More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_1467 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012803  Mlut_07310  putative glutamate--cysteine ligase/putative amino acid ligase  60.91 
 
 
699 aa  754    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10610  DNA helicase, Rad3  52.1 
 
 
673 aa  640    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.382167  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1504  helicase c2  57.83 
 
 
672 aa  684    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.328202  normal  0.416282 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1467  helicase c2  100 
 
 
690 aa  1386    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0659778  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17400  DNA helicase, Rad3  53.63 
 
 
765 aa  672    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0589917  normal  0.041503 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1469  helicase c2  87.52 
 
 
685 aa  1172    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000142659 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23060  DNA helicase, Rad3  51.63 
 
 
692 aa  631  1e-179  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0774743 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1563  helicase c2  51.94 
 
 
728 aa  628  1e-178  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.192384  decreased coverage  0.00181092 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1256  helicase c2  53.31 
 
 
696 aa  621  1e-176  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6530  putative ATP-dependent helicase  52.12 
 
 
674 aa  605  1.0000000000000001e-171  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.290122  normal  0.0410108 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2435  helicase c2  54.59 
 
 
679 aa  603  1.0000000000000001e-171  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.184328  normal  0.864461 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0995  helicase c2  49.57 
 
 
681 aa  591  1e-167  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.900844  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3345  DEAD/DEAH box helicase domain protein  47.91 
 
 
694 aa  586  1e-166  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.127637  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1812  helicase c2  47.53 
 
 
706 aa  580  1e-164  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29270  DNA helicase, Rad3  49.79 
 
 
684 aa  579  1e-164  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.318454 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3855  helicase c2  52.17 
 
 
665 aa  581  1e-164  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.210682  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3929  helicase c2  52.17 
 
 
665 aa  581  1e-164  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0336304  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3841  helicase c2  52.17 
 
 
665 aa  581  1e-164  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.478709  normal  0.0359375 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2347  helicase c2  51.39 
 
 
670 aa  572  1.0000000000000001e-162  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.490547  normal  0.859108 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1052  helicase c2  49.85 
 
 
669 aa  570  1e-161  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.325194 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1957  helicase c2  48.32 
 
 
699 aa  567  1e-160  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0276528  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2167  helicase c2:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  48.25 
 
 
706 aa  566  1e-160  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4298  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  50.51 
 
 
666 aa  568  1e-160  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.641288 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2205  helicase c2  51.98 
 
 
676 aa  561  1e-158  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.632178  normal  0.363279 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1280  helicase c2  51.22 
 
 
677 aa  550  1e-155  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0225088  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11361  ATP-dependent helicase dinG  49.25 
 
 
664 aa  541  9.999999999999999e-153  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00520548  normal  0.0965757 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0323  helicase c2  48.52 
 
 
699 aa  541  9.999999999999999e-153  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000323796 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0280  helicase c2  48.6 
 
 
683 aa  536  1e-151  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0332575 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3824  helicase c2  49.71 
 
 
676 aa  536  1e-151  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.00296278  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0239  helicase c2  46.1 
 
 
664 aa  512  1e-143  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1480  helicase c2  47.74 
 
 
710 aa  505  1e-141  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.124092  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1566  helicase c2  45.05 
 
 
844 aa  315  1.9999999999999998e-84  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.102401  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0636  helicase c2  33.84 
 
 
660 aa  293  1e-77  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4634  helicase c2  33.04 
 
 
674 aa  287  5e-76  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1106  helicase c2  30.52 
 
 
636 aa  281  4e-74  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.243566 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2527  helicase c2  33.68 
 
 
653 aa  275  2.0000000000000002e-72  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0816709  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1933  helicase c2  32.76 
 
 
639 aa  274  5.000000000000001e-72  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0997  helicase c2  33.74 
 
 
643 aa  272  1e-71  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.179863 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1835  helicase c2  32.2 
 
 
636 aa  270  5e-71  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00837342  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01778  conserved protein with nucleoside triphosphate hydrolase domain  32.2 
 
 
636 aa  270  5.9999999999999995e-71  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.548012  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2034  hypothetical protein  32.2 
 
 
636 aa  270  5.9999999999999995e-71  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01766  hypothetical protein  32.2 
 
 
636 aa  270  5.9999999999999995e-71  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.479225  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2535  hypothetical protein  32.2 
 
 
636 aa  270  5.9999999999999995e-71  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.50615  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1896  hypothetical protein  32.2 
 
 
636 aa  270  5.9999999999999995e-71  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1825  helicase c2  32.2 
 
 
636 aa  270  5.9999999999999995e-71  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.979985  normal  0.491186 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0532  helicase c2  33.92 
 
 
649 aa  270  7e-71  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2094  helicase c2  35.16 
 
 
673 aa  269  1e-70  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.239782  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1347  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  28.74 
 
 
957 aa  269  1e-70  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.579486 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1380  hypothetical protein  32.05 
 
 
636 aa  269  1e-70  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.434814  normal  0.350106 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1990  ATP-dependent helicase DinG  28.32 
 
 
709 aa  268  2.9999999999999995e-70  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01131  ATP-dependent helicase  31.34 
 
 
639 aa  268  2.9999999999999995e-70  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.625206  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2763  helicase c2  31.76 
 
 
634 aa  268  2.9999999999999995e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0359097  hitchhiker  0.00537714 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2228  helicase c2  32.61 
 
 
639 aa  268  4e-70  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.232993  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1412  helicase c2  32.59 
 
 
658 aa  267  5e-70  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.102914  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2068  hypothetical protein  32.05 
 
 
636 aa  267  5.999999999999999e-70  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1743  DNA polymerase III, epsilon subunit  29.38 
 
 
930 aa  266  7e-70  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.23026  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3886  ATP-dependent helicase  30.09 
 
 
647 aa  266  7e-70  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1779  helicase c2:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  32.17 
 
 
641 aa  266  8.999999999999999e-70  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.66637 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3621  helicase c2  31.19 
 
 
838 aa  265  1e-69  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1364  helicase c2  32.59 
 
 
640 aa  265  2e-69  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0911  putative ATP-dependent helicase  32.07 
 
 
651 aa  265  2e-69  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2809  helicase c2  31.38 
 
 
707 aa  265  2e-69  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2677  helicase c2  31.01 
 
 
646 aa  265  2e-69  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.663694  normal  0.183253 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1409  helicase c2  32.53 
 
 
651 aa  265  2e-69  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1575  putative ATP-dependent helicase  32.18 
 
 
646 aa  264  3e-69  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.718112  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1235  helicase c2  32.99 
 
 
743 aa  264  4.999999999999999e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0895293  normal  0.149585 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1921  helicase c2  32.99 
 
 
725 aa  264  4.999999999999999e-69  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.782434  normal  0.028244 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2147  helicase c2  33.28 
 
 
641 aa  263  1e-68  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0303331  hitchhiker  0.00135971 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1342  helicase c2  31.62 
 
 
754 aa  262  1e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1593  helicase c2  32.47 
 
 
725 aa  262  1e-68  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.601772  normal  0.0255754 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2517  ATP-dependent helicase, DEXD family  33.28 
 
 
641 aa  263  1e-68  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.764826  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1269  helicase c2  30.89 
 
 
636 aa  261  4e-68  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0411  helicase c2  32.02 
 
 
646 aa  260  7e-68  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2022  hypothetical protein  31.53 
 
 
636 aa  259  1e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.6889  normal  0.891564 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1495  hypothetical protein  31.53 
 
 
636 aa  259  1e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1965  hypothetical protein  31.53 
 
 
636 aa  259  1e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4478  helicase c2  33.43 
 
 
633 aa  259  1e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.647625  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1003  DNA polymerase III, epsilon subunit  30.17 
 
 
960 aa  259  2e-67  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1961  hypothetical protein  31.53 
 
 
636 aa  258  3e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.915388  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1310  hypothetical protein  31.53 
 
 
636 aa  258  3e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.027986  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1295  helicase c2  33.81 
 
 
664 aa  256  1.0000000000000001e-66  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2316  helicase c2  32.49 
 
 
670 aa  255  2.0000000000000002e-66  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004095  DinG family ATP-dependent helicase YoaA  31.1 
 
 
646 aa  254  3e-66  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1863  helicase c2  34.57 
 
 
668 aa  254  4.0000000000000004e-66  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.879395 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1897  hypothetical protein  31.49 
 
 
652 aa  254  5.000000000000001e-66  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1886  hypothetical protein  30.42 
 
 
652 aa  254  5.000000000000001e-66  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2877  helicase c2  33.28 
 
 
658 aa  254  5.000000000000001e-66  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.679539 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1990  helicase c2  32.39 
 
 
649 aa  253  7e-66  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2378  helicase c2  31.42 
 
 
636 aa  253  9.000000000000001e-66  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01597  ATP-dependent helicase  32.83 
 
 
675 aa  252  1e-65  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2128  helicase c2  30.94 
 
 
634 aa  253  1e-65  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01374  ATP-dependent helicase  30.85 
 
 
644 aa  251  2e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2302  ATP-dependent helicase, DinG family protein  29.94 
 
 
662 aa  251  2e-65  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.783815  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2017  hypothetical protein  30.7 
 
 
634 aa  251  3e-65  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.451998  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2013  helicase c2  32.78 
 
 
639 aa  251  3e-65  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.479282  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2406  hypothetical protein  30.7 
 
 
634 aa  251  3e-65  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00282147  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0733  ATP-dependent DNA helicase  30.72 
 
 
640 aa  251  4e-65  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.982369  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2251  ATP-dependent helicase, putative  33.33 
 
 
755 aa  250  6e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.247338  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0648  helicase c2  32.16 
 
 
668 aa  249  8e-65  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2178  helicase c2  33.19 
 
 
685 aa  250  8e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>