297 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_0995 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013171  Apre_0995  DEAD_2 domain protein  100 
 
 		 777 aa  1574    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2947  DEAD_2 domain protein  40.44 
 
 		 774 aa  635  1e-180  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.443127  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0289  DEAD_2  41.45 
 
 		 785 aa  627  1e-178  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00121679  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0660  DEAD_2 domain protein  40.75 
 
 		 790 aa  626  1e-178  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1408  putative ATP-dependent helicase  41.66 
 
 		 781 aa  589  1e-167  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1217  ATP-dependent helicase, putative  41.27 
 
 		 781 aa  585  1.0000000000000001e-165  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.11747  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0224  DEAD_2 domain-containing protein  39.63 
 
 		 852 aa  513  1e-144  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0115724  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5309  DEAD_2 domain-containing protein  32.77 
 
 		 756 aa  444  1e-123  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.173286  hitchhiker  0.0033003 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4233  helicase c2  32.3 
 
 		 757 aa  433  1e-120  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.134799  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5421  DEAD_2 domain protein  32 
 
 		 754 aa  426  1e-118  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2972  DEAD_2 domain-containing protein  31.06 
 
 		 753 aa  426  1e-118  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.114076 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5966  helicase c2  31.54 
 
 		 766 aa  427  1e-118  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.224812  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3978  helicase c2  31.71 
 
 		 766 aa  427  1e-118  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0904062  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4389  helicase c2  31.71 
 
 		 766 aa  427  1e-118  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.787433  normal  0.56553 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1630  Rad3-related DNA helicases-like  31.33 
 
 		 766 aa  421  1e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.138986  normal  0.527518 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3801  helicase c2  31.15 
 
 		 766 aa  419  1e-116  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.354929 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4268  helicase c2  31.15 
 
 		 766 aa  419  9.999999999999999e-116  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0100597  normal  0.178799 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40350  hypothetical protein  30.64 
 
 		 758 aa  419  9.999999999999999e-116  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.650358  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2806  DEAD_2 domain protein  30.42 
 
 		 785 aa  415  1e-114  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.717048  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2850  DEAD_2 domain-containing protein  31.07 
 
 		 753 aa  415  1e-114  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5827  DEAD_2  29.8 
 
 		 779 aa  414  1e-114  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2943  DEAD_2 domain-containing protein  30.47 
 
 		 753 aa  416  1e-114  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1180  hypothetical protein  30.87 
 
 		 754 aa  416  1e-114  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.749053  normal  0.379614 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3423  hypothetical protein  30.72 
 
 		 758 aa  413  1e-114  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2839  DEAD_2 domain protein  30.97 
 
 		 762 aa  412  1e-113  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0984  DEAD_2 domain-containing protein  31.44 
 
 		 773 aa  410  1e-113  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2909  DEAD_2  30.59 
 
 		 775 aa  404  1e-111  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0996428 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1550  DNA repair helicase  30.5 
 
 		 745 aa  404  1e-111  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4111  helicase c2  30.24 
 
 		 766 aa  404  1e-111  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.620969 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2690  DEAD_2  29.88 
 
 		 772 aa  396  1e-109  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00215798 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1260  putative ATP-dependent helicase  30.64 
 
 		 755 aa  394  1e-108  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3036  hypothetical protein  29.93 
 
 		 761 aa  393  1e-108  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0104594  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1361  helicase c2  30 
 
 		 801 aa  394  1e-108  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1186  putative ATP-dependent helicase  30.64 
 
 		 755 aa  391  1e-107  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.146047  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0185  helicase c2  29.16 
 
 		 798 aa  392  1e-107  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2510  helicase c2  28.25 
 
 		 788 aa  387  1e-106  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00268076 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2454  Uvs006  30.58 
 
 		 746 aa  387  1e-106  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.107257  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5813  helicase c2  30.09 
 
 		 790 aa  385  1e-105  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.208635 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1416  helicase c2  27.17 
 
 		 855 aa  381  1e-104  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0909  hypothetical protein  29.62 
 
 		 773 aa  382  1e-104  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.205853  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1498  helicase c2  29.73 
 
 		 773 aa  377  1e-103  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.486316  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0015  DEAD_2 domain-containing protein  29.53 
 
 		 750 aa  376  1e-103  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.338089  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2428  helicase c2  27.28 
 
 		 855 aa  371  1e-101  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.376304  normal  0.732574 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2112  DEAD_2 domain-containing protein  28.61 
 
 		 797 aa  321  3.9999999999999996e-86  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1847  DEAD_2 domain-containing protein  27.42 
 
 		 807 aa  313  1e-83  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4042  DEAD_2 domain protein  27.97 
 
 		 798 aa  308  3e-82  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4133  DEAD_2 domain protein  27.28 
 
 		 798 aa  305  3.0000000000000004e-81  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0928  ATP-dependent helicase, putative  30.56 
 
 		 495 aa  246  1.9999999999999999e-63  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.568065  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1376  DNA repair helicase, truncation  32.27 
 
 		 431 aa  229  1e-58  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.731908  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4835  helicase c2  33.33 
 
 		 874 aa  177  9e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0589586 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0965  helicase c2  26.4 
 
 		 654 aa  137  6.0000000000000005e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.228923  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0196  DEAD_2 domain protein  24.53 
 
 		 619 aa  135  1.9999999999999998e-30  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.544403  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0478  DEAD_2 domain-containing protein  23.64 
 
 		 588 aa  132  3e-29  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.738253  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1699  DEAD_2 domain protein  24.34 
 
 		 670 aa  131  4.0000000000000003e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0524758  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1104  queuine tRNA-ribosyltransferase  25.23 
 
 		 676 aa  126  2e-27  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1812  DEAD_2 domain-containing protein  23.11 
 
 		 617 aa  124  5e-27  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0429091  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1117  DEAD_2 domain-containing protein  23.18 
 
 		 582 aa  124  9.999999999999999e-27  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1117  DEAD_2 domain-containing protein  24.53 
 
 		 712 aa  121  6e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.708962  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1672  helicase c2  26.46 
 
 		 739 aa  117  1.0000000000000001e-24  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0789  helicase c2  22.71 
 
 		 669 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.222881  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2627  DEAD_2 domain protein  21.92 
 
 		 723 aa  112  3e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.510755 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1737  DEAD_2 domain-containing protein  21.45 
 
 		 574 aa  111  4.0000000000000004e-23  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000703978 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2097  helicase c2  24.81 
 
 		 644 aa  100  1e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0479006  normal  0.269462 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0335  DEAD_2 domain protein  21.86 
 
 		 723 aa  100  1e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1416  DEAD_2 domain protein  23.8 
 
 		 722 aa  99.4  3e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1566  Rad3-related DNA helicases  21.96 
 
 		 726 aa  98.6  4e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000243015  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0823  DEAD_2 domain protein  20.71 
 
 		 739 aa  97.1  1e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0390  DEAD_2 domain-containing protein  23.39 
 
 		 580 aa  97.1  1e-18  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.12513 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1769  DEAD_2 domain protein  21.55 
 
 		 729 aa  95.9  3e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.863576  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2455  helicase c2  23.36 
 
 		 641 aa  95.5  4e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3886  ATP-dependent helicase  22.99 
 
 		 647 aa  92  4e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA05570  general RNA polymerase II transcription factor, putative  20.83 
 
 		 799 aa  90.5  1e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.946623  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1918  helicase c2  28.24 
 
 		 790 aa  89.7  2e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.885633  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2535  helicase C2  27.72 
 
 		 645 aa  87.4  8e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.801549  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1197  helicase c2  22.69 
 
 		 661 aa  87.4  9e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.0000973223  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1357  DEAD_2 domain-containing protein  22.09 
 
 		 575 aa  86.7  0.000000000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0243831 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1376  DNA helicase RepD  25.98 
 
 		 773 aa  85.1  0.000000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.905642  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0816  helicase c2  27.24 
 
 		 787 aa  84.3  0.000000000000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.524115 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1495  hypothetical protein  22.15 
 
 		 636 aa  81.3  0.00000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1961  hypothetical protein  22.15 
 
 		 636 aa  80.9  0.00000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.915388  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1727  helicase c2  29.13 
 
 		 641 aa  80.9  0.00000000000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2022  hypothetical protein  22.15 
 
 		 636 aa  80.5  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.6889  normal  0.891564 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1965  hypothetical protein  22.15 
 
 		 636 aa  80.5  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0620  DEAD_2 domain-containing protein  21.83 
 
 		 634 aa  80.5  0.0000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1310  hypothetical protein  21.99 
 
 		 636 aa  79.7  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.027986  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_24915  predicted protein  20.61 
 
 		 791 aa  79.7  0.0000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.615618  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1575  putative ATP-dependent helicase  21.27 
 
 		 646 aa  79.3  0.0000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.718112  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3766  helicase c2  31.41 
 
 		 806 aa  80.1  0.0000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1269  helicase c2  21.71 
 
 		 636 aa  79.3  0.0000000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2013  helicase c2  22.98 
 
 		 639 aa  79  0.0000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.479282  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1886  hypothetical protein  22.62 
 
 		 652 aa  77.8  0.0000000000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01131  ATP-dependent helicase  22.71 
 
 		 639 aa  77.8  0.0000000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.625206  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0733  ATP-dependent DNA helicase  22.6 
 
 		 640 aa  75.5  0.000000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.982369  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01597  ATP-dependent helicase  24 
 
 		 675 aa  75.9  0.000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1897  hypothetical protein  22.69 
 
 		 652 aa  75.5  0.000000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2515  helicase c2  20.8 
 
 		 917 aa  74.7  0.000000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2196  helicase c2  29.84 
 
 		 641 aa  73.9  0.00000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00456377 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1933  helicase c2  25.1 
 
 		 639 aa  73.2  0.00000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_54439  YPL008W (CHL1)-like protein  22.76 
 
 		 835 aa  73.6  0.00000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.106037 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2413  helicase c2  28.34 
 
 		 669 aa  72.4  0.00000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0561182  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>