282 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_0335 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_2627  DEAD_2 domain protein  67.68 
 
 		 723 aa  1015    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.510755 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1769  DEAD_2 domain protein  89.3 
 
 		 729 aa  1345    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.863576  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0823  DEAD_2 domain protein  65.26 
 
 		 739 aa  976    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0335  DEAD_2 domain protein  100 
 
 		 723 aa  1479    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1416  DEAD_2 domain protein  66.16 
 
 		 722 aa  997    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1566  Rad3-related DNA helicases  41.7 
 
 		 726 aa  601  1e-170  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000243015  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1376  DNA helicase RepD  41.22 
 
 		 773 aa  583  1.0000000000000001e-165  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.905642  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0816  helicase c2  30.03 
 
 		 787 aa  243  1e-62  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.524115 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0196  DEAD_2 domain protein  24.79 
 
 		 619 aa  182  2e-44  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.544403  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2465  helicase c2  39.67 
 
 		 806 aa  180  8e-44  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1918  helicase c2  41.1 
 
 		 790 aa  176  9.999999999999999e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.885633  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2975  helicase c2  37.46 
 
 		 807 aa  173  9e-42  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3766  helicase c2  37.99 
 
 		 806 aa  165  2.0000000000000002e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1104  queuine tRNA-ribosyltransferase  24.5 
 
 		 676 aa  150  7e-35  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1672  helicase c2  23.5 
 
 		 739 aa  141  6e-32  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0789  helicase c2  23.64 
 
 		 669 aa  137  6.0000000000000005e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.222881  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0965  helicase c2  22.39 
 
 		 654 aa  134  7.999999999999999e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.228923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_50344  DNA helicase component of transcription factor b  21.8 
 
 		 793 aa  130  1.0000000000000001e-28  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1117  DEAD_2 domain-containing protein  22.15 
 
 		 712 aa  123  9.999999999999999e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.708962  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09436  5' to 3' DNA helicase (Eurofung)  22.47 
 
 		 791 aa  120  7.999999999999999e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4133  DEAD_2 domain protein  24.19 
 
 		 798 aa  117  1.0000000000000001e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA05570  general RNA polymerase II transcription factor, putative  20.9 
 
 		 799 aa  114  4.0000000000000004e-24  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.946623  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1699  DEAD_2 domain protein  22.75 
 
 		 670 aa  114  5e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0524758  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1942  helicase c2  23.51 
 
 		 832 aa  112  3e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.357662  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1812  DEAD_2 domain-containing protein  24.45 
 
 		 617 aa  108  5e-22  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0429091  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0289  DEAD_2  21.99 
 
 		 785 aa  107  7e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00121679  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_54072  xeroderma pigmentosum group D complementing protein  22.66 
 
 		 782 aa  106  1e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_37445  predicted protein  22.82 
 
 		 938 aa  106  2e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.258887  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1217  ATP-dependent helicase, putative  21.51 
 
 		 781 aa  100  1e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.11747  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0995  DEAD_2 domain protein  21.86 
 
 		 777 aa  100  1e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4042  DEAD_2 domain protein  25.68 
 
 		 798 aa  99.4  2e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3224  DNA polymerase III, epsilon subunit  24.02 
 
 		 927 aa  98.6  3e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00101103  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1847  DEAD_2 domain-containing protein  24.66 
 
 		 807 aa  94  1e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0185  helicase c2  25.26 
 
 		 798 aa  93.2  1e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07920  helicase c2  22.71 
 
 		 822 aa  91.3  5e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_24915  predicted protein  21.54 
 
 		 791 aa  90.9  8e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.615618  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1408  putative ATP-dependent helicase  21.92 
 
 		 781 aa  90.1  1e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0015  DEAD_2 domain-containing protein  29.96 
 
 		 750 aa  90.1  1e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.338089  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0528  helicase c2  20.66 
 
 		 667 aa  89.7  2e-16  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1867  DEAD_2 domain-containing protein  23.21 
 
 		 541 aa  89  3e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.512598 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0660  DEAD_2 domain protein  22.48 
 
 		 790 aa  87.8  6e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5309  DEAD_2 domain-containing protein  22.77 
 
 		 756 aa  87.4  8e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.173286  hitchhiker  0.0033003 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2947  DEAD_2 domain protein  22.03 
 
 		 774 aa  87  0.000000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.443127  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4835  helicase c2  29.29 
 
 		 874 aa  85.5  0.000000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0589586 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1288  DEAD_2 domain protein  23.14 
 
 		 550 aa  83.6  0.00000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5827  DEAD_2  23.3 
 
 		 779 aa  83.6  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_54439  YPL008W (CHL1)-like protein  22.51 
 
 		 835 aa  83.6  0.00000000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.106037 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1902  helicase c2  23.54 
 
 		 646 aa  81.3  0.00000000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0188  helicase c2  23.1 
 
 		 659 aa  81.3  0.00000000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00148037  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2112  DEAD_2 domain-containing protein  29.71 
 
 		 797 aa  81.3  0.00000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_37740  predicted protein  23.48 
 
 		 849 aa  80.1  0.0000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.689797  normal  0.0804873 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0224  DEAD_2 domain-containing protein  22.04 
 
 		 852 aa  80.5  0.0000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0115724  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2972  DEAD_2 domain-containing protein  21.39 
 
 		 753 aa  79.7  0.0000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.114076 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0478  DEAD_2 domain-containing protein  22.36 
 
 		 588 aa  78.2  0.0000000000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.738253  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1347  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  21.92 
 
 		 957 aa  77.8  0.0000000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.579486 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1550  DNA repair helicase  24.53 
 
 		 745 aa  77.8  0.0000000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2454  Uvs006  31.56 
 
 		 746 aa  77.4  0.0000000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.107257  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1260  putative ATP-dependent helicase  31.56 
 
 		 755 aa  77.4  0.0000000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1186  putative ATP-dependent helicase  31.56 
 
 		 755 aa  77  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.146047  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1990  ATP-dependent helicase DinG  22.73 
 
 		 709 aa  75.9  0.000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2690  DEAD_2  23.9 
 
 		 772 aa  75.9  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00215798 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23060  DNA helicase, Rad3  24.25 
 
 		 692 aa  76.3  0.000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0774743 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0984  DEAD_2 domain-containing protein  24.07 
 
 		 773 aa  75.9  0.000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3036  hypothetical protein  26.07 
 
 		 761 aa  74.7  0.000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0104594  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5966  helicase c2  30.25 
 
 		 766 aa  74.7  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.224812  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0390  DEAD_2 domain-containing protein  23.09 
 
 		 580 aa  74.7  0.000000000006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.12513 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01131  ATP-dependent helicase  21.39 
 
 		 639 aa  74.3  0.000000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.625206  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1630  Rad3-related DNA helicases-like  29.92 
 
 		 766 aa  74.3  0.000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.138986  normal  0.527518 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4233  helicase c2  28.69 
 
 		 757 aa  74.3  0.000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.134799  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3801  helicase c2  29.92 
 
 		 766 aa  74.3  0.000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.354929 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_26944  predicted protein  25.94 
 
 		 788 aa  73.9  0.000000000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.168097 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_32894  predicted protein  23.72 
 
 		 1067 aa  73.9  0.000000000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0780237  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1671  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  22.1 
 
 		 934 aa  73.6  0.00000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.697043  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1376  DNA repair helicase, truncation  31.11 
 
 		 431 aa  73.9  0.00000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.731908  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5813  helicase c2  29.11 
 
 		 790 aa  73.6  0.00000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.208635 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4268  helicase c2  29.51 
 
 		 766 aa  73.6  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0100597  normal  0.178799 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0928  ATP-dependent helicase, putative  31.11 
 
 		 495 aa  73.9  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.568065  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2510  helicase c2  24.01 
 
 		 788 aa  72.8  0.00000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00268076 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4634  helicase c2  23.3 
 
 		 674 aa  73.2  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1709  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  22.1 
 
 		 934 aa  72.8  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000649538  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2909  DEAD_2  23.05 
 
 		 775 aa  72  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0996428 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3978  helicase c2  28.4 
 
 		 766 aa  72.4  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0904062  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4389  helicase c2  28.4 
 
 		 766 aa  72.4  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.787433  normal  0.56553 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2943  DEAD_2 domain-containing protein  29.75 
 
 		 753 aa  72  0.00000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1117  DEAD_2 domain-containing protein  28.57 
 
 		 582 aa  72  0.00000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2806  DEAD_2 domain protein  27.63 
 
 		 785 aa  71.6  0.00000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.717048  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0909  hypothetical protein  23.71 
 
 		 773 aa  71.2  0.00000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.205853  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1424  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  21.96 
 
 		 934 aa  70.1  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1636  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  21.96 
 
 		 934 aa  70.1  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00174148 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1106  helicase c2  20.3 
 
 		 636 aa  69.7  0.0000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.243566 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1425  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  21.96 
 
 		 934 aa  70.1  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.446116  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4111  helicase c2  27.48 
 
 		 766 aa  69.3  0.0000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.620969 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0620  DEAD_2 domain-containing protein  22.78 
 
 		 634 aa  69.3  0.0000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2839  DEAD_2 domain protein  29.34 
 
 		 762 aa  68.9  0.0000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1452  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  21.26 
 
 		 934 aa  69.3  0.0000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1737  DEAD_2 domain-containing protein  24.27 
 
 		 574 aa  68.9  0.0000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000703978 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1565  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  21.26 
 
 		 934 aa  69.3  0.0000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.554006  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2850  DEAD_2 domain-containing protein  29.34 
 
 		 753 aa  69.3  0.0000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_14100  exonuclease, DNA polymerase III, epsilon subunit family  27.97 
 
 		 1043 aa  67.8  0.0000000006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5421  DEAD_2 domain protein  22.63 
 
 		 754 aa  67.4  0.0000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>