More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_0013 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_0021  ATP-dependent DNA helicase DinG  74.51 
 
 		 692 aa  1063    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2732  ATP-dependent DNA helicase DinG  69.84 
 
 		 738 aa  1001    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.196414  normal  0.101558 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2033  ATP-dependent DNA helicase DinG  52.14 
 
 		 716 aa  722    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0014  ATP-dependent DNA helicase DinG  83.2 
 
 		 729 aa  1209    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.11513  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0013  ATP-dependent DNA helicase DinG  100 
 
 		 741 aa  1487    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4158  ATP-dependent DNA helicase DinG  83.2 
 
 		 758 aa  1210    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4334  ATP-dependent DNA helicase DinG  36.72 
 
 		 714 aa  431  1e-119  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.044641  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1225  ATP-dependent DNA helicase DinG  37.5 
 
 		 714 aa  426  1e-118  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50840  ATP-dependent DNA helicase DinG  36.61 
 
 		 714 aa  428  1e-118  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00144938 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1125  ATP-dependent DNA helicase DinG  37.55 
 
 		 714 aa  423  1e-117  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.437588  hitchhiker  0.0000838668 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1161  ATP-dependent DNA helicase DinG  37.55 
 
 		 714 aa  423  1e-117  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.665209  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19450  ATP-dependent DNA helicase DinG  38.31 
 
 		 714 aa  423  1e-117  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3856  ATP-dependent DNA helicase DinG  36.33 
 
 		 714 aa  419  1e-116  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.160495  normal  0.793215 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4290  ATP-dependent DNA helicase DinG  37.28 
 
 		 714 aa  419  1e-116  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1146  ATP-dependent DNA helicase DinG  37.05 
 
 		 714 aa  420  1e-116  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.980909  normal  0.730569 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1427  ATP-dependent DNA helicase DinG  36.29 
 
 		 714 aa  419  9.999999999999999e-116  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.152164  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4120  ATP-dependent helicase, DinG family  36.33 
 
 		 714 aa  419  9.999999999999999e-116  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0503  helicase c2  39.17 
 
 		 750 aa  411  1e-113  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.516825  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1624  ATP-dependent DNA helicase DinG  36.67 
 
 		 721 aa  389  1e-107  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0995  ATP-dependent DNA helicase DinG  36.67 
 
 		 708 aa  387  1e-106  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.196461  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2381  ATP-dependent DNA helicase DinG  33.25 
 
 		 720 aa  379  1e-104  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00980399 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1585  ATP-dependent DNA helicase DinG  36.14 
 
 		 725 aa  380  1e-104  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.629158  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2118  ATP-dependent DNA helicase DinG  31.2 
 
 		 707 aa  363  8e-99  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.149773  hitchhiker  0.000000714427 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1513  ATP-dependent DNA helicase DinG  33.15 
 
 		 690 aa  362  1e-98  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.433839  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1249  ATP-dependent DNA helicase DinG  31.87 
 
 		 691 aa  362  1e-98  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000153763 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1566  ATP-dependent DNA helicase DinG  32.74 
 
 		 692 aa  355  2e-96  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000620367 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2178  ATP-dependent DNA helicase DinG  32.62 
 
 		 686 aa  353  5.9999999999999994e-96  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.647766 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2630  ATP-dependent DNA helicase DinG  33.43 
 
 		 690 aa  353  8e-96  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.920562  hitchhiker  0.00302525 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2538  ATP-dependent DNA helicase DinG  33.14 
 
 		 690 aa  353  8.999999999999999e-96  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.536241  unclonable  0.0000322681 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1819  ATP-dependent DNA helicase DinG  33.43 
 
 		 690 aa  352  1e-95  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3086  ATP-dependent DNA helicase DinG  31.82 
 
 		 692 aa  352  1e-95  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.175143  hitchhiker  0.0000411022 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2470  ATP-dependent DNA helicase DinG  33.29 
 
 		 690 aa  352  2e-95  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00127477 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1629  ATP-dependent DNA helicase DinG  33.33 
 
 		 690 aa  351  2e-95  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.117477  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2725  ATP-dependent DNA helicase DinG  33.33 
 
 		 690 aa  351  3e-95  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0300555  hitchhiker  0.000425027 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1618  ATP-dependent DNA helicase DinG  33.33 
 
 		 690 aa  351  4e-95  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.326155  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1652  ATP-dependent DNA helicase DinG  33.33 
 
 		 690 aa  351  4e-95  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.303868 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2483  ATP-dependent DNA helicase DinG  31.97 
 
 		 690 aa  348  2e-94  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00204554 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2656  ATP-dependent DNA helicase DinG  33.19 
 
 		 690 aa  348  2e-94  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.765136  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2272  ATP-dependent DNA helicase DinG  33.1 
 
 		 712 aa  347  5e-94  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1446  ATP-dependent DNA helicase DinG  34.34 
 
 		 703 aa  342  1e-92  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000107544  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01557  ATP-dependent DNA helicase DinG  33.87 
 
 		 691 aa  341  2.9999999999999998e-92  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003963  ATP-dependent helicase DinG/Rad3  33.48 
 
 		 691 aa  340  5e-92  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2429  ATP-dependent DNA helicase DinG  31.19 
 
 		 691 aa  340  5.9999999999999996e-92  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2630  ATP-dependent DNA helicase DinG  30.65 
 
 		 691 aa  334  3e-90  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0350  ATP-dependent DNA helicase DinG  33.1 
 
 		 711 aa  333  9e-90  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  decreased coverage  0.00468076  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3854  ATP-dependent DNA helicase DinG  33.92 
 
 		 700 aa  331  3e-89  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1129  ATP-dependent DNA helicase DinG  31.12 
 
 		 694 aa  316  9.999999999999999e-85  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0640459  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02825  ATP-dependent DNA helicase DinG  32.99 
 
 		 710 aa  307  5.0000000000000004e-82  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1461  ATP-dependent DNA helicase DinG  30.69 
 
 		 732 aa  297  6e-79  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.498771 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2856  ATP-dependent DNA helicase DinG  30.46 
 
 		 726 aa  295  2e-78  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.642331  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2777  ATP-dependent DNA helicase DinG  30.46 
 
 		 726 aa  295  2e-78  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1321  ATP-dependent DNA helicase DinG  30.46 
 
 		 726 aa  294  4e-78  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2398  ATP-dependent DNA helicase DinG  30.34 
 
 		 715 aa  290  1e-76  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.927767  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2495  ATP-dependent DNA helicase DinG  29.48 
 
 		 701 aa  288  2e-76  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.324564  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0969  ATP-dependent DNA helicase DinG  30.51 
 
 		 714 aa  285  1.0000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.725445  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0948  ATP-dependent DNA helicase DinG  30.51 
 
 		 714 aa  285  3.0000000000000004e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.607089  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0884  ATP-dependent DNA helicase DinG  30.51 
 
 		 714 aa  285  3.0000000000000004e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2910  ATP-dependent DNA helicase DinG  29.25 
 
 		 699 aa  285  3.0000000000000004e-75  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0857  ATP-dependent DNA helicase DinG  30.51 
 
 		 714 aa  284  4.0000000000000003e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2553  ATP-dependent DNA helicase DinG  30.3 
 
 		 716 aa  284  5.000000000000001e-75  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1552  ATP-dependent DNA helicase DinG  29.12 
 
 		 699 aa  282  1e-74  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00766  ATP-dependent DNA helicase  30.43 
 
 		 716 aa  281  2e-74  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2843  helicase c2  30.43 
 
 		 716 aa  281  2e-74  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0916  ATP-dependent DNA helicase DinG  30.37 
 
 		 714 aa  282  2e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0823  ATP-dependent DNA helicase DinG  30.43 
 
 		 716 aa  282  2e-74  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0866  ATP-dependent DNA helicase DinG  30.43 
 
 		 716 aa  281  2e-74  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00783  hypothetical protein  30.43 
 
 		 716 aa  281  2e-74  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0948  ATP-dependent DNA helicase DinG  30.29 
 
 		 762 aa  281  3e-74  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2844  ATP-dependent DNA helicase DinG  30.29 
 
 		 716 aa  280  1e-73  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0506897 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0853  ATP-dependent DNA helicase DinG  30.29 
 
 		 716 aa  280  1e-73  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1289  ATP-dependent DNA helicase DinG  29.8 
 
 		 725 aa  278  3e-73  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.649523  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0363  ATP-dependent helicase DinG  32.16 
 
 		 840 aa  272  1e-71  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.01237  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0509  helicase c2  30.96 
 
 		 843 aa  260  8e-68  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4122  helicase c2  29.93 
 
 		 843 aa  258  2e-67  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000977416  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1651  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  30.9 
 
 		 952 aa  256  9e-67  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0188  helicase c2  31.98 
 
 		 659 aa  253  1e-65  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00148037  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1467  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  28.03 
 
 		 934 aa  253  1e-65  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.533097  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1709  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  27.49 
 
 		 934 aa  250  8e-65  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000649538  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1671  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  27.34 
 
 		 934 aa  249  2e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.697043  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1598  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  28.01 
 
 		 934 aa  248  3e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00523268  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3747  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  28.01 
 
 		 934 aa  247  6e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.739451  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07920  helicase c2  26.97 
 
 		 822 aa  243  7e-63  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1452  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  27.71 
 
 		 934 aa  243  1e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1565  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  27.71 
 
 		 934 aa  243  1e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.554006  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3770  helicase c2  28.72 
 
 		 830 aa  241  2.9999999999999997e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1424  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  27.57 
 
 		 934 aa  240  6.999999999999999e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1636  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  27.57 
 
 		 934 aa  240  6.999999999999999e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00174148 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4323  helicase c2  31.75 
 
 		 631 aa  239  1e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3854  helicase c2  28.59 
 
 		 830 aa  239  1e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000920192 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3029  DnaQ family exonuclease/DinG family helicase  28.24 
 
 		 929 aa  239  1e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1425  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  27.42 
 
 		 934 aa  238  2e-61  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.446116  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1265  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  28.11 
 
 		 929 aa  236  1.0000000000000001e-60  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00466144  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0023  Rad3-related DNA helicases  30.64 
 
 		 851 aa  232  2e-59  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000466591  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0997  helicase c2  31.44 
 
 		 643 aa  231  5e-59  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.179863 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1412  helicase c2  28.73 
 
 		 658 aa  230  8e-59  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.102914  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1347  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  27.21 
 
 		 957 aa  229  1e-58  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.579486 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1899  DNA polymerase III, epsilon subunit  31 
 
 		 956 aa  227  6e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0589249 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1743  DNA polymerase III, epsilon subunit  29.2 
 
 		 930 aa  226  1e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.23026  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1197  helicase c2  29.92 
 
 		 661 aa  225  2e-57  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.0000973223  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4468  helicase c2  32.07 
 
 		 635 aa  225  3e-57  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.261313  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>