More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_3824 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_3824  helicase c2  100 
 
 		 676 aa  1347    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.00296278  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0995  helicase c2  52.03 
 
 		 681 aa  625  1e-178  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.900844  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6530  putative ATP-dependent helicase  53.69 
 
 		 674 aa  614  9.999999999999999e-175  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.290122  normal  0.0410108 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1812  helicase c2  51.88 
 
 		 706 aa  611  1e-173  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1504  helicase c2  53.4 
 
 		 672 aa  608  1e-173  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.328202  normal  0.416282 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17400  DNA helicase, Rad3  51.81 
 
 		 765 aa  600  1e-170  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0589917  normal  0.041503 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29270  DNA helicase, Rad3  51.46 
 
 		 684 aa  598  1e-170  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.318454 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2205  helicase c2  54.32 
 
 		 676 aa  584  1.0000000000000001e-165  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.632178  normal  0.363279 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3345  DEAD/DEAH box helicase domain protein  51.3 
 
 		 694 aa  580  1e-164  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.127637  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10610  DNA helicase, Rad3  51.68 
 
 		 673 aa  572  1.0000000000000001e-162  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.382167  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1467  helicase c2  49.64 
 
 		 690 aa  574  1.0000000000000001e-162  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0659778  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1957  helicase c2  49.5 
 
 		 699 aa  571  1e-161  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0276528  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1469  helicase c2  48.46 
 
 		 685 aa  565  1e-160  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000142659 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3841  helicase c2  52.32 
 
 		 665 aa  563  1.0000000000000001e-159  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.478709  normal  0.0359375 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2167  helicase c2:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  50.22 
 
 		 706 aa  565  1.0000000000000001e-159  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3855  helicase c2  52.32 
 
 		 665 aa  563  1.0000000000000001e-159  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.210682  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3929  helicase c2  52.32 
 
 		 665 aa  563  1.0000000000000001e-159  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0336304  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1563  helicase c2  51.16 
 
 		 728 aa  559  1e-158  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.192384  decreased coverage  0.00181092 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4298  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  52.5 
 
 		 666 aa  561  1e-158  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.641288 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23060  DNA helicase, Rad3  52.59 
 
 		 692 aa  555  1e-157  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0774743 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2347  helicase c2  50.29 
 
 		 670 aa  558  1e-157  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.490547  normal  0.859108 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1256  helicase c2  52.14 
 
 		 696 aa  548  1e-154  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1280  helicase c2  51.09 
 
 		 677 aa  541  9.999999999999999e-153  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0225088  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11361  ATP-dependent helicase dinG  50.52 
 
 		 664 aa  535  1e-151  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00520548  normal  0.0965757 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0239  helicase c2  47.55 
 
 		 664 aa  530  1e-149  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07310  putative glutamate--cysteine ligase/putative amino acid ligase  49.14 
 
 		 699 aa  529  1e-149  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0323  helicase c2  48.66 
 
 		 699 aa  519  1e-146  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000323796 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1052  helicase c2  47.28 
 
 		 669 aa  519  1e-146  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.325194 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0280  helicase c2  47.24 
 
 		 683 aa  511  1e-143  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0332575 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2435  helicase c2  48.69 
 
 		 679 aa  481  1e-134  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.184328  normal  0.864461 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1480  helicase c2  46.29 
 
 		 710 aa  449  1.0000000000000001e-124  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.124092  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1566  helicase c2  45.85 
 
 		 844 aa  311  2.9999999999999997e-83  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.102401  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0997  helicase c2  34.69 
 
 		 643 aa  292  1e-77  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.179863 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0636  helicase c2  34.64 
 
 		 660 aa  286  5.999999999999999e-76  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1575  putative ATP-dependent helicase  32.46 
 
 		 646 aa  284  5.000000000000001e-75  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.718112  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1380  hypothetical protein  33.38 
 
 		 636 aa  275  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.434814  normal  0.350106 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1835  helicase c2  33.23 
 
 		 636 aa  274  3e-72  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00837342  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004095  DinG family ATP-dependent helicase YoaA  31.39 
 
 		 646 aa  274  3e-72  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01778  conserved protein with nucleoside triphosphate hydrolase domain  33.23 
 
 		 636 aa  274  5.000000000000001e-72  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.548012  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1896  hypothetical protein  33.23 
 
 		 636 aa  274  5.000000000000001e-72  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2535  hypothetical protein  33.23 
 
 		 636 aa  274  5.000000000000001e-72  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.50615  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01766  hypothetical protein  33.23 
 
 		 636 aa  274  5.000000000000001e-72  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.479225  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1825  helicase c2  33.23 
 
 		 636 aa  274  5.000000000000001e-72  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.979985  normal  0.491186 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2034  hypothetical protein  33.23 
 
 		 636 aa  274  5.000000000000001e-72  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1545  DNA polymerase III, epsilon subunit  31.95 
 
 		 944 aa  271  2e-71  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.676592  decreased coverage  0.000191845 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2068  hypothetical protein  33.08 
 
 		 636 aa  271  2.9999999999999997e-71  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6611  helicase c2  34.22 
 
 		 729 aa  270  5e-71  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0933933 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1961  hypothetical protein  32.49 
 
 		 636 aa  268  2e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.915388  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1495  hypothetical protein  32.49 
 
 		 636 aa  268  2.9999999999999995e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1965  hypothetical protein  32.49 
 
 		 636 aa  268  2.9999999999999995e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1310  hypothetical protein  32.49 
 
 		 636 aa  268  2.9999999999999995e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.027986  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2022  hypothetical protein  32.49 
 
 		 636 aa  268  2.9999999999999995e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.6889  normal  0.891564 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01374  ATP-dependent helicase  30.99 
 
 		 644 aa  267  4e-70  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0911  putative ATP-dependent helicase  32.27 
 
 		 651 aa  265  3e-69  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1106  helicase c2  30.59 
 
 		 636 aa  265  3e-69  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.243566 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1593  helicase c2  30.82 
 
 		 725 aa  263  6e-69  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.601772  normal  0.0255754 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1921  helicase c2  30.54 
 
 		 725 aa  263  6.999999999999999e-69  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.782434  normal  0.028244 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4634  helicase c2  31.48 
 
 		 674 aa  262  1e-68  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1897  hypothetical protein  30.36 
 
 		 652 aa  261  2e-68  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1409  helicase c2  33.54 
 
 		 651 aa  262  2e-68  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1933  helicase c2  33.19 
 
 		 639 aa  260  7e-68  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2316  helicase c2  34.02 
 
 		 670 aa  259  8e-68  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1235  helicase c2  31.79 
 
 		 743 aa  259  9e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0895293  normal  0.149585 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1886  hypothetical protein  29.5 
 
 		 652 aa  259  1e-67  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1269  helicase c2  30.33 
 
 		 636 aa  259  1e-67  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1412  helicase c2  30.08 
 
 		 658 aa  259  1e-67  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.102914  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1626  ATP-dependent DNA helicase-related protein  29.69 
 
 		 713 aa  258  2e-67  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01597  ATP-dependent helicase  33.84 
 
 		 675 aa  258  2e-67  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2763  helicase c2  33.13 
 
 		 634 aa  258  3e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0359097  hitchhiker  0.00537714 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0188  helicase c2  30.93 
 
 		 659 aa  257  6e-67  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00148037  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1342  helicase c2  31.09 
 
 		 754 aa  257  6e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1990  helicase c2  33.53 
 
 		 649 aa  256  7e-67  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2809  helicase c2  31.55 
 
 		 707 aa  256  7e-67  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2677  helicase c2  31.46 
 
 		 646 aa  255  2.0000000000000002e-66  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.663694  normal  0.183253 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1863  helicase c2  33.88 
 
 		 668 aa  255  2.0000000000000002e-66  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.879395 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0532  helicase c2  34.32 
 
 		 649 aa  254  3e-66  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2378  helicase c2  32.42 
 
 		 636 aa  254  5.000000000000001e-66  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2013  helicase c2  33.13 
 
 		 639 aa  253  6e-66  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.479282  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0411  helicase c2  30.84 
 
 		 646 aa  253  7e-66  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1990  ATP-dependent helicase DinG  26.94 
 
 		 709 aa  252  1e-65  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0648  helicase c2  31.28 
 
 		 668 aa  253  1e-65  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1743  DNA polymerase III, epsilon subunit  31.38 
 
 		 930 aa  252  2e-65  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.23026  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2228  helicase c2  33.98 
 
 		 639 aa  250  5e-65  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.232993  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2128  helicase c2  31.89 
 
 		 634 aa  250  7e-65  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2406  hypothetical protein  31.89 
 
 		 634 aa  249  9e-65  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00282147  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2877  helicase c2  33.23 
 
 		 658 aa  249  1e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.679539 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1364  helicase c2  31.37 
 
 		 640 aa  249  1e-64  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2017  hypothetical protein  31.89 
 
 		 634 aa  249  1e-64  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.451998  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2094  helicase c2  33.78 
 
 		 673 aa  248  3e-64  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.239782  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1779  helicase c2:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  31.52 
 
 		 641 aa  247  4e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.66637 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2196  helicase c2  31.04 
 
 		 641 aa  247  6e-64  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00456377 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1403  helicase c2  32.34 
 
 		 757 aa  247  6e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.127709  hitchhiker  0.000000348035 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2524  helicase c2  32.04 
 
 		 755 aa  246  9.999999999999999e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00188741  decreased coverage  0.000000000263353 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1940  ATP-dependent helicase DinG  30.67 
 
 		 665 aa  246  9.999999999999999e-64  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.497186  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2527  helicase c2  30.86 
 
 		 653 aa  245  1.9999999999999999e-63  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0816709  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2517  ATP-dependent helicase, DEXD family  31.88 
 
 		 641 aa  245  1.9999999999999999e-63  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.764826  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01131  ATP-dependent helicase  31.66 
 
 		 639 aa  245  1.9999999999999999e-63  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.625206  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3093  helicase c2  32.88 
 
 		 681 aa  245  1.9999999999999999e-63  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.649657 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2147  helicase c2  31.88 
 
 		 641 aa  245  1.9999999999999999e-63  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0303331  hitchhiker  0.00135971 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2178  helicase c2  33.38 
 
 		 685 aa  244  3e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>