More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_003963 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011312  VSAL_I1129  ATP-dependent DNA helicase DinG  68.3 
 
 		 694 aa  1002    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0640459  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1652  ATP-dependent DNA helicase DinG  49.78 
 
 		 690 aa  705    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.303868 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2272  ATP-dependent DNA helicase DinG  48.04 
 
 		 712 aa  689    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1819  ATP-dependent DNA helicase DinG  51.65 
 
 		 690 aa  720    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1629  ATP-dependent DNA helicase DinG  49.78 
 
 		 690 aa  705    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.117477  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1618  ATP-dependent DNA helicase DinG  49.78 
 
 		 690 aa  705    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.326155  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003963  ATP-dependent helicase DinG/Rad3  100 
 
 		 691 aa  1431    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3086  ATP-dependent DNA helicase DinG  51.94 
 
 		 692 aa  745    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.175143  hitchhiker  0.0000411022 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1566  ATP-dependent DNA helicase DinG  50.94 
 
 		 692 aa  723    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000620367 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01557  ATP-dependent DNA helicase DinG  93.34 
 
 		 691 aa  1352    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2429  ATP-dependent DNA helicase DinG  50.94 
 
 		 691 aa  712    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2725  ATP-dependent DNA helicase DinG  49.64 
 
 		 690 aa  702    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0300555  hitchhiker  0.000425027 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2470  ATP-dependent DNA helicase DinG  51.37 
 
 		 690 aa  719    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00127477 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2538  ATP-dependent DNA helicase DinG  51.22 
 
 		 690 aa  720    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.536241  unclonable  0.0000322681 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2630  ATP-dependent DNA helicase DinG  50.94 
 
 		 691 aa  707    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2483  ATP-dependent DNA helicase DinG  50.5 
 
 		 690 aa  716    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00204554 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1446  ATP-dependent DNA helicase DinG  75.69 
 
 		 703 aa  1114    Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000107544  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2656  ATP-dependent DNA helicase DinG  51.08 
 
 		 690 aa  724    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.765136  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2630  ATP-dependent DNA helicase DinG  51.51 
 
 		 690 aa  721    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.920562  hitchhiker  0.00302525 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1249  ATP-dependent DNA helicase DinG  50 
 
 		 691 aa  698    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000153763 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2178  ATP-dependent DNA helicase DinG  48.99 
 
 		 686 aa  674    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.647766 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1513  ATP-dependent DNA helicase DinG  50.79 
 
 		 690 aa  715    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.433839  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0995  ATP-dependent DNA helicase DinG  40.23 
 
 		 708 aa  490  1e-137  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.196461  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1624  ATP-dependent DNA helicase DinG  38.89 
 
 		 721 aa  488  1e-136  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2381  ATP-dependent DNA helicase DinG  38.1 
 
 		 720 aa  468  9.999999999999999e-131  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00980399 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1585  ATP-dependent DNA helicase DinG  37.98 
 
 		 725 aa  468  9.999999999999999e-131  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.629158  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2118  ATP-dependent DNA helicase DinG  38.39 
 
 		 707 aa  464  1e-129  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.149773  hitchhiker  0.000000714427 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1225  ATP-dependent DNA helicase DinG  37.79 
 
 		 714 aa  462  9.999999999999999e-129  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1125  ATP-dependent DNA helicase DinG  37.81 
 
 		 714 aa  449  1e-125  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.437588  hitchhiker  0.0000838668 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4290  ATP-dependent DNA helicase DinG  37.81 
 
 		 714 aa  449  1e-125  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4120  ATP-dependent helicase, DinG family  36.83 
 
 		 714 aa  449  1e-125  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1146  ATP-dependent DNA helicase DinG  37.95 
 
 		 714 aa  450  1e-125  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.980909  normal  0.730569 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3856  ATP-dependent DNA helicase DinG  36.69 
 
 		 714 aa  449  1e-125  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.160495  normal  0.793215 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1427  ATP-dependent DNA helicase DinG  37.48 
 
 		 714 aa  452  1e-125  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.152164  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1161  ATP-dependent DNA helicase DinG  37.81 
 
 		 714 aa  449  1e-125  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.665209  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4334  ATP-dependent DNA helicase DinG  36.64 
 
 		 714 aa  444  1e-123  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.044641  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50840  ATP-dependent DNA helicase DinG  36.66 
 
 		 714 aa  445  1e-123  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00144938 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19450  ATP-dependent DNA helicase DinG  37.67 
 
 		 714 aa  441  9.999999999999999e-123  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0350  ATP-dependent DNA helicase DinG  35.23 
 
 		 711 aa  430  1e-119  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  decreased coverage  0.00468076  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3854  ATP-dependent DNA helicase DinG  33.15 
 
 		 700 aa  373  1e-102  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0857  ATP-dependent DNA helicase DinG  34.88 
 
 		 714 aa  360  4e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0969  ATP-dependent DNA helicase DinG  34.88 
 
 		 714 aa  360  5e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.725445  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0948  ATP-dependent DNA helicase DinG  34.88 
 
 		 714 aa  360  6e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.607089  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0884  ATP-dependent DNA helicase DinG  34.74 
 
 		 714 aa  358  1.9999999999999998e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0916  ATP-dependent DNA helicase DinG  34.74 
 
 		 714 aa  358  1.9999999999999998e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02825  ATP-dependent DNA helicase DinG  32.92 
 
 		 710 aa  355  1e-96  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2856  ATP-dependent DNA helicase DinG  33.19 
 
 		 726 aa  351  2e-95  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.642331  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2777  ATP-dependent DNA helicase DinG  33.19 
 
 		 726 aa  351  2e-95  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1321  ATP-dependent DNA helicase DinG  33.19 
 
 		 726 aa  351  3e-95  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2033  ATP-dependent DNA helicase DinG  32.08 
 
 		 716 aa  351  3e-95  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2910  ATP-dependent DNA helicase DinG  33.1 
 
 		 699 aa  350  5e-95  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1552  ATP-dependent DNA helicase DinG  33.66 
 
 		 699 aa  348  1e-94  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2495  ATP-dependent DNA helicase DinG  33.76 
 
 		 701 aa  348  2e-94  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.324564  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1289  ATP-dependent DNA helicase DinG  33.8 
 
 		 725 aa  346  8e-94  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.649523  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1461  ATP-dependent DNA helicase DinG  32.34 
 
 		 732 aa  342  1e-92  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.498771 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00766  ATP-dependent DNA helicase  33.8 
 
 		 716 aa  340  4e-92  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2843  helicase c2  33.8 
 
 		 716 aa  340  4e-92  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00783  hypothetical protein  33.8 
 
 		 716 aa  340  4e-92  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0503  helicase c2  34.55 
 
 		 750 aa  340  4e-92  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.516825  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0823  ATP-dependent DNA helicase DinG  33.8 
 
 		 716 aa  340  5e-92  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2553  ATP-dependent DNA helicase DinG  33.52 
 
 		 716 aa  340  5.9999999999999996e-92  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0866  ATP-dependent DNA helicase DinG  33.8 
 
 		 716 aa  340  5.9999999999999996e-92  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0853  ATP-dependent DNA helicase DinG  33.94 
 
 		 716 aa  339  9e-92  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2844  ATP-dependent DNA helicase DinG  33.94 
 
 		 716 aa  339  9e-92  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0506897 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2398  ATP-dependent DNA helicase DinG  32.77 
 
 		 715 aa  338  1.9999999999999998e-91  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.927767  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0948  ATP-dependent DNA helicase DinG  33.15 
 
 		 762 aa  338  1.9999999999999998e-91  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0013  ATP-dependent DNA helicase DinG  33.14 
 
 		 741 aa  334  4e-90  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0021  ATP-dependent DNA helicase DinG  32.95 
 
 		 692 aa  332  1e-89  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4158  ATP-dependent DNA helicase DinG  32.04 
 
 		 758 aa  331  3e-89  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2732  ATP-dependent DNA helicase DinG  31.83 
 
 		 738 aa  330  5.0000000000000004e-89  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.196414  normal  0.101558 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0014  ATP-dependent DNA helicase DinG  32.04 
 
 		 729 aa  328  2.0000000000000001e-88  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.11513  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4122  helicase c2  30.6 
 
 		 843 aa  276  9e-73  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000977416  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3167  helicase c2  30.5 
 
 		 876 aa  276  9e-73  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000644587  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0509  helicase c2  32.54 
 
 		 843 aa  276  9e-73  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1197  helicase c2  32.15 
 
 		 661 aa  268  2e-70  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.0000973223  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0363  ATP-dependent helicase DinG  31.51 
 
 		 840 aa  267  4e-70  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.01237  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0636  helicase c2  29.91 
 
 		 660 aa  265  3e-69  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0188  helicase c2  32.57 
 
 		 659 aa  264  4e-69  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00148037  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0023  Rad3-related DNA helicases  30.35 
 
 		 851 aa  263  6.999999999999999e-69  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000466591  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3854  helicase c2  30.87 
 
 		 830 aa  259  1e-67  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000920192 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0997  helicase c2  32.11 
 
 		 643 aa  247  6.999999999999999e-64  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.179863 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07920  helicase c2  28.28 
 
 		 822 aa  246  8e-64  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3621  helicase c2  31.17 
 
 		 838 aa  244  3.9999999999999997e-63  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1154  DNA polymerase III, epsilon subunit  29.97 
 
 		 921 aa  244  5e-63  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3886  ATP-dependent helicase  29.47 
 
 		 647 aa  241  2.9999999999999997e-62  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3029  DnaQ family exonuclease/DinG family helicase  28.37 
 
 		 929 aa  241  2.9999999999999997e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1990  ATP-dependent helicase DinG  28.53 
 
 		 709 aa  238  4e-61  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1743  DNA polymerase III, epsilon subunit  27.46 
 
 		 930 aa  236  1.0000000000000001e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.23026  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0024  helicase c2  27.98 
 
 		 846 aa  235  2.0000000000000002e-60  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1575  putative ATP-dependent helicase  28.8 
 
 		 646 aa  235  2.0000000000000002e-60  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.718112  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1235  helicase c2  30.39 
 
 		 743 aa  234  5e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0895293  normal  0.149585 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1106  helicase c2  28.06 
 
 		 636 aa  233  7.000000000000001e-60  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.243566 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01131  ATP-dependent helicase  29.39 
 
 		 639 aa  233  1e-59  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.625206  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004095  DinG family ATP-dependent helicase YoaA  28.46 
 
 		 646 aa  232  1e-59  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1409  helicase c2  29.4 
 
 		 651 aa  232  2e-59  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2378  helicase c2  28.97 
 
 		 636 aa  232  2e-59  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01374  ATP-dependent helicase  28.66 
 
 		 644 aa  231  3e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2809  helicase c2  29.18 
 
 		 707 aa  231  3e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3486  helicase c2  28.55 
 
 		 698 aa  231  5e-59  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2302  ATP-dependent helicase, DinG family protein  28.11 
 
 		 662 aa  230  8e-59  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.783815  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>