More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_2627 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013743  Htur_0335  DEAD_2 domain protein  67.68 
 
 		 723 aa  1015    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1769  DEAD_2 domain protein  66.98 
 
 		 729 aa  1009    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.863576  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1416  DEAD_2 domain protein  63.64 
 
 		 722 aa  929    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0823  DEAD_2 domain protein  64.36 
 
 		 739 aa  943    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2627  DEAD_2 domain protein  100 
 
 		 723 aa  1466    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.510755 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1566  Rad3-related DNA helicases  40.87 
 
 		 726 aa  565  1.0000000000000001e-159  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000243015  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1376  DNA helicase RepD  38.58 
 
 		 773 aa  542  1e-153  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.905642  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0816  helicase c2  30.17 
 
 		 787 aa  231  3e-59  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.524115 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2975  helicase c2  28.99 
 
 		 807 aa  221  3.9999999999999997e-56  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0196  DEAD_2 domain protein  24.11 
 
 		 619 aa  162  2e-38  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.544403  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2465  helicase c2  36.81 
 
 		 806 aa  160  7e-38  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1104  queuine tRNA-ribosyltransferase  23.13 
 
 		 676 aa  159  2e-37  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1918  helicase c2  36.64 
 
 		 790 aa  152  2e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.885633  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_50344  DNA helicase component of transcription factor b  22.88 
 
 		 793 aa  150  6e-35  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1672  helicase c2  24.23 
 
 		 739 aa  146  2e-33  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3766  helicase c2  35.6 
 
 		 806 aa  145  3e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA05570  general RNA polymerase II transcription factor, putative  23.22 
 
 		 799 aa  139  3.0000000000000003e-31  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.946623  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09436  5' to 3' DNA helicase (Eurofung)  24.15 
 
 		 791 aa  138  4e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1117  DEAD_2 domain-containing protein  22.25 
 
 		 712 aa  134  6e-30  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.708962  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0965  helicase c2  21.79 
 
 		 654 aa  130  7.000000000000001e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.228923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0789  helicase c2  22.51 
 
 		 669 aa  120  7.999999999999999e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.222881  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_26944  predicted protein  22.1 
 
 		 788 aa  114  8.000000000000001e-24  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.168097 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3224  DNA polymerase III, epsilon subunit  23.97 
 
 		 927 aa  112  3e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00101103  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0995  DEAD_2 domain protein  21.92 
 
 		 777 aa  112  3e-23  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_54072  xeroderma pigmentosum group D complementing protein  22.12 
 
 		 782 aa  110  1e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_24915  predicted protein  21.34 
 
 		 791 aa  105  2e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.615618  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4133  DEAD_2 domain protein  25.35 
 
 		 798 aa  105  2e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1699  DEAD_2 domain protein  21.34 
 
 		 670 aa  105  3e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0524758  normal  1 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_32894  predicted protein  23.27 
 
 		 1067 aa  103  8e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0780237  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1117  DEAD_2 domain-containing protein  24.74 
 
 		 582 aa  103  1e-20  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1671  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  23.58 
 
 		 934 aa  102  3e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.697043  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1424  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  23.26 
 
 		 934 aa  102  3e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1425  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  23.26 
 
 		 934 aa  102  3e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.446116  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1636  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  23.26 
 
 		 934 aa  102  3e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00174148 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1709  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  23.28 
 
 		 934 aa  102  4e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000649538  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4042  DEAD_2 domain protein  25.4 
 
 		 798 aa  100  7e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1408  putative ATP-dependent helicase  22.46 
 
 		 781 aa  99  3e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1452  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  22.99 
 
 		 934 aa  98.2  5e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1565  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  22.99 
 
 		 934 aa  98.2  5e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.554006  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1812  DEAD_2 domain-containing protein  23.47 
 
 		 617 aa  97.4  8e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0429091  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1347  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  22.38 
 
 		 957 aa  97.4  9e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.579486 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1467  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  23.55 
 
 		 934 aa  96.7  1e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.533097  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2112  DEAD_2 domain-containing protein  21.2 
 
 		 797 aa  96.3  2e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1598  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  23.6 
 
 		 934 aa  95.5  3e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00523268  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1217  ATP-dependent helicase, putative  22.35 
 
 		 781 aa  94.4  7e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.11747  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3747  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  23.47 
 
 		 934 aa  92.8  2e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.739451  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1265  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  22.87 
 
 		 929 aa  92  3e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00466144  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1847  DEAD_2 domain-containing protein  23.28 
 
 		 807 aa  90.1  1e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_10282  predicted protein  21.85 
 
 		 614 aa  89  3e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0188  helicase c2  23.45 
 
 		 659 aa  88.2  5e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00148037  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2947  DEAD_2 domain protein  21.46 
 
 		 774 aa  87.8  6e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.443127  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1545  DNA polymerase III, epsilon subunit  23.81 
 
 		 944 aa  85.9  0.000000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.676592  decreased coverage  0.000191845 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0015  DEAD_2 domain-containing protein  24.65 
 
 		 750 aa  85.1  0.000000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.338089  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0390  DEAD_2 domain-containing protein  23.62 
 
 		 580 aa  83.2  0.00000000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.12513 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1575  putative ATP-dependent helicase  23.12 
 
 		 646 aa  82.8  0.00000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.718112  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0289  DEAD_2  27.8 
 
 		 785 aa  82.8  0.00000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00121679  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3886  ATP-dependent helicase  21.26 
 
 		 647 aa  82  0.00000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0224  DEAD_2 domain-containing protein  22.26 
 
 		 852 aa  82.4  0.00000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0115724  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0185  helicase c2  22.92 
 
 		 798 aa  81.6  0.00000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0660  DEAD_2 domain protein  24.57 
 
 		 790 aa  80.1  0.0000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1902  helicase c2  23.24 
 
 		 646 aa  79.3  0.0000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_54439  YPL008W (CHL1)-like protein  19.34 
 
 		 835 aa  77.4  0.0000000000008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.106037 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3086  ATP-dependent DNA helicase DinG  24.04 
 
 		 692 aa  77.4  0.0000000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.175143  hitchhiker  0.0000411022 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2909  DEAD_2  22.65 
 
 		 775 aa  77.4  0.0000000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0996428 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1743  DNA polymerase III, epsilon subunit  22.9 
 
 		 930 aa  77  0.000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.23026  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40350  hypothetical protein  23.91 
 
 		 758 aa  75.9  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.650358  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1409  helicase c2  24.19 
 
 		 651 aa  75.5  0.000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_37445  predicted protein  24.17 
 
 		 938 aa  75.1  0.000000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.258887  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5813  helicase c2  30.25 
 
 		 790 aa  75.1  0.000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.208635 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_37740  predicted protein  22.97 
 
 		 849 aa  75.1  0.000000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.689797  normal  0.0804873 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3423  hypothetical protein  27.62 
 
 		 758 aa  74.7  0.000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1498  helicase c2  22.87 
 
 		 773 aa  74.3  0.000000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.486316  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01374  ATP-dependent helicase  22.99 
 
 		 644 aa  73.9  0.000000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1737  DEAD_2 domain-containing protein  23.99 
 
 		 574 aa  73.9  0.00000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000703978 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1288  DEAD_2 domain protein  22.64 
 
 		 550 aa  73.6  0.00000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1269  helicase c2  23.29 
 
 		 636 aa  73.6  0.00000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2013  helicase c2  22.84 
 
 		 639 aa  73.9  0.00000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.479282  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1656  hypothetical protein  23.3 
 
 		 645 aa  73.2  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.10694 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1442  ATP-dependent helicase DinG  23.3 
 
 		 645 aa  73.2  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3725  hypothetical protein  23.3 
 
 		 645 aa  72.8  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0167806  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1629  ATP-dependent DNA helicase DinG  23.39 
 
 		 690 aa  72.8  0.00000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.117477  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_14100  exonuclease, DNA polymerase III, epsilon subunit family  26.1 
 
 		 1043 aa  72  0.00000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1566  ATP-dependent DNA helicase DinG  21.59 
 
 		 692 aa  72.4  0.00000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000620367 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0911  putative ATP-dependent helicase  22.24 
 
 		 651 aa  72.4  0.00000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2725  ATP-dependent DNA helicase DinG  23.2 
 
 		 690 aa  72.4  0.00000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0300555  hitchhiker  0.000425027 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1618  ATP-dependent DNA helicase DinG  23.2 
 
 		 690 aa  72  0.00000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.326155  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003963  ATP-dependent helicase DinG/Rad3  20.69 
 
 		 691 aa  72  0.00000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1550  DNA repair helicase  24.42 
 
 		 745 aa  72  0.00000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1652  ATP-dependent DNA helicase DinG  23.2 
 
 		 690 aa  72  0.00000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.303868 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1470  hypothetical protein  24.46 
 
 		 645 aa  71.6  0.00000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.36032  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1586  hypothetical protein  24.46 
 
 		 645 aa  71.6  0.00000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.674087  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2228  helicase c2  21.86 
 
 		 639 aa  71.6  0.00000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.232993  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0478  DEAD_2 domain-containing protein  23.48 
 
 		 588 aa  71.6  0.00000000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.738253  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB05090  CHL1 helicase, putative  21.21 
 
 		 849 aa  71.2  0.00000000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1357  DEAD_2 domain-containing protein  32.27 
 
 		 575 aa  70.9  0.00000000007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0243831 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4835  helicase c2  27.31 
 
 		 874 aa  70.9  0.00000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0589586 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1692  hypothetical protein  23.15 
 
 		 645 aa  70.9  0.00000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1731  hypothetical protein  23.15 
 
 		 645 aa  70.9  0.00000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000833443  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2406  hypothetical protein  22.49 
 
 		 634 aa  70.9  0.00000000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00282147  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1619  hypothetical protein  22.99 
 
 		 645 aa  70.9  0.00000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.68003  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>