More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_2302 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_1933  helicase c2  54.99 
 
 		 639 aa  705    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01778  conserved protein with nucleoside triphosphate hydrolase domain  56.06 
 
 		 636 aa  721    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.548012  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1835  helicase c2  55.91 
 
 		 636 aa  717    Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00837342  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1896  hypothetical protein  56.06 
 
 		 636 aa  721    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1575  putative ATP-dependent helicase  57.57 
 
 		 646 aa  771    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.718112  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3886  ATP-dependent helicase  47.35 
 
 		 647 aa  640    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2378  helicase c2  54.99 
 
 		 636 aa  697    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01766  hypothetical protein  56.06 
 
 		 636 aa  721    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.479225  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1990  helicase c2  54.2 
 
 		 649 aa  706    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2406  hypothetical protein  54.33 
 
 		 634 aa  706    Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00282147  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2068  hypothetical protein  55.91 
 
 		 636 aa  717    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004095  DinG family ATP-dependent helicase YoaA  57.75 
 
 		 646 aa  772    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01131  ATP-dependent helicase  49.3 
 
 		 639 aa  656    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.625206  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1965  hypothetical protein  55.28 
 
 		 636 aa  712    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2128  helicase c2  54.17 
 
 		 634 aa  706    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2013  helicase c2  54.82 
 
 		 639 aa  718    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.479282  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2809  helicase c2  49.29 
 
 		 707 aa  670    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0733  ATP-dependent DNA helicase  51.1 
 
 		 640 aa  664    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.982369  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1380  hypothetical protein  55.91 
 
 		 636 aa  720    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.434814  normal  0.350106 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2535  hypothetical protein  56.06 
 
 		 636 aa  721    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.50615  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2022  hypothetical protein  55.28 
 
 		 636 aa  712    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.6889  normal  0.891564 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1495  hypothetical protein  55.12 
 
 		 636 aa  710    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0911  putative ATP-dependent helicase  58.26 
 
 		 651 aa  769    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2763  helicase c2  56.76 
 
 		 634 aa  733    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0359097  hitchhiker  0.00537714 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01374  ATP-dependent helicase  57.81 
 
 		 644 aa  779    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1825  helicase c2  56.06 
 
 		 636 aa  721    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.979985  normal  0.491186 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2034  hypothetical protein  56.06 
 
 		 636 aa  721    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2302  ATP-dependent helicase, DinG family protein  100 
 
 		 662 aa  1355    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.783815  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1961  hypothetical protein  55.12 
 
 		 636 aa  711    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.915388  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1310  hypothetical protein  55.28 
 
 		 636 aa  712    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.027986  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2228  helicase c2  55.15 
 
 		 639 aa  706    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.232993  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2017  hypothetical protein  54.49 
 
 		 634 aa  708    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.451998  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2172  helicase c2  44.2 
 
 		 659 aa  546  1e-154  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1805  helicase c2  44.04 
 
 		 659 aa  544  1e-153  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2455  helicase c2  44.55 
 
 		 641 aa  543  1e-153  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1727  helicase c2  44.67 
 
 		 641 aa  543  1e-153  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1859  helicase c2  44.2 
 
 		 674 aa  545  1e-153  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.347581  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0411  helicase c2  41.89 
 
 		 646 aa  542  9.999999999999999e-153  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1364  helicase c2  43.17 
 
 		 640 aa  537  1e-151  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2081  ATP-dependent helicase DinG  44.13 
 
 		 633 aa  535  1e-150  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1934  helicase c2  43.57 
 
 		 640 aa  532  1e-150  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.101214  normal  0.540234 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2413  helicase c2  43.57 
 
 		 669 aa  531  1e-149  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0561182  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1824  helicase c2  43.48 
 
 		 664 aa  531  1e-149  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.678424  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1619  helicase c2  44.39 
 
 		 629 aa  530  1e-149  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2424  helicase c2  43.57 
 
 		 669 aa  531  1e-149  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2532  helicase c2  43.42 
 
 		 640 aa  531  1e-149  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.139439 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2535  helicase C2  43.3 
 
 		 645 aa  530  1e-149  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.801549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1412  helicase c2  42.21 
 
 		 658 aa  520  1e-146  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.102914  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2097  helicase c2  43.82 
 
 		 644 aa  516  1.0000000000000001e-145  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0479006  normal  0.269462 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2196  helicase c2  42.13 
 
 		 641 aa  516  1.0000000000000001e-145  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00456377 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1342  helicase c2  39.41 
 
 		 754 aa  509  1e-143  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1235  helicase c2  40.61 
 
 		 743 aa  509  1e-143  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0895293  normal  0.149585 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0648  helicase c2  41.38 
 
 		 668 aa  502  1e-141  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1921  helicase c2  40.21 
 
 		 725 aa  503  1e-141  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.782434  normal  0.028244 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2527  helicase c2  40.96 
 
 		 653 aa  502  1e-141  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0816709  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1626  ATP-dependent DNA helicase-related protein  40.42 
 
 		 713 aa  502  1e-140  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1409  helicase c2  41.89 
 
 		 651 aa  501  1e-140  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1593  helicase c2  39.76 
 
 		 725 aa  500  1e-140  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.601772  normal  0.0255754 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2517  ATP-dependent helicase, DEXD family  41.1 
 
 		 641 aa  491  1e-137  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.764826  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1779  helicase c2:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  39.07 
 
 		 641 aa  489  1e-137  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.66637 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2147  helicase c2  41.1 
 
 		 641 aa  491  1e-137  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0303331  hitchhiker  0.00135971 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1991  ATP-dependent helicase, putative  42.38 
 
 		 645 aa  488  1e-136  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1940  ATP-dependent helicase DinG  41.65 
 
 		 665 aa  488  1e-136  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.497186  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2524  helicase c2  37.94 
 
 		 755 aa  483  1e-135  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00188741  decreased coverage  0.000000000263353 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1886  hypothetical protein  41.78 
 
 		 652 aa  480  1e-134  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1403  helicase c2  40.56 
 
 		 757 aa  480  1e-134  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.127709  hitchhiker  0.000000348035 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0997  helicase c2  40.41 
 
 		 643 aa  478  1e-133  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.179863 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2251  ATP-dependent helicase, putative  40.96 
 
 		 755 aa  477  1e-133  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.247338  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1612  putative ATP-dependent helicase  37.46 
 
 		 751 aa  476  1e-133  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00100383  normal  0.548735 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1897  hypothetical protein  41.17 
 
 		 652 aa  474  1e-132  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1156  helicase c2  41.3 
 
 		 649 aa  471  1.0000000000000001e-131  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3093  helicase c2  40.9 
 
 		 681 aa  467  9.999999999999999e-131  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.649657 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01597  ATP-dependent helicase  40.52 
 
 		 675 aa  460  9.999999999999999e-129  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0636  helicase c2  38.91 
 
 		 660 aa  452  1.0000000000000001e-126  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1967  ATP-dependent helicase  40.5 
 
 		 675 aa  449  1e-125  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1269  helicase c2  38.45 
 
 		 636 aa  449  1e-125  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1901  helicase c2  40.5 
 
 		 675 aa  449  1e-125  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1295  helicase c2  40.46 
 
 		 664 aa  442  1e-123  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0532  helicase c2  37.29 
 
 		 649 aa  431  1e-119  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1863  helicase c2  38.02 
 
 		 668 aa  421  1e-116  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.879395 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2877  helicase c2  35.78 
 
 		 658 aa  419  9.999999999999999e-116  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.679539 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4634  helicase c2  36.27 
 
 		 674 aa  411  1e-113  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2005  putative ATP-dependent DNA helicase-related protein  36.67 
 
 		 666 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.349435 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2316  helicase c2  36.08 
 
 		 670 aa  405  1e-111  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2677  helicase c2  36.29 
 
 		 646 aa  402  9.999999999999999e-111  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.663694  normal  0.183253 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4478  helicase c2  35.68 
 
 		 633 aa  388  1e-106  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.647625  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4323  helicase c2  36.26 
 
 		 631 aa  386  1e-106  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4459  helicase c2  36.58 
 
 		 633 aa  385  1e-105  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.157065  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2178  helicase c2  35.59 
 
 		 685 aa  385  1e-105  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3499  helicase c2  34.26 
 
 		 724 aa  384  1e-105  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.285018  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4468  helicase c2  34.87 
 
 		 635 aa  369  1e-100  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.261313  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1900  helicase c2  34.79 
 
 		 688 aa  346  6e-94  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1828  helicase c2  34.79 
 
 		 688 aa  344  2.9999999999999997e-93  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.147958  normal  0.434412 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1106  helicase c2  33.49 
 
 		 636 aa  342  2e-92  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.243566 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1942  helicase c2  31.53 
 
 		 832 aa  332  1e-89  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.357662  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1347  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  32.46 
 
 		 957 aa  325  1e-87  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.579486 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4122  helicase c2  31.77 
 
 		 843 aa  324  3e-87  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000977416  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0023  Rad3-related DNA helicases  32.05 
 
 		 851 aa  322  9.999999999999999e-87  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000466591  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0188  helicase c2  33.64 
 
 		 659 aa  319  1e-85  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00148037  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1899  DNA polymerase III, epsilon subunit  32.18 
 
 		 956 aa  318  2e-85  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0589249 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>