More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_2435 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014151  Cfla_1563  helicase c2  60.78 
 
 		 728 aa  721    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.192384  decreased coverage  0.00181092 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1256  helicase c2  58.84 
 
 		 696 aa  677    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23060  DNA helicase, Rad3  57.86 
 
 		 692 aa  696    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0774743 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2435  helicase c2  100 
 
 		 679 aa  1325    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.184328  normal  0.864461 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1467  helicase c2  54.59 
 
 		 690 aa  631  1e-179  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0659778  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1052  helicase c2  55.64 
 
 		 669 aa  627  1e-178  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.325194 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1504  helicase c2  55.92 
 
 		 672 aa  601  1e-170  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.328202  normal  0.416282 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1469  helicase c2  53.36 
 
 		 685 aa  600  1e-170  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000142659 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10610  DNA helicase, Rad3  50.36 
 
 		 673 aa  594  1e-168  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.382167  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17400  DNA helicase, Rad3  52.89 
 
 		 765 aa  587  1e-166  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0589917  normal  0.041503 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1812  helicase c2  50.36 
 
 		 706 aa  574  1.0000000000000001e-162  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29270  DNA helicase, Rad3  51.73 
 
 		 684 aa  567  1e-160  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.318454 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6530  putative ATP-dependent helicase  51.86 
 
 		 674 aa  568  1e-160  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.290122  normal  0.0410108 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0995  helicase c2  50.37 
 
 		 681 aa  560  1e-158  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.900844  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11361  ATP-dependent helicase dinG  53.81 
 
 		 664 aa  558  1e-157  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00520548  normal  0.0965757 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3345  DEAD/DEAH box helicase domain protein  50.79 
 
 		 694 aa  556  1e-157  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.127637  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3855  helicase c2  53.63 
 
 		 665 aa  551  1e-155  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.210682  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3841  helicase c2  53.63 
 
 		 665 aa  551  1e-155  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.478709  normal  0.0359375 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3929  helicase c2  53.63 
 
 		 665 aa  551  1e-155  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0336304  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2205  helicase c2  53.14 
 
 		 676 aa  544  1e-153  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.632178  normal  0.363279 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2347  helicase c2  53.47 
 
 		 670 aa  539  9.999999999999999e-153  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.490547  normal  0.859108 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4298  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  53.09 
 
 		 666 aa  540  9.999999999999999e-153  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.641288 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1957  helicase c2  49.64 
 
 		 699 aa  538  1e-151  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0276528  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07310  putative glutamate--cysteine ligase/putative amino acid ligase  51.1 
 
 		 699 aa  534  1e-150  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0280  helicase c2  51.05 
 
 		 683 aa  528  1e-148  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0332575 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0323  helicase c2  50.9 
 
 		 699 aa  522  1e-147  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000323796 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2167  helicase c2:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  50.59 
 
 		 706 aa  522  1e-146  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0239  helicase c2  46.52 
 
 		 664 aa  501  1e-140  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1480  helicase c2  51.39 
 
 		 710 aa  486  1e-136  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.124092  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1280  helicase c2  49.27 
 
 		 677 aa  487  1e-136  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0225088  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3824  helicase c2  49.42 
 
 		 676 aa  476  1e-133  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.00296278  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0636  helicase c2  35.47 
 
 		 660 aa  301  2e-80  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4634  helicase c2  34.4 
 
 		 674 aa  292  2e-77  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2677  helicase c2  31.87 
 
 		 646 aa  286  1.0000000000000001e-75  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.663694  normal  0.183253 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1566  helicase c2  47.11 
 
 		 844 aa  285  3.0000000000000004e-75  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.102401  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1364  helicase c2  32.62 
 
 		 640 aa  281  2e-74  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3621  helicase c2  33.83 
 
 		 838 aa  280  6e-74  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2147  helicase c2  35.21 
 
 		 641 aa  277  5e-73  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0303331  hitchhiker  0.00135971 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2517  ATP-dependent helicase, DEXD family  35.21 
 
 		 641 aa  277  5e-73  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.764826  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1933  helicase c2  34.35 
 
 		 639 aa  276  7e-73  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2228  helicase c2  34.56 
 
 		 639 aa  274  3e-72  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.232993  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1412  helicase c2  32.18 
 
 		 658 aa  273  9e-72  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.102914  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0709  helicase c2  34.83 
 
 		 650 aa  273  1e-71  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.968194 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0997  helicase c2  34.05 
 
 		 643 aa  271  2.9999999999999997e-71  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.179863 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0820  helicase c2  33.91 
 
 		 650 aa  270  5e-71  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.932295  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2316  helicase c2  33.38 
 
 		 670 aa  269  1e-70  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0532  helicase c2  36.18 
 
 		 649 aa  269  2e-70  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1921  helicase c2  33.28 
 
 		 725 aa  268  2e-70  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.782434  normal  0.028244 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01597  ATP-dependent helicase  35.12 
 
 		 675 aa  268  2e-70  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1835  helicase c2  33.94 
 
 		 636 aa  268  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00837342  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01778  conserved protein with nucleoside triphosphate hydrolase domain  32.93 
 
 		 636 aa  268  4e-70  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.548012  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1347  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  28.51 
 
 		 957 aa  267  4e-70  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.579486 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2535  hypothetical protein  32.93 
 
 		 636 aa  268  4e-70  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.50615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1896  hypothetical protein  32.93 
 
 		 636 aa  268  4e-70  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01766  hypothetical protein  32.93 
 
 		 636 aa  268  4e-70  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.479225  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1825  helicase c2  32.93 
 
 		 636 aa  268  4e-70  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.979985  normal  0.491186 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2034  hypothetical protein  32.93 
 
 		 636 aa  268  4e-70  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1593  helicase c2  32.79 
 
 		 725 aa  267  5e-70  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.601772  normal  0.0255754 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1409  helicase c2  34.84 
 
 		 651 aa  266  8e-70  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1380  hypothetical protein  33.54 
 
 		 636 aa  266  8e-70  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.434814  normal  0.350106 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0911  putative ATP-dependent helicase  32.66 
 
 		 651 aa  266  1e-69  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2068  hypothetical protein  32.99 
 
 		 636 aa  265  2e-69  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0897  helicase c2  34.21 
 
 		 647 aa  265  3e-69  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1743  DNA polymerase III, epsilon subunit  29.93 
 
 		 930 aa  264  4e-69  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.23026  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1154  DNA polymerase III, epsilon subunit  33.95 
 
 		 921 aa  264  4e-69  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1612  putative ATP-dependent helicase  33.54 
 
 		 751 aa  263  6e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00100383  normal  0.548735 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0733  ATP-dependent DNA helicase  31.69 
 
 		 640 aa  262  2e-68  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.982369  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1863  helicase c2  32.79 
 
 		 668 aa  259  8e-68  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.879395 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1003  DNA polymerase III, epsilon subunit  31.84 
 
 		 960 aa  259  1e-67  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2524  helicase c2  33.69 
 
 		 755 aa  259  1e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00188741  decreased coverage  0.000000000263353 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01131  ATP-dependent helicase  31.77 
 
 		 639 aa  259  1e-67  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.625206  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2809  helicase c2  31.16 
 
 		 707 aa  259  2e-67  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2172  helicase c2  29.9 
 
 		 659 aa  259  2e-67  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2455  helicase c2  30.4 
 
 		 641 aa  258  4e-67  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1805  helicase c2  29.9 
 
 		 659 aa  257  6e-67  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3886  ATP-dependent helicase  31.12 
 
 		 647 aa  256  7e-67  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2763  helicase c2  32.28 
 
 		 634 aa  256  1.0000000000000001e-66  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0359097  hitchhiker  0.00537714 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1403  helicase c2  33.13 
 
 		 757 aa  256  1.0000000000000001e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.127709  hitchhiker  0.000000348035 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2094  helicase c2  34.68 
 
 		 673 aa  256  1.0000000000000001e-66  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.239782  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0528  helicase c2  24.31 
 
 		 667 aa  256  1.0000000000000001e-66  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1990  helicase c2  34.21 
 
 		 649 aa  255  2.0000000000000002e-66  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2302  ATP-dependent helicase, DinG family protein  30.61 
 
 		 662 aa  254  3e-66  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.783815  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1235  helicase c2  34.07 
 
 		 743 aa  254  5.000000000000001e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0895293  normal  0.149585 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2128  helicase c2  32.32 
 
 		 634 aa  253  6e-66  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2017  hypothetical protein  32.32 
 
 		 634 aa  253  8.000000000000001e-66  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.451998  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1991  ATP-dependent helicase, putative  32.71 
 
 		 645 aa  253  9.000000000000001e-66  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0188  helicase c2  32.98 
 
 		 659 aa  252  1e-65  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00148037  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01374  ATP-dependent helicase  31.17 
 
 		 644 aa  252  1e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1886  hypothetical protein  30.32 
 
 		 652 aa  253  1e-65  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004095  DinG family ATP-dependent helicase YoaA  30.91 
 
 		 646 aa  253  1e-65  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1859  helicase c2  30.13 
 
 		 674 aa  253  1e-65  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.347581  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2406  hypothetical protein  32.32 
 
 		 634 aa  253  1e-65  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00282147  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1990  ATP-dependent helicase DinG  26.75 
 
 		 709 aa  251  2e-65  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2081  ATP-dependent helicase DinG  29.35 
 
 		 633 aa  252  2e-65  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2378  helicase c2  33.02 
 
 		 636 aa  252  2e-65  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1197  helicase c2  32.73 
 
 		 661 aa  252  2e-65  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.0000973223  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1897  hypothetical protein  30.12 
 
 		 652 aa  251  3e-65  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1269  helicase c2  30.6 
 
 		 636 aa  251  4e-65  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2527  helicase c2  33.89 
 
 		 653 aa  250  5e-65  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0816709  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2207  putative ATP-dependent helicase  31.72 
 
 		 749 aa  248  3e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>