More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_14100 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013204  Elen_3112  DNA polymerase III, epsilon subunit  55.94 
 
 		 966 aa  1144    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.0000116759  hitchhiker  0.000000000648685 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_14100  exonuclease, DNA polymerase III, epsilon subunit family  100 
 
 		 1043 aa  2152    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28440  exonuclease, DNA polymerase III, epsilon subunit family  48.89 
 
 		 986 aa  993    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.32018  normal  0.0233138 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1359  DNA polymerase III, epsilon subunit  39.52 
 
 		 978 aa  690    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.838712  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1545  DNA polymerase III, epsilon subunit  28.84 
 
 		 944 aa  347  5e-94  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.676592  decreased coverage  0.000191845 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1899  DNA polymerase III, epsilon subunit  28.77 
 
 		 956 aa  345  2.9999999999999997e-93  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0589249 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3224  DNA polymerase III, epsilon subunit  26.29 
 
 		 927 aa  339  1.9999999999999998e-91  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00101103  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1743  DNA polymerase III, epsilon subunit  26.29 
 
 		 930 aa  317  9e-85  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.23026  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0562  DNA polymerase III, epsilon subunit  28.39 
 
 		 921 aa  285  3.0000000000000004e-75  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1347  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  26.89 
 
 		 957 aa  285  4.0000000000000003e-75  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.579486 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3167  helicase c2  29.97 
 
 		 876 aa  257  6e-67  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000644587  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0363  ATP-dependent helicase DinG  29.02 
 
 		 840 aa  248  3e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.01237  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1942  helicase c2  25.62 
 
 		 832 aa  248  3e-64  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.357662  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3621  helicase c2  29.21 
 
 		 838 aa  244  6e-63  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0509  helicase c2  28.27 
 
 		 843 aa  237  1.0000000000000001e-60  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4122  helicase c2  27.65 
 
 		 843 aa  234  4.0000000000000004e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000977416  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0528  helicase c2  25.47 
 
 		 667 aa  228  5.0000000000000005e-58  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1651  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  31.82 
 
 		 952 aa  224  7e-57  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1990  ATP-dependent helicase DinG  24.57 
 
 		 709 aa  199  2.0000000000000003e-49  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1003  DNA polymerase III, epsilon subunit  27.5 
 
 		 960 aa  196  2e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1452  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  29.52 
 
 		 934 aa  194  5e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1565  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  29.52 
 
 		 934 aa  194  5e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.554006  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1671  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  29.71 
 
 		 934 aa  194  7e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.697043  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1424  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  29.14 
 
 		 934 aa  194  1e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1636  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  29.14 
 
 		 934 aa  194  1e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00174148 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1709  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  29.52 
 
 		 934 aa  192  2e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000649538  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1425  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  29.14 
 
 		 934 aa  192  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.446116  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1265  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  29.55 
 
 		 929 aa  190  9e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00466144  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1467  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  28.95 
 
 		 934 aa  189  2e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.533097  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3747  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  29.17 
 
 		 934 aa  187  6e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.739451  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1598  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  29.17 
 
 		 934 aa  187  7e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00523268  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1154  DNA polymerase III, epsilon subunit  31.45 
 
 		 921 aa  185  4.0000000000000006e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2156  DNA polymerase III, epsilon subunit  30.36 
 
 		 934 aa  181  7e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.814989  hitchhiker  0.00934468 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3029  DnaQ family exonuclease/DinG family helicase  27.07 
 
 		 929 aa  180  1e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3086  ATP-dependent DNA helicase DinG  25.7 
 
 		 692 aa  180  1e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.175143  hitchhiker  0.0000411022 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1249  ATP-dependent DNA helicase DinG  26.01 
 
 		 691 aa  180  2e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000153763 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4158  ATP-dependent DNA helicase DinG  26.89 
 
 		 758 aa  173  1e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0014  ATP-dependent DNA helicase DinG  27.31 
 
 		 729 aa  172  4e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.11513  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1129  ATP-dependent DNA helicase DinG  24.71 
 
 		 694 aa  170  1e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0640459  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0023  Rad3-related DNA helicases  31.2 
 
 		 851 aa  164  6e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000466591  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0024  helicase c2  31.53 
 
 		 846 aa  163  2e-38  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2115  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  29.4 
 
 		 921 aa  161  7e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07920  helicase c2  34.66 
 
 		 822 aa  157  1e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1132  hypothetical protein  33.21 
 
 		 681 aa  156  2e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1409  helicase c2  36.12 
 
 		 651 aa  154  1e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0504  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  28.54 
 
 		 909 aa  151  5e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0411  helicase c2  34.28 
 
 		 646 aa  151  7e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2527  helicase c2  37.4 
 
 		 653 aa  150  1.0000000000000001e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0816709  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003963  ATP-dependent helicase DinG/Rad3  23.99 
 
 		 691 aa  149  3e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01557  ATP-dependent DNA helicase DinG  24.11 
 
 		 691 aa  148  5e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1197  helicase c2  28.44 
 
 		 661 aa  144  6e-33  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.0000973223  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3886  ATP-dependent helicase  30.85 
 
 		 647 aa  144  8e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01374  ATP-dependent helicase  36.6 
 
 		 644 aa  144  9e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1364  helicase c2  34.88 
 
 		 640 aa  144  9.999999999999999e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4323  helicase c2  34.9 
 
 		 631 aa  143  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004095  DinG family ATP-dependent helicase YoaA  36.9 
 
 		 646 aa  142  1.9999999999999998e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4478  helicase c2  34.9 
 
 		 633 aa  142  3e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.647625  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4459  helicase c2  34.9 
 
 		 633 aa  141  4.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.157065  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4468  helicase c2  35.69 
 
 		 635 aa  141  6e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.261313  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2517  ATP-dependent helicase, DEXD family  34.57 
 
 		 641 aa  141  7.999999999999999e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.764826  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2147  helicase c2  34.57 
 
 		 641 aa  141  7.999999999999999e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0303331  hitchhiker  0.00135971 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1469  helicase c2  35.32 
 
 		 685 aa  140  8.999999999999999e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000142659 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2677  helicase c2  27.14 
 
 		 646 aa  140  1e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.663694  normal  0.183253 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1575  putative ATP-dependent helicase  35.11 
 
 		 646 aa  140  2e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.718112  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0911  putative ATP-dependent helicase  35.74 
 
 		 651 aa  139  3.0000000000000003e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0636  helicase c2  30.32 
 
 		 660 aa  139  4e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0188  helicase c2  31.82 
 
 		 659 aa  138  6.0000000000000005e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00148037  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1467  helicase c2  32.18 
 
 		 690 aa  137  9e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0659778  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2302  ATP-dependent helicase, DinG family protein  36.58 
 
 		 662 aa  137  9e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.783815  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0997  helicase c2  34.1 
 
 		 643 aa  137  9.999999999999999e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.179863 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1106  helicase c2  33.6 
 
 		 636 aa  136  1.9999999999999998e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.243566 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1779  helicase c2:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  33.22 
 
 		 641 aa  136  3e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.66637 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1156  helicase c2  36.29 
 
 		 649 aa  135  3e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3242  helicase c2  39.6 
 
 		 740 aa  135  3e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1342  helicase c2  32.73 
 
 		 754 aa  135  5e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1863  helicase c2  33.84 
 
 		 668 aa  133  2.0000000000000002e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.879395 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3486  helicase c2  30.85 
 
 		 698 aa  132  3e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2877  helicase c2  32.94 
 
 		 658 aa  132  4.0000000000000003e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.679539 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3770  helicase c2  32.16 
 
 		 830 aa  132  4.0000000000000003e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1412  helicase c2  32.1 
 
 		 658 aa  131  5.0000000000000004e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.102914  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1957  helicase c2  37.27 
 
 		 699 aa  131  6e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0276528  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0733  ATP-dependent DNA helicase  32.68 
 
 		 640 aa  131  7.000000000000001e-29  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.982369  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0532  helicase c2  32.55 
 
 		 649 aa  130  1.0000000000000001e-28  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1593  helicase c2  34.23 
 
 		 725 aa  130  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.601772  normal  0.0255754 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3854  helicase c2  32.55 
 
 		 830 aa  130  2.0000000000000002e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000920192 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3499  helicase c2  37.55 
 
 		 724 aa  130  2.0000000000000002e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.285018  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4634  helicase c2  34.64 
 
 		 674 aa  130  2.0000000000000002e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1897  hypothetical protein  32.55 
 
 		 652 aa  129  3e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1886  hypothetical protein  32.16 
 
 		 652 aa  129  3e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1921  helicase c2  33.85 
 
 		 725 aa  129  4.0000000000000003e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.782434  normal  0.028244 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6611  helicase c2  32.47 
 
 		 729 aa  129  4.0000000000000003e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0933933 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0897  helicase c2  32.79 
 
 		 647 aa  128  4.0000000000000003e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2013  helicase c2  35.88 
 
 		 639 aa  128  4.0000000000000003e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.479282  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2068  hypothetical protein  35.83 
 
 		 636 aa  128  5e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1626  ATP-dependent DNA helicase-related protein  35.9 
 
 		 713 aa  128  6e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2347  helicase c2  31.74 
 
 		 670 aa  128  7e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.490547  normal  0.859108 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2617  helicase c2  35.68 
 
 		 668 aa  128  7e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.203354  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1835  helicase c2  35.34 
 
 		 636 aa  127  8.000000000000001e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00837342  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3093  helicase c2  34.45 
 
 		 681 aa  127  9e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.649657 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4298  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.4 
 
 		 666 aa  127  1e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.641288 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>