137 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_50344 on replicon NC_009048
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
BN001308  ANIA_09436  5' to 3' DNA helicase (Eurofung)  71.09 
 
 		 791 aa  1227    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA05570  general RNA polymerase II transcription factor, putative  61.02 
 
 		 799 aa  1045    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.946623  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_50344  DNA helicase component of transcription factor b  100 
 
 		 793 aa  1651    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_26944  predicted protein  49.8 
 
 		 788 aa  791    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.168097 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_54072  xeroderma pigmentosum group D complementing protein  46.39 
 
 		 782 aa  738    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_37445  predicted protein  24.63 
 
 		 938 aa  202  1.9999999999999998e-50  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.258887  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_40695  predicted protein  25.49 
 
 		 749 aa  198  4.0000000000000005e-49  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00000000149445  normal  0.993011 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_24915  predicted protein  23.95 
 
 		 791 aa  182  2e-44  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.615618  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_37740  predicted protein  24.09 
 
 		 849 aa  179  3e-43  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.689797  normal  0.0804873 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_32894  predicted protein  24.5 
 
 		 1067 aa  171  4e-41  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0780237  normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB05090  CHL1 helicase, putative  24.08 
 
 		 849 aa  162  3e-38  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2627  DEAD_2 domain protein  22.88 
 
 		 723 aa  150  9e-35  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.510755 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10414  DNA helicase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G05590)  29.07 
 
 		 841 aa  144  6e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1416  DEAD_2 domain protein  23.85 
 
 		 722 aa  139  3.0000000000000003e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_54439  YPL008W (CHL1)-like protein  26.23 
 
 		 835 aa  130  9.000000000000001e-29  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.106037 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0335  DEAD_2 domain protein  21.8 
 
 		 723 aa  130  1.0000000000000001e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1769  DEAD_2 domain protein  22.1 
 
 		 729 aa  129  2.0000000000000002e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.863576  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1812  DEAD_2 domain-containing protein  21.59 
 
 		 617 aa  125  5e-27  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0429091  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1117  DEAD_2 domain-containing protein  22.55 
 
 		 712 aa  121  6e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.708962  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0823  DEAD_2 domain protein  20.49 
 
 		 739 aa  115  4.0000000000000004e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1672  helicase c2  22.7 
 
 		 739 aa  110  1e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_10282  predicted protein  26.35 
 
 		 614 aa  109  2e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1104  queuine tRNA-ribosyltransferase  20.64 
 
 		 676 aa  102  4e-20  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1699  DEAD_2 domain protein  20.35 
 
 		 670 aa  99.8  2e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0524758  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1918  helicase c2  22.56 
 
 		 790 aa  95.1  5e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.885633  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0789  helicase c2  26.02 
 
 		 669 aa  90.9  9e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.222881  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3766  helicase c2  22.81 
 
 		 806 aa  88.2  6e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2465  helicase c2  21.75 
 
 		 806 aa  87.8  8e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1408  putative ATP-dependent helicase  22.87 
 
 		 781 aa  82  0.00000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1376  DNA helicase RepD  26.27 
 
 		 773 aa  81.6  0.00000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.905642  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0620  DEAD_2 domain-containing protein  21.07 
 
 		 634 aa  81.6  0.00000000000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0965  helicase c2  26.12 
 
 		 654 aa  79  0.0000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.228923  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0660  DEAD_2 domain protein  22.97 
 
 		 790 aa  77  0.000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0196  DEAD_2 domain protein  21.77 
 
 		 619 aa  77  0.000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.544403  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0816  helicase c2  20.98 
 
 		 787 aa  75.9  0.000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.524115 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1498  helicase c2  20.89 
 
 		 773 aa  73.6  0.00000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.486316  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1361  helicase c2  22.02 
 
 		 801 aa  72.4  0.00000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1566  Rad3-related DNA helicases  27.82 
 
 		 726 aa  71.6  0.00000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000243015  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1217  ATP-dependent helicase, putative  26.01 
 
 		 781 aa  70.9  0.00000000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.11747  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0995  DEAD_2 domain protein  25 
 
 		 777 aa  70.9  0.0000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2112  DEAD_2 domain-containing protein  25.08 
 
 		 797 aa  70.1  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1737  DEAD_2 domain-containing protein  22.14 
 
 		 574 aa  70.1  0.0000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000703978 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2454  Uvs006  21.86 
 
 		 746 aa  68.9  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.107257  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2975  helicase c2  23.74 
 
 		 807 aa  68.9  0.0000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1260  putative ATP-dependent helicase  21.86 
 
 		 755 aa  68.6  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1186  putative ATP-dependent helicase  21.73 
 
 		 755 aa  68.9  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.146047  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1357  DEAD_2 domain-containing protein  23.42 
 
 		 575 aa  68.6  0.0000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0243831 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1550  DNA repair helicase  21.58 
 
 		 745 aa  68.2  0.0000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1117  DEAD_2 domain-containing protein  22.08 
 
 		 582 aa  67  0.000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2630  ATP-dependent DNA helicase DinG  22.06 
 
 		 691 aa  65.9  0.000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4133  DEAD_2 domain protein  22.75 
 
 		 798 aa  65.9  0.000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1847  DEAD_2 domain-containing protein  25.19 
 
 		 807 aa  65.1  0.000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0390  DEAD_2 domain-containing protein  23.92 
 
 		 580 aa  64.3  0.000000009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.12513 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1249  ATP-dependent DNA helicase DinG  20.16 
 
 		 691 aa  64.3  0.00000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000153763 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4042  DEAD_2 domain protein  21.82 
 
 		 798 aa  63.2  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1129  ATP-dependent DNA helicase DinG  22.18 
 
 		 694 aa  62.8  0.00000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0640459  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1819  ATP-dependent DNA helicase DinG  20.95 
 
 		 690 aa  62.8  0.00000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0928  ATP-dependent helicase, putative  21.35 
 
 		 495 aa  62.8  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.568065  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1618  ATP-dependent DNA helicase DinG  20.78 
 
 		 690 aa  62.4  0.00000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.326155  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1652  ATP-dependent DNA helicase DinG  20.78 
 
 		 690 aa  62.4  0.00000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.303868 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2725  ATP-dependent DNA helicase DinG  20.78 
 
 		 690 aa  62.4  0.00000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0300555  hitchhiker  0.000425027 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1629  ATP-dependent DNA helicase DinG  20.78 
 
 		 690 aa  62.4  0.00000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.117477  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1513  ATP-dependent DNA helicase DinG  20.76 
 
 		 690 aa  62  0.00000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.433839  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1376  DNA repair helicase, truncation  21.39 
 
 		 431 aa  62  0.00000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.731908  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2483  ATP-dependent DNA helicase DinG  24.32 
 
 		 690 aa  61.6  0.00000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00204554 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2429  ATP-dependent DNA helicase DinG  21.72 
 
 		 691 aa  60.5  0.0000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2470  ATP-dependent DNA helicase DinG  20.95 
 
 		 690 aa  60.5  0.0000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00127477 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2538  ATP-dependent DNA helicase DinG  28.85 
 
 		 690 aa  60.5  0.0000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.536241  unclonable  0.0000322681 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2630  ATP-dependent DNA helicase DinG  28.85 
 
 		 690 aa  60.5  0.0000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.920562  hitchhiker  0.00302525 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0185  helicase c2  20.39 
 
 		 798 aa  59.7  0.0000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2947  DEAD_2 domain protein  24.82 
 
 		 774 aa  59.7  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.443127  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2972  DEAD_2 domain-containing protein  20.37 
 
 		 753 aa  60.1  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.114076 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2656  ATP-dependent DNA helicase DinG  27.56 
 
 		 690 aa  58.9  0.0000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.765136  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19450  ATP-dependent DNA helicase DinG  20.11 
 
 		 714 aa  58.5  0.0000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2806  DEAD_2 domain protein  23.47 
 
 		 785 aa  57.8  0.0000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.717048  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1566  ATP-dependent DNA helicase DinG  28.57 
 
 		 692 aa  57.8  0.0000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000620367 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1514  DnaQ family exonuclease/DinG family helicase  24.49 
 
 		 897 aa  57.4  0.0000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.103927  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1543  DnaQ family exonuclease/DinG family helicase  24.49 
 
 		 897 aa  57.4  0.0000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.959984  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3086  ATP-dependent DNA helicase DinG  27.56 
 
 		 692 aa  57  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.175143  hitchhiker  0.0000411022 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1446  ATP-dependent DNA helicase DinG  21.75 
 
 		 703 aa  57.4  0.000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000107544  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0289  DEAD_2  25.09 
 
 		 785 aa  56.6  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00121679  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1867  DEAD_2 domain-containing protein  24.79 
 
 		 541 aa  56.2  0.000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.512598 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0350  ATP-dependent DNA helicase DinG  21.38 
 
 		 711 aa  56.2  0.000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  decreased coverage  0.00468076  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2178  ATP-dependent DNA helicase DinG  25 
 
 		 686 aa  55.5  0.000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.647766 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2839  DEAD_2 domain protein  23.97 
 
 		 762 aa  55.1  0.000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2850  DEAD_2 domain-containing protein  23.97 
 
 		 753 aa  54.7  0.000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0984  DEAD_2 domain-containing protein  24.9 
 
 		 773 aa  54.3  0.000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1288  DEAD_2 domain protein  22.27 
 
 		 550 aa  53.1  0.00002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1146  ATP-dependent DNA helicase DinG  20.47 
 
 		 714 aa  53.1  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.980909  normal  0.730569 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1453  helicase c2  20.97 
 
 		 669 aa  52.4  0.00003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2510  helicase c2  20.07 
 
 		 788 aa  52  0.00004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00268076 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2943  DEAD_2 domain-containing protein  23.34 
 
 		 753 aa  51.6  0.00005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003963  ATP-dependent helicase DinG/Rad3  20.26 
 
 		 691 aa  51.2  0.00007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1125  ATP-dependent DNA helicase DinG  26.9 
 
 		 714 aa  50.8  0.00009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.437588  hitchhiker  0.0000838668 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5827  DEAD_2  22.09 
 
 		 779 aa  50.8  0.00009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1161  ATP-dependent DNA helicase DinG  26.9 
 
 		 714 aa  50.8  0.00009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.665209  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01557  ATP-dependent DNA helicase DinG  20.32 
 
 		 691 aa  50.8  0.00009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3856  ATP-dependent DNA helicase DinG  21.22 
 
 		 714 aa  50.8  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.160495  normal  0.793215 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3854  ATP-dependent DNA helicase DinG  21.35 
 
 		 700 aa  50.1  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5421  DEAD_2 domain protein  19.69 
 
 		 754 aa  50.8  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>