More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_2732 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_0014  ATP-dependent DNA helicase DinG  70.18 
 
 
729 aa  990    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.11513  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0021  ATP-dependent DNA helicase DinG  68.87 
 
 
692 aa  940    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2033  ATP-dependent DNA helicase DinG  53.1 
 
 
716 aa  707    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2732  ATP-dependent DNA helicase DinG  100 
 
 
738 aa  1480    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.196414  normal  0.101558 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0013  ATP-dependent DNA helicase DinG  69.71 
 
 
741 aa  998    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4158  ATP-dependent DNA helicase DinG  70.59 
 
 
758 aa  995    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0503  helicase c2  40.78 
 
 
750 aa  426  1e-117  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.516825  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4334  ATP-dependent DNA helicase DinG  35.76 
 
 
714 aa  397  1e-109  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.044641  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50840  ATP-dependent DNA helicase DinG  34.74 
 
 
714 aa  398  1e-109  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00144938 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19450  ATP-dependent DNA helicase DinG  37.75 
 
 
714 aa  397  1e-109  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1125  ATP-dependent DNA helicase DinG  37.17 
 
 
714 aa  389  1e-107  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.437588  hitchhiker  0.0000838668 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1161  ATP-dependent DNA helicase DinG  37.17 
 
 
714 aa  389  1e-107  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.665209  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1146  ATP-dependent DNA helicase DinG  36.75 
 
 
714 aa  387  1e-106  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.980909  normal  0.730569 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4290  ATP-dependent DNA helicase DinG  36.89 
 
 
714 aa  387  1e-106  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4120  ATP-dependent helicase, DinG family  35.48 
 
 
714 aa  387  1e-106  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3856  ATP-dependent DNA helicase DinG  35.35 
 
 
714 aa  387  1e-106  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.160495  normal  0.793215 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1427  ATP-dependent DNA helicase DinG  35.69 
 
 
714 aa  388  1e-106  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.152164  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0995  ATP-dependent DNA helicase DinG  37.93 
 
 
708 aa  380  1e-104  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.196461  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1225  ATP-dependent DNA helicase DinG  34.87 
 
 
714 aa  379  1e-103  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1624  ATP-dependent DNA helicase DinG  36.01 
 
 
721 aa  365  2e-99  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1585  ATP-dependent DNA helicase DinG  34.4 
 
 
725 aa  359  8e-98  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.629158  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2118  ATP-dependent DNA helicase DinG  31.66 
 
 
707 aa  357  3.9999999999999996e-97  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.149773  hitchhiker  0.000000714427 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2178  ATP-dependent DNA helicase DinG  33.29 
 
 
686 aa  352  2e-95  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.647766 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2272  ATP-dependent DNA helicase DinG  33.2 
 
 
712 aa  348  3e-94  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01557  ATP-dependent DNA helicase DinG  33.38 
 
 
691 aa  346  1e-93  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1513  ATP-dependent DNA helicase DinG  32.3 
 
 
690 aa  343  8e-93  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.433839  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1249  ATP-dependent DNA helicase DinG  32.17 
 
 
691 aa  341  2.9999999999999998e-92  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000153763 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1446  ATP-dependent DNA helicase DinG  33.1 
 
 
703 aa  339  9e-92  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000107544  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2538  ATP-dependent DNA helicase DinG  32.36 
 
 
690 aa  339  9.999999999999999e-92  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.536241  unclonable  0.0000322681 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0350  ATP-dependent DNA helicase DinG  33.98 
 
 
711 aa  337  3.9999999999999995e-91  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  decreased coverage  0.00468076  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2470  ATP-dependent DNA helicase DinG  32.36 
 
 
690 aa  337  3.9999999999999995e-91  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00127477 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2630  ATP-dependent DNA helicase DinG  32.51 
 
 
690 aa  337  3.9999999999999995e-91  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.920562  hitchhiker  0.00302525 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2656  ATP-dependent DNA helicase DinG  30.81 
 
 
690 aa  335  2e-90  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.765136  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1819  ATP-dependent DNA helicase DinG  32.36 
 
 
690 aa  334  3e-90  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003963  ATP-dependent helicase DinG/Rad3  31.69 
 
 
691 aa  332  1e-89  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2725  ATP-dependent DNA helicase DinG  31.3 
 
 
690 aa  332  1e-89  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0300555  hitchhiker  0.000425027 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1629  ATP-dependent DNA helicase DinG  32.02 
 
 
690 aa  331  3e-89  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.117477  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1652  ATP-dependent DNA helicase DinG  32.02 
 
 
690 aa  331  3e-89  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.303868 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1618  ATP-dependent DNA helicase DinG  32.02 
 
 
690 aa  331  3e-89  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.326155  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1566  ATP-dependent DNA helicase DinG  30.34 
 
 
692 aa  327  4.0000000000000003e-88  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000620367 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2483  ATP-dependent DNA helicase DinG  30.8 
 
 
690 aa  327  6e-88  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00204554 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3086  ATP-dependent DNA helicase DinG  30.22 
 
 
692 aa  322  9.999999999999999e-87  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.175143  hitchhiker  0.0000411022 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2630  ATP-dependent DNA helicase DinG  31.53 
 
 
691 aa  321  3e-86  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2429  ATP-dependent DNA helicase DinG  31.87 
 
 
691 aa  320  6e-86  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1129  ATP-dependent DNA helicase DinG  31.68 
 
 
694 aa  313  1e-83  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0640459  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3854  ATP-dependent DNA helicase DinG  32.14 
 
 
700 aa  310  5e-83  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2777  ATP-dependent DNA helicase DinG  33.33 
 
 
726 aa  308  2.0000000000000002e-82  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2856  ATP-dependent DNA helicase DinG  33.33 
 
 
726 aa  308  2.0000000000000002e-82  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.642331  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1321  ATP-dependent DNA helicase DinG  33.33 
 
 
726 aa  308  2.0000000000000002e-82  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2553  ATP-dependent DNA helicase DinG  31.99 
 
 
716 aa  301  2e-80  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0866  ATP-dependent DNA helicase DinG  31.93 
 
 
716 aa  301  2e-80  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00766  ATP-dependent DNA helicase  31.99 
 
 
716 aa  301  3e-80  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2843  helicase c2  31.99 
 
 
716 aa  301  3e-80  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00783  hypothetical protein  31.99 
 
 
716 aa  301  3e-80  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0948  ATP-dependent DNA helicase DinG  31.86 
 
 
762 aa  300  4e-80  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0823  ATP-dependent DNA helicase DinG  31.99 
 
 
716 aa  301  4e-80  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2844  ATP-dependent DNA helicase DinG  31.99 
 
 
716 aa  300  9e-80  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0506897 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0853  ATP-dependent DNA helicase DinG  31.99 
 
 
716 aa  300  9e-80  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0857  ATP-dependent DNA helicase DinG  31.62 
 
 
714 aa  297  5e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0884  ATP-dependent DNA helicase DinG  31.18 
 
 
714 aa  297  5e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02825  ATP-dependent DNA helicase DinG  32.03 
 
 
710 aa  296  6e-79  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1461  ATP-dependent DNA helicase DinG  31.98 
 
 
732 aa  297  6e-79  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.498771 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0948  ATP-dependent DNA helicase DinG  31.48 
 
 
714 aa  296  7e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.607089  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1552  ATP-dependent DNA helicase DinG  31.28 
 
 
699 aa  296  7e-79  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0969  ATP-dependent DNA helicase DinG  31.34 
 
 
714 aa  295  2e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.725445  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0916  ATP-dependent DNA helicase DinG  31.42 
 
 
714 aa  295  2e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2495  ATP-dependent DNA helicase DinG  32.78 
 
 
701 aa  295  3e-78  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.324564  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2910  ATP-dependent DNA helicase DinG  31.22 
 
 
699 aa  293  5e-78  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1289  ATP-dependent DNA helicase DinG  30.96 
 
 
725 aa  285  2.0000000000000002e-75  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.649523  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2398  ATP-dependent DNA helicase DinG  31.38 
 
 
715 aa  280  6e-74  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.927767  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3670  helicase c2  33.06 
 
 
664 aa  264  4e-69  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.978483  normal  0.986261 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0188  helicase c2  32.15 
 
 
659 aa  261  3e-68  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00148037  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3167  helicase c2  31.05 
 
 
876 aa  248  2e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000644587  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0363  ATP-dependent helicase DinG  30.92 
 
 
840 aa  247  4.9999999999999997e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.01237  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07920  helicase c2  27.09 
 
 
822 aa  245  1.9999999999999999e-63  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0509  helicase c2  29.8 
 
 
843 aa  241  2.9999999999999997e-62  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3621  helicase c2  31.56 
 
 
838 aa  240  8e-62  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0636  helicase c2  29.71 
 
 
660 aa  238  3e-61  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1467  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  27.45 
 
 
934 aa  234  4.0000000000000004e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.533097  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3029  DnaQ family exonuclease/DinG family helicase  28.59 
 
 
929 aa  233  8.000000000000001e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0997  helicase c2  31.5 
 
 
643 aa  231  4e-59  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.179863 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1709  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  27.82 
 
 
934 aa  231  4e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000649538  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1671  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  27.67 
 
 
934 aa  231  5e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.697043  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1651  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  29.82 
 
 
952 aa  230  6e-59  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1265  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  27.21 
 
 
929 aa  229  2e-58  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00466144  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1598  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  27.19 
 
 
934 aa  228  3e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00523268  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3747  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  27.19 
 
 
934 aa  228  3e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.739451  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1347  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  27.26 
 
 
957 aa  227  7e-58  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.579486 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0023  Rad3-related DNA helicases  29.58 
 
 
851 aa  226  2e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000466591  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4122  helicase c2  28.84 
 
 
843 aa  223  7e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000977416  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1452  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  27.51 
 
 
934 aa  223  9.999999999999999e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1565  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  27.51 
 
 
934 aa  223  9.999999999999999e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.554006  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0411  helicase c2  30.43 
 
 
646 aa  223  9.999999999999999e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3770  helicase c2  28.38 
 
 
830 aa  222  1.9999999999999999e-56  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1424  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  27.37 
 
 
934 aa  221  3e-56  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1636  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  27.37 
 
 
934 aa  221  3e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00174148 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3854  helicase c2  28.04 
 
 
830 aa  220  6e-56  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000920192 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1425  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  27.22 
 
 
934 aa  220  7.999999999999999e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.446116  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1197  helicase c2  30.11 
 
 
661 aa  219  1e-55  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.0000973223  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1743  DNA polymerase III, epsilon subunit  30.07 
 
 
930 aa  219  1e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.23026  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>