More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_1052 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013530  Xcel_1256  helicase c2  59.64 
 
 		 696 aa  723    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1563  helicase c2  57.14 
 
 		 728 aa  704    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.192384  decreased coverage  0.00181092 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23060  DNA helicase, Rad3  60.44 
 
 		 692 aa  749    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0774743 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1052  helicase c2  100 
 
 		 669 aa  1342    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.325194 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2435  helicase c2  55.64 
 
 		 679 aa  629  1e-179  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.184328  normal  0.864461 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1504  helicase c2  53.18 
 
 		 672 aa  619  1e-176  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.328202  normal  0.416282 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17400  DNA helicase, Rad3  50.97 
 
 		 765 aa  602  1.0000000000000001e-171  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0589917  normal  0.041503 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1467  helicase c2  49.85 
 
 		 690 aa  597  1e-169  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0659778  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1469  helicase c2  50 
 
 		 685 aa  590  1e-167  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000142659 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10610  DNA helicase, Rad3  48.24 
 
 		 673 aa  577  1.0000000000000001e-163  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.382167  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1812  helicase c2  47.44 
 
 		 706 aa  577  1.0000000000000001e-163  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0995  helicase c2  47.43 
 
 		 681 aa  570  1e-161  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.900844  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1957  helicase c2  47.9 
 
 		 699 aa  552  1e-156  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0276528  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6530  putative ATP-dependent helicase  47.94 
 
 		 674 aa  545  1e-154  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.290122  normal  0.0410108 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07310  putative glutamate--cysteine ligase/putative amino acid ligase  49.56 
 
 		 699 aa  546  1e-154  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29270  DNA helicase, Rad3  47.47 
 
 		 684 aa  541  9.999999999999999e-153  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.318454 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2205  helicase c2  50.15 
 
 		 676 aa  531  1e-149  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.632178  normal  0.363279 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3841  helicase c2  49.62 
 
 		 665 aa  527  1e-148  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.478709  normal  0.0359375 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3855  helicase c2  49.62 
 
 		 665 aa  527  1e-148  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.210682  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3929  helicase c2  49.62 
 
 		 665 aa  527  1e-148  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0336304  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0280  helicase c2  47.71 
 
 		 683 aa  524  1e-147  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0332575 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3345  DEAD/DEAH box helicase domain protein  46.09 
 
 		 694 aa  522  1e-147  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.127637  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0323  helicase c2  47.47 
 
 		 699 aa  517  1.0000000000000001e-145  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000323796 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2167  helicase c2:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  48.69 
 
 		 706 aa  514  1e-144  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3824  helicase c2  47.29 
 
 		 676 aa  509  1e-143  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.00296278  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4298  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  47.74 
 
 		 666 aa  510  1e-143  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.641288 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11361  ATP-dependent helicase dinG  47.97 
 
 		 664 aa  508  9.999999999999999e-143  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00520548  normal  0.0965757 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0239  helicase c2  44.18 
 
 		 664 aa  508  9.999999999999999e-143  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1280  helicase c2  48.12 
 
 		 677 aa  502  1e-141  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0225088  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2347  helicase c2  47.07 
 
 		 670 aa  492  9.999999999999999e-139  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.490547  normal  0.859108 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1480  helicase c2  48.48 
 
 		 710 aa  474  1e-132  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.124092  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4634  helicase c2  33.84 
 
 		 674 aa  313  7.999999999999999e-84  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0636  helicase c2  33.44 
 
 		 660 aa  308  3e-82  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0997  helicase c2  34.39 
 
 		 643 aa  298  2e-79  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.179863 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1412  helicase c2  32.2 
 
 		 658 aa  290  7e-77  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.102914  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1921  helicase c2  33.29 
 
 		 725 aa  289  1e-76  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.782434  normal  0.028244 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1106  helicase c2  30.33 
 
 		 636 aa  288  2e-76  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.243566 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2809  helicase c2  32.48 
 
 		 707 aa  288  2.9999999999999996e-76  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1342  helicase c2  33.29 
 
 		 754 aa  287  4e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1626  ATP-dependent DNA helicase-related protein  32.9 
 
 		 713 aa  286  1.0000000000000001e-75  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1593  helicase c2  33.29 
 
 		 725 aa  285  1.0000000000000001e-75  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.601772  normal  0.0255754 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1364  helicase c2  33.49 
 
 		 640 aa  283  5.000000000000001e-75  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1743  DNA polymerase III, epsilon subunit  31.23 
 
 		 930 aa  283  7.000000000000001e-75  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.23026  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1235  helicase c2  33.19 
 
 		 743 aa  283  8.000000000000001e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0895293  normal  0.149585 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0648  helicase c2  32.22 
 
 		 668 aa  282  1e-74  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1347  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  30.5 
 
 		 957 aa  283  1e-74  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.579486 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2517  ATP-dependent helicase, DEXD family  33.02 
 
 		 641 aa  281  2e-74  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.764826  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2147  helicase c2  33.02 
 
 		 641 aa  281  2e-74  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0303331  hitchhiker  0.00135971 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0532  helicase c2  34.93 
 
 		 649 aa  281  2e-74  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01778  conserved protein with nucleoside triphosphate hydrolase domain  32.63 
 
 		 636 aa  280  8e-74  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.548012  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2034  hypothetical protein  32.63 
 
 		 636 aa  280  8e-74  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1896  hypothetical protein  32.63 
 
 		 636 aa  280  8e-74  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1825  helicase c2  32.63 
 
 		 636 aa  280  8e-74  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.979985  normal  0.491186 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01766  hypothetical protein  32.63 
 
 		 636 aa  280  8e-74  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.479225  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2535  hypothetical protein  32.63 
 
 		 636 aa  280  8e-74  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.50615  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1835  helicase c2  32.63 
 
 		 636 aa  279  1e-73  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00837342  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01597  ATP-dependent helicase  33.89 
 
 		 675 aa  279  1e-73  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1566  helicase c2  43.44 
 
 		 844 aa  279  1e-73  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.102401  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1409  helicase c2  34.4 
 
 		 651 aa  279  2e-73  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01131  ATP-dependent helicase  32.36 
 
 		 639 aa  278  2e-73  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.625206  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0363  ATP-dependent helicase DinG  31.91 
 
 		 840 aa  278  3e-73  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.01237  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3167  helicase c2  31.53 
 
 		 876 aa  278  3e-73  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000644587  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1380  hypothetical protein  32.48 
 
 		 636 aa  278  3e-73  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.434814  normal  0.350106 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4323  helicase c2  33.92 
 
 		 631 aa  277  5e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0709  helicase c2  32.78 
 
 		 650 aa  276  7e-73  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.968194 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1886  hypothetical protein  30.91 
 
 		 652 aa  276  9e-73  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2068  hypothetical protein  32.48 
 
 		 636 aa  276  9e-73  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2378  helicase c2  32.16 
 
 		 636 aa  275  1.0000000000000001e-72  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2677  helicase c2  31.06 
 
 		 646 aa  276  1.0000000000000001e-72  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.663694  normal  0.183253 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1991  ATP-dependent helicase, putative  34.09 
 
 		 645 aa  275  2.0000000000000002e-72  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4478  helicase c2  33.19 
 
 		 633 aa  275  2.0000000000000002e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.647625  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0897  helicase c2  33.69 
 
 		 647 aa  275  2.0000000000000002e-72  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0188  helicase c2  33.02 
 
 		 659 aa  275  2.0000000000000002e-72  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00148037  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2094  helicase c2  33.86 
 
 		 673 aa  274  3e-72  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.239782  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1495  hypothetical protein  32.01 
 
 		 636 aa  274  4.0000000000000004e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1965  hypothetical protein  32.01 
 
 		 636 aa  274  5.000000000000001e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2022  hypothetical protein  32.01 
 
 		 636 aa  274  5.000000000000001e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.6889  normal  0.891564 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1961  hypothetical protein  32.01 
 
 		 636 aa  273  6e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.915388  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1310  hypothetical protein  32.01 
 
 		 636 aa  273  6e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.027986  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0820  helicase c2  32.47 
 
 		 650 aa  273  9e-72  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.932295  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1897  hypothetical protein  29.91 
 
 		 652 aa  273  1e-71  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0911  putative ATP-dependent helicase  31.68 
 
 		 651 aa  272  2e-71  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0411  helicase c2  31.88 
 
 		 646 aa  271  2e-71  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3093  helicase c2  32.78 
 
 		 681 aa  271  2.9999999999999997e-71  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.649657 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1934  helicase c2  31.33 
 
 		 640 aa  270  5e-71  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.101214  normal  0.540234 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2763  helicase c2  33.14 
 
 		 634 aa  270  5e-71  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0359097  hitchhiker  0.00537714 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2413  helicase c2  30.93 
 
 		 669 aa  270  5.9999999999999995e-71  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0561182  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2424  helicase c2  31.33 
 
 		 669 aa  270  7e-71  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2532  helicase c2  31.18 
 
 		 640 aa  270  8.999999999999999e-71  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.139439 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1295  helicase c2  33.19 
 
 		 664 aa  269  1e-70  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2527  helicase c2  31.99 
 
 		 653 aa  267  4e-70  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0816709  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1156  helicase c2  34.25 
 
 		 649 aa  267  5.999999999999999e-70  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004095  DinG family ATP-dependent helicase YoaA  32.67 
 
 		 646 aa  266  1e-69  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2196  helicase c2  32.03 
 
 		 641 aa  265  2e-69  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00456377 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01374  ATP-dependent helicase  31.96 
 
 		 644 aa  265  2e-69  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2013  helicase c2  32.72 
 
 		 639 aa  265  2e-69  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.479282  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1727  helicase c2  30.18 
 
 		 641 aa  265  3e-69  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1824  helicase c2  30.55 
 
 		 664 aa  263  6e-69  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.678424  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1612  putative ATP-dependent helicase  33.49 
 
 		 751 aa  263  6e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00100383  normal  0.548735 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4468  helicase c2  33.18 
 
 		 635 aa  263  8.999999999999999e-69  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.261313  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>