More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_1480 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008578  Acel_1480  helicase c2  100 
 
 		 710 aa  1391    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.124092  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0995  helicase c2  51.37 
 
 		 681 aa  624  1e-177  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.900844  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4298  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  54.66 
 
 		 666 aa  621  1e-176  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.641288 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1812  helicase c2  48.8 
 
 		 706 aa  612  9.999999999999999e-175  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3841  helicase c2  52.94 
 
 		 665 aa  610  1e-173  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.478709  normal  0.0359375 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11361  ATP-dependent helicase dinG  53.9 
 
 		 664 aa  610  1e-173  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00520548  normal  0.0965757 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6530  putative ATP-dependent helicase  50.76 
 
 		 674 aa  612  1e-173  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.290122  normal  0.0410108 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3855  helicase c2  52.94 
 
 		 665 aa  610  1e-173  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.210682  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3929  helicase c2  52.94 
 
 		 665 aa  610  1e-173  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0336304  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2205  helicase c2  54.1 
 
 		 676 aa  606  9.999999999999999e-173  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.632178  normal  0.363279 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2347  helicase c2  53.35 
 
 		 670 aa  599  1e-170  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.490547  normal  0.859108 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17400  DNA helicase, Rad3  51.71 
 
 		 765 aa  587  1e-166  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0589917  normal  0.041503 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29270  DNA helicase, Rad3  49.73 
 
 		 684 aa  587  1e-166  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.318454 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1504  helicase c2  51.6 
 
 		 672 aa  585  1.0000000000000001e-165  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.328202  normal  0.416282 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3345  DEAD/DEAH box helicase domain protein  47.27 
 
 		 694 aa  565  1e-160  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.127637  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23060  DNA helicase, Rad3  48.82 
 
 		 692 aa  561  1e-158  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0774743 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1957  helicase c2  48.11 
 
 		 699 aa  557  1e-157  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0276528  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1467  helicase c2  47.63 
 
 		 690 aa  556  1e-157  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0659778  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0239  helicase c2  46.31 
 
 		 664 aa  551  1e-155  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1469  helicase c2  47.32 
 
 		 685 aa  545  1e-154  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000142659 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1256  helicase c2  49.3 
 
 		 696 aa  542  1e-153  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1563  helicase c2  49.32 
 
 		 728 aa  532  1e-150  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.192384  decreased coverage  0.00181092 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10610  DNA helicase, Rad3  47.04 
 
 		 673 aa  534  1e-150  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.382167  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0280  helicase c2  46.91 
 
 		 683 aa  522  1e-147  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0332575 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2435  helicase c2  51.16 
 
 		 679 aa  520  1e-146  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.184328  normal  0.864461 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0323  helicase c2  46.83 
 
 		 699 aa  516  1.0000000000000001e-145  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000323796 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2167  helicase c2:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  47.1 
 
 		 706 aa  515  1e-144  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1052  helicase c2  47.81 
 
 		 669 aa  511  1e-143  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.325194 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07310  putative glutamate--cysteine ligase/putative amino acid ligase  46.26 
 
 		 699 aa  487  1e-136  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3824  helicase c2  45.74 
 
 		 676 aa  480  1e-134  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.00296278  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1280  helicase c2  45.78 
 
 		 677 aa  459  9.999999999999999e-129  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0225088  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1566  helicase c2  47.17 
 
 		 844 aa  328  3e-88  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.102401  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4634  helicase c2  32.77 
 
 		 674 aa  285  3.0000000000000004e-75  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1593  helicase c2  31.82 
 
 		 725 aa  272  2e-71  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.601772  normal  0.0255754 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0997  helicase c2  32.81 
 
 		 643 aa  271  2.9999999999999997e-71  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.179863 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1342  helicase c2  31.64 
 
 		 754 aa  268  2e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0897  helicase c2  33.14 
 
 		 647 aa  266  8e-70  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1921  helicase c2  31.39 
 
 		 725 aa  264  4e-69  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.782434  normal  0.028244 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1743  DNA polymerase III, epsilon subunit  29.55 
 
 		 930 aa  262  2e-68  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.23026  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2251  ATP-dependent helicase, putative  32.16 
 
 		 755 aa  259  1e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.247338  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1403  helicase c2  31.95 
 
 		 757 aa  257  4e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.127709  hitchhiker  0.000000348035 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2524  helicase c2  31.82 
 
 		 755 aa  256  8e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00188741  decreased coverage  0.000000000263353 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1612  putative ATP-dependent helicase  31.78 
 
 		 751 aa  256  1.0000000000000001e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00100383  normal  0.548735 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2677  helicase c2  30.83 
 
 		 646 aa  255  2.0000000000000002e-66  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.663694  normal  0.183253 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1412  helicase c2  30.4 
 
 		 658 aa  254  4.0000000000000004e-66  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.102914  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1886  hypothetical protein  29.17 
 
 		 652 aa  251  3e-65  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0709  helicase c2  33.14 
 
 		 650 aa  251  5e-65  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.968194 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1364  helicase c2  31.59 
 
 		 640 aa  250  8e-65  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4478  helicase c2  33 
 
 		 633 aa  249  9e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.647625  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2207  putative ATP-dependent helicase  32.23 
 
 		 749 aa  249  1e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2336  ATP-dependent helicase, putative  32.09 
 
 		 752 aa  248  2e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0562  DNA polymerase III, epsilon subunit  33.8 
 
 		 921 aa  248  2e-64  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2170  putative ATP-dependent helicase  32.09 
 
 		 752 aa  248  2e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.779886  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1086  putative ATP-dependent helicase  32.09 
 
 		 752 aa  248  3e-64  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.00956322  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1326  ATP-dependent helicase, putative  32.09 
 
 		 752 aa  248  3e-64  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0729389  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1815  putative ATP-dependent helicase  32.09 
 
 		 752 aa  248  3e-64  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0081  putative ATP-dependent helicase  32.09 
 
 		 752 aa  248  3e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.892999  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1409  helicase c2  33.13 
 
 		 651 aa  247  4e-64  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0636  helicase c2  31.36 
 
 		 660 aa  246  9.999999999999999e-64  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1805  helicase c2  28.73 
 
 		 659 aa  245  1.9999999999999999e-63  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1727  helicase c2  29.08 
 
 		 641 aa  245  1.9999999999999999e-63  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2013  helicase c2  31.5 
 
 		 639 aa  244  3.9999999999999997e-63  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.479282  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2147  helicase c2  31.67 
 
 		 641 aa  243  7e-63  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0303331  hitchhiker  0.00135971 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2517  ATP-dependent helicase, DEXD family  31.67 
 
 		 641 aa  243  7e-63  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.764826  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1295  helicase c2  33.29 
 
 		 664 aa  242  2e-62  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2228  helicase c2  33.58 
 
 		 639 aa  242  2e-62  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.232993  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0411  helicase c2  31.4 
 
 		 646 aa  242  2e-62  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1933  helicase c2  31.89 
 
 		 639 aa  242  2e-62  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2005  putative ATP-dependent DNA helicase-related protein  34.03 
 
 		 666 aa  241  4e-62  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.349435 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2172  helicase c2  28.46 
 
 		 659 aa  241  5e-62  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1859  helicase c2  28.32 
 
 		 674 aa  239  9e-62  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.347581  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0532  helicase c2  34.61 
 
 		 649 aa  239  1e-61  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1156  helicase c2  33.72 
 
 		 649 aa  238  2e-61  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2081  ATP-dependent helicase DinG  29.54 
 
 		 633 aa  238  3e-61  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0733  ATP-dependent DNA helicase  30.03 
 
 		 640 aa  236  1.0000000000000001e-60  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.982369  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0911  putative ATP-dependent helicase  30.82 
 
 		 651 aa  233  9e-60  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2763  helicase c2  30.58 
 
 		 634 aa  233  9e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0359097  hitchhiker  0.00537714 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2017  hypothetical protein  30.77 
 
 		 634 aa  232  2e-59  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.451998  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1106  helicase c2  30.42 
 
 		 636 aa  232  2e-59  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.243566 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2406  hypothetical protein  30.77 
 
 		 634 aa  232  2e-59  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00282147  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004095  DinG family ATP-dependent helicase YoaA  29.57 
 
 		 646 aa  232  2e-59  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2128  helicase c2  30.62 
 
 		 634 aa  230  6e-59  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2424  helicase c2  29.99 
 
 		 669 aa  229  1e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1863  helicase c2  32.56 
 
 		 668 aa  229  2e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.879395 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1967  ATP-dependent helicase  32.76 
 
 		 675 aa  228  3e-58  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2178  helicase c2  32.97 
 
 		 685 aa  228  3e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1901  helicase c2  32.76 
 
 		 675 aa  228  3e-58  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2809  helicase c2  29.78 
 
 		 707 aa  228  4e-58  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1934  helicase c2  29.84 
 
 		 640 aa  228  4e-58  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.101214  normal  0.540234 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0648  helicase c2  29.13 
 
 		 668 aa  227  5.0000000000000005e-58  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4468  helicase c2  31.06 
 
 		 635 aa  227  7e-58  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.261313  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2535  helicase C2  28 
 
 		 645 aa  226  1e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.801549  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4459  helicase c2  31.68 
 
 		 633 aa  226  1e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.157065  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2532  helicase c2  29.7 
 
 		 640 aa  226  1e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.139439 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1990  helicase c2  32.48 
 
 		 649 aa  226  1e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1269  helicase c2  28.12 
 
 		 636 aa  224  4.9999999999999996e-57  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1598  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  26.27 
 
 		 934 aa  223  7e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00523268  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1452  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  26.03 
 
 		 934 aa  223  8e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1565  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  26.03 
 
 		 934 aa  223  8e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.554006  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3747  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  26.27 
 
 		 934 aa  223  8e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.739451  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>