More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_1918 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_0816  helicase c2  63.42 
 
 		 787 aa  997    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.524115 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3766  helicase c2  84.58 
 
 		 806 aa  1357    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1918  helicase c2  100 
 
 		 790 aa  1594    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.885633  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2465  helicase c2  43.47 
 
 		 806 aa  545  1e-153  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2975  helicase c2  41.59 
 
 		 807 aa  530  1e-149  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1566  Rad3-related DNA helicases  25.25 
 
 		 726 aa  187  5e-46  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000243015  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0335  DEAD_2 domain protein  41.1 
 
 		 723 aa  176  9.999999999999999e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1769  DEAD_2 domain protein  38.85 
 
 		 729 aa  166  2.0000000000000002e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.863576  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1376  DNA helicase RepD  26.89 
 
 		 773 aa  163  1e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.905642  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0823  DEAD_2 domain protein  38 
 
 		 739 aa  154  8e-36  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2627  DEAD_2 domain protein  36.64 
 
 		 723 aa  152  2e-35  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.510755 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1416  DEAD_2 domain protein  36.79 
 
 		 722 aa  137  7.000000000000001e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1104  queuine tRNA-ribosyltransferase  30.41 
 
 		 676 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4133  DEAD_2 domain protein  34.1 
 
 		 798 aa  110  9.000000000000001e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4042  DEAD_2 domain protein  31.92 
 
 		 798 aa  108  5e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0789  helicase c2  32.16 
 
 		 669 aa  106  2e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.222881  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2947  DEAD_2 domain protein  27.89 
 
 		 774 aa  105  2e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.443127  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1672  helicase c2  25.74 
 
 		 739 aa  105  2e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0196  DEAD_2 domain protein  27.45 
 
 		 619 aa  105  4e-21  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.544403  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1847  DEAD_2 domain-containing protein  30.3 
 
 		 807 aa  104  6e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1217  ATP-dependent helicase, putative  30.42 
 
 		 781 aa  100  9e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.11747  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0185  helicase c2  32.06 
 
 		 798 aa  100  1e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0965  helicase c2  29.39 
 
 		 654 aa  99.8  2e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.228923  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1408  putative ATP-dependent helicase  30.19 
 
 		 781 aa  99.4  3e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2839  DEAD_2 domain protein  28.18 
 
 		 762 aa  95.9  2e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2850  DEAD_2 domain-containing protein  28.18 
 
 		 753 aa  95.9  2e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0224  DEAD_2 domain-containing protein  30.97 
 
 		 852 aa  95.9  2e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0115724  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2112  DEAD_2 domain-containing protein  29.62 
 
 		 797 aa  95.9  3e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1117  DEAD_2 domain-containing protein  28.72 
 
 		 712 aa  95.1  4e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.708962  normal  1 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_50344  DNA helicase component of transcription factor b  22.56 
 
 		 793 aa  94.7  6e-18  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2972  DEAD_2 domain-containing protein  30.69 
 
 		 753 aa  93.2  2e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.114076 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5827  DEAD_2  31.18 
 
 		 779 aa  93.2  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2943  DEAD_2 domain-containing protein  28.39 
 
 		 753 aa  92.8  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4111  helicase c2  29.59 
 
 		 766 aa  91.7  4e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.620969 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3423  hypothetical protein  29.63 
 
 		 758 aa  91.3  6e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0660  DEAD_2 domain protein  26.49 
 
 		 790 aa  90.9  9e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0995  DEAD_2 domain protein  28.24 
 
 		 777 aa  90.1  1e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1260  putative ATP-dependent helicase  28.73 
 
 		 755 aa  89.4  3e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1186  putative ATP-dependent helicase  28.73 
 
 		 755 aa  89  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.146047  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2454  Uvs006  28.73 
 
 		 746 aa  89.4  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.107257  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1550  DNA repair helicase  29.48 
 
 		 745 aa  88.6  4e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40350  hypothetical protein  28.84 
 
 		 758 aa  87.8  7e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.650358  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1498  helicase c2  29.74 
 
 		 773 aa  87.4  9e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.486316  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2510  helicase c2  28.74 
 
 		 788 aa  86.3  0.000000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00268076 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5309  DEAD_2 domain-containing protein  28.63 
 
 		 756 aa  86.3  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.173286  hitchhiker  0.0033003 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1699  DEAD_2 domain protein  29.01 
 
 		 670 aa  86.7  0.000000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0524758  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0909  hypothetical protein  29.64 
 
 		 773 aa  86.3  0.000000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.205853  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0984  DEAD_2 domain-containing protein  29.85 
 
 		 773 aa  85.1  0.000000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2690  DEAD_2  25.91 
 
 		 772 aa  85.1  0.000000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00215798 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0928  ATP-dependent helicase, putative  27.99 
 
 		 495 aa  84.7  0.000000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.568065  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1376  DNA repair helicase, truncation  27.99 
 
 		 431 aa  84.3  0.000000000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.731908  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0289  DEAD_2  27.55 
 
 		 785 aa  84.3  0.000000000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00121679  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5813  helicase c2  30.55 
 
 		 790 aa  83.6  0.00000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.208635 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1361  helicase c2  27.88 
 
 		 801 aa  83.6  0.00000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0015  DEAD_2 domain-containing protein  26.12 
 
 		 750 aa  81.3  0.00000000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.338089  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4233  helicase c2  27.84 
 
 		 757 aa  80.5  0.0000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.134799  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09436  5' to 3' DNA helicase (Eurofung)  21.14 
 
 		 791 aa  79.3  0.0000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5966  helicase c2  28.25 
 
 		 766 aa  80.1  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.224812  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1812  DEAD_2 domain-containing protein  31.36 
 
 		 617 aa  78.2  0.0000000000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0429091  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3801  helicase c2  27.44 
 
 		 766 aa  77.8  0.0000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.354929 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3036  hypothetical protein  26.62 
 
 		 761 aa  77  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0104594  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1630  Rad3-related DNA helicases-like  27.88 
 
 		 766 aa  77  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.138986  normal  0.527518 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4268  helicase c2  27.08 
 
 		 766 aa  77  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0100597  normal  0.178799 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2909  DEAD_2  25.76 
 
 		 775 aa  76.3  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0996428 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4835  helicase c2  32.02 
 
 		 874 aa  76.3  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0589586 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3978  helicase c2  27.51 
 
 		 766 aa  75.1  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0904062  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4389  helicase c2  27.51 
 
 		 766 aa  75.1  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.787433  normal  0.56553 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5421  DEAD_2 domain protein  25.66 
 
 		 754 aa  75.1  0.000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1180  hypothetical protein  25.66 
 
 		 754 aa  75.1  0.000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.749053  normal  0.379614 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2428  helicase c2  27.87 
 
 		 855 aa  75.1  0.000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.376304  normal  0.732574 
 
 
-
 
NC_006670  CNA05570  general RNA polymerase II transcription factor, putative  20.52 
 
 		 799 aa  74.7  0.000000000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.946623  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1416  helicase c2  28.79 
 
 		 855 aa  74.7  0.000000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2806  DEAD_2 domain protein  28.24 
 
 		 785 aa  73.6  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.717048  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_54072  xeroderma pigmentosum group D complementing protein  26.32 
 
 		 782 aa  71.2  0.00000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_40695  predicted protein  27.24 
 
 		 749 aa  69.3  0.0000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00000000149445  normal  0.993011 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1132  hypothetical protein  25.66 
 
 		 681 aa  68.6  0.0000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1737  DEAD_2 domain-containing protein  29.81 
 
 		 574 aa  68.2  0.0000000006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000703978 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2483  ATP-dependent DNA helicase DinG  25.9 
 
 		 690 aa  67.8  0.0000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00204554 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2538  ATP-dependent DNA helicase DinG  27.02 
 
 		 690 aa  65.5  0.000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.536241  unclonable  0.0000322681 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1117  DEAD_2 domain-containing protein  30.58 
 
 		 582 aa  65.5  0.000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1819  ATP-dependent DNA helicase DinG  26.8 
 
 		 690 aa  65.5  0.000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1249  ATP-dependent DNA helicase DinG  25.74 
 
 		 691 aa  65.5  0.000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000153763 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2470  ATP-dependent DNA helicase DinG  30.57 
 
 		 690 aa  65.1  0.000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00127477 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2630  ATP-dependent DNA helicase DinG  30.57 
 
 		 690 aa  65.1  0.000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.920562  hitchhiker  0.00302525 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2656  ATP-dependent DNA helicase DinG  25.57 
 
 		 690 aa  63.2  0.00000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.765136  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1513  ATP-dependent DNA helicase DinG  31.21 
 
 		 690 aa  63.2  0.00000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.433839  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0390  DEAD_2 domain-containing protein  27.44 
 
 		 580 aa  63.2  0.00000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.12513 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1618  ATP-dependent DNA helicase DinG  29.94 
 
 		 690 aa  61.6  0.00000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.326155  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1629  ATP-dependent DNA helicase DinG  29.94 
 
 		 690 aa  61.6  0.00000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.117477  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1652  ATP-dependent DNA helicase DinG  29.94 
 
 		 690 aa  61.6  0.00000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.303868 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2809  helicase c2  25.57 
 
 		 707 aa  62  0.00000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2725  ATP-dependent DNA helicase DinG  29.94 
 
 		 690 aa  61.6  0.00000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0300555  hitchhiker  0.000425027 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003963  ATP-dependent helicase DinG/Rad3  23.5 
 
 		 691 aa  61.2  0.00000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0911  putative ATP-dependent helicase  25.2 
 
 		 651 aa  61.2  0.00000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_26944  predicted protein  24.31 
 
 		 788 aa  61.2  0.00000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.168097 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1902  helicase c2  28.49 
 
 		 646 aa  60.5  0.0000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3855  helicase c2  32.29 
 
 		 665 aa  59.3  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.210682  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6530  putative ATP-dependent helicase  30.11 
 
 		 674 aa  60.1  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.290122  normal  0.0410108 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3929  helicase c2  32.29 
 
 		 665 aa  59.3  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0336304  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4634  helicase c2  30.25 
 
 		 674 aa  59.3  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>