More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP1025 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP1025  DNA polymerase III, epsilon subunit/ATP-dependent helicase DinG  100 
 
 		 902 aa  1840    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1514  DnaQ family exonuclease/DinG family helicase  80.09 
 
 		 897 aa  1506    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.103927  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1543  DnaQ family exonuclease/DinG family helicase  80.09 
 
 		 897 aa  1506    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.959984  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2115  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  30.8 
 
 		 921 aa  385  1e-105  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1671  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  30.03 
 
 		 934 aa  380  1e-104  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.697043  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1425  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  29.57 
 
 		 934 aa  381  1e-104  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.446116  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3747  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  30.49 
 
 		 934 aa  380  1e-104  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.739451  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1709  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  30.03 
 
 		 934 aa  380  1e-104  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000649538  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1452  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  29.57 
 
 		 934 aa  378  1e-103  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1424  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  29.47 
 
 		 934 aa  379  1e-103  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1565  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  29.57 
 
 		 934 aa  378  1e-103  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.554006  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1598  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  30.44 
 
 		 934 aa  379  1e-103  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00523268  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1636  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  29.47 
 
 		 934 aa  379  1e-103  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00174148 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1467  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  30.23 
 
 		 934 aa  370  1e-101  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.533097  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1265  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  29.32 
 
 		 929 aa  360  7e-98  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00466144  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3224  DNA polymerase III, epsilon subunit  26.55 
 
 		 927 aa  300  1e-79  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00101103  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1545  DNA polymerase III, epsilon subunit  24.84 
 
 		 944 aa  298  3e-79  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.676592  decreased coverage  0.000191845 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3029  DnaQ family exonuclease/DinG family helicase  26.17 
 
 		 929 aa  292  2e-77  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0562  DNA polymerase III, epsilon subunit  24.3 
 
 		 921 aa  290  6e-77  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1651  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  24.74 
 
 		 952 aa  279  2e-73  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1743  DNA polymerase III, epsilon subunit  26.47 
 
 		 930 aa  270  7e-71  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.23026  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0916  DnaQ family exonuclease/DinG family helicase  27.38 
 
 		 954 aa  267  5.999999999999999e-70  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0504  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  34.03 
 
 		 909 aa  265  4e-69  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1154  DNA polymerase III, epsilon subunit  25.11 
 
 		 921 aa  244  7e-63  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1347  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  24.97 
 
 		 957 aa  237  7e-61  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.579486 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2024  Rad3-related DNA helicase  31.33 
 
 		 791 aa  218  5e-55  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.323186  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1030  Rad3-related DNA helicase  35.38 
 
 		 937 aa  216  9.999999999999999e-55  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0174435  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0023  Rad3-related DNA helicases  23.46 
 
 		 851 aa  194  6e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000466591  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1942  helicase c2  25.25 
 
 		 832 aa  192  2.9999999999999997e-47  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.357662  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4122  helicase c2  23.54 
 
 		 843 aa  190  1e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000977416  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1106  helicase c2  26.73 
 
 		 636 aa  190  1e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.243566 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2156  DNA polymerase III, epsilon subunit  29.49 
 
 		 934 aa  187  5e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.814989  hitchhiker  0.00934468 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3621  helicase c2  22.74 
 
 		 838 aa  188  5e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2517  ATP-dependent helicase, DEXD family  24.8 
 
 		 641 aa  184  6e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.764826  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2147  helicase c2  24.8 
 
 		 641 aa  184  6e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0303331  hitchhiker  0.00135971 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1899  DNA polymerase III, epsilon subunit  28.34 
 
 		 956 aa  182  2e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0589249 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0524  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  28.85 
 
 		 835 aa  183  2e-44  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00517102  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0188  helicase c2  24.39 
 
 		 659 aa  181  5.999999999999999e-44  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00148037  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0820  helicase c2  23.45 
 
 		 650 aa  180  1e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.932295  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0709  helicase c2  23.52 
 
 		 650 aa  179  2e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.968194 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6611  helicase c2  23.61 
 
 		 729 aa  179  2e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0933933 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28440  exonuclease, DNA polymerase III, epsilon subunit family  24.1 
 
 		 986 aa  177  9.999999999999999e-43  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.32018  normal  0.0233138 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004095  DinG family ATP-dependent helicase YoaA  25.41 
 
 		 646 aa  175  3.9999999999999995e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2677  helicase c2  24.93 
 
 		 646 aa  175  3.9999999999999995e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.663694  normal  0.183253 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0528  helicase c2  25.79 
 
 		 667 aa  174  9e-42  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07920  helicase c2  25.97 
 
 		 822 aa  173  1e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0911  putative ATP-dependent helicase  25.34 
 
 		 651 aa  172  2e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1003  DNA polymerase III, epsilon subunit  28.34 
 
 		 960 aa  171  5e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01374  ATP-dependent helicase  24.18 
 
 		 644 aa  170  1e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3167  helicase c2  22.13 
 
 		 876 aa  168  4e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000644587  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3770  helicase c2  22.24 
 
 		 830 aa  167  6.9999999999999995e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2172  helicase c2  25.42 
 
 		 659 aa  166  2.0000000000000002e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2094  helicase c2  22.57 
 
 		 673 aa  166  2.0000000000000002e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.239782  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1805  helicase c2  25.37 
 
 		 659 aa  166  3e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1859  helicase c2  25.57 
 
 		 674 aa  166  3e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.347581  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2532  helicase c2  25.11 
 
 		 640 aa  165  4.0000000000000004e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.139439 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1990  ATP-dependent helicase DinG  25.45 
 
 		 709 aa  164  6e-39  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2535  helicase C2  24.93 
 
 		 645 aa  164  6e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.801549  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4468  helicase c2  22.62 
 
 		 635 aa  164  6e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.261313  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1575  putative ATP-dependent helicase  24.39 
 
 		 646 aa  164  8.000000000000001e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.718112  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2424  helicase c2  25.11 
 
 		 669 aa  163  1e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0636  helicase c2  23.39 
 
 		 660 aa  163  1e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3093  helicase c2  23.03 
 
 		 681 aa  162  4e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.649657 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1824  helicase c2  25.11 
 
 		 664 aa  161  5e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.678424  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1626  ATP-dependent DNA helicase-related protein  23.18 
 
 		 713 aa  160  1e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1412  helicase c2  24.62 
 
 		 658 aa  159  2e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.102914  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2809  helicase c2  25.19 
 
 		 707 aa  159  2e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2413  helicase c2  25.11 
 
 		 669 aa  159  2e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0561182  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0363  ATP-dependent helicase DinG  21.37 
 
 		 840 aa  158  4e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.01237  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1934  helicase c2  24.96 
 
 		 640 aa  158  4e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.101214  normal  0.540234 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1593  helicase c2  22.76 
 
 		 725 aa  158  4e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.601772  normal  0.0255754 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1197  helicase c2  23.14 
 
 		 661 aa  158  4e-37  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.0000973223  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3486  helicase c2  24.04 
 
 		 698 aa  157  7e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2097  helicase c2  24.85 
 
 		 644 aa  157  1e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0479006  normal  0.269462 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1727  helicase c2  24.21 
 
 		 641 aa  157  1e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1295  helicase c2  23.43 
 
 		 664 aa  156  2e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1921  helicase c2  22.35 
 
 		 725 aa  155  2.9999999999999998e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.782434  normal  0.028244 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4478  helicase c2  22.41 
 
 		 633 aa  155  4e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.647625  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1269  helicase c2  24.15 
 
 		 636 aa  155  4e-36  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0024  helicase c2  23.4 
 
 		 846 aa  154  5.9999999999999996e-36  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4459  helicase c2  22.26 
 
 		 633 aa  154  8e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.157065  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2455  helicase c2  25.64 
 
 		 641 aa  152  2e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0997  helicase c2  22.34 
 
 		 643 aa  151  5e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.179863 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01778  conserved protein with nucleoside triphosphate hydrolase domain  24.57 
 
 		 636 aa  151  7e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.548012  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2535  hypothetical protein  24.57 
 
 		 636 aa  151  7e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.50615  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1825  helicase c2  24.57 
 
 		 636 aa  151  7e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.979985  normal  0.491186 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1896  hypothetical protein  24.57 
 
 		 636 aa  151  7e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01766  hypothetical protein  24.57 
 
 		 636 aa  151  7e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.479225  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2034  hypothetical protein  24.57 
 
 		 636 aa  151  7e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1961  hypothetical protein  24.77 
 
 		 636 aa  150  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.915388  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1965  hypothetical protein  24.77 
 
 		 636 aa  150  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2022  hypothetical protein  24.77 
 
 		 636 aa  150  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.6889  normal  0.891564 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1380  hypothetical protein  24.57 
 
 		 636 aa  150  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.434814  normal  0.350106 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4323  helicase c2  22.01 
 
 		 631 aa  149  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1310  hypothetical protein  24.77 
 
 		 636 aa  149  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.027986  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2302  ATP-dependent helicase, DinG family protein  22.84 
 
 		 662 aa  149  2.0000000000000003e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.783815  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2205  helicase c2  22.77 
 
 		 676 aa  149  3e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.632178  normal  0.363279 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1495  hypothetical protein  24.77 
 
 		 636 aa  148  3e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4634  helicase c2  24.37 
 
 		 674 aa  148  4.0000000000000006e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1886  hypothetical protein  24.48 
 
 		 652 aa  147  6e-34  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>