More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_0504 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003909  BCE_1671  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  42.69 
 
 		 934 aa  738    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.697043  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1452  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  43.45 
 
 		 934 aa  758    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1424  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  43.39 
 
 		 934 aa  758    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1425  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  43.34 
 
 		 934 aa  756    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.446116  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3747  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  43 
 
 		 934 aa  738    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.739451  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1565  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  43.45 
 
 		 934 aa  758    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.554006  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1598  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  43 
 
 		 934 aa  738    Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00523268  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2115  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  60.3 
 
 		 921 aa  1116    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1636  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  43.39 
 
 		 934 aa  758    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00174148 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1709  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  42.8 
 
 		 934 aa  739    Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000649538  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0504  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  100 
 
 		 909 aa  1825    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1265  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  42.41 
 
 		 929 aa  741    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00466144  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1467  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  43.6 
 
 		 934 aa  755    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.533097  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2156  DNA polymerase III, epsilon subunit  34.54 
 
 		 934 aa  434  1e-120  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.814989  hitchhiker  0.00934468 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1743  DNA polymerase III, epsilon subunit  31.68 
 
 		 930 aa  432  1e-119  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.23026  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1899  DNA polymerase III, epsilon subunit  34.85 
 
 		 956 aa  432  1e-119  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0589249 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1545  DNA polymerase III, epsilon subunit  34.58 
 
 		 944 aa  432  1e-119  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.676592  decreased coverage  0.000191845 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1651  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  33.93 
 
 		 952 aa  427  1e-118  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1154  DNA polymerase III, epsilon subunit  32.91 
 
 		 921 aa  416  9.999999999999999e-116  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3029  DnaQ family exonuclease/DinG family helicase  32.87 
 
 		 929 aa  412  1e-113  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1003  DNA polymerase III, epsilon subunit  30.72 
 
 		 960 aa  412  1e-113  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3224  DNA polymerase III, epsilon subunit  32.64 
 
 		 927 aa  412  1e-113  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00101103  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1347  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  30.25 
 
 		 957 aa  407  1.0000000000000001e-112  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.579486 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0562  DNA polymerase III, epsilon subunit  34.53 
 
 		 921 aa  402  9.999999999999999e-111  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1030  Rad3-related DNA helicase  30.28 
 
 		 937 aa  363  6e-99  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0174435  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3167  helicase c2  34.4 
 
 		 876 aa  330  6e-89  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000644587  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3621  helicase c2  35.27 
 
 		 838 aa  327  7e-88  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0363  ATP-dependent helicase DinG  34.65 
 
 		 840 aa  323  6e-87  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.01237  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0023  Rad3-related DNA helicases  33.8 
 
 		 851 aa  323  7e-87  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000466591  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4122  helicase c2  33.71 
 
 		 843 aa  316  9.999999999999999e-85  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000977416  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0916  DnaQ family exonuclease/DinG family helicase  38.19 
 
 		 954 aa  306  8.000000000000001e-82  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0024  helicase c2  30.26 
 
 		 846 aa  305  2.0000000000000002e-81  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3854  helicase c2  32.92 
 
 		 830 aa  299  1e-79  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000920192 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3770  helicase c2  33 
 
 		 830 aa  298  3e-79  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0188  helicase c2  33.68 
 
 		 659 aa  298  5e-79  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00148037  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0509  helicase c2  32.54 
 
 		 843 aa  297  7e-79  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1942  helicase c2  29.08 
 
 		 832 aa  289  1e-76  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.357662  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07920  helicase c2  30.66 
 
 		 822 aa  286  1.0000000000000001e-75  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1235  helicase c2  33.24 
 
 		 743 aa  284  6.000000000000001e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0895293  normal  0.149585 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1106  helicase c2  31.55 
 
 		 636 aa  281  5e-74  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.243566 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1990  ATP-dependent helicase DinG  28.59 
 
 		 709 aa  275  4.0000000000000004e-72  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004095  DinG family ATP-dependent helicase YoaA  32.27 
 
 		 646 aa  274  5.000000000000001e-72  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3112  DNA polymerase III, epsilon subunit  28.26 
 
 		 966 aa  274  6e-72  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.0000116759  hitchhiker  0.000000000648685 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0411  helicase c2  33.03 
 
 		 646 aa  273  1e-71  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0648  helicase c2  33.49 
 
 		 668 aa  272  2.9999999999999997e-71  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01778  conserved protein with nucleoside triphosphate hydrolase domain  32.57 
 
 		 636 aa  271  4e-71  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.548012  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1896  hypothetical protein  32.57 
 
 		 636 aa  271  4e-71  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01766  hypothetical protein  32.57 
 
 		 636 aa  271  4e-71  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.479225  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2034  hypothetical protein  32.57 
 
 		 636 aa  271  4e-71  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2535  hypothetical protein  32.57 
 
 		 636 aa  271  4e-71  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.50615  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1825  helicase c2  32.57 
 
 		 636 aa  271  4e-71  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.979985  normal  0.491186 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2378  helicase c2  32.36 
 
 		 636 aa  270  8e-71  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1961  hypothetical protein  32.88 
 
 		 636 aa  270  1e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.915388  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2022  hypothetical protein  32.72 
 
 		 636 aa  270  1e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.6889  normal  0.891564 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1380  hypothetical protein  32.42 
 
 		 636 aa  270  1e-70  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.434814  normal  0.350106 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0897  helicase c2  32.99 
 
 		 647 aa  270  1e-70  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01374  ATP-dependent helicase  32.27 
 
 		 644 aa  270  1e-70  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1965  hypothetical protein  32.72 
 
 		 636 aa  270  1e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1495  hypothetical protein  32.57 
 
 		 636 aa  268  2.9999999999999995e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6611  helicase c2  33.04 
 
 		 729 aa  268  2.9999999999999995e-70  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0933933 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2068  hypothetical protein  32.42 
 
 		 636 aa  268  4e-70  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1310  hypothetical protein  32.57 
 
 		 636 aa  268  4e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.027986  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1835  helicase c2  32.42 
 
 		 636 aa  267  7e-70  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00837342  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28440  exonuclease, DNA polymerase III, epsilon subunit family  27.75 
 
 		 986 aa  267  7e-70  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.32018  normal  0.0233138 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4468  helicase c2  33.9 
 
 		 635 aa  267  7e-70  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.261313  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0733  ATP-dependent DNA helicase  31.28 
 
 		 640 aa  267  8e-70  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.982369  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0911  putative ATP-dependent helicase  31.34 
 
 		 651 aa  266  1e-69  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0997  helicase c2  33.83 
 
 		 643 aa  265  2e-69  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.179863 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1025  DNA polymerase III, epsilon subunit/ATP-dependent helicase DinG  34.03 
 
 		 902 aa  265  3e-69  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3886  ATP-dependent helicase  31.67 
 
 		 647 aa  265  4e-69  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1364  helicase c2  31.82 
 
 		 640 aa  265  4e-69  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1197  helicase c2  32.67 
 
 		 661 aa  264  4.999999999999999e-69  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.0000973223  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1514  DnaQ family exonuclease/DinG family helicase  33.75 
 
 		 897 aa  264  6e-69  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.103927  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1543  DnaQ family exonuclease/DinG family helicase  33.75 
 
 		 897 aa  264  6e-69  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.959984  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2005  putative ATP-dependent DNA helicase-related protein  33.24 
 
 		 666 aa  261  3e-68  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.349435 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2677  helicase c2  31.98 
 
 		 646 aa  261  6e-68  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.663694  normal  0.183253 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0709  helicase c2  32.07 
 
 		 650 aa  259  1e-67  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.968194 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2207  putative ATP-dependent helicase  33.03 
 
 		 749 aa  258  4e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1859  helicase c2  31.87 
 
 		 674 aa  258  5e-67  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.347581  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2406  hypothetical protein  31.16 
 
 		 634 aa  257  6e-67  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00282147  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4323  helicase c2  33.08 
 
 		 631 aa  257  7e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1412  helicase c2  30.78 
 
 		 658 aa  257  8e-67  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.102914  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1805  helicase c2  32.58 
 
 		 659 aa  257  8e-67  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0820  helicase c2  31.92 
 
 		 650 aa  256  9e-67  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.932295  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2128  helicase c2  31 
 
 		 634 aa  256  1.0000000000000001e-66  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2524  helicase c2  32.55 
 
 		 755 aa  256  1.0000000000000001e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00188741  decreased coverage  0.000000000263353 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2017  hypothetical protein  31 
 
 		 634 aa  256  2.0000000000000002e-66  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.451998  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4478  helicase c2  33.33 
 
 		 633 aa  256  2.0000000000000002e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.647625  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0636  helicase c2  30.52 
 
 		 660 aa  256  2.0000000000000002e-66  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2302  ATP-dependent helicase, DinG family protein  30.53 
 
 		 662 aa  255  2.0000000000000002e-66  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.783815  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2251  ATP-dependent helicase, putative  33.28 
 
 		 755 aa  255  3e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.247338  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2172  helicase c2  31.57 
 
 		 659 aa  255  3e-66  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1403  helicase c2  32.91 
 
 		 757 aa  255  3e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.127709  hitchhiker  0.000000348035 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1934  helicase c2  32.06 
 
 		 640 aa  254  4.0000000000000004e-66  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.101214  normal  0.540234 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1612  putative ATP-dependent helicase  31.42 
 
 		 751 aa  254  5.000000000000001e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00100383  normal  0.548735 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2413  helicase c2  31.91 
 
 		 669 aa  253  1e-65  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0561182  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2424  helicase c2  31.91 
 
 		 669 aa  253  1e-65  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2013  helicase c2  32.48 
 
 		 639 aa  253  1e-65  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.479282  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2527  helicase c2  32.98 
 
 		 653 aa  253  1e-65  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0816709  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2763  helicase c2  31.75 
 
 		 634 aa  252  2e-65  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0359097  hitchhiker  0.00537714 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>