  0.0359375 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1957  helicase c2  100 
 
 		 699 aa  1383    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0276528  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1812  helicase c2  51.59 
 
 		 706 aa  653    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2205  helicase c2  59.97 
 
 		 676 aa  714    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.632178  normal  0.363279 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1280  helicase c2  66.14 
 
 		 677 aa  827    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0225088  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2347  helicase c2  59.48 
 
 		 670 aa  716    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.490547  normal  0.859108 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1504  helicase c2  54.51 
 
 		 672 aa  644    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.328202  normal  0.416282 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3855  helicase c2  59.5 
 
 		 665 aa  719    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.210682  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6530  putative ATP-dependent helicase  59.83 
 
 		 674 aa  766    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.290122  normal  0.0410108 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3345  DEAD/DEAH box helicase domain protein  58.85 
 
 		 694 aa  741    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.127637  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11361  ATP-dependent helicase dinG  56.25 
 
 		 664 aa  681    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00520548  normal  0.0965757 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3929  helicase c2  59.5 
 
 		 665 aa  719    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0336304  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4298  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  59.45 
 
 		 666 aa  717    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.641288 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17400  DNA helicase, Rad3  52.09 
 
 		 765 aa  647    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0589917  normal  0.041503 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23060  DNA helicase, Rad3  50.5 
 
 		 692 aa  602  1.0000000000000001e-171  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0774743 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1256  helicase c2  51.04 
 
 		 696 aa  590  1e-167  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1563  helicase c2  52.33 
 
 		 728 aa  585  1e-166  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.192384  decreased coverage  0.00181092 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0239  helicase c2  47.57 
 
 		 664 aa  578  1e-164  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10610  DNA helicase, Rad3  50 
 
 		 673 aa  576  1.0000000000000001e-163  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.382167  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1467  helicase c2  48.45 
 
 		 690 aa  575  1.0000000000000001e-162  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0659778  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0280  helicase c2  49.57 
 
 		 683 aa  562  1.0000000000000001e-159  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0332575 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1469  helicase c2  48.88 
 
 		 685 aa  564  1.0000000000000001e-159  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000142659 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3824  helicase c2  49.5 
 
 		 676 aa  556  1e-157  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.00296278  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0323  helicase c2  49.14 
 
 		 699 aa  555  1e-156  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000323796 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1052  helicase c2  47.82 
 
 		 669 aa  536  1e-151  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.325194 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2435  helicase c2  49.86 
 
 		 679 aa  534  1e-150  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.184328  normal  0.864461 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07310  putative glutamate--cysteine ligase/putative amino acid ligase  46.64 
 
 		 699 aa  519  1e-146  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1480  helicase c2  47.71 
 
 		 710 aa  500  1e-140  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.124092  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1566  helicase c2  58.35 
 
 		 844 aa  440  9.999999999999999e-123  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.102401  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0820  helicase c2  34.99 
 
 		 650 aa  320  5e-86  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.932295  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0709  helicase c2  34.84 
 
 		 650 aa  319  1e-85  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.968194 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4634  helicase c2  33.24 
 
 		 674 aa  304  3.0000000000000004e-81  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1575  putative ATP-dependent helicase  34.19 
 
 		 646 aa  304  3.0000000000000004e-81  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.718112  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004095  DinG family ATP-dependent helicase YoaA  34.1 
 
 		 646 aa  300  6e-80  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01374  ATP-dependent helicase  34.11 
 
 		 644 aa  300  6e-80  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01131  ATP-dependent helicase  32.35 
 
 		 639 aa  294  4e-78  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.625206  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1933  helicase c2  33.57 
 
 		 639 aa  292  1e-77  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1106  helicase c2  30.21 
 
 		 636 aa  291  2e-77  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.243566 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4323  helicase c2  35.35 
 
 		 631 aa  290  7e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4478  helicase c2  35.35 
 
 		 633 aa  288  2e-76  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.647625  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0636  helicase c2  33 
 
 		 660 aa  288  2.9999999999999996e-76  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4459  helicase c2  35.56 
 
 		 633 aa  288  2.9999999999999996e-76  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.157065  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0997  helicase c2  33.72 
 
 		 643 aa  287  4e-76  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.179863 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1380  hypothetical protein  33.38 
 
 		 636 aa  287  4e-76  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.434814  normal  0.350106 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01778  conserved protein with nucleoside triphosphate hydrolase domain  33.38 
 
 		 636 aa  287  5e-76  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.548012  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01766  hypothetical protein  33.38 
 
 		 636 aa  287  5e-76  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.479225  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1825  helicase c2  33.38 
 
 		 636 aa  287  5e-76  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.979985  normal  0.491186 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2034  hypothetical protein  33.38 
 
 		 636 aa  287  5e-76  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2535  hypothetical protein  33.38 
 
 		 636 aa  287  5e-76  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.50615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1896  hypothetical protein  33.38 
 
 		 636 aa  287  5e-76  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1835  helicase c2  33.38 
 
 		 636 aa  286  7e-76  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00837342  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1364  helicase c2  32.41 
 
 		 640 aa  286  9e-76  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0911  putative ATP-dependent helicase  32.66 
 
 		 651 aa  286  1.0000000000000001e-75  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1593  helicase c2  32.34 
 
 		 725 aa  284  4.0000000000000003e-75  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.601772  normal  0.0255754 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2068  hypothetical protein  33.24 
 
 		 636 aa  284  5.000000000000001e-75  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2013  helicase c2  34.2 
 
 		 639 aa  283  7.000000000000001e-75  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.479282  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2094  helicase c2  35.36 
 
 		 673 aa  282  1e-74  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.239782  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0897  helicase c2  32.65 
 
 		 647 aa  282  1e-74  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1412  helicase c2  31.78 
 
 		 658 aa  282  2e-74  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.102914  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2809  helicase c2  32.22 
 
 		 707 aa  281  2e-74  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2763  helicase c2  33.24 
 
 		 634 aa  281  3e-74  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0359097  hitchhiker  0.00537714 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1495  hypothetical protein  32.36 
 
 		 636 aa  280  7e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2022  hypothetical protein  32.36 
 
 		 636 aa  280  7e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.6889  normal  0.891564 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1965  hypothetical protein  32.36 
 
 		 636 aa  280  7e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1310  hypothetical protein  32.26 
 
 		 636 aa  280  7e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.027986  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1961  hypothetical protein  32.36 
 
 		 636 aa  279  1e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.915388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2378  helicase c2  32.99 
 
 		 636 aa  278  3e-73  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2424  helicase c2  32.8 
 
 		 669 aa  277  4e-73  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2128  helicase c2  33.53 
 
 		 634 aa  277  6e-73  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2017  hypothetical protein  33.05 
 
 		 634 aa  276  8e-73  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.451998  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2413  helicase c2  32.65 
 
 		 669 aa  276  8e-73  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0561182  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1824  helicase c2  31.85 
 
 		 664 aa  276  1.0000000000000001e-72  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.678424  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2532  helicase c2  32.65 
 
 		 640 aa  275  2.0000000000000002e-72  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.139439 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2455  helicase c2  30.72 
 
 		 641 aa  275  3e-72  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1934  helicase c2  32.41 
 
 		 640 aa  275  3e-72  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.101214  normal  0.540234 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2517  ATP-dependent helicase, DEXD family  32.68 
 
 		 641 aa  274  5.000000000000001e-72  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.764826  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2147  helicase c2  32.68 
 
 		 641 aa  274  5.000000000000001e-72  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0303331  hitchhiker  0.00135971 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2081  ATP-dependent helicase DinG  31.88 
 
 		 633 aa  273  9e-72  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1409  helicase c2  33.82 
 
 		 651 aa  272  1e-71  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0188  helicase c2  33.91 
 
 		 659 aa  272  1e-71  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00148037  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1940  ATP-dependent helicase DinG  33.63 
 
 		 665 aa  272  2e-71  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.497186  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2535  helicase C2  29.91 
 
 		 645 aa  271  2.9999999999999997e-71  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.801549  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2196  helicase c2  31.38 
 
 		 641 aa  270  5e-71  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00456377 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1859  helicase c2  31.74 
 
 		 674 aa  270  5e-71  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.347581  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1269  helicase c2  30.47 
 
 		 636 aa  270  7e-71  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0411  helicase c2  32.7 
 
 		 646 aa  270  8.999999999999999e-71  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3886  ATP-dependent helicase  31.22 
 
 		 647 aa  269  2e-70  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1990  helicase c2  33.68 
 
 		 649 aa  268  2e-70  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1805  helicase c2  30.68 
 
 		 659 aa  268  2e-70  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2172  helicase c2  30.94 
 
 		 659 aa  268  2e-70  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1897  hypothetical protein  29.65 
 
 		 652 aa  268  2.9999999999999995e-70  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0532  helicase c2  33.24 
 
 		 649 aa  268  2.9999999999999995e-70  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1743  DNA polymerase III, epsilon subunit  31.03 
 
 		 930 aa  268  4e-70  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.23026  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01597  ATP-dependent helicase  34.01 
 
 		 675 aa  267  5e-70  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1156  helicase c2  33.48 
 
 		 649 aa  267  5.999999999999999e-70  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2302  ATP-dependent helicase, DinG family protein  30.67 
 
 		 662 aa  266  7e-70  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.783815  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1886  hypothetical protein  29.45 
 
 		 652 aa  266  8.999999999999999e-70  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>